MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	76788715
2	NC_007429	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	76788716
3	NC_007429	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	76788716
4	NC_007429	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	76788716
5	NC_007429	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	76788716
6	NC_007429	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	76788717
7	NC_007429	TGGTA	2	10	8286	8295	20 %	40 %	40 %	0 %	76788719
8	NC_007429	CGAAA	2	10	9694	9703	60 %	0 %	20 %	20 %	76788720
9	NC_007429	GGCTG	2	10	10328	10337	0 %	20 %	60 %	20 %	76788721
10	NC_007429	CCTCT	2	10	11120	11129	0 %	40 %	0 %	60 %	76788722
11	NC_007429	AAAGG	2	10	11279	11288	60 %	0 %	40 %	0 %	76788722
12	NC_007429	AAGAA	2	10	12398	12407	80 %	0 %	20 %	0 %	76788723
13	NC_007429	AAAGA	2	10	13797	13806	80 %	0 %	20 %	0 %	76788724
14	NC_007429	GGTGT	2	10	13901	13910	0 %	40 %	60 %	0 %	76788724
15	NC_007429	GATTT	2	10	15644	15653	20 %	60 %	20 %	0 %	76788726
16	NC_007429	CGTTC	2	10	16755	16764	0 %	40 %	20 %	40 %	76788727
17	NC_007429	GCTTC	2	10	17128	17137	0 %	40 %	20 %	40 %	76788727
18	NC_007429	GAAGG	2	10	17499	17508	40 %	0 %	60 %	0 %	76788727
19	NC_007429	GTTGT	2	10	20925	20934	0 %	60 %	40 %	0 %	76788730
20	NC_007429	AAGAT	2	10	22037	22046	60 %	20 %	20 %	0 %	76788731
21	NC_007429	TTTGC	2	10	22648	22657	0 %	60 %	20 %	20 %	76788731
22	NC_007429	GGAAA	2	10	24402	24411	60 %	0 %	40 %	0 %	76788731
23	NC_007429	AGAGG	2	10	26129	26138	40 %	0 %	60 %	0 %	76788732
24	NC_007429	GGAGA	2	10	27908	27917	40 %	0 %	60 %	0 %	76788733
25	NC_007429	GGATA	2	10	27934	27943	40 %	20 %	40 %	0 %	76788733
26	NC_007429	ATCCG	2	10	28659	28668	20 %	20 %	20 %	40 %	76788735
27	NC_007429	AGGGT	2	10	29177	29186	20 %	20 %	60 %	0 %	76788735
28	NC_007429	CCTAT	2	10	30217	30226	20 %	40 %	0 %	40 %	76788736
29	NC_007429	GAAGG	2	10	31016	31025	40 %	0 %	60 %	0 %	76788737
30	NC_007429	GAGCT	2	10	32056	32065	20 %	20 %	40 %	20 %	76788738
31	NC_007429	CTATT	2	10	36729	36738	20 %	60 %	0 %	20 %	76788744
32	NC_007429	TCCTA	2	10	36776	36785	20 %	40 %	0 %	40 %	76788744
33	NC_007429	ACGAT	2	10	38692	38701	40 %	20 %	20 %	20 %	76788745
34	NC_007429	TTTGA	2	10	39057	39066	20 %	60 %	20 %	0 %	76788745
35	NC_007429	AGCAA	2	10	42708	42717	60 %	0 %	20 %	20 %	76788748
36	NC_007429	CGATG	2	10	42765	42774	20 %	20 %	40 %	20 %	76788748
37	NC_007429	TGCAA	2	10	42923	42932	40 %	20 %	20 %	20 %	76788749
38	NC_007429	CAAAA	2	10	43242	43251	80 %	0 %	0 %	20 %	76788749
39	NC_007429	TTTAT	2	10	44839	44848	20 %	80 %	0 %	0 %	76788753
40	NC_007429	CTTTC	2	10	46935	46944	0 %	60 %	0 %	40 %	76788755
41	NC_007429	AGTTT	2	10	47474	47483	20 %	60 %	20 %	0 %	76788755
42	NC_007429	CTTTT	2	10	50636	50645	0 %	80 %	0 %	20 %	76788758
43	NC_007429	CCGTA	2	10	54409	54418	20 %	20 %	20 %	40 %	76788761
44	NC_007429	TTATC	2	10	55812	55821	20 %	60 %	0 %	20 %	76788762
45	NC_007429	TGAGT	2	10	55833	55842	20 %	40 %	40 %	0 %	76788762
46	NC_007429	GTTGT	2	10	56868	56877	0 %	60 %	40 %	0 %	76788763
