MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 459

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	GTCG	2	8	162	169	0 %	25 %	50 %	25 %	94152465
2	NC_007971	GAAG	2	8	1673	1680	50 %	0 %	50 %	0 %	94152464
3	NC_007971	AACG	2	8	3143	3150	50 %	0 %	25 %	25 %	94152463
4	NC_007971	GCCG	2	8	3156	3163	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
5	NC_007971	TCGT	2	8	3654	3661	0 %	50 %	25 %	25 %	94152462
6	NC_007971	CGTC	2	8	3662	3669	0 %	25 %	25 %	50 %	94152462
7	NC_007971	TAGG	2	8	3840	3847	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
8	NC_007971	AACC	2	8	4170	4177	50 %	0 %	0 %	50 %	94152462
9	NC_007971	GTGA	2	8	4198	4205	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
10	NC_007971	GATA	2	8	4342	4349	50 %	25 %	25 %	0 %	94152462
11	NC_007971	CGCC	2	8	4411	4418	0 %	0 %	25 %	75 %	94152462
12	NC_007971	TGGA	2	8	6841	6848	25 %	25 %	50 %	0 %	94152461
13	NC_007971	CGCT	2	8	8015	8022	0 %	25 %	25 %	50 %	94152460
14	NC_007971	CGGC	2	8	8233	8240	0 %	0 %	50 %	50 %	94152460
15	NC_007971	CTCC	2	8	8478	8485	0 %	25 %	0 %	75 %	94152460
16	NC_007971	GCGG	2	8	8514	8521	0 %	0 %	75 %	25 %	94152460
17	NC_007971	GGGC	2	8	8551	8558	0 %	0 %	75 %	25 %	94152460
18	NC_007971	TCGA	2	8	8755	8762	25 %	25 %	25 %	25 %	94152460
19	NC_007971	GTCT	2	8	9261	9268	0 %	50 %	25 %	25 %	94152460
20	NC_007971	CTCG	2	8	9336	9343	0 %	25 %	25 %	50 %	94152460
21	NC_007971	GTGC	2	8	9392	9399	0 %	25 %	50 %	25 %	94152460
22	NC_007971	GCGA	2	8	11403	11410	25 %	0 %	50 %	25 %	94152458
23	NC_007971	TCGA	2	8	13075	13082	25 %	25 %	25 %	25 %	94152457
24	NC_007971	CGAT	2	8	13330	13337	25 %	25 %	25 %	25 %	94152457
25	NC_007971	GAAT	2	8	13478	13485	50 %	25 %	25 %	0 %	94152457
26	NC_007971	GCGA	2	8	14257	14264	25 %	0 %	50 %	25 %	94152455
27	NC_007971	GGTC	2	8	14759	14766	0 %	25 %	50 %	25 %	94152454
28	NC_007971	CATT	2	8	14840	14847	25 %	50 %	0 %	25 %	94152454
29	NC_007971	GCCG	2	8	14881	14888	0 %	0 %	50 %	50 %	94152454
30	NC_007971	CATC	2	8	15228	15235	25 %	25 %	0 %	50 %	94152454
31	NC_007971	CCAC	2	8	15401	15408	25 %	0 %	0 %	75 %	94152454
32	NC_007971	CGTG	2	8	16019	16026	0 %	25 %	50 %	25 %	94152452
33	NC_007971	CCGT	2	8	16769	16776	0 %	25 %	25 %	50 %	94152450
34	NC_007971	GCCG	2	8	17727	17734	0 %	0 %	50 %	50 %	94152450
35	NC_007971	AACA	2	8	18418	18425	75 %	0 %	0 %	25 %	94152450
36	NC_007971	CATG	2	8	18435	18442	25 %	25 %	25 %	25 %	94152450
37	NC_007971	GCTG	3	12	21120	21131	0 %	25 %	50 %	25 %	94152446
38	NC_007971	GCCG	2	8	21403	21410	0 %	0 %	50 %	50 %	94152446
39	NC_007971	ATCC	2	8	21762	21769	25 %	25 %	0 %	50 %	94152445
40	NC_007971	CGGC	2	8	21789	21796	0 %	0 %	50 %	50 %	94152445
41	NC_007971	CGGC	2	8	21897	21904	0 %	0 %	50 %	50 %	94152445
42	NC_007971	CATA	2	8	22328	22335	50 %	25 %	0 %	25 %	94152445
43	NC_007971	GAGG	2	8	22501	22508	25 %	0 %	75 %	0 %	94152445
44	NC_007971	TGGC	2	8	22629	22636	0 %	25 %	50 %	25 %	94152445
45	NC_007971	CGGG	2	8	22659	22666	0 %	0 %	75 %	25 %	94152445
46	NC_007971	ATGG	2	8	22694	22701	25 %	25 %	50 %	0 %	94152445
47	NC_007971	GCGG	2	8	23946	23953	0 %	0 %	75 %	25 %	94152443
