MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 77778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007963	GC	3	6	140128	140133	0 %	0 %	50 %	50 %	92112251
3002	NC_007963	CGC	2	6	140217	140222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112251
3003	NC_007963	TGC	2	6	140277	140282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112252
3004	NC_007963	TGC	2	6	140331	140336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112252
3005	NC_007963	CG	3	6	140341	140346	0 %	0 %	50 %	50 %	92112252
3006	NC_007963	ACG	2	6	140373	140378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112252
3007	NC_007963	CTGG	2	8	140437	140444	0 %	25 %	50 %	25 %	92112252
3008	NC_007963	GCG	2	6	140474	140479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112252
3009	NC_007963	CGG	2	6	140585	140590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112252
3010	NC_007963	CGAC	2	8	140607	140614	25 %	0 %	25 %	50 %	92112252
3011	NC_007963	CG	3	6	140619	140624	0 %	0 %	50 %	50 %	92112252
3012	NC_007963	GC	3	6	140645	140650	0 %	0 %	50 %	50 %	92112252
3013	NC_007963	GCGA	2	8	140696	140703	25 %	0 %	50 %	25 %	92112252
3014	NC_007963	TCA	3	9	140723	140731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112252
3015	NC_007963	CGT	2	6	140791	140796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112253
3016	NC_007963	GCC	2	6	140801	140806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112253
3017	NC_007963	GGC	2	6	140899	140904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112253
3018	NC_007963	GCT	2	6	140905	140910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112253
3019	NC_007963	GC	3	6	140926	140931	0 %	0 %	50 %	50 %	92112253
3020	NC_007963	TCG	2	6	140970	140975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112253
3021	NC_007963	GC	3	6	141045	141050	0 %	0 %	50 %	50 %	92112253
3022	NC_007963	CGC	2	6	141052	141057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112253
3023	NC_007963	GCTG	2	8	141072	141079	0 %	25 %	50 %	25 %	92112253
3024	NC_007963	TTG	2	6	141096	141101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112253
3025	NC_007963	CG	3	6	141392	141397	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3026	NC_007963	GAT	2	6	141417	141422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112254
3027	NC_007963	GTG	2	6	141463	141468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112254
3028	NC_007963	ATC	2	6	141469	141474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112254
3029	NC_007963	GGC	3	9	141475	141483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112254
3030	NC_007963	ATCGAT	2	12	141541	141552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	92112254
3031	NC_007963	GAA	2	6	141553	141558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112254
3032	NC_007963	CG	3	6	141563	141568	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3033	NC_007963	ACG	2	6	141605	141610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112254
3034	NC_007963	CG	3	6	141614	141619	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3035	NC_007963	GC	3	6	141659	141664	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3036	NC_007963	ATC	2	6	141688	141693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112254
3037	NC_007963	CGG	2	6	141716	141721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112254
3038	NC_007963	GCT	2	6	141762	141767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112254
3039	NC_007963	CGG	2	6	141774	141779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112254
3040	NC_007963	GCA	2	6	141789	141794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112254
3041	NC_007963	CGC	2	6	141803	141808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112254
3042	NC_007963	GC	3	6	141840	141845	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3043	NC_007963	CG	3	6	141856	141861	0 %	0 %	50 %	50 %	92112254
3044	NC_007963	TGG	2	6	141916	141921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112254
3045	NC_007963	GTGAC	2	10	141947	141956	20 %	20 %	40 %	20 %	92112254
3046	NC_007963	GCC	2	6	141976	141981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112254
3047	NC_007963	TAC	2	6	142003	142008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112254
3048	NC_007963	GTG	2	6	142025	142030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112254
3049	NC_007963	GCC	2	6	142041	142046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112254
3050	NC_007963	CGT	2	6	142054	142059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112254
3051	NC_007963	TTG	2	6	142222	142227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112255
3052	NC_007963	GGC	2	6	142274	142279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112255
3053	NC_007963	CGA	2	6	142286	142291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3054	NC_007963	CGT	2	6	142436	142441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3055	NC_007963	CT	3	6	142541	142546	0 %	50 %	0 %	50 %	92112255
3056	NC_007963	ACC	2	6	142566	142571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112255
3057	NC_007963	ACG	2	6	142576	142581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3058	NC_007963	CAC	2	6	142664	142669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112255
3059	NC_007963	TCCC	2	8	142697	142704	0 %	25 %	0 %	75 %	92112255
3060	NC_007963	GGT	2	6	142889	142894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112255
3061	NC_007963	GAC	2	6	142905	142910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3062	NC_007963	CGA	2	6	142988	142993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3063	NC_007963	CTG	2	6	143031	143036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112255
3064	NC_007963	ACA	2	6	143089	143094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112255
3065	NC_007963	TCA	2	6	143095	143100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112255
3066	NC_007963	ACC	2	6	143133	143138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112255
3067	NC_007963	CGC	2	6	143152	143157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112255
3068	NC_007963	CCG	2	6	143214	143219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112255
