MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 1484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	GCTTT	2	10	638	647	0 %	60 %	20 %	20 %	78045102
2	NC_007503	ATTAA	2	10	741	750	60 %	40 %	0 %	0 %	78045102
3	NC_007503	TATTT	2	10	1415	1424	20 %	80 %	0 %	0 %	78043134
4	NC_007503	TTATG	2	10	1510	1519	20 %	60 %	20 %	0 %	78043134
5	NC_007503	CAAAG	2	10	2476	2485	60 %	0 %	20 %	20 %	78044593
6	NC_007503	GGTAA	2	10	3385	3394	40 %	20 %	40 %	0 %	78044593
7	NC_007503	GAAGC	2	10	5636	5645	40 %	0 %	40 %	20 %	78043339
8	NC_007503	GTTTA	2	10	7096	7105	20 %	60 %	20 %	0 %	78043660
9	NC_007503	CGGTA	2	10	7106	7115	20 %	20 %	40 %	20 %	78043660
10	NC_007503	CCCGG	2	10	9127	9136	0 %	0 %	40 %	60 %	78044965
11	NC_007503	AGGAA	2	10	10109	10118	60 %	0 %	40 %	0 %	78043356
12	NC_007503	GAAAA	2	10	10576	10585	80 %	0 %	20 %	0 %	78044734
13	NC_007503	AGGGA	2	10	12392	12401	40 %	0 %	60 %	0 %	78042797
14	NC_007503	CGGTA	2	10	13425	13434	20 %	20 %	40 %	20 %	78043673
15	NC_007503	AGGCA	2	10	13668	13677	40 %	0 %	40 %	20 %	78043673
16	NC_007503	TCAGG	2	10	16364	16373	20 %	20 %	40 %	20 %	78044479
17	NC_007503	TATAT	2	10	16707	16716	40 %	60 %	0 %	0 %	78044479
18	NC_007503	TCTTT	2	10	18072	18081	0 %	80 %	0 %	20 %	78043016
19	NC_007503	AAAAT	2	10	18479	18488	80 %	20 %	0 %	0 %	78043016
20	NC_007503	TTTCT	2	10	20428	20437	0 %	80 %	0 %	20 %	78045025
21	NC_007503	TTTTC	2	10	21610	21619	0 %	80 %	0 %	20 %	78043847
22	NC_007503	GAAAA	2	10	22353	22362	80 %	0 %	20 %	0 %	78044067
23	NC_007503	AGCCG	2	10	23483	23492	20 %	0 %	40 %	40 %	78044623
24	NC_007503	TAAAA	2	10	25771	25780	80 %	20 %	0 %	0 %	78045203
25	NC_007503	AAATA	2	10	27485	27494	80 %	20 %	0 %	0 %	78043206
26	NC_007503	TGCCA	2	10	27953	27962	20 %	20 %	20 %	40 %	78043206
27	NC_007503	GAAAA	2	10	34001	34010	80 %	0 %	20 %	0 %	78043236
28	NC_007503	TCTAC	2	10	35409	35418	20 %	40 %	0 %	40 %	78044081
29	NC_007503	GAAAA	2	10	37628	37637	80 %	0 %	20 %	0 %	78044911
30	NC_007503	GGGTT	2	10	37793	37802	0 %	40 %	60 %	0 %	78042679
31	NC_007503	GCCCA	2	10	38733	38742	20 %	0 %	20 %	60 %	78042679
32	NC_007503	CTTTT	2	10	39197	39206	0 %	80 %	0 %	20 %	78042679
33	NC_007503	AAGGT	2	10	43039	43048	40 %	20 %	40 %	0 %	78042958
34	NC_007503	AAATC	2	10	43238	43247	60 %	20 %	0 %	20 %	78042983
35	NC_007503	ATAAA	2	10	46657	46666	80 %	20 %	0 %	0 %	78044578
36	NC_007503	ATTTA	2	10	48179	48188	40 %	60 %	0 %	0 %	78042746
37	NC_007503	CAAGT	2	10	48666	48675	40 %	20 %	20 %	20 %	78042746
38	NC_007503	TGGCA	2	10	51183	51192	20 %	20 %	40 %	20 %	78044230
39	NC_007503	GAACC	2	10	53004	53013	40 %	0 %	20 %	40 %	78044723
40	NC_007503	AAAAG	2	10	62829	62838	80 %	0 %	20 %	0 %	78044978
41	NC_007503	GGGGC	2	10	62889	62898	0 %	0 %	80 %	20 %	78044978
42	NC_007503	GGCTG	2	10	63077	63086	0 %	20 %	60 %	20 %	78044978
43	NC_007503	TACCT	2	10	66240	66249	20 %	40 %	0 %	40 %	78043036
44	NC_007503	CCAGA	2	10	66317	66326	40 %	0 %	20 %	40 %	78043036
45	NC_007503	TTAAA	2	10	67387	67396	60 %	40 %	0 %	0 %	78045094
46	NC_007503	GATAT	2	10	67675	67684	40 %	40 %	20 %	0 %	78045094
