MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 5560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007514	AAAC	2	8	592	599	75 %	0 %	0 %	25 %	78187985
2	NC_007514	AGCA	2	8	719	726	50 %	0 %	25 %	25 %	78187985
3	NC_007514	TAGA	2	8	737	744	50 %	25 %	25 %	0 %	78187985
4	NC_007514	TAAG	2	8	1331	1338	50 %	25 %	25 %	0 %	78187985
5	NC_007514	CAAC	2	8	1388	1395	50 %	0 %	0 %	50 %	78187985
6	NC_007514	TTCT	2	8	2120	2127	0 %	75 %	0 %	25 %	78187986
7	NC_007514	TTGC	2	8	2552	2559	0 %	50 %	25 %	25 %	78187986
8	NC_007514	CATT	2	8	3376	3383	25 %	50 %	0 %	25 %	78187987
9	NC_007514	TTTA	2	8	4207	4214	25 %	75 %	0 %	0 %	78187987
10	NC_007514	ACAA	2	8	4270	4277	75 %	0 %	0 %	25 %	78187987
11	NC_007514	GGAA	2	8	4306	4313	50 %	0 %	50 %	0 %	78187987
12	NC_007514	TTAA	2	8	4367	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	78187988
13	NC_007514	TTGC	2	8	4550	4557	0 %	50 %	25 %	25 %	78187988
14	NC_007514	CAAT	2	8	4829	4836	50 %	25 %	0 %	25 %	78187988
15	NC_007514	ACCA	2	8	7555	7562	50 %	0 %	0 %	50 %	78187990
16	NC_007514	TTGC	2	8	7890	7897	0 %	50 %	25 %	25 %	78187990
17	NC_007514	CTTG	2	8	8982	8989	0 %	50 %	25 %	25 %	78187991
18	NC_007514	TGTT	2	8	9056	9063	0 %	75 %	25 %	0 %	78187991
19	NC_007514	AAGC	2	8	9097	9104	50 %	0 %	25 %	25 %	78187991
20	NC_007514	ATGG	2	8	9232	9239	25 %	25 %	50 %	0 %	78187991
21	NC_007514	TGCG	2	8	11651	11658	0 %	25 %	50 %	25 %	78187992
22	NC_007514	AGCA	2	8	12330	12337	50 %	0 %	25 %	25 %	78187993
23	NC_007514	GGTG	2	8	13256	13263	0 %	25 %	75 %	0 %	78187993
24	NC_007514	AGGG	2	8	14254	14261	25 %	0 %	75 %	0 %	78187994
25	NC_007514	AGCG	2	8	14362	14369	25 %	0 %	50 %	25 %	78187994
26	NC_007514	AATT	2	8	14817	14824	50 %	50 %	0 %	0 %	78187995
27	NC_007514	AATT	2	8	15006	15013	50 %	50 %	0 %	0 %	78187995
28	NC_007514	GAGC	2	8	15451	15458	25 %	0 %	50 %	25 %	78187996
29	NC_007514	TGGT	2	8	15924	15931	0 %	50 %	50 %	0 %	78187997
30	NC_007514	TGGT	2	8	15965	15972	0 %	50 %	50 %	0 %	78187997
31	NC_007514	AAAT	2	8	16626	16633	75 %	25 %	0 %	0 %	78187998
32	NC_007514	AATG	2	8	16937	16944	50 %	25 %	25 %	0 %	78187999
33	NC_007514	TATG	2	8	16980	16987	25 %	50 %	25 %	0 %	78187999
34	NC_007514	GATT	2	8	17019	17026	25 %	50 %	25 %	0 %	78188000
35	NC_007514	TTGT	2	8	17185	17192	0 %	75 %	25 %	0 %	78188000
36	NC_007514	TGGT	2	8	17652	17659	0 %	50 %	50 %	0 %	78188001
37	NC_007514	CAAG	2	8	18432	18439	50 %	0 %	25 %	25 %	78188002
38	NC_007514	AGCA	2	8	18523	18530	50 %	0 %	25 %	25 %	78188002
39	NC_007514	ATGG	2	8	19265	19272	25 %	25 %	50 %	0 %	78188003
40	NC_007514	GCAA	2	8	21303	21310	50 %	0 %	25 %	25 %	78188005
41	NC_007514	TGCC	2	8	21405	21412	0 %	25 %	25 %	50 %	78188005
42	NC_007514	AACG	2	8	22666	22673	50 %	0 %	25 %	25 %	78188006
43	NC_007514	AATT	2	8	22805	22812	50 %	50 %	0 %	0 %	78188006
44	NC_007514	GGTG	2	8	22970	22977	0 %	25 %	75 %	0 %	78188006
45	NC_007514	GATA	2	8	23238	23245	50 %	25 %	25 %	0 %	78188006
46	NC_007514	GCAA	2	8	23313	23320	50 %	0 %	25 %	25 %	78188006
47	NC_007514	TGCT	2	8	24982	24989	0 %	50 %	25 %	25 %	78188008
