MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 44459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007503	A	6	6	208766	208771	100 %	0 %	0 %	0 %	78042788
4002	NC_007503	GGA	2	6	208776	208781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042788
4003	NC_007503	TCA	2	6	208797	208802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78042788
4004	NC_007503	ATT	2	6	208919	208924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78042886
4005	NC_007503	TTGC	2	8	208940	208947	0 %	50 %	25 %	25 %	78042886
4006	NC_007503	AAGA	2	8	209015	209022	75 %	0 %	25 %	0 %	78042886
4007	NC_007503	A	6	6	209080	209085	100 %	0 %	0 %	0 %	78042886
4008	NC_007503	TGGCTC	2	12	209094	209105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042886
4009	NC_007503	AGTA	2	8	209108	209115	50 %	25 %	25 %	0 %	78042886
4010	NC_007503	ACC	2	6	209136	209141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78042886
4011	NC_007503	GGGC	2	8	209172	209179	0 %	0 %	75 %	25 %	78042886
4012	NC_007503	A	6	6	209262	209267	100 %	0 %	0 %	0 %	78042886
4013	NC_007503	ATG	2	6	209406	209411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042886
4014	NC_007503	CGGC	2	8	209438	209445	0 %	0 %	50 %	50 %	78042886
4015	NC_007503	TTA	2	6	209539	209544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78042886
4016	NC_007503	CAA	2	6	209556	209561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78042886
4017	NC_007503	A	6	6	209622	209627	100 %	0 %	0 %	0 %	78042886
4018	NC_007503	GGC	2	6	209771	209776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78042886
4019	NC_007503	A	6	6	209777	209782	100 %	0 %	0 %	0 %	78042886
4020	NC_007503	TGG	2	6	209795	209800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78042886
4021	NC_007503	AGG	2	6	209853	209858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042886
4022	NC_007503	AG	3	6	209867	209872	50 %	0 %	50 %	0 %	78042886
4023	NC_007503	TTA	2	6	209906	209911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78042886
4024	NC_007503	CGGG	2	8	209915	209922	0 %	0 %	75 %	25 %	78042886
4025	NC_007503	GAA	2	6	209933	209938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78042886
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4028	NC_007503	TCT	2	6	210358	210363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043726
4029	NC_007503	CTT	2	6	210383	210388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043726
4030	NC_007503	TTC	2	6	210423	210428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043726
4031	NC_007503	CTCTT	2	10	210486	210495	0 %	60 %	0 %	40 %	78043726
4032	NC_007503	CA	3	6	210537	210542	50 %	0 %	0 %	50 %	78043726
4033	NC_007503	ATTT	2	8	210582	210589	25 %	75 %	0 %	0 %	78043726
4034	NC_007503	GAA	2	6	210875	210880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044097
4035	NC_007503	T	6	6	210885	210890	0 %	100 %	0 %	0 %	78044097
4036	NC_007503	GAA	2	6	210905	210910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044097
4037	NC_007503	AGA	2	6	210928	210933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044097
4038	NC_007503	ATTAT	2	10	210942	210951	40 %	60 %	0 %	0 %	78044097
4039	NC_007503	ATG	2	6	211094	211099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044605
4040	NC_007503	T	6	6	211111	211116	0 %	100 %	0 %	0 %	78044605
4041	NC_007503	CTTA	2	8	211138	211145	25 %	50 %	0 %	25 %	78044605
4042	NC_007503	T	6	6	211208	211213	0 %	100 %	0 %	0 %	78044605
4043	NC_007503	T	6	6	211222	211227	0 %	100 %	0 %	0 %	78044605
4044	NC_007503	ACT	2	6	211286	211291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044605
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4046	NC_007503	TTG	2	6	211385	211390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044605
4047	NC_007503	TAT	2	6	211428	211433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044605
4048	NC_007503	TGA	2	6	211444	211449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044605
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4050	NC_007503	GTA	2	6	211496	211501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044605
4051	NC_007503	GAT	2	6	211613	211618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044605
4052	NC_007503	TGG	2	6	211623	211628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044605
4053	NC_007503	TATTT	2	10	211659	211668	20 %	80 %	0 %	0 %	78044605
4054	NC_007503	ACT	2	6	211761	211766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044605
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4056	NC_007503	ATT	2	6	211860	211865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044605
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4059	NC_007503	GGAC	2	8	212042	212049	25 %	0 %	50 %	25 %	78044605
4060	NC_007503	A	6	6	212095	212100	100 %	0 %	0 %	0 %	78044605
4061	NC_007503	CTG	2	6	212103	212108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044605
4062	NC_007503	A	6	6	212142	212147	100 %	0 %	0 %	0 %	78044605
4063	NC_007503	T	6	6	212164	212169	0 %	100 %	0 %	0 %	78044605
4064	NC_007503	CGG	2	6	212184	212189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044605
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4068	NC_007503	A	6	6	212331	212336	100 %	0 %	0 %	0 %	78044605
4069	NC_007503	TAAT	2	8	212364	212371	50 %	50 %	0 %	0 %	78044605
4070	NC_007503	T	6	6	212403	212408	0 %	100 %	0 %	0 %	78044605
4071	NC_007503	CCTA	2	8	212417	212424	25 %	25 %	0 %	50 %	78044605
4072	NC_007503	TGA	2	6	212625	212630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043150
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4089	NC_007503	GAG	2	6	213591	213596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044347
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4092	NC_007503	T	7	7	213739	213745	0 %	100 %	0 %	0 %	78044347
4093	NC_007503	CGGG	2	8	213755	213762	0 %	0 %	75 %	25 %	78044347
4094	NC_007503	AAG	2	6	213763	213768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044347
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4096	NC_007503	A	6	6	213821	213826	100 %	0 %	0 %	0 %	78044347
4097	NC_007503	GGT	2	6	213851	213856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044347
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4099	NC_007503	CT	3	6	214207	214212	0 %	50 %	0 %	50 %	78044347
4100	NC_007503	TA	3	6	214219	214224	50 %	50 %	0 %	0 %	78044347
4101	NC_007503	ACC	2	6	214233	214238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78044347
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4107	NC_007503	TTG	2	6	214663	214668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044347
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4109	NC_007503	CGC	2	6	214711	214716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78044347
4110	NC_007503	GGAA	2	8	214787	214794	50 %	0 %	50 %	0 %	78044347
4111	NC_007503	CGG	2	6	214804	214809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044347
4112	NC_007503	GAT	2	6	214872	214877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044347
4113	NC_007503	GGT	2	6	214912	214917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044347
4114	NC_007503	CGG	2	6	215017	215022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044347
4115	NC_007503	CGG	2	6	215050	215055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044347
4116	NC_007503	AGC	2	6	215063	215068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044347
4117	NC_007503	GCG	2	6	215136	215141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044347
4118	NC_007503	GGA	2	6	215147	215152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044347
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4122	NC_007503	A	6	6	215329	215334	100 %	0 %	0 %	0 %	78044347
4123	NC_007503	GT	3	6	215451	215456	0 %	50 %	50 %	0 %	78043018
4124	NC_007503	TATT	2	8	215457	215464	25 %	75 %	0 %	0 %	78043018
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4374	NC_007503	TGTTT	2	10	229138	229147	0 %	80 %	20 %	0 %	78043060
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