MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 1487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	GTTAT	2	10	1609	1618	20 %	60 %	20 %	0 %	46445637
2	NC_005861	GATTG	2	10	1940	1949	20 %	40 %	40 %	0 %	46445637
3	NC_005861	AATTT	2	10	4756	4765	40 %	60 %	0 %	0 %	46445638
4	NC_005861	GAAGT	2	10	4885	4894	40 %	20 %	40 %	0 %	46445638
5	NC_005861	GAAAA	2	10	7904	7913	80 %	0 %	20 %	0 %	46445639
6	NC_005861	TAAAT	2	10	9456	9465	60 %	40 %	0 %	0 %	46445641
7	NC_005861	TTTTC	2	10	10582	10591	0 %	80 %	0 %	20 %	46445641
8	NC_005861	ATCTT	2	10	10779	10788	20 %	60 %	0 %	20 %	46445641
9	NC_005861	GAATT	2	10	12045	12054	40 %	40 %	20 %	0 %	46445642
10	NC_005861	AAATT	2	10	12236	12245	60 %	40 %	0 %	0 %	46445642
11	NC_005861	TGAAT	2	10	12829	12838	40 %	40 %	20 %	0 %	46445642
12	NC_005861	GAATG	2	10	17467	17476	40 %	20 %	40 %	0 %	46445643
13	NC_005861	ATGAC	2	10	17993	18002	40 %	20 %	20 %	20 %	46445643
14	NC_005861	TTTCG	2	10	18260	18269	0 %	60 %	20 %	20 %	46445643
15	NC_005861	AAATG	2	10	18330	18339	60 %	20 %	20 %	0 %	46445643
16	NC_005861	CTTTT	2	10	18464	18473	0 %	80 %	0 %	20 %	46445643
17	NC_005861	TTGAT	2	10	18539	18548	20 %	60 %	20 %	0 %	46445643
18	NC_005861	ATATT	2	10	18567	18576	40 %	60 %	0 %	0 %	46445643
19	NC_005861	GCAAA	2	10	18879	18888	60 %	0 %	20 %	20 %	46445644
20	NC_005861	AATTA	2	10	20722	20731	60 %	40 %	0 %	0 %	46445644
21	NC_005861	TTATT	2	10	21558	21567	20 %	80 %	0 %	0 %	46445645
22	NC_005861	TTTGA	2	10	22165	22174	20 %	60 %	20 %	0 %	46445646
23	NC_005861	AATTT	2	10	23540	23549	40 %	60 %	0 %	0 %	46445646
24	NC_005861	AATCG	2	10	24324	24333	40 %	20 %	20 %	20 %	46445647
25	NC_005861	ATTAA	2	10	24707	24716	60 %	40 %	0 %	0 %	46445647
26	NC_005861	GATGG	2	10	27029	27038	20 %	20 %	60 %	0 %	46445650
27	NC_005861	ATTTT	2	10	29219	29228	20 %	80 %	0 %	0 %	46445651
28	NC_005861	ATGAA	2	10	30997	31006	60 %	20 %	20 %	0 %	46445652
29	NC_005861	CCAAG	2	10	31500	31509	40 %	0 %	20 %	40 %	46445652
30	NC_005861	AAATA	2	10	33195	33204	80 %	20 %	0 %	0 %	46445655
31	NC_005861	TCGAT	2	10	33526	33535	20 %	40 %	20 %	20 %	46445656
32	NC_005861	CTTTT	2	10	34985	34994	0 %	80 %	0 %	20 %	46445657
33	NC_005861	AGTTT	2	10	35288	35297	20 %	60 %	20 %	0 %	46445657
34	NC_005861	ATTTC	2	10	35388	35397	20 %	60 %	0 %	20 %	46445657
35	NC_005861	ATGAT	2	10	40433	40442	40 %	40 %	20 %	0 %	46445660
36	NC_005861	TTAAA	2	10	43091	43100	60 %	40 %	0 %	0 %	46445661
37	NC_005861	AGATG	2	10	43853	43862	40 %	20 %	40 %	0 %	46445662
38	NC_005861	TGTCT	2	10	46964	46973	0 %	60 %	20 %	20 %	46445666
39	NC_005861	TGATT	2	10	50179	50188	20 %	60 %	20 %	0 %	46445667
40	NC_005861	TAGTT	2	10	51493	51502	20 %	60 %	20 %	0 %	46445667
41	NC_005861	AAGAA	2	10	56438	56447	80 %	0 %	20 %	0 %	46445671
42	NC_005861	GACAC	2	10	56908	56917	40 %	0 %	20 %	40 %	46445671
43	NC_005861	AAGAA	2	10	57986	57995	80 %	0 %	20 %	0 %	46445672
44	NC_005861	TTTGG	2	10	58109	58118	0 %	60 %	40 %	0 %	46445672
45	NC_005861	AGGAG	2	10	62349	62358	40 %	0 %	60 %	0 %	46445674
46	NC_005861	TTTTG	2	10	67932	67941	0 %	80 %	20 %	0 %	46445675