47	NC_007503	TTTAC	2	10	69084	69093	20 %	60 %	0 %	20 %	78043315
48	NC_007503	TTTTA	2	10	70774	70783	20 %	80 %	0 %	0 %	78044342
49	NC_007503	ATTTA	2	10	74684	74693	40 %	60 %	0 %	0 %	78044551
50	NC_007503	ATAAA	2	10	75240	75249	80 %	20 %	0 %	0 %	78044152
51	NC_007503	AAAGC	2	10	75872	75881	60 %	0 %	20 %	20 %	78044152
52	NC_007503	TTTAA	2	10	76312	76321	40 %	60 %	0 %	0 %	78043038
53	NC_007503	ATTTA	2	10	78263	78272	40 %	60 %	0 %	0 %	78043258
54	NC_007503	CGGTT	2	10	81796	81805	0 %	40 %	40 %	20 %	78042752
55	NC_007503	TTTAA	2	10	82820	82829	40 %	60 %	0 %	0 %	78042650
56	NC_007503	TGGGG	2	10	84338	84347	0 %	20 %	80 %	0 %	78042642
57	NC_007503	TTTTC	2	10	84651	84660	0 %	80 %	0 %	20 %	78042642
58	NC_007503	AATTA	2	10	86566	86575	60 %	40 %	0 %	0 %	78044501
59	NC_007503	AAATT	2	10	86859	86868	60 %	40 %	0 %	0 %	78044501
60	NC_007503	TAAAA	2	10	90005	90014	80 %	20 %	0 %	0 %	78042964
61	NC_007503	GTAAG	2	10	91001	91010	40 %	20 %	40 %	0 %	78042874
62	NC_007503	AAAAC	2	10	93251	93260	80 %	0 %	0 %	20 %	78043138
63	NC_007503	CGCAT	2	10	94131	94140	20 %	20 %	20 %	40 %	78042762
64	NC_007503	TACTT	2	10	95823	95832	20 %	60 %	0 %	20 %	78043216
65	NC_007503	GTTTT	2	10	96163	96172	0 %	80 %	20 %	0 %	78043216
66	NC_007503	TTCCT	2	10	96742	96751	0 %	60 %	0 %	40 %	78044882
67	NC_007503	ATACC	2	10	97404	97413	40 %	20 %	0 %	40 %	78042949
68	NC_007503	CGGGG	2	10	99580	99589	0 %	0 %	80 %	20 %	78044335
69	NC_007503	CGATC	2	10	99676	99685	20 %	20 %	20 %	40 %	78044335
70	NC_007503	ACCAA	2	10	108915	108924	60 %	0 %	0 %	40 %	78044367
71	NC_007503	ACGCC	2	10	109289	109298	20 %	0 %	20 %	60 %	78044367
72	NC_007503	TAAAA	2	10	114454	114463	80 %	20 %	0 %	0 %	78044660
73	NC_007503	GGAAG	2	10	114728	114737	40 %	0 %	60 %	0 %	78044660
74	NC_007503	TCCCG	2	10	115262	115271	0 %	20 %	20 %	60 %	78044660
75	NC_007503	TATTT	2	10	116847	116856	20 %	80 %	0 %	0 %	78042880
76	NC_007503	TTTTA	2	10	121772	121781	20 %	80 %	0 %	0 %	78042726
77	NC_007503	TAAAT	2	10	122822	122831	60 %	40 %	0 %	0 %	78042726
78	NC_007503	AAAGA	2	10	125722	125731	80 %	0 %	20 %	0 %	78042713
79	NC_007503	AGCGG	2	10	127970	127979	20 %	0 %	60 %	20 %	78042687
80	NC_007503	TTTAA	2	10	128135	128144	40 %	60 %	0 %	0 %	78042687
81	NC_007503	CCGGT	2	10	129318	129327	0 %	20 %	40 %	40 %	78044328
82	NC_007503	AAAGG	2	10	129637	129646	60 %	0 %	40 %	0 %	78044328
83	NC_007503	ATTAT	3	15	132427	132441	40 %	60 %	0 %	0 %	78043869
84	NC_007503	ATTTA	2	10	132490	132499	40 %	60 %	0 %	0 %	78043869
85	NC_007503	TTTAT	2	10	132530	132539	20 %	80 %	0 %	0 %	78043869
86	NC_007503	ATTTT	2	10	132707	132716	20 %	80 %	0 %	0 %	78043869
87	NC_007503	GTCTT	2	10	134120	134129	0 %	60 %	20 %	20 %	78042770
88	NC_007503	AAAGA	2	10	134294	134303	80 %	0 %	20 %	0 %	78042770
89	NC_007503	CGGGC	2	10	136086	136095	0 %	0 %	60 %	40 %	78044472
90	NC_007503	TTTCG	2	10	138635	138644	0 %	60 %	20 %	20 %	78042996
91	NC_007503	GCCCG	2	10	139422	139431	0 %	0 %	40 %	60 %	78044530
92	NC_007503	TAAAT	2	10	139507	139516	60 %	40 %	0 %	0 %	78044530
93	NC_007503	CGGGG	2	10	140375	140384	0 %	0 %	80 %	20 %	78045200
