MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 25825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AGA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445635
2	NC_005861	TAT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445635
3	NC_005861	AGC	2	6	186	191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445635
4	NC_005861	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445635
5	NC_005861	TGA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445636
6	NC_005861	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445636
7	NC_005861	CTC	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
8	NC_005861	ATC	2	6	1119	1124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
9	NC_005861	AGC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
10	NC_005861	GAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
11	NC_005861	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
12	NC_005861	GTT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
13	NC_005861	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
14	NC_005861	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445637
15	NC_005861	ATT	2	6	1529	1534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
16	NC_005861	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
17	NC_005861	ATT	2	6	1664	1669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
18	NC_005861	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
19	NC_005861	ACA	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
20	NC_005861	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
21	NC_005861	CAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
22	NC_005861	AAC	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
23	NC_005861	AGG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
24	NC_005861	CTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
25	NC_005861	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
26	NC_005861	GAT	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
27	NC_005861	AAG	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
28	NC_005861	TCA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
29	NC_005861	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
30	NC_005861	AAG	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
31	NC_005861	AAG	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
32	NC_005861	TGA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
33	NC_005861	GAA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
34	NC_005861	TTC	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
35	NC_005861	GTT	2	6	2855	2860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
36	NC_005861	GCA	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
37	NC_005861	GGA	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
38	NC_005861	GTT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
39	NC_005861	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
40	NC_005861	TGA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
41	NC_005861	ATT	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
42	NC_005861	CAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
43	NC_005861	CAG	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
44	NC_005861	CCT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
45	NC_005861	AAC	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
46	NC_005861	TGT	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
47	NC_005861	GCA	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
48	NC_005861	CAA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445638
49	NC_005861	ACG	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
50	NC_005861	GTG	2	6	4597	4602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
51	NC_005861	GTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
52	NC_005861	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445638
53	NC_005861	GAT	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445638
54	NC_005861	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
55	NC_005861	TGG	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
56	NC_005861	GCA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
57	NC_005861	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445638
58	NC_005861	GCT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445638
59	NC_005861	GGA	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445638
60	NC_005861	AAG	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
61	NC_005861	TTA	3	9	5660	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445638
62	NC_005861	AGA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
63	NC_005861	TCT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
64	NC_005861	TGA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
65	NC_005861	CGC	2	6	6021	6026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46445639
66	NC_005861	CTA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
67	NC_005861	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
68	NC_005861	CTT	3	9	6128	6136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
69	NC_005861	AAT	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
70	NC_005861	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
71	NC_005861	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
72	NC_005861	CGG	2	6	6371	6376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46445639
73	NC_005861	AAC	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445639
74	NC_005861	CCT	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
75	NC_005861	CTG	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445639
76	NC_005861	TGC	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445639
77	NC_005861	GTT	2	6	6524	6529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
78	NC_005861	CTT	2	6	6562	6567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
79	NC_005861	AGG	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445639
80	NC_005861	TGA	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
81	NC_005861	TAA	2	6	6717	6722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
82	NC_005861	GTT	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
83	NC_005861	ATA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
84	NC_005861	TCT	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
85	NC_005861	CTT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
86	NC_005861	TCA	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
87	NC_005861	TAA	2	6	7179	7184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
88	NC_005861	TCC	2	6	7185	7190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
89	NC_005861	AAT	2	6	7255	7260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
90	NC_005861	TCA	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
91	NC_005861	TTC	2	6	7281	7286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
92	NC_005861	TTC	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
93	NC_005861	TTC	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
94	NC_005861	AAT	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
95	NC_005861	CTT	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
96	NC_005861	AAT	2	6	7434	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
97	NC_005861	TAT	2	6	7509	7514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
98	NC_005861	TTC	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
99	NC_005861	TTA	2	6	7717	7722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
100	NC_005861	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
101	NC_005861	TCC	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