47	NC_005861	GCTTC	2	10	68481	68490	0 %	40 %	20 %	40 %	46445675
48	NC_005861	AACGA	2	10	73765	73774	60 %	0 %	20 %	20 %	46445677
49	NC_005861	CAATT	2	10	75741	75750	40 %	40 %	0 %	20 %	46445678
50	NC_005861	GCTCG	2	10	75803	75812	0 %	20 %	40 %	40 %	46445678
51	NC_005861	AGGAG	2	10	81906	81915	40 %	0 %	60 %	0 %	46445680
52	NC_005861	GCCTA	2	10	83510	83519	20 %	20 %	20 %	40 %	46445680
53	NC_005861	ATCTC	2	10	84462	84471	20 %	40 %	0 %	40 %	46445680
54	NC_005861	AGGGA	2	10	85303	85312	40 %	0 %	60 %	0 %	46445681
55	NC_005861	AAATT	2	10	85509	85518	60 %	40 %	0 %	0 %	46445682
56	NC_005861	TTTCT	2	10	86883	86892	0 %	80 %	0 %	20 %	46445682
57	NC_005861	AGGAG	2	10	92149	92158	40 %	0 %	60 %	0 %	46445685
58	NC_005861	GAGAT	2	10	92421	92430	40 %	20 %	40 %	0 %	46445685
59	NC_005861	TGGCT	2	10	92964	92973	0 %	40 %	40 %	20 %	46445685
60	NC_005861	AATAT	2	10	93390	93399	60 %	40 %	0 %	0 %	46445685
61	NC_005861	TCGAT	2	10	94691	94700	20 %	40 %	20 %	20 %	46445685
62	NC_005861	GAGAT	2	10	95970	95979	40 %	20 %	40 %	0 %	46445686
63	NC_005861	CAGAG	2	10	105013	105022	40 %	0 %	40 %	20 %	46445691
64	NC_005861	TTAGC	2	10	110125	110134	20 %	40 %	20 %	20 %	46445692
65	NC_005861	AGGAG	2	10	111089	111098	40 %	0 %	60 %	0 %	46445693
66	NC_005861	AAGAT	2	10	111361	111370	60 %	20 %	20 %	0 %	46445693
67	NC_005861	GCTAT	2	10	121189	121198	20 %	40 %	20 %	20 %	46445698
68	NC_005861	TTTGT	2	10	121715	121724	0 %	80 %	20 %	0 %	46445698
69	NC_005861	CATCA	2	10	121951	121960	40 %	20 %	0 %	40 %	46445698
70	NC_005861	AATTG	2	10	124054	124063	40 %	40 %	20 %	0 %	46445700
71	NC_005861	TAAAA	2	10	125481	125490	80 %	20 %	0 %	0 %	46445701
72	NC_005861	AATTT	2	10	127119	127128	40 %	60 %	0 %	0 %	161611311
73	NC_005861	GTTGT	2	10	128535	128544	0 %	60 %	40 %	0 %	46445705
74	NC_005861	GATTT	2	10	128747	128756	20 %	60 %	20 %	0 %	46445705
75	NC_005861	TTTCA	2	10	129121	129130	20 %	60 %	0 %	20 %	46445705
76	NC_005861	AAAAT	2	10	131006	131015	80 %	20 %	0 %	0 %	46445705
77	NC_005861	AAAGC	2	10	134886	134895	60 %	0 %	20 %	20 %	46445710
78	NC_005861	TGATT	2	10	135857	135866	20 %	60 %	20 %	0 %	46445711
79	NC_005861	GAAAG	2	10	137763	137772	60 %	0 %	40 %	0 %	46445712
80	NC_005861	TACCA	2	10	141474	141483	40 %	20 %	0 %	40 %	46445716
81	NC_005861	AAAGT	2	10	146032	146041	60 %	20 %	20 %	0 %	46445720
82	NC_005861	AATCG	2	10	149616	149625	40 %	20 %	20 %	20 %	46445722
83	NC_005861	AATTG	2	10	150427	150436	40 %	40 %	20 %	0 %	46445723
84	NC_005861	AGTAA	2	10	151884	151893	60 %	20 %	20 %	0 %	46445725
85	NC_005861	AATAG	2	10	154190	154199	60 %	20 %	20 %	0 %	46445727
86	NC_005861	TAAAA	2	10	154967	154976	80 %	20 %	0 %	0 %	46445727
87	NC_005861	TCATT	2	10	156536	156545	20 %	60 %	0 %	20 %	46445728
88	NC_005861	GCTTG	2	10	156559	156568	0 %	40 %	40 %	20 %	46445728
89	NC_005861	CAAAG	2	10	157086	157095	60 %	0 %	20 %	20 %	46445728
90	NC_005861	AAAGT	2	10	157366	157375	60 %	20 %	20 %	0 %	46445729
91	NC_005861	AAAAT	2	10	159169	159178	80 %	20 %	0 %	0 %	46445730
92	NC_005861	GTTTG	2	10	159420	159429	0 %	60 %	40 %	0 %	46445731