48	NC_007971	GCAG	2	8	24014	24021	25 %	0 %	50 %	25 %	94152443
49	NC_007971	AGCC	2	8	24026	24033	25 %	0 %	25 %	50 %	94152443
50	NC_007971	GAGC	2	8	24095	24102	25 %	0 %	50 %	25 %	94152443
51	NC_007971	GGGT	2	8	25566	25573	0 %	25 %	75 %	0 %	94152442
52	NC_007971	TTGC	2	8	25865	25872	0 %	50 %	25 %	25 %	291464757
53	NC_007971	AAGC	2	8	25922	25929	50 %	0 %	25 %	25 %	291464757
54	NC_007971	TGCT	2	8	26286	26293	0 %	50 %	25 %	25 %	94152441
55	NC_007971	CAAA	2	8	26565	26572	75 %	0 %	0 %	25 %	94152440
56	NC_007971	CCAC	2	8	26731	26738	25 %	0 %	0 %	75 %	94152440
57	NC_007971	ACCA	2	8	27091	27098	50 %	0 %	0 %	50 %	291464758
58	NC_007971	GGAT	2	8	27292	27299	25 %	25 %	50 %	0 %	94152439
59	NC_007971	ACGG	2	8	28269	28276	25 %	0 %	50 %	25 %	94152437
60	NC_007971	GCTT	2	8	28640	28647	0 %	50 %	25 %	25 %	94152437
61	NC_007971	GGTT	2	8	29654	29661	0 %	50 %	50 %	0 %	94152436
62	NC_007971	GGAT	2	8	30674	30681	25 %	25 %	50 %	0 %	94152433
63	NC_007971	GTCG	2	8	31061	31068	0 %	25 %	50 %	25 %	94152433
64	NC_007971	ATCC	2	8	32845	32852	25 %	25 %	0 %	50 %	94152430
65	NC_007971	TCAA	2	8	34538	34545	50 %	25 %	0 %	25 %	94152427
66	NC_007971	GCAG	2	8	35246	35253	25 %	0 %	50 %	25 %	94152426
67	NC_007971	GCAA	2	8	36639	36646	50 %	0 %	25 %	25 %	94152425
68	NC_007971	GCCG	2	8	37948	37955	0 %	0 %	50 %	50 %	94152423
69	NC_007971	CGAG	2	8	38030	38037	25 %	0 %	50 %	25 %	94152423
70	NC_007971	GGCC	2	8	38144	38151	0 %	0 %	50 %	50 %	94152423
71	NC_007971	GACT	2	8	38780	38787	25 %	25 %	25 %	25 %	94152422
72	NC_007971	GTCG	2	8	39148	39155	0 %	25 %	50 %	25 %	94152421
73	NC_007971	ATGG	2	8	39655	39662	25 %	25 %	50 %	0 %	94152421
74	NC_007971	TCCA	2	8	39863	39870	25 %	25 %	0 %	50 %	94152420
75	NC_007971	GCCT	2	8	40006	40013	0 %	25 %	25 %	50 %	94152420
76	NC_007971	GCGA	2	8	40159	40166	25 %	0 %	50 %	25 %	94152420
77	NC_007971	AGCG	2	8	40294	40301	25 %	0 %	50 %	25 %	94152420
78	NC_007971	AGCG	2	8	40380	40387	25 %	0 %	50 %	25 %	94152420
79	NC_007971	CGGC	2	8	40539	40546	0 %	0 %	50 %	50 %	94152420
80	NC_007971	TGGC	2	8	40638	40645	0 %	25 %	50 %	25 %	94152420
81	NC_007971	TCGA	2	8	40880	40887	25 %	25 %	25 %	25 %	94152419
82	NC_007971	GTCG	2	8	40967	40974	0 %	25 %	50 %	25 %	94152419
83	NC_007971	CAGC	2	8	41095	41102	25 %	0 %	25 %	50 %	94152419
84	NC_007971	ATGG	2	8	42697	42704	25 %	25 %	50 %	0 %	94152417
85	NC_007971	TCGC	2	8	44074	44081	0 %	25 %	25 %	50 %	94152416
86	NC_007971	TGGG	2	8	44182	44189	0 %	25 %	75 %	0 %	94152416
87	NC_007971	GAAC	2	8	44823	44830	50 %	0 %	25 %	25 %	94152416
88	NC_007971	GGTC	3	12	44908	44919	0 %	25 %	50 %	25 %	94152416
89	NC_007971	CGAA	2	8	45250	45257	50 %	0 %	25 %	25 %	94152415
90	NC_007971	CGTG	2	8	46397	46404	0 %	25 %	50 %	25 %	94152413
91	NC_007971	CCTG	2	8	46793	46800	0 %	25 %	25 %	50 %	94152413
92	NC_007971	GAAC	2	8	48474	48481	50 %	0 %	25 %	25 %	94152411
93	NC_007971	CGGG	2	8	50276	50283	0 %	0 %	75 %	25 %	94152409
94	NC_007971	GGCT	2	8	50986	50993	0 %	25 %	50 %	25 %	94152408
95	NC_007971	TTTC	2	8	51142	51149	0 %	75 %	0 %	25 %	94152408
