MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 44459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007503	TTG	2	6	54337	54342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044013
1003	NC_007503	CGA	2	6	54483	54488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044013
1004	NC_007503	A	7	7	54532	54538	100 %	0 %	0 %	0 %	78044013
1005	NC_007503	TAA	2	6	54540	54545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044013
1006	NC_007503	TAA	2	6	54588	54593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044013
1007	NC_007503	TCT	2	6	54632	54637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044013
1008	NC_007503	TAA	2	6	54705	54710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044013
1009	NC_007503	ATGC	2	8	54723	54730	25 %	25 %	25 %	25 %	78044013
1010	NC_007503	TGA	2	6	54777	54782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044013
1011	NC_007503	TTTC	2	8	54785	54792	0 %	75 %	0 %	25 %	78044013
1012	NC_007503	AAT	2	6	54826	54831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044013
1013	NC_007503	A	6	6	54872	54877	100 %	0 %	0 %	0 %	78044013
1014	NC_007503	CCGG	2	8	54878	54885	0 %	0 %	50 %	50 %	78044013
1015	NC_007503	TTA	2	6	54905	54910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044013
1016	NC_007503	AAT	2	6	55035	55040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044013
1017	NC_007503	TTA	2	6	55046	55051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044013
1018	NC_007503	A	6	6	55060	55065	100 %	0 %	0 %	0 %	78044013
1019	NC_007503	T	6	6	55206	55211	0 %	100 %	0 %	0 %	78043435
1020	NC_007503	GAA	2	6	55239	55244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043435
1021	NC_007503	TA	3	6	55248	55253	50 %	50 %	0 %	0 %	78043435
1022	NC_007503	TTG	2	6	55313	55318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043435
1023	NC_007503	AGA	2	6	55393	55398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043435
1024	NC_007503	TGTA	2	8	55418	55425	25 %	50 %	25 %	0 %	78043435
1025	NC_007503	GAGG	2	8	55445	55452	25 %	0 %	75 %	0 %	78043435
1026	NC_007503	CAA	2	6	55503	55508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043435
1027	NC_007503	T	6	6	55547	55552	0 %	100 %	0 %	0 %	78043435
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1029	NC_007503	A	6	6	55602	55607	100 %	0 %	0 %	0 %	78043435
1030	NC_007503	TCC	2	6	55658	55663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78043435
1031	NC_007503	AATC	2	8	55823	55830	50 %	25 %	0 %	25 %	78043435
1032	NC_007503	CT	3	6	55876	55881	0 %	50 %	0 %	50 %	78043435
1033	NC_007503	A	6	6	55935	55940	100 %	0 %	0 %	0 %	78043435
1034	NC_007503	TGC	2	6	56045	56050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043435
1035	NC_007503	A	8	8	56204	56211	100 %	0 %	0 %	0 %	78043041
1036	NC_007503	AAC	2	6	56308	56313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043041
1037	NC_007503	A	6	6	56357	56362	100 %	0 %	0 %	0 %	78043041
1038	NC_007503	TAA	2	6	56369	56374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043041
1039	NC_007503	TTG	2	6	56410	56415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043041
1040	NC_007503	GAA	2	6	56533	56538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043041
1041	NC_007503	ATAG	2	8	56560	56567	50 %	25 %	25 %	0 %	78043041
1042	NC_007503	TG	3	6	56581	56586	0 %	50 %	50 %	0 %	78043041
1043	NC_007503	ATT	2	6	56681	56686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043041
1044	NC_007503	GTG	2	6	56699	56704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043041
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1049	NC_007503	TTA	2	6	56894	56899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043041
1050	NC_007503	TA	3	6	56960	56965	50 %	50 %	0 %	0 %	78043041
1051	NC_007503	A	6	6	57079	57084	100 %	0 %	0 %	0 %	78043041
1052	NC_007503	AAT	3	9	57090	57098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043041
1053	NC_007503	AGC	2	6	57105	57110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043041
1054	NC_007503	TTAA	2	8	57178	57185	50 %	50 %	0 %	0 %	78043041
1055	NC_007503	GCT	2	6	57223	57228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043041
1056	NC_007503	A	6	6	57355	57360	100 %	0 %	0 %	0 %	78043041
1057	NC_007503	CAG	2	6	57698	57703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044497
1058	NC_007503	TGA	2	6	57736	57741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044497
1059	NC_007503	TGA	2	6	57769	57774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044497
1060	NC_007503	A	6	6	57820	57825	100 %	0 %	0 %	0 %	78044497
1061	NC_007503	CGG	2	6	57910	57915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044497
1062	NC_007503	ACT	2	6	57951	57956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044497
1063	NC_007503	TTA	2	6	58025	58030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044497
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1065	NC_007503	GAG	2	6	58076	58081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044497
1066	NC_007503	A	6	6	58088	58093	100 %	0 %	0 %	0 %	78044497
1067	NC_007503	GCA	2	6	58160	58165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044497
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1070	NC_007503	A	7	7	58220	58226	100 %	0 %	0 %	0 %	78044497
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1074	NC_007503	GCG	3	9	58304	58312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044497
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1078	NC_007503	CCCA	2	8	58541	58548	25 %	0 %	0 %	75 %	78044497
1079	NC_007503	CGGA	2	8	58635	58642	25 %	0 %	50 %	25 %	78044497
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1086	NC_007503	GGC	3	9	59155	59163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044612
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1100	NC_007503	GAT	2	6	59991	59996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044612
1101	NC_007503	GAA	2	6	60031	60036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044612
1102	NC_007503	GA	3	6	60046	60051	50 %	0 %	50 %	0 %	78044612
1103	NC_007503	AAT	2	6	60078	60083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044612
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1108	NC_007503	TTAT	2	8	60217	60224	25 %	75 %	0 %	0 %	78044612
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1110	NC_007503	A	7	7	60249	60255	100 %	0 %	0 %	0 %	78044612
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1112	NC_007503	TCT	2	6	60317	60322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044612
1113	NC_007503	A	7	7	60733	60739	100 %	0 %	0 %	0 %	78044032
1114	NC_007503	TAAA	2	8	60755	60762	75 %	25 %	0 %	0 %	78044032
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1128	NC_007503	CCG	2	6	61373	61378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78043071
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