MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 46687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_007514	AAT	2	6	196398	196403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188159
3503	NC_007514	AGCC	2	8	196546	196553	25 %	0 %	25 %	50 %	78188159
3504	NC_007514	CAT	2	6	196609	196614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188159
3505	NC_007514	A	6	6	196640	196645	100 %	0 %	0 %	0 %	78188159
3506	NC_007514	ATCC	2	8	196779	196786	25 %	25 %	0 %	50 %	78188159
3507	NC_007514	CGC	2	6	196818	196823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188159
3508	NC_007514	CCAT	2	8	196858	196865	25 %	25 %	0 %	50 %	78188159
3509	NC_007514	TGG	2	6	196897	196902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3510	NC_007514	CGC	2	6	196924	196929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188159
3511	NC_007514	CAA	2	6	197023	197028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188159
3512	NC_007514	TCC	2	6	197049	197054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188159
3513	NC_007514	TTCGC	2	10	197096	197105	0 %	40 %	20 %	40 %	78188159
3514	NC_007514	GT	3	6	197150	197155	0 %	50 %	50 %	0 %	78188159
3515	NC_007514	GGC	2	6	197186	197191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188159
3516	NC_007514	TGG	2	6	197197	197202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3517	NC_007514	TGG	2	6	197218	197223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3518	NC_007514	A	6	6	197288	197293	100 %	0 %	0 %	0 %	78188159
3519	NC_007514	GTT	2	6	197377	197382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188159
3520	NC_007514	TGG	2	6	197383	197388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3521	NC_007514	AGT	2	6	197410	197415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188159
3522	NC_007514	CAT	2	6	197485	197490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188159
3523	NC_007514	ACT	2	6	197519	197524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188159
3524	NC_007514	T	7	7	197524	197530	0 %	100 %	0 %	0 %	78188159
3525	NC_007514	CCA	2	6	197613	197618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188159
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3527	NC_007514	GCT	2	6	197679	197684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188159
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3529	NC_007514	CGA	2	6	197744	197749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188159
3530	NC_007514	TGG	2	6	197758	197763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3531	NC_007514	CTTTG	2	10	197791	197800	0 %	60 %	20 %	20 %	78188159
3532	NC_007514	CCG	2	6	197830	197835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188159
3533	NC_007514	TAA	2	6	197839	197844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188159
3534	NC_007514	T	7	7	197919	197925	0 %	100 %	0 %	0 %	78188159
3535	NC_007514	GCG	2	6	197930	197935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188159
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3537	NC_007514	A	7	7	198080	198086	100 %	0 %	0 %	0 %	78188159
3538	NC_007514	TGAG	2	8	198088	198095	25 %	25 %	50 %	0 %	78188159
3539	NC_007514	AATT	2	8	198110	198117	50 %	50 %	0 %	0 %	78188159
3540	NC_007514	A	6	6	198127	198132	100 %	0 %	0 %	0 %	78188159
3541	NC_007514	T	7	7	198168	198174	0 %	100 %	0 %	0 %	78188159
3542	NC_007514	CGGG	2	8	198225	198232	0 %	0 %	75 %	25 %	78188159
3543	NC_007514	TGG	2	6	198292	198297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
3544	NC_007514	T	6	6	198338	198343	0 %	100 %	0 %	0 %	78188159
3545	NC_007514	T	6	6	198386	198391	0 %	100 %	0 %	0 %	78188159
3546	NC_007514	A	6	6	198416	198421	100 %	0 %	0 %	0 %	78188159
3547	NC_007514	TAA	2	6	198442	198447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188159
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3549	NC_007514	GTTGC	2	10	198517	198526	0 %	40 %	40 %	20 %	78188159
3550	NC_007514	TGG	2	6	198539	198544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188159
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3552	NC_007514	CTT	2	6	198724	198729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188160
3553	NC_007514	TCA	2	6	198792	198797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188160
3554	NC_007514	CTG	2	6	198851	198856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188160
3555	NC_007514	TAA	2	6	198883	198888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188160
3556	NC_007514	TTGA	2	8	199010	199017	25 %	50 %	25 %	0 %	78188161
3557	NC_007514	GTTG	2	8	199076	199083	0 %	50 %	50 %	0 %	78188161
3558	NC_007514	CGC	2	6	199159	199164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188161
3559	NC_007514	TTG	2	6	199176	199181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188161
3560	NC_007514	T	6	6	199244	199249	0 %	100 %	0 %	0 %	78188161
3561	NC_007514	GCA	2	6	199324	199329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188161
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3563	NC_007514	GCATTC	2	12	199373	199384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78188161
3564	NC_007514	GCT	2	6	199392	199397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188161
3565	NC_007514	GAG	2	6	199444	199449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188161
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3567	NC_007514	GAG	2	6	199647	199652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188161
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3571	NC_007514	ACC	2	6	199733	199738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188161
3572	NC_007514	GAG	2	6	199782	199787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188161
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3579	NC_007514	CGT	2	6	200354	200359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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3583	NC_007514	AAT	2	6	200458	200463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188162
3584	NC_007514	GCG	2	6	200557	200562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
3585	NC_007514	CTA	2	6	200570	200575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188162
3586	NC_007514	TCC	2	6	200579	200584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188162
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3589	NC_007514	GCG	2	6	200746	200751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
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3593	NC_007514	TGG	2	6	201009	201014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188162
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3597	NC_007514	TTG	2	6	201198	201203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188162
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3601	NC_007514	GCA	2	6	201279	201284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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3603	NC_007514	TCA	2	6	201392	201397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188162
3604	NC_007514	TGG	3	9	201402	201410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188162
3605	NC_007514	GTC	2	6	201436	201441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188162
3606	NC_007514	TC	3	6	201619	201624	0 %	50 %	0 %	50 %	78188162
3607	NC_007514	A	6	6	201649	201654	100 %	0 %	0 %	0 %	78188162
3608	NC_007514	CAGCT	2	10	201691	201700	20 %	20 %	20 %	40 %	78188162
3609	NC_007514	CTC	2	6	201760	201765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188162
3610	NC_007514	CT	3	6	201784	201789	0 %	50 %	0 %	50 %	78188162
3611	NC_007514	ATG	2	6	201828	201833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188162
3612	NC_007514	TGG	2	6	201913	201918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188162
3613	NC_007514	C	7	7	201927	201933	0 %	0 %	0 %	100 %	78188162
3614	NC_007514	AGC	2	6	201979	201984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
3615	NC_007514	GCA	2	6	202017	202022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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3617	NC_007514	GCG	2	6	202074	202079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
3618	NC_007514	GCA	2	6	202084	202089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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3620	NC_007514	CAAG	2	8	202209	202216	50 %	0 %	25 %	25 %	78188162
3621	NC_007514	GCG	2	6	202220	202225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
3622	NC_007514	GGTTAA	2	12	202276	202287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188162
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3624	NC_007514	GGA	2	6	202307	202312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188162
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