MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56 plasmid pCfe1

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007900	GGT	2	6	56	61	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898814
2	NC_007900	GGT	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898814
3	NC_007900	GCT	2	6	204	209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898814
4	NC_007900	TAA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898814
5	NC_007900	TAT	2	6	467	472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898814
6	NC_007900	TGT	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898814
7	NC_007900	TAA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898814
8	NC_007900	AGG	2	6	739	744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89898814
9	NC_007900	ACA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898814
10	NC_007900	TTA	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898814
11	NC_007900	AAT	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898814
12	NC_007900	GAA	3	9	1227	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898815
13	NC_007900	AAC	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898815
14	NC_007900	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898815
15	NC_007900	TTG	2	6	1463	1468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898815
16	NC_007900	GTA	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898815
17	NC_007900	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898815
18	NC_007900	TCT	2	6	1851	1856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898815
19	NC_007900	TGT	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898815
20	NC_007900	ATG	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898816
21	NC_007900	GAA	3	9	2283	2291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898816
22	NC_007900	TGT	2	6	2360	2365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898816
23	NC_007900	CAT	2	6	2382	2387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898816
24	NC_007900	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898816
25	NC_007900	AGA	2	6	2487	2492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898816
26	NC_007900	ACC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898816
27	NC_007900	TAA	2	6	2600	2605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898816
28	NC_007900	TCT	2	6	2606	2611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898816
29	NC_007900	AAG	2	6	2735	2740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898816
30	NC_007900	GAC	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898816
31	NC_007900	GTT	3	9	2928	2936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898816
32	NC_007900	TAT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898816
33	NC_007900	ATA	2	6	3187	3192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898816
34	NC_007900	CAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898816
35	NC_007900	TGT	2	6	3377	3382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898816
36	NC_007900	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898816
37	NC_007900	ATT	3	9	3508	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898816
38	NC_007900	TTC	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898816
39	NC_007900	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898817
40	NC_007900	AGA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898817
41	NC_007900	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898817
42	NC_007900	TGC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898817
43	NC_007900	GAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898817
44	NC_007900	GGA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89898817
45	NC_007900	AAG	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898817
46	NC_007900	AGT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898817
47	NC_007900	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898817
48	NC_007900	TCA	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898817
49	NC_007900	TAG	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898817
50	NC_007900	CAA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898817
51	NC_007900	CAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898817
52	NC_007900	ACA	2	6	4664	4669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898817
53	NC_007900	AAC	2	6	4670	4675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898817
54	NC_007900	ATA	2	6	4788	4793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898818
55	NC_007900	AAG	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898818
56	NC_007900	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898818
57	NC_007900	TAG	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898818
58	NC_007900	CAG	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898818
59	NC_007900	GTC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898818
60	NC_007900	TGG	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898818
61	NC_007900	GTG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898818
62	NC_007900	AAC	3	9	5473	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898818
63	NC_007900	ACA	2	6	5512	5517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898818
64	NC_007900	ATA	2	6	5527	5532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898818
65	NC_007900	TTA	2	6	5657	5662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898819
66	NC_007900	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898819
67	NC_007900	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898819
68	NC_007900	AAC	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898820
69	NC_007900	GTA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898820
70	NC_007900	GAA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898820
71	NC_007900	ATC	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898820
72	NC_007900	TCT	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898820
73	NC_007900	TGG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898820
74	NC_007900	CCA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898820
75	NC_007900	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898820
76	NC_007900	TAG	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898820
77	NC_007900	TAA	2	6	6635	6640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898820
78	NC_007900	AAG	2	6	6757	6762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898821
79	NC_007900	TAG	2	6	6890	6895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898821
80	NC_007900	TAC	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898821
81	NC_007900	ATT	2	6	7124	7129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89898821
82	NC_007900	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898821
83	NC_007900	GAA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898821
84	NC_007900	ATA	2	6	7420	7425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89898821
85	NC_007900	CAG	2	6	7437	7442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.