48	NC_007514	CAAT	2	8	25512	25519	50 %	25 %	0 %	25 %	78188008
49	NC_007514	GCAA	2	8	26634	26641	50 %	0 %	25 %	25 %	78188010
50	NC_007514	TTTG	2	8	26906	26913	0 %	75 %	25 %	0 %	78188010
51	NC_007514	CTGC	2	8	27981	27988	0 %	25 %	25 %	50 %	78188010
52	NC_007514	GGCT	2	8	28379	28386	0 %	25 %	50 %	25 %	78188010
53	NC_007514	TTCG	2	8	28819	28826	0 %	50 %	25 %	25 %	78188011
54	NC_007514	TCCT	2	8	28881	28888	0 %	50 %	0 %	50 %	78188011
55	NC_007514	ATTG	2	8	29384	29391	25 %	50 %	25 %	0 %	78188011
56	NC_007514	CAAG	2	8	30017	30024	50 %	0 %	25 %	25 %	78188012
57	NC_007514	AGTT	2	8	30688	30695	25 %	50 %	25 %	0 %	78188012
58	NC_007514	TGGA	2	8	30945	30952	25 %	25 %	50 %	0 %	78188012
59	NC_007514	GAAA	2	8	31732	31739	75 %	0 %	25 %	0 %	78188013
60	NC_007514	CTTG	2	8	31975	31982	0 %	50 %	25 %	25 %	78188013
61	NC_007514	CGTG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	50 %	25 %	78188013
62	NC_007514	TAAC	2	8	32989	32996	50 %	25 %	0 %	25 %	78188013
63	NC_007514	TTTG	2	8	33891	33898	0 %	75 %	25 %	0 %	78188014
64	NC_007514	TCAT	2	8	34336	34343	25 %	50 %	0 %	25 %	78188015
65	NC_007514	CTTT	2	8	34939	34946	0 %	75 %	0 %	25 %	78188017
66	NC_007514	GAAT	2	8	35062	35069	50 %	25 %	25 %	0 %	78188017
67	NC_007514	TCTG	2	8	35517	35524	0 %	50 %	25 %	25 %	78188017
68	NC_007514	GTTT	2	8	35669	35676	0 %	75 %	25 %	0 %	78188017
69	NC_007514	CAAT	2	8	35761	35768	50 %	25 %	0 %	25 %	78188017
70	NC_007514	CAAC	2	8	36451	36458	50 %	0 %	0 %	50 %	78188018
71	NC_007514	AAAT	2	8	36628	36635	75 %	25 %	0 %	0 %	78188018
72	NC_007514	GATA	2	8	36694	36701	50 %	25 %	25 %	0 %	78188018
73	NC_007514	ATTA	2	8	36926	36933	50 %	50 %	0 %	0 %	78188018
74	NC_007514	CTTG	2	8	37404	37411	0 %	50 %	25 %	25 %	78188019
75	NC_007514	ATCC	2	8	37694	37701	25 %	25 %	0 %	50 %	78188019
76	NC_007514	AGCA	2	8	38227	38234	50 %	0 %	25 %	25 %	78188019
77	NC_007514	GCAA	2	8	38657	38664	50 %	0 %	25 %	25 %	78188020
78	NC_007514	TAAA	2	8	39172	39179	75 %	25 %	0 %	0 %	78188020
79	NC_007514	GCAG	2	8	39631	39638	25 %	0 %	50 %	25 %	78188020
80	NC_007514	ATCC	2	8	40337	40344	25 %	25 %	0 %	50 %	78188021
81	NC_007514	TGCC	2	8	40545	40552	0 %	25 %	25 %	50 %	78188021
82	NC_007514	ATTG	2	8	41305	41312	25 %	50 %	25 %	0 %	78188022
83	NC_007514	TTTA	2	8	41491	41498	25 %	75 %	0 %	0 %	78188022
84	NC_007514	TTGC	2	8	41671	41678	0 %	50 %	25 %	25 %	78188022
85	NC_007514	AGCA	2	8	41804	41811	50 %	0 %	25 %	25 %	78188022
86	NC_007514	ATTG	2	8	41836	41843	25 %	50 %	25 %	0 %	78188022
87	NC_007514	CAAT	2	8	42578	42585	50 %	25 %	0 %	25 %	78188023
88	NC_007514	CAAT	2	8	43542	43549	50 %	25 %	0 %	25 %	78188023
89	NC_007514	TGGT	2	8	43693	43700	0 %	50 %	50 %	0 %	78188023
90	NC_007514	CATT	2	8	45977	45984	25 %	50 %	0 %	25 %	78188025
91	NC_007514	GCAA	2	8	46657	46664	50 %	0 %	25 %	25 %	78188025
92	NC_007514	GATC	2	8	47265	47272	25 %	25 %	25 %	25 %	78188026
93	NC_007514	AGGG	2	8	48481	48488	25 %	0 %	75 %	0 %	78188026
94	NC_007514	AGAT	2	8	48652	48659	50 %	25 %	25 %	0 %	78188026
