MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 46687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007514	CTC	2	6	29477	29482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188011
502	NC_007514	TTG	2	6	29488	29493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188011
503	NC_007514	A	8	8	29682	29689	100 %	0 %	0 %	0 %	78188012
504	NC_007514	CCGCA	2	10	29734	29743	20 %	0 %	20 %	60 %	78188012
505	NC_007514	TGC	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188012
506	NC_007514	GTT	2	6	29781	29786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188012
507	NC_007514	GCA	2	6	29826	29831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188012
508	NC_007514	TGG	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188012
509	NC_007514	TTG	2	6	29998	30003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188012
510	NC_007514	CAAG	2	8	30017	30024	50 %	0 %	25 %	25 %	78188012
511	NC_007514	A	7	7	30120	30126	100 %	0 %	0 %	0 %	78188012
512	NC_007514	CTG	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188012
513	NC_007514	ATT	2	6	30225	30230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188012
514	NC_007514	TGC	2	6	30236	30241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188012
515	NC_007514	GCA	2	6	30267	30272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188012
516	NC_007514	TTG	2	6	30403	30408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188012
517	NC_007514	GAC	2	6	30507	30512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188012
518	NC_007514	GAT	2	6	30561	30566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188012
519	NC_007514	AGG	2	6	30571	30576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188012
520	NC_007514	GAT	3	9	30657	30665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188012
521	NC_007514	GCA	2	6	30672	30677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188012
522	NC_007514	GAG	2	6	30679	30684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188012
523	NC_007514	AGTT	2	8	30688	30695	25 %	50 %	25 %	0 %	78188012
524	NC_007514	GCG	2	6	30696	30701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188012
525	NC_007514	GTG	2	6	30894	30899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188012
526	NC_007514	A	6	6	30921	30926	100 %	0 %	0 %	0 %	78188012
527	NC_007514	TGGA	2	8	30945	30952	25 %	25 %	50 %	0 %	78188012
528	NC_007514	AGG	2	6	30964	30969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188012
529	NC_007514	GCG	2	6	31370	31375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188013
530	NC_007514	TGG	2	6	31510	31515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188013
531	NC_007514	TTC	2	6	31596	31601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188013
532	NC_007514	TCA	3	9	31626	31634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188013
533	NC_007514	GTG	2	6	31678	31683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188013
534	NC_007514	GAAA	2	8	31732	31739	75 %	0 %	25 %	0 %	78188013
535	NC_007514	CAA	2	6	31748	31753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188013
536	NC_007514	ATA	3	9	31791	31799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188013
537	NC_007514	CTTG	2	8	31975	31982	0 %	50 %	25 %	25 %	78188013
538	NC_007514	ACC	2	6	31988	31993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188013
539	NC_007514	GCG	2	6	32096	32101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188013
540	NC_007514	CTTTG	2	10	32111	32120	0 %	60 %	20 %	20 %	78188013
541	NC_007514	CG	3	6	32131	32136	0 %	0 %	50 %	50 %	78188013
542	NC_007514	GCA	2	6	32142	32147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188013
543	NC_007514	AAT	2	6	32162	32167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188013
544	NC_007514	AAC	2	6	32219	32224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188013
545	NC_007514	TTGGTT	2	12	32262	32273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188013
546	NC_007514	CCT	2	6	32326	32331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188013
547	NC_007514	T	7	7	32379	32385	0 %	100 %	0 %	0 %	78188013
548	NC_007514	CGTG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	50 %	25 %	78188013
549	NC_007514	TGT	2	6	32461	32466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188013
550	NC_007514	AAT	2	6	32663	32668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188013
551	NC_007514	AAT	3	9	32711	32719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188013
552	NC_007514	GGT	2	6	32735	32740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188013
553	NC_007514	GGT	2	6	32768	32773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188013
554	NC_007514	GTA	2	6	32846	32851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188013
555	NC_007514	TAC	2	6	32903	32908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188013
556	NC_007514	ACC	2	6	32966	32971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188013
557	NC_007514	TAAC	2	8	32989	32996	50 %	25 %	0 %	25 %	78188013
558	NC_007514	CCA	2	6	33111	33116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188013
559	NC_007514	CAA	2	6	33139	33144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188013
560	NC_007514	TGG	2	6	33263	33268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188013
561	NC_007514	TTTG	2	8	33891	33898	0 %	75 %	25 %	0 %	78188014
562	NC_007514	AAT	2	6	33903	33908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188014
563	NC_007514	GTG	2	6	33910	33915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188014
