MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 20502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007429	GGGC	2	8	27871	27878	0 %	0 %	75 %	25 %	76788733
502	NC_007429	T	6	6	27887	27892	0 %	100 %	0 %	0 %	76788733
503	NC_007429	TGA	2	6	27900	27905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788733
504	NC_007429	GGAGA	2	10	27908	27917	40 %	0 %	60 %	0 %	76788733
505	NC_007429	GGATA	2	10	27934	27943	40 %	20 %	40 %	0 %	76788733
506	NC_007429	A	7	7	27958	27964	100 %	0 %	0 %	0 %	76788733
507	NC_007429	AAG	2	6	27975	27980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788733
508	NC_007429	T	6	6	27995	28000	0 %	100 %	0 %	0 %	76788733
509	NC_007429	A	8	8	28092	28099	100 %	0 %	0 %	0 %	76788734
510	NC_007429	TTC	2	6	28136	28141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788734
511	NC_007429	CAGA	2	8	28176	28183	50 %	0 %	25 %	25 %	76788734
512	NC_007429	TTC	2	6	28254	28259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788734
513	NC_007429	AAG	2	6	28269	28274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788734
514	NC_007429	TTC	2	6	28369	28374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788734
515	NC_007429	AAG	2	6	28401	28406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788734
516	NC_007429	A	6	6	28407	28412	100 %	0 %	0 %	0 %	76788734
517	NC_007429	GAA	2	6	28639	28644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788735
518	NC_007429	ATCCG	2	10	28659	28668	20 %	20 %	20 %	40 %	76788735
519	NC_007429	TTC	2	6	28772	28777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788735
520	NC_007429	TAG	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788735
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522	NC_007429	GAT	3	9	28915	28923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788735
523	NC_007429	GAG	2	6	28958	28963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788735
524	NC_007429	TG	3	6	28990	28995	0 %	50 %	50 %	0 %	76788735
525	NC_007429	GCA	2	6	29014	29019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788735
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527	NC_007429	AGGGT	2	10	29177	29186	20 %	20 %	60 %	0 %	76788735
528	NC_007429	TTC	2	6	29213	29218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788735
529	NC_007429	CAG	2	6	29225	29230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788735
530	NC_007429	GAA	2	6	29239	29244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788735
531	NC_007429	TGA	2	6	29253	29258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788735
532	NC_007429	TTC	2	6	29286	29291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788735
533	NC_007429	CTG	2	6	29327	29332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788735
534	NC_007429	GC	4	8	29457	29464	0 %	0 %	50 %	50 %	76788735
535	NC_007429	AAG	2	6	29465	29470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788735
536	NC_007429	TA	3	6	29579	29584	50 %	50 %	0 %	0 %	76788735
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539	NC_007429	TCT	2	6	29768	29773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788736
540	NC_007429	ACA	2	6	29996	30001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788736
541	NC_007429	ATG	2	6	30006	30011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788736
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543	NC_007429	TTTG	2	8	30163	30170	0 %	75 %	25 %	0 %	76788736
544	NC_007429	TTGT	2	8	30198	30205	0 %	75 %	25 %	0 %	76788736
545	NC_007429	CCTAT	2	10	30217	30226	20 %	40 %	0 %	40 %	76788736
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549	NC_007429	T	8	8	30467	30474	0 %	100 %	0 %	0 %	76788736
550	NC_007429	ATG	2	6	30492	30497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788736
551	NC_007429	GA	3	6	30530	30535	50 %	0 %	50 %	0 %	76788736
552	NC_007429	AG	3	6	30628	30633	50 %	0 %	50 %	0 %	76788737
553	NC_007429	GTT	2	6	30709	30714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788737
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556	NC_007429	TCT	2	6	30784	30789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788737
557	NC_007429	ACT	2	6	30874	30879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788737
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560	NC_007429	CCT	2	6	30938	30943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788737
561	NC_007429	AAAC	2	8	30991	30998	75 %	0 %	0 %	25 %	76788737
562	NC_007429	T	6	6	31008	31013	0 %	100 %	0 %	0 %	76788737
563	NC_007429	GAAGG	2	10	31016	31025	40 %	0 %	60 %	0 %	76788737
564	NC_007429	GGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76788737
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567	NC_007429	TAG	2	6	31145	31150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788737
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601	NC_007429	GC	3	6	32682	32687	0 %	0 %	50 %	50 %	76788739
602	NC_007429	CT	3	6	32732	32737	0 %	50 %	0 %	50 %	76788739
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618	NC_007429	CTT	2	6	34090	34095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788741
619	NC_007429	T	6	6	34112	34117	0 %	100 %	0 %	0 %	76788741
620	NC_007429	GTT	2	6	34130	34135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788741
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