47	NC_007429	GAGCA	2	10	60396	60405	40 %	0 %	40 %	20 %	76788765
48	NC_007429	TGTGA	2	10	62845	62854	20 %	40 %	40 %	0 %	76788767
49	NC_007429	AGTGA	2	10	64366	64375	40 %	20 %	40 %	0 %	76788768
50	NC_007429	CCTTC	2	10	64640	64649	0 %	40 %	0 %	60 %	76788768
51	NC_007429	AGGAG	2	10	66868	66877	40 %	0 %	60 %	0 %	76788770
52	NC_007429	GTTAA	2	10	66998	67007	40 %	40 %	20 %	0 %	76788770
53	NC_007429	CAAGC	2	10	69375	69384	40 %	0 %	20 %	40 %	76788772
54	NC_007429	GGAGC	2	10	70245	70254	20 %	0 %	60 %	20 %	76788773
55	NC_007429	GCGAT	2	10	70435	70444	20 %	20 %	40 %	20 %	76788773
56	NC_007429	CTCTT	2	10	70789	70798	0 %	60 %	0 %	40 %	76788773
57	NC_007429	AGGGG	2	10	71435	71444	20 %	0 %	80 %	0 %	76788773
58	NC_007429	AAGAA	2	10	71477	71486	80 %	0 %	20 %	0 %	76788773
59	NC_007429	ATTGG	2	10	72767	72776	20 %	40 %	40 %	0 %	76788775
60	NC_007429	GAAAA	2	10	73839	73848	80 %	0 %	20 %	0 %	76788775
61	NC_007429	TATTT	2	10	76783	76792	20 %	80 %	0 %	0 %	76788777
62	NC_007429	TGTCT	2	10	80570	80579	0 %	60 %	20 %	20 %	76788780
63	NC_007429	TTACT	2	10	81077	81086	20 %	60 %	0 %	20 %	76788780
64	NC_007429	AGAAA	2	10	82467	82476	80 %	0 %	20 %	0 %	76788782
65	NC_007429	GGAAG	2	10	82980	82989	40 %	0 %	60 %	0 %	76788782
66	NC_007429	GATCC	2	10	86531	86540	20 %	20 %	20 %	40 %	76788785
67	NC_007429	AGAGC	2	10	87866	87875	40 %	0 %	40 %	20 %	76788786
68	NC_007429	TTTTC	2	10	91598	91607	0 %	80 %	0 %	20 %	76788789
69	NC_007429	GGATG	2	10	91858	91867	20 %	20 %	60 %	0 %	76788790
70	NC_007429	CAACA	2	10	93397	93406	60 %	0 %	0 %	40 %	76788791
71	NC_007429	ACAGC	2	10	94442	94451	40 %	0 %	20 %	40 %	76788793
72	NC_007429	CTTTT	2	10	94816	94825	0 %	80 %	0 %	20 %	76788794
73	NC_007429	GGAAC	2	10	95154	95163	40 %	0 %	40 %	20 %	76788795
74	NC_007429	GGATT	2	10	96054	96063	20 %	40 %	40 %	0 %	76788795
75	NC_007429	CAATC	2	10	97156	97165	40 %	20 %	0 %	40 %	76788797
76	NC_007429	TTTGC	2	10	97290	97299	0 %	60 %	20 %	20 %	76788797
77	NC_007429	ATTCA	2	10	97554	97563	40 %	40 %	0 %	20 %	76788797
78	NC_007429	GATCC	2	10	97813	97822	20 %	20 %	20 %	40 %	76788797
79	NC_007429	GTTTT	2	10	98234	98243	0 %	80 %	20 %	0 %	76788797
80	NC_007429	AAGCT	2	10	99437	99446	40 %	20 %	20 %	20 %	76788798
81	NC_007429	AGGGG	2	10	99796	99805	20 %	0 %	80 %	0 %	76788798
82	NC_007429	ATAGC	2	10	100495	100504	40 %	20 %	20 %	20 %	76788799
83	NC_007429	TTCCC	2	10	101099	101108	0 %	40 %	0 %	60 %	76788800
84	NC_007429	AGCGA	2	10	103423	103432	40 %	0 %	40 %	20 %	76788802
85	NC_007429	TTTCT	2	10	103781	103790	0 %	80 %	0 %	20 %	76788802
86	NC_007429	CTTCT	2	10	103835	103844	0 %	60 %	0 %	40 %	76788802
87	NC_007429	ATCAT	2	10	104987	104996	40 %	40 %	0 %	20 %	76788803
88	NC_007429	GGCAT	2	10	105695	105704	20 %	20 %	40 %	20 %	76788803
89	NC_007429	AAAGC	2	10	109421	109430	60 %	0 %	20 %	20 %	76788806
90	NC_007429	GCATT	2	10	110582	110591	20 %	40 %	20 %	20 %	76788809
91	NC_007429	TGTTT	2	10	115259	115268	0 %	80 %	20 %	0 %	76788812
92	NC_007429	CATGT	2	10	115637	115646	20 %	40 %	20 %	20 %	76788812
93	NC_007429	TATCG	2	10	116341	116350	20 %	40 %	20 %	20 %	76788812