3069	NC_007963	TGC	2	6	143445	143450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3070	NC_007963	GGC	2	6	143464	143469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112256
3071	NC_007963	TCG	2	6	143493	143498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3072	NC_007963	CAC	2	6	143533	143538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112256
3073	NC_007963	GTAC	2	8	143610	143617	25 %	25 %	25 %	25 %	92112256
3074	NC_007963	TGG	2	6	143631	143636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112256
3075	NC_007963	GCT	2	6	143638	143643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3076	NC_007963	GCT	2	6	143650	143655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3077	NC_007963	GGC	2	6	143677	143682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112256
3078	NC_007963	ATC	2	6	143687	143692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3079	NC_007963	CGGT	2	8	143700	143707	0 %	25 %	50 %	25 %	92112256
3080	NC_007963	GCT	2	6	143782	143787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3081	NC_007963	TGC	2	6	143817	143822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3082	NC_007963	AGCCTG	2	12	143846	143857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3083	NC_007963	TCA	2	6	143871	143876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3084	NC_007963	TGG	2	6	143946	143951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112256
3085	NC_007963	TCG	2	6	143955	143960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3086	NC_007963	CGC	2	6	143990	143995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3087	NC_007963	CTGG	2	8	144028	144035	0 %	25 %	50 %	25 %	92112256
3088	NC_007963	ATC	2	6	144047	144052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3089	NC_007963	CGC	2	6	144057	144062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3090	NC_007963	CTG	2	6	144074	144079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3091	NC_007963	GCG	3	9	144132	144140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112256
3092	NC_007963	CGC	2	6	144160	144165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3093	NC_007963	CG	3	6	144261	144266	0 %	0 %	50 %	50 %	92112256
3094	NC_007963	ACCTGA	2	12	144354	144365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	92112256
3095	NC_007963	CTC	2	6	144373	144378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112256
3096	NC_007963	TGG	2	6	144408	144413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112256
3097	NC_007963	GAC	2	6	144427	144432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3098	NC_007963	GGCCA	2	10	144446	144455	20 %	0 %	40 %	40 %	92112256
3099	NC_007963	TGA	2	6	144516	144521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112256
3100	NC_007963	CG	3	6	144532	144537	0 %	0 %	50 %	50 %	92112256
3101	NC_007963	TGA	2	6	144581	144586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112257
3102	NC_007963	GAT	2	6	144587	144592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112257
3103	NC_007963	CCG	2	6	144606	144611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112257
3104	NC_007963	GC	3	6	144615	144620	0 %	0 %	50 %	50 %	92112257
3105	NC_007963	GGT	2	6	144634	144639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3106	NC_007963	GTG	2	6	144675	144680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3107	NC_007963	GGT	2	6	144683	144688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3108	NC_007963	GCT	2	6	144698	144703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3109	NC_007963	TCA	2	6	144805	144810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3110	NC_007963	GC	3	6	144811	144816	0 %	0 %	50 %	50 %	92112257
3111	NC_007963	ATC	2	6	144828	144833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3112	NC_007963	GCC	2	6	144852	144857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112257
3113	NC_007963	CTG	2	6	144897	144902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3114	NC_007963	CTGG	2	8	144905	144912	0 %	25 %	50 %	25 %	92112257
3115	NC_007963	TGC	3	9	144985	144993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3116	NC_007963	CGG	2	6	144995	145000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112257
3117	NC_007963	CTGACC	2	12	145050	145061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	92112257
3118	NC_007963	CCA	2	6	145066	145071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112257
3119	NC_007963	TCG	2	6	145078	145083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3120	NC_007963	CGTG	2	8	145139	145146	0 %	25 %	50 %	25 %	92112257
3121	NC_007963	GTG	2	6	145155	145160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3122	NC_007963	TCA	2	6	145189	145194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3123	NC_007963	TGC	2	6	145219	145224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3124	NC_007963	GTT	2	6	145226	145231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112257
3125	NC_007963	GCT	2	6	145259	145264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3126	NC_007963	TGG	2	6	145273	145278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3127	NC_007963	CAT	2	6	145280	145285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3128	NC_007963	GTC	2	6	145314	145319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
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3130	NC_007963	TGC	2	6	145408	145413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3131	NC_007963	ATC	2	6	145491	145496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3132	NC_007963	CTG	2	6	145509	145514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
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3141	NC_007963	CCG	2	6	145981	145986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112258
3142	NC_007963	CTG	2	6	146047	146052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112258
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3145	NC_007963	CAG	3	9	146177	146185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112258
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3154	NC_007963	GCTG	2	8	146540	146547	0 %	25 %	50 %	25 %	92112259