564	NC_007514	TTG	2	6	33976	33981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188014
565	NC_007514	GGAAAG	2	12	33994	34005	50 %	0 %	50 %	0 %	78188014
566	NC_007514	GAT	2	6	34101	34106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188014
567	NC_007514	TTG	2	6	34117	34122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188014
568	NC_007514	T	6	6	34232	34237	0 %	100 %	0 %	0 %	78188015
569	NC_007514	AAT	2	6	34272	34277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188015
570	NC_007514	TGA	3	9	34321	34329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188015
571	NC_007514	TCAT	2	8	34336	34343	25 %	50 %	0 %	25 %	78188015
572	NC_007514	TCC	2	6	34400	34405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188016
573	NC_007514	TAT	2	6	34456	34461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188016
574	NC_007514	T	6	6	34464	34469	0 %	100 %	0 %	0 %	78188016
575	NC_007514	CAA	2	6	34527	34532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188016
576	NC_007514	CTG	3	9	34569	34577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188016
577	NC_007514	GCA	2	6	34635	34640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188016
578	NC_007514	ATA	2	6	34933	34938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188017
579	NC_007514	CTTT	2	8	34939	34946	0 %	75 %	0 %	25 %	78188017
580	NC_007514	TCA	2	6	35008	35013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188017
581	NC_007514	ATG	2	6	35015	35020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188017
582	NC_007514	T	8	8	35054	35061	0 %	100 %	0 %	0 %	78188017
583	NC_007514	GAAT	2	8	35062	35069	50 %	25 %	25 %	0 %	78188017
584	NC_007514	CAC	2	6	35153	35158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188017
585	NC_007514	T	6	6	35217	35222	0 %	100 %	0 %	0 %	78188017
586	NC_007514	ATTCA	2	10	35223	35232	40 %	40 %	0 %	20 %	78188017
587	NC_007514	AAT	2	6	35245	35250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188017
588	NC_007514	ATT	2	6	35263	35268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188017
589	NC_007514	GAT	2	6	35300	35305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188017
590	NC_007514	CTT	2	6	35312	35317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188017
591	NC_007514	A	7	7	35319	35325	100 %	0 %	0 %	0 %	78188017
592	NC_007514	TAG	2	6	35341	35346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188017
593	NC_007514	TC	3	6	35374	35379	0 %	50 %	0 %	50 %	78188017
594	NC_007514	TAA	2	6	35400	35405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188017
595	NC_007514	TTA	2	6	35432	35437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188017
596	NC_007514	CTT	2	6	35438	35443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188017
597	NC_007514	TCTG	2	8	35517	35524	0 %	50 %	25 %	25 %	78188017
598	NC_007514	ACC	2	6	35530	35535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188017
599	NC_007514	CTT	2	6	35660	35665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188017
600	NC_007514	GTTT	2	8	35669	35676	0 %	75 %	25 %	0 %	78188017
601	NC_007514	TA	3	6	35711	35716	50 %	50 %	0 %	0 %	78188017
602	NC_007514	CAAT	2	8	35761	35768	50 %	25 %	0 %	25 %	78188017
603	NC_007514	TCT	2	6	35848	35853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188017
604	NC_007514	T	7	7	35888	35894	0 %	100 %	0 %	0 %	78188017
605	NC_007514	AAT	2	6	35934	35939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188017
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607	NC_007514	CAAC	2	8	36451	36458	50 %	0 %	0 %	50 %	78188018
608	NC_007514	GTC	2	6	36560	36565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188018
609	NC_007514	AAAT	2	8	36628	36635	75 %	25 %	0 %	0 %	78188018
610	NC_007514	A	6	6	36673	36678	100 %	0 %	0 %	0 %	78188018
611	NC_007514	GATA	2	8	36694	36701	50 %	25 %	25 %	0 %	78188018
612	NC_007514	AGG	2	6	36711	36716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188018
613	NC_007514	AGC	2	6	36903	36908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188018
614	NC_007514	ATTA	2	8	36926	36933	50 %	50 %	0 %	0 %	78188018
615	NC_007514	CA	3	6	36989	36994	50 %	0 %	0 %	50 %	78188018
616	NC_007514	CGC	2	6	37047	37052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188018
617	NC_007514	ATG	2	6	37105	37110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188018
618	NC_007514	AAT	2	6	37121	37126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188018
619	NC_007514	AGC	2	6	37143	37148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188018
620	NC_007514	TAA	2	6	37161	37166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188019
621	NC_007514	GGT	2	6	37167	37172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188019
622	NC_007514	ATC	2	6	37220	37225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188019
623	NC_007514	GTA	2	6	37315	37320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188019
624	NC_007514	A	6	6	37345	37350	100 %	0 %	0 %	0 %	78188019
625	NC_007514	CTTG	2	8	37404	37411	0 %	50 %	25 %	25 %	78188019
626	NC_007514	A	6	6	37459	37464	100 %	0 %	0 %	0 %	78188019
627	NC_007514	CTA	2	6	37509	37514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188019
628	NC_007514	GCG	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188019
629	NC_007514	CAA	2	6	37608	37613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188019
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631	NC_007514	ATCC	2	8	37694	37701	25 %	25 %	0 %	50 %	78188019
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