94	NC_007429	TTTCT	2	10	116857	116866	0 %	80 %	0 %	20 %	76788813
95	NC_007429	AAAGA	2	10	119103	119112	80 %	0 %	20 %	0 %	76788816
96	NC_007429	GCTTC	2	10	123093	123102	0 %	40 %	20 %	40 %	76788820
97	NC_007429	TACAA	2	10	126882	126891	60 %	20 %	0 %	20 %	76788824
98	NC_007429	ATCCA	2	10	129287	129296	40 %	20 %	0 %	40 %	76788827
99	NC_007429	GAAGA	2	10	130837	130846	60 %	0 %	40 %	0 %	76788827
100	NC_007429	AAAAG	2	10	132750	132759	80 %	0 %	20 %	0 %	76788828
101	NC_007429	GATTC	2	10	133081	133090	20 %	40 %	20 %	20 %	76788828
102	NC_007429	GGATA	2	10	135687	135696	40 %	20 %	40 %	0 %	76788830
103	NC_007429	ATTGG	2	10	136352	136361	20 %	40 %	40 %	0 %	76788831
104	NC_007429	ATTGT	2	10	136385	136394	20 %	60 %	20 %	0 %	76788831
105	NC_007429	TGTTT	2	10	136811	136820	0 %	80 %	20 %	0 %	76788832
106	NC_007429	TCCAG	2	10	140554	140563	20 %	20 %	20 %	40 %	76788838
107	NC_007429	GTACA	2	10	141285	141294	40 %	20 %	20 %	20 %	76788839
108	NC_007429	TAGAT	2	10	141658	141667	40 %	40 %	20 %	0 %	76788839
109	NC_007429	AAAAC	2	10	142550	142559	80 %	0 %	0 %	20 %	76788840
110	NC_007429	TGCTA	2	10	143636	143645	20 %	40 %	20 %	20 %	76788842
111	NC_007429	GGAGC	2	10	143683	143692	20 %	0 %	60 %	20 %	76788842
112	NC_007429	CTGGG	2	10	145097	145106	0 %	20 %	60 %	20 %	76788844
113	NC_007429	GTTTT	2	10	145844	145853	0 %	80 %	20 %	0 %	76788845
114	NC_007429	GAACC	2	10	149578	149587	40 %	0 %	20 %	40 %	76788846
115	NC_007429	ATTCT	2	10	153074	153083	20 %	60 %	0 %	20 %	76788850
116	NC_007429	CTGTG	2	10	153278	153287	0 %	40 %	40 %	20 %	76788850
117	NC_007429	TTCTT	2	10	155751	155760	0 %	80 %	0 %	20 %	76788853
118	NC_007429	AGGAA	2	10	160310	160319	60 %	0 %	40 %	0 %	76788857
119	NC_007429	AGAGA	2	10	163541	163550	60 %	0 %	40 %	0 %	76788860
120	NC_007429	AGCAA	2	10	163976	163985	60 %	0 %	20 %	20 %	76788860
121	NC_007429	CAAAA	2	10	167479	167488	80 %	0 %	0 %	20 %	76788862
122	NC_007429	AAGAG	2	10	168312	168321	60 %	0 %	40 %	0 %	76788862
123	NC_007429	GATTG	2	10	168657	168666	20 %	40 %	40 %	0 %	76788862
124	NC_007429	GTTTT	2	10	175136	175145	0 %	80 %	20 %	0 %	76788866
125	NC_007429	TATTG	2	10	175159	175168	20 %	60 %	20 %	0 %	76788866
126	NC_007429	CAGCA	2	10	175518	175527	40 %	0 %	20 %	40 %	76788866
127	NC_007429	TAGGA	2	10	175823	175832	40 %	20 %	40 %	0 %	76788867
128	NC_007429	TGATT	2	10	177750	177759	20 %	60 %	20 %	0 %	76788868
129	NC_007429	TTTTC	2	10	178430	178439	0 %	80 %	0 %	20 %	76788868
130	NC_007429	GGAAT	2	10	179990	179999	40 %	20 %	40 %	0 %	76788869
131	NC_007429	AGAGT	2	10	181401	181410	40 %	20 %	40 %	0 %	76788870
132	NC_007429	TTGAA	2	10	182091	182100	40 %	40 %	20 %	0 %	76788872
133	NC_007429	TTTGC	2	10	182967	182976	0 %	60 %	20 %	20 %	76788872
134	NC_007429	TTGAG	2	10	183662	183671	20 %	40 %	40 %	0 %	76788873
135	NC_007429	GAATG	2	10	183687	183696	40 %	20 %	40 %	0 %	76788873
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137	NC_007429	GGATC	2	10	190943	190952	20 %	20 %	40 %	20 %	76788882
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