94	NC_007503	TTTTA	2	10	141684	141693	20 %	80 %	0 %	0 %	78043403
95	NC_007503	TAAAA	2	10	145318	145327	80 %	20 %	0 %	0 %	78044822
96	NC_007503	ACCAA	2	10	147407	147416	60 %	0 %	0 %	40 %	78043747
97	NC_007503	CTTTG	2	10	150963	150972	0 %	60 %	20 %	20 %	78044945
98	NC_007503	CGTTA	2	10	151913	151922	20 %	40 %	20 %	20 %	78044385
99	NC_007503	AAGAA	2	10	151950	151959	80 %	0 %	20 %	0 %	78044385
100	NC_007503	CCGGG	2	10	152171	152180	0 %	0 %	60 %	40 %	78044385
101	NC_007503	AAAAG	2	10	152843	152852	80 %	0 %	20 %	0 %	78044385
102	NC_007503	CAAAA	2	10	154815	154824	80 %	0 %	0 %	20 %	78045204
103	NC_007503	GAGCA	2	10	158088	158097	40 %	0 %	40 %	20 %	78045171
104	NC_007503	TCCGG	2	10	162336	162345	0 %	20 %	40 %	40 %	78044887
105	NC_007503	CAATA	2	10	162392	162401	60 %	20 %	0 %	20 %	78044887
106	NC_007503	TGACC	2	10	165207	165216	20 %	20 %	20 %	40 %	78043233
107	NC_007503	AGGAA	2	10	166110	166119	60 %	0 %	40 %	0 %	78043233
108	NC_007503	TAAAA	2	10	168177	168186	80 %	20 %	0 %	0 %	78043233
109	NC_007503	CTAAA	2	10	168197	168206	60 %	20 %	0 %	20 %	78043233
110	NC_007503	GGAAA	2	10	168743	168752	60 %	0 %	40 %	0 %	78045210
111	NC_007503	TAAAG	2	10	170834	170843	60 %	20 %	20 %	0 %	78043488
112	NC_007503	ATGAT	2	10	170952	170961	40 %	40 %	20 %	0 %	78043488
113	NC_007503	GAACC	2	10	173144	173153	40 %	0 %	20 %	40 %	78042798
114	NC_007503	TTTTA	2	10	173941	173950	20 %	80 %	0 %	0 %	78042798
115	NC_007503	GTGCG	2	10	175514	175523	0 %	20 %	60 %	20 %	78043933
116	NC_007503	ATAAA	2	10	175553	175562	80 %	20 %	0 %	0 %	78043933
117	NC_007503	GGGAA	2	10	178807	178816	40 %	0 %	60 %	0 %	78043578
118	NC_007503	CGGAC	2	10	180195	180204	20 %	0 %	40 %	40 %	78043977
119	NC_007503	GAAAA	2	10	181235	181244	80 %	0 %	20 %	0 %	78043977
120	NC_007503	GCCAT	2	10	181296	181305	20 %	20 %	20 %	40 %	78043977
121	NC_007503	ATTTT	2	10	182625	182634	20 %	80 %	0 %	0 %	78042845
122	NC_007503	AGGAA	2	10	183933	183942	60 %	0 %	40 %	0 %	78043239
123	NC_007503	GTTTT	2	10	189069	189078	0 %	80 %	20 %	0 %	78043165
124	NC_007503	AAAGC	2	10	189871	189880	60 %	0 %	20 %	20 %	78043165
125	NC_007503	GAAAA	2	10	191365	191374	80 %	0 %	20 %	0 %	78045052
126	NC_007503	TTTTG	2	10	191476	191485	0 %	80 %	20 %	0 %	78045052
127	NC_007503	TGGGG	2	10	191967	191976	0 %	20 %	80 %	0 %	78044885
128	NC_007503	TTGGT	2	10	193940	193949	0 %	60 %	40 %	0 %	78042993
129	NC_007503	AGCCA	2	10	196114	196123	40 %	0 %	20 %	40 %	78044939
130	NC_007503	AAAAG	2	10	198896	198905	80 %	0 %	20 %	0 %	78044035
131	NC_007503	GTGAT	2	10	199647	199656	20 %	40 %	40 %	0 %	78043469
132	NC_007503	AATTA	2	10	200490	200499	60 %	40 %	0 %	0 %	78043469
133	NC_007503	TGAAG	2	10	201079	201088	40 %	20 %	40 %	0 %	78043469
134	NC_007503	CATGC	2	10	202684	202693	20 %	20 %	20 %	40 %	78042881
135	NC_007503	GATTG	2	10	204246	204255	20 %	40 %	40 %	0 %	78042817
136	NC_007503	TAAGA	2	10	204824	204833	60 %	20 %	20 %	0 %	78043502
137	NC_007503	AAAGG	2	10	206168	206177	60 %	0 %	40 %	0 %	78043246
138	NC_007503	CTCTT	2	10	210486	210495	0 %	60 %	0 %	40 %	78043726
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