93	NC_005861	GGTTT	2	10	162585	162594	0 %	60 %	40 %	0 %	46445733
94	NC_005861	TACTT	2	10	162875	162884	20 %	60 %	0 %	20 %	46445734
95	NC_005861	GTCTT	2	10	165586	165595	0 %	60 %	20 %	20 %	46445736
96	NC_005861	AAACA	2	10	166543	166552	80 %	0 %	0 %	20 %	46445736
97	NC_005861	ATGAT	2	10	167036	167045	40 %	40 %	20 %	0 %	46445737
98	NC_005861	ATTCT	2	10	168393	168402	20 %	60 %	0 %	20 %	46445737
99	NC_005861	TTTGA	2	10	168778	168787	20 %	60 %	20 %	0 %	46445737
100	NC_005861	GTCTT	2	10	168793	168802	0 %	60 %	20 %	20 %	46445737
101	NC_005861	CTAAA	2	10	169469	169478	60 %	20 %	0 %	20 %	46445738
102	NC_005861	TATGC	2	10	170044	170053	20 %	40 %	20 %	20 %	46445740
103	NC_005861	TATTG	2	10	171768	171777	20 %	60 %	20 %	0 %	46445740
104	NC_005861	TGGGA	2	10	172346	172355	20 %	20 %	60 %	0 %	46445740
105	NC_005861	GATTG	2	10	177643	177652	20 %	40 %	40 %	0 %	46445744
106	NC_005861	TTGGT	2	10	180729	180738	0 %	60 %	40 %	0 %	46445745
107	NC_005861	CTTAA	2	10	183507	183516	40 %	40 %	0 %	20 %	46445750
108	NC_005861	ATTGA	2	10	184207	184216	40 %	40 %	20 %	0 %	46445750
109	NC_005861	AAAGG	2	10	184403	184412	60 %	0 %	40 %	0 %	46445750
110	NC_005861	CGGTT	2	10	187069	187078	0 %	40 %	40 %	20 %	46445752
111	NC_005861	AGTAA	2	10	187454	187463	60 %	20 %	20 %	0 %	46445752
112	NC_005861	AAGGC	2	10	189788	189797	40 %	0 %	40 %	20 %	46445754
113	NC_005861	TTCCA	2	10	192599	192608	20 %	40 %	0 %	40 %	46445755
114	NC_005861	AATTT	2	10	193376	193385	40 %	60 %	0 %	0 %	46445756
115	NC_005861	ATGTA	2	10	194784	194793	40 %	40 %	20 %	0 %	46445758
116	NC_005861	AGAAC	2	10	195100	195109	60 %	0 %	20 %	20 %	46445759
117	NC_005861	AAGGA	2	10	195626	195635	60 %	0 %	40 %	0 %	46445759
118	NC_005861	TTGAT	2	10	196615	196624	20 %	60 %	20 %	0 %	46445760
119	NC_005861	TCAAA	2	10	199970	199979	60 %	20 %	0 %	20 %	46445763
120	NC_005861	CAAAC	2	10	200789	200798	60 %	0 %	0 %	40 %	46445764
121	NC_005861	AGTTT	2	10	204352	204361	20 %	60 %	20 %	0 %	46445767
122	NC_005861	GAATT	2	10	207999	208008	40 %	40 %	20 %	0 %	46445769
123	NC_005861	GGATT	2	10	208265	208274	20 %	40 %	40 %	0 %	46445769
124	NC_005861	TGAAA	2	10	208486	208495	60 %	20 %	20 %	0 %	46445769
125	NC_005861	GTTTG	2	10	208583	208592	0 %	60 %	40 %	0 %	46445769
126	NC_005861	TATTT	2	10	209287	209296	20 %	80 %	0 %	0 %	46445770
127	NC_005861	AAATT	2	10	209508	209517	60 %	40 %	0 %	0 %	46445770
128	NC_005861	CGAAA	2	10	210053	210062	60 %	0 %	20 %	20 %	161611310
129	NC_005861	CCATT	2	10	212118	212127	20 %	40 %	0 %	40 %	46445772
130	NC_005861	TAAAA	2	10	213479	213488	80 %	20 %	0 %	0 %	46445773
131	NC_005861	GAAAA	2	10	218635	218644	80 %	0 %	20 %	0 %	46445777
132	NC_005861	AAGTA	2	10	219969	219978	60 %	20 %	20 %	0 %	46445779
133	NC_005861	AAAAT	2	10	221689	221698	80 %	20 %	0 %	0 %	46445780
134	NC_005861	AAAAG	2	10	223262	223271	80 %	0 %	20 %	0 %	46445780
135	NC_005861	AAATT	2	10	224077	224086	60 %	40 %	0 %	0 %	46445781
136	NC_005861	ACAGA	2	10	225804	225813	60 %	0 %	20 %	20 %	46445783
137	NC_005861	TGAAA	2	10	230089	230098	60 %	20 %	20 %	0 %	46445787
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