MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 20502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007429	CAA	2	6	280291	280296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788970
5502	NC_007429	CTTC	2	8	280329	280336	0 %	50 %	0 %	50 %	76788970
5503	NC_007429	ATA	2	6	280341	280346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788970
5504	NC_007429	ATAA	2	8	280421	280428	75 %	25 %	0 %	0 %	76788970
5505	NC_007429	GAA	2	6	280444	280449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788970
5506	NC_007429	AAAT	2	8	280457	280464	75 %	25 %	0 %	0 %	76788970
5507	NC_007429	TC	3	6	280475	280480	0 %	50 %	0 %	50 %	76788970
5508	NC_007429	GAA	2	6	280492	280497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788970
5509	NC_007429	TAA	2	6	280574	280579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788970
5510	NC_007429	CAT	2	6	280583	280588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788970
5511	NC_007429	ACG	2	6	280679	280684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788970
5512	NC_007429	CAT	2	6	280900	280905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788970
5513	NC_007429	GGAACA	2	12	280917	280928	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76788970
5514	NC_007429	ATGCT	2	10	280995	281004	20 %	40 %	20 %	20 %	76788970
5515	NC_007429	TCT	2	6	281116	281121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788970
5516	NC_007429	TCC	2	6	281219	281224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788970
5517	NC_007429	CAT	2	6	281239	281244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788970
5518	NC_007429	CTT	2	6	281293	281298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788970
5519	NC_007429	AGA	2	6	281310	281315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788970
5520	NC_007429	CTC	2	6	281343	281348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788970
5521	NC_007429	GTA	2	6	281372	281377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788970
5522	NC_007429	ATA	2	6	281399	281404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788970
5523	NC_007429	ACC	2	6	281422	281427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76788970
5524	NC_007429	CCAT	2	8	281434	281441	25 %	25 %	0 %	50 %	76788970
5525	NC_007429	GAG	2	6	281494	281499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788970
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5527	NC_007429	GCA	2	6	281811	281816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788971
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5529	NC_007429	TCT	2	6	281839	281844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788971
5530	NC_007429	GCA	2	6	281869	281874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788971
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5533	NC_007429	ACG	2	6	282050	282055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788971
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5535	NC_007429	TCT	2	6	282145	282150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788972
5536	NC_007429	TGA	2	6	282174	282179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788972
5537	NC_007429	CT	3	6	282222	282227	0 %	50 %	0 %	50 %	76788972
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5540	NC_007429	GAA	2	6	282265	282270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788972
5541	NC_007429	GA	3	6	282290	282295	50 %	0 %	50 %	0 %	76788972
5542	NC_007429	AAAG	2	8	282322	282329	75 %	0 %	25 %	0 %	76788972
5543	NC_007429	ATA	2	6	282420	282425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788972
5544	NC_007429	CAT	2	6	282488	282493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788972
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5546	NC_007429	GTT	2	6	282568	282573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788972
5547	NC_007429	GAT	2	6	282601	282606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788972
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5549	NC_007429	A	6	6	282676	282681	100 %	0 %	0 %	0 %	76788972
5550	NC_007429	TTA	2	6	282698	282703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788972
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5552	NC_007429	TTC	2	6	282753	282758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788972
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5555	NC_007429	CTT	2	6	282848	282853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788972
5556	NC_007429	TCC	2	6	283023	283028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788972
5557	NC_007429	CAG	2	6	283031	283036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788972
5558	NC_007429	GAA	2	6	283136	283141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788972
5559	NC_007429	CACGCG	2	12	283290	283301	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	76788972
5560	NC_007429	ATT	3	9	283314	283322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788972
5561	NC_007429	TTTCTT	2	12	283469	283480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	76788972
5562	NC_007429	TCT	2	6	283593	283598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788973
5563	NC_007429	TGC	2	6	283616	283621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788973
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5565	NC_007429	TTG	2	6	283657	283662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788973
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5571	NC_007429	CAG	2	6	283809	283814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788973
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5580	NC_007429	ATA	2	6	284283	284288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788973
5581	NC_007429	TGC	2	6	284290	284295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788973
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5588	NC_007429	AGT	2	6	284821	284826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788973
5589	NC_007429	GCT	2	6	284853	284858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788973
5590	NC_007429	TTC	2	6	284874	284879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788973
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5593	NC_007429	TAT	2	6	284916	284921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788973
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5595	NC_007429	CT	3	6	285009	285014	0 %	50 %	0 %	50 %	76788973
5596	NC_007429	ATA	2	6	285052	285057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788973
5597	NC_007429	CT	3	6	285148	285153	0 %	50 %	0 %	50 %	76788973
5598	NC_007429	TCT	2	6	285188	285193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788973
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5601	NC_007429	TCT	2	6	285365	285370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788973
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5605	NC_007429	CAG	2	6	285703	285708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788973
5606	NC_007429	CTC	2	6	285757	285762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788973
5607	NC_007429	TAC	2	6	285781	285786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788973
5608	NC_007429	GCT	2	6	285831	285836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788973
5609	NC_007429	GAA	2	6	285877	285882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788973
5610	NC_007429	ATA	2	6	285924	285929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788973
5611	NC_007429	CGTT	2	8	285931	285938	0 %	50 %	25 %	25 %	76788973
5612	NC_007429	ATTC	2	8	285940	285947	25 %	50 %	0 %	25 %	76788973
5613	NC_007429	CAT	2	6	286259	286264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788974
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5615	NC_007429	ATC	2	6	286307	286312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788974
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5618	NC_007429	CTG	2	6	286428	286433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788974
5619	NC_007429	CCA	2	6	286553	286558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76788974
5620	NC_007429	CAC	2	6	286744	286749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76788974
5621	NC_007429	CCT	2	6	286778	286783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788974
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5999	NC_007429	A	6	6	305138	305143	100 %	0 %	0 %	0 %	76788992
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