95	NC_007514	GTTT	2	8	49139	49146	0 %	75 %	25 %	0 %	78188027
96	NC_007514	TAAA	2	8	49267	49274	75 %	25 %	0 %	0 %	78188027
97	NC_007514	CAAG	2	8	49361	49368	50 %	0 %	25 %	25 %	78188027
98	NC_007514	ACCG	2	8	50923	50930	25 %	0 %	25 %	50 %	78188028
99	NC_007514	GTAA	2	8	51563	51570	50 %	25 %	25 %	0 %	78188029
100	NC_007514	TGGC	2	8	51793	51800	0 %	25 %	50 %	25 %	78188029
101	NC_007514	GTGC	2	8	51948	51955	0 %	25 %	50 %	25 %	78188029
102	NC_007514	CTTG	2	8	52084	52091	0 %	50 %	25 %	25 %	78188029
103	NC_007514	ATCA	2	8	53382	53389	50 %	25 %	0 %	25 %	78188031
104	NC_007514	AAAG	2	8	54445	54452	75 %	0 %	25 %	0 %	78188033
105	NC_007514	GGCT	2	8	55900	55907	0 %	25 %	50 %	25 %	78188033
106	NC_007514	TTCG	2	8	56100	56107	0 %	50 %	25 %	25 %	78188033
107	NC_007514	GGTT	2	8	57291	57298	0 %	50 %	50 %	0 %	78188034
108	NC_007514	TGAT	2	8	58182	58189	25 %	50 %	25 %	0 %	78188035
109	NC_007514	GCTG	2	8	58636	58643	0 %	25 %	50 %	25 %	78188035
110	NC_007514	GCGT	2	8	60410	60417	0 %	25 %	50 %	25 %	78188036
111	NC_007514	TGGG	2	8	60800	60807	0 %	25 %	75 %	0 %	78188037
112	NC_007514	TGGT	2	8	61088	61095	0 %	50 %	50 %	0 %	78188037
113	NC_007514	TTTA	2	8	61420	61427	25 %	75 %	0 %	0 %	78188037
114	NC_007514	CAAC	2	8	61808	61815	50 %	0 %	0 %	50 %	78188037
115	NC_007514	AGCA	2	8	62045	62052	50 %	0 %	25 %	25 %	78188037
116	NC_007514	ACTC	2	8	62182	62189	25 %	25 %	0 %	50 %	78188038
117	NC_007514	TTGT	2	8	62284	62291	0 %	75 %	25 %	0 %	78188038
118	NC_007514	TGGG	2	8	62324	62331	0 %	25 %	75 %	0 %	78188038
119	NC_007514	CTTT	2	8	62360	62367	0 %	75 %	0 %	25 %	78188038
120	NC_007514	GCTT	2	8	62479	62486	0 %	50 %	25 %	25 %	78188038
121	NC_007514	GTTT	2	8	62944	62951	0 %	75 %	25 %	0 %	78188038
122	NC_007514	TACC	2	8	62988	62995	25 %	25 %	0 %	50 %	78188038
123	NC_007514	TTAT	2	8	63072	63079	25 %	75 %	0 %	0 %	78188038
124	NC_007514	GCCA	2	8	63303	63310	25 %	0 %	25 %	50 %	78188038
125	NC_007514	GCGG	2	8	63386	63393	0 %	0 %	75 %	25 %	78188039
126	NC_007514	TTTG	2	8	63601	63608	0 %	75 %	25 %	0 %	78188039
127	NC_007514	GGTA	2	8	63670	63677	25 %	25 %	50 %	0 %	78188039
128	NC_007514	ACCG	2	8	64809	64816	25 %	0 %	25 %	50 %	78188040
129	NC_007514	AAGC	2	8	65271	65278	50 %	0 %	25 %	25 %	78188040
130	NC_007514	GAAG	2	8	65439	65446	50 %	0 %	50 %	0 %	78188040
131	NC_007514	GGAG	2	8	66442	66449	25 %	0 %	75 %	0 %	78188041
132	NC_007514	CGAG	2	8	66790	66797	25 %	0 %	50 %	25 %	78188041
133	NC_007514	TGGC	2	8	67586	67593	0 %	25 %	50 %	25 %	78188042
134	NC_007514	ACCA	2	8	70548	70555	50 %	0 %	0 %	50 %	78188044
135	NC_007514	CCAG	2	8	71613	71620	25 %	0 %	25 %	50 %	78188045
136	NC_007514	TGGT	2	8	72382	72389	0 %	50 %	50 %	0 %	78188046
137	NC_007514	TTTG	2	8	72493	72500	0 %	75 %	25 %	0 %	78188047
138	NC_007514	CTTG	2	8	73429	73436	0 %	50 %	25 %	25 %	78188048
139	NC_007514	GTTT	2	8	73656	73663	0 %	75 %	25 %	0 %	78188048
140	NC_007514	CTTG	2	8	73777	73784	0 %	50 %	25 %	25 %	78188048
141	NC_007514	TGCT	2	8	74229	74236	0 %	50 %	25 %	25 %	78188049
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