102	NC_005861	ATA	2	6	7962	7967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
103	NC_005861	TCC	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
104	NC_005861	GTT	2	6	8107	8112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
105	NC_005861	AAT	2	6	8207	8212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
106	NC_005861	AGC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445639
107	NC_005861	TAG	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
108	NC_005861	GGA	2	6	9214	9219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445640
109	NC_005861	GAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445641
110	NC_005861	CTT	2	6	9580	9585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
111	NC_005861	AGT	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445641
112	NC_005861	ATG	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445641
113	NC_005861	TTC	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
114	NC_005861	CTG	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445641
115	NC_005861	ATA	2	6	10002	10007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
116	NC_005861	TAA	2	6	10021	10026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
117	NC_005861	TTC	2	6	10336	10341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
118	NC_005861	GCC	2	6	10406	10411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46445641
119	NC_005861	AAT	2	6	10451	10456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
120	NC_005861	CAA	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445641
121	NC_005861	AGC	2	6	10493	10498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445641
122	NC_005861	GGT	2	6	10602	10607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445641
123	NC_005861	GAA	2	6	10668	10673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445641
124	NC_005861	AGA	2	6	10709	10714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445641
125	NC_005861	TGT	2	6	10940	10945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445641
126	NC_005861	GAT	2	6	10949	10954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445641
127	NC_005861	CAA	2	6	11788	11793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445642
128	NC_005861	AGC	2	6	11910	11915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445642
129	NC_005861	GAA	2	6	11917	11922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445642
130	NC_005861	AGC	2	6	12037	12042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445642
131	NC_005861	ATT	2	6	12157	12162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
132	NC_005861	ATC	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445642
133	NC_005861	TGA	2	6	12193	12198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445642
134	NC_005861	AAC	2	6	12201	12206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445642
135	NC_005861	TAT	2	6	12227	12232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
136	NC_005861	TAT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
137	NC_005861	GCA	2	6	12658	12663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445642
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139	NC_005861	GAG	2	6	12776	12781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445642
140	NC_005861	CTA	2	6	12789	12794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445642
141	NC_005861	AAG	2	6	12855	12860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445642
142	NC_005861	CTT	2	6	12896	12901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445642
143	NC_005861	TGA	2	6	12924	12929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445642
144	NC_005861	CCT	2	6	12950	12955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445642
145	NC_005861	GAT	2	6	12974	12979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445642
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147	NC_005861	ATT	2	6	13085	13090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
148	NC_005861	CTC	2	6	13098	13103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445642
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151	NC_005861	GTT	2	6	13273	13278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445642
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153	NC_005861	ATT	2	6	13323	13328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
154	NC_005861	CAA	2	6	13349	13354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445642
155	NC_005861	CAT	2	6	13409	13414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445642
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159	NC_005861	GAA	2	6	13649	13654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445642
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161	NC_005861	GAA	2	6	13733	13738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445642
162	NC_005861	ACA	2	6	13837	13842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445642
163	NC_005861	ATG	2	6	13895	13900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445642
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165	NC_005861	ATT	2	6	14147	14152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445642
166	NC_005861	AAT	2	6	14279	14284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445642
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222	NC_005861	TAA	2	6	18824	18829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445643
223	NC_005861	TTA	2	6	18972	18977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
224	NC_005861	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
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239	NC_005861	ATT	2	6	19785	19790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
240	NC_005861	GAT	2	6	19805	19810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445644
241	NC_005861	ATG	2	6	19821	19826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445644
242	NC_005861	AGA	2	6	20103	20108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445644
243	NC_005861	GGT	2	6	20302	20307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445644
244	NC_005861	TAT	3	9	20318	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
245	NC_005861	GTT	2	6	20458	20463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445644
246	NC_005861	CAA	2	6	20670	20675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445644
247	NC_005861	TGT	2	6	21472	21477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445645
248	NC_005861	CTA	2	6	21502	21507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445645
249	NC_005861	CAA	2	6	21583	21588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445645
250	NC_005861	AAG	2	6	21692	21697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445646
251	NC_005861	AAC	2	6	21766	21771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445646
252	NC_005861	CTG	2	6	21777	21782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445646
253	NC_005861	AAC	2	6	21903	21908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445646
254	NC_005861	AGA	2	6	21938	21943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445646
255	NC_005861	TTC	2	6	21955	21960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445646
256	NC_005861	TCT	2	6	21986	21991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445646
257	NC_005861	GCT	2	6	22059	22064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445646
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259	NC_005861	TGT	2	6	22436	22441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445646
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