3155	NC_007963	GC	3	6	146554	146559	0 %	0 %	50 %	50 %	92112259
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3231	NC_007963	CGG	2	6	149768	149773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112262
3232	NC_007963	TCG	2	6	149785	149790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112262
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3237	NC_007963	GTG	2	6	150270	150275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112262
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3242	NC_007963	CGC	2	6	150455	150460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112262
3243	NC_007963	TGG	2	6	150584	150589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112262
3244	NC_007963	CGC	2	6	150615	150620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112262
3245	NC_007963	GA	4	8	150621	150628	50 %	0 %	50 %	0 %	92112262
3246	NC_007963	TGC	2	6	150637	150642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112262
3247	NC_007963	ATG	2	6	150685	150690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112262
3248	NC_007963	GAA	2	6	150847	150852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112263
3249	NC_007963	TCA	2	6	150864	150869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112263
3250	NC_007963	CAC	2	6	150897	150902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112263
3251	NC_007963	ACA	2	6	150962	150967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112263
3252	NC_007963	GCT	2	6	150972	150977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3253	NC_007963	ATC	2	6	151013	151018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112263
3254	NC_007963	TTC	2	6	151024	151029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112263
3255	NC_007963	GCA	2	6	151068	151073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112263
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3257	NC_007963	CGA	2	6	151131	151136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3258	NC_007963	CTG	2	6	151138	151143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3259	NC_007963	CTG	2	6	151162	151167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3260	NC_007963	ACCGGT	2	12	151171	151182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3261	NC_007963	TCA	2	6	151292	151297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112263
3262	NC_007963	TAC	2	6	151354	151359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112263
3263	NC_007963	CG	3	6	151370	151375	0 %	0 %	50 %	50 %	92112263
3264	NC_007963	GACC	2	8	151401	151408	25 %	0 %	25 %	50 %	92112263
3265	NC_007963	CGA	2	6	151524	151529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112263
3266	NC_007963	TCG	2	6	151592	151597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112263
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3268	NC_007963	CCGA	2	8	151905	151912	25 %	0 %	25 %	50 %	92112264
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3273	NC_007963	GGCG	2	8	152261	152268	0 %	0 %	75 %	25 %	92112264
3274	NC_007963	CTG	2	6	152319	152324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112264
3275	NC_007963	CGG	2	6	152353	152358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112264
3276	NC_007963	GCA	2	6	152462	152467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112264
3277	NC_007963	GAC	2	6	152809	152814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112265
3278	NC_007963	CGA	2	6	152866	152871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112265
3279	NC_007963	CTG	2	6	152891	152896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112265
3280	NC_007963	GCAT	2	8	152932	152939	25 %	25 %	25 %	25 %	92112265
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3282	NC_007963	TCG	2	6	153075	153080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112265
3283	NC_007963	GAAC	2	8	153103	153110	50 %	0 %	25 %	25 %	92112265
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3322	NC_007963	AGC	3	9	155175	155183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112268
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3325	NC_007963	GA	5	10	155302	155311	50 %	0 %	50 %	0 %	92112269
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3334	NC_007963	CAG	2	6	156376	156381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112270
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3342	NC_007963	CGG	2	6	156870	156875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112270
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3345	NC_007963	TGGCC	2	10	156972	156981	0 %	20 %	40 %	40 %	92112270
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3350	NC_007963	TATCGA	2	12	157179	157190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	92112270
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3353	NC_007963	CGG	3	9	157262	157270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112271
3354	NC_007963	GCC	2	6	157275	157280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112271
3355	NC_007963	GTG	2	6	157332	157337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112271
3356	NC_007963	CCG	2	6	157368	157373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112271
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3358	NC_007963	TCGA	2	8	157446	157453	25 %	25 %	25 %	25 %	92112271
3359	NC_007963	CGA	2	6	157511	157516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112271
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3365	NC_007963	GGC	2	6	157709	157714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112271
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3367	NC_007963	TCGAGG	2	12	157735	157746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	92112271
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3491	NC_007963	GCG	2	6	163491	163496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112277
3492	NC_007963	G	6	6	163509	163514	0 %	0 %	100 %	0 %	92112277
3493	NC_007963	CGC	2	6	163545	163550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112277
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3498	NC_007963	TCA	2	6	163805	163810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112277
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