96	NC_007971	CGAC	2	8	51242	51249	25 %	0 %	25 %	50 %	94152408
97	NC_007971	AGAA	2	8	51298	51305	75 %	0 %	25 %	0 %	94152408
98	NC_007971	GGTT	2	8	51827	51834	0 %	50 %	50 %	0 %	94152408
99	NC_007971	GAAT	2	8	52355	52362	50 %	25 %	25 %	0 %	94152407
100	NC_007971	ATCA	2	8	52638	52645	50 %	25 %	0 %	25 %	94152407
101	NC_007971	AGCC	2	8	53749	53756	25 %	0 %	25 %	50 %	94152407
102	NC_007971	ATGA	2	8	54664	54671	50 %	25 %	25 %	0 %	94152405
103	NC_007971	GAGC	2	8	54766	54773	25 %	0 %	50 %	25 %	94152405
104	NC_007971	GGCA	2	8	55148	55155	25 %	0 %	50 %	25 %	94152405
105	NC_007971	GCCA	2	8	58535	58542	25 %	0 %	25 %	50 %	94152401
106	NC_007971	GCAG	2	8	58939	58946	25 %	0 %	50 %	25 %	94152401
107	NC_007971	CAAT	2	8	59177	59184	50 %	25 %	0 %	25 %	94152400
108	NC_007971	GCCG	2	8	59684	59691	0 %	0 %	50 %	50 %	94152400
109	NC_007971	TCCA	2	8	60290	60297	25 %	25 %	0 %	50 %	94152400
110	NC_007971	GGGC	2	8	60703	60710	0 %	0 %	75 %	25 %	94152399
111	NC_007971	AGGA	2	8	61003	61010	50 %	0 %	50 %	0 %	94152399
112	NC_007971	AGCC	2	8	61139	61146	25 %	0 %	25 %	50 %	94152399
113	NC_007971	TGAC	2	8	61260	61267	25 %	25 %	25 %	25 %	94152399
114	NC_007971	CAGC	2	8	61320	61327	25 %	0 %	25 %	50 %	94152399
115	NC_007971	CTGC	2	8	61553	61560	0 %	25 %	25 %	50 %	94152399
116	NC_007971	GCGG	2	8	62120	62127	0 %	0 %	75 %	25 %	94152398
117	NC_007971	AGCT	2	8	62365	62372	25 %	25 %	25 %	25 %	94152398
118	NC_007971	GCCT	2	8	62394	62401	0 %	25 %	25 %	50 %	94152398
119	NC_007971	GCTG	2	8	62957	62964	0 %	25 %	50 %	25 %	94152397
120	NC_007971	GCCG	2	8	63921	63928	0 %	0 %	50 %	50 %	94152396
121	NC_007971	CAGT	2	8	65958	65965	25 %	25 %	25 %	25 %	94152393
122	NC_007971	CAAA	2	8	66329	66336	75 %	0 %	0 %	25 %	94152392
123	NC_007971	TGCC	2	8	67888	67895	0 %	25 %	25 %	50 %	94152391
124	NC_007971	GGCT	2	8	68035	68042	0 %	25 %	50 %	25 %	94152391
125	NC_007971	AGGT	2	8	68130	68137	25 %	25 %	50 %	0 %	94152391
126	NC_007971	GGCA	2	8	68389	68396	25 %	0 %	50 %	25 %	94152391
127	NC_007971	TTGA	2	8	69144	69151	25 %	50 %	25 %	0 %	94152391
128	NC_007971	GGTC	2	8	69752	69759	0 %	25 %	50 %	25 %	94152390
129	NC_007971	CGGC	2	8	69812	69819	0 %	0 %	50 %	50 %	94152390
130	NC_007971	CGCA	2	8	69885	69892	25 %	0 %	25 %	50 %	94152390
131	NC_007971	CACG	2	8	70083	70090	25 %	0 %	25 %	50 %	94152390
132	NC_007971	CGGC	2	8	70738	70745	0 %	0 %	50 %	50 %	94152390
133	NC_007971	GCCA	2	8	70783	70790	25 %	0 %	25 %	50 %	94152390
134	NC_007971	GTCG	2	8	71172	71179	0 %	25 %	50 %	25 %	94152390
135	NC_007971	GCCG	2	8	71204	71211	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
136	NC_007971	CGCA	2	8	71270	71277	25 %	0 %	25 %	50 %	94152389
137	NC_007971	TGGC	2	8	71301	71308	0 %	25 %	50 %	25 %	94152389
138	NC_007971	CGTC	2	8	71566	71573	0 %	25 %	25 %	50 %	94152389
139	NC_007971	GCGG	2	8	71765	71772	0 %	0 %	75 %	25 %	94152389
140	NC_007971	CGCC	2	8	73744	73751	0 %	0 %	25 %	75 %	94152387
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142	NC_007971	GCCC	2	8	75001	75008	0 %	0 %	25 %	75 %	291464759
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