MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	33241336
2	NC_005043	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	33241339
3	NC_005043	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	33241339
4	NC_005043	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	33241340
5	NC_005043	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	33241341
6	NC_005043	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	33241341
7	NC_005043	TCGAA	2	10	12459	12468	40 %	20 %	20 %	20 %	33241345
8	NC_005043	GGGAT	2	10	13871	13880	20 %	20 %	60 %	0 %	33241347
9	NC_005043	GAGGG	2	10	13993	14002	20 %	0 %	80 %	0 %	33241347
10	NC_005043	GAGAG	2	10	15583	15592	40 %	0 %	60 %	0 %	33241347
11	NC_005043	TCTCG	2	10	22800	22809	0 %	40 %	20 %	40 %	33241353
12	NC_005043	GCTAT	2	10	27135	27144	20 %	40 %	20 %	20 %	33241355
13	NC_005043	TCTAG	2	10	27428	27437	20 %	40 %	20 %	20 %	33241356
14	NC_005043	AATAT	2	10	27513	27522	60 %	40 %	0 %	0 %	33241357
15	NC_005043	CCACT	2	10	27594	27603	20 %	20 %	0 %	60 %	33241357
16	NC_005043	TGCTT	2	10	34190	34199	0 %	60 %	20 %	20 %	33241360
17	NC_005043	ATCTT	2	10	35068	35077	20 %	60 %	0 %	20 %	33241362
18	NC_005043	TTTTC	2	10	35825	35834	0 %	80 %	0 %	20 %	33241362
19	NC_005043	TCAAA	2	10	37061	37070	60 %	20 %	0 %	20 %	33241363
20	NC_005043	GGCAA	2	10	37967	37976	40 %	0 %	40 %	20 %	33241364
21	NC_005043	GCATA	2	10	39454	39463	40 %	20 %	20 %	20 %	33241365
22	NC_005043	AAGAC	2	10	41974	41983	60 %	0 %	20 %	20 %	33241366
23	NC_005043	TTTAA	2	10	42660	42669	40 %	60 %	0 %	0 %	33241367
24	NC_005043	ATTTG	2	10	43640	43649	20 %	60 %	20 %	0 %	33241368
25	NC_005043	CCGCT	2	10	46913	46922	0 %	20 %	20 %	60 %	33241372
26	NC_005043	GGATA	2	10	49954	49963	40 %	20 %	40 %	0 %	33241374
27	NC_005043	ATAAA	2	10	50101	50110	80 %	20 %	0 %	0 %	33241374
28	NC_005043	AGATC	2	10	51838	51847	40 %	20 %	20 %	20 %	33241376
29	NC_005043	CACAT	2	10	52717	52726	40 %	20 %	0 %	40 %	33241377
30	NC_005043	TCGAG	2	10	57593	57602	20 %	20 %	40 %	20 %	33241381
31	NC_005043	GAGAG	2	10	58153	58162	40 %	0 %	60 %	0 %	33241381
32	NC_005043	TAAGC	2	10	61224	61233	40 %	20 %	20 %	20 %	33241384
33	NC_005043	CTAAA	2	10	63654	63663	60 %	20 %	0 %	20 %	33241385
34	NC_005043	GCAAA	2	10	64054	64063	60 %	0 %	20 %	20 %	33241386
35	NC_005043	CTATA	2	10	64907	64916	40 %	40 %	0 %	20 %	33241388
36	NC_005043	AAAGT	2	10	66136	66145	60 %	20 %	20 %	0 %	33241389
37	NC_005043	CCGTG	2	10	67283	67292	0 %	20 %	40 %	40 %	33241390
38	NC_005043	TATTT	2	10	67678	67687	20 %	80 %	0 %	0 %	33241391
39	NC_005043	ATTTT	2	10	70205	70214	20 %	80 %	0 %	0 %	33241392
40	NC_005043	CCAAC	2	10	71730	71739	40 %	0 %	0 %	60 %	33241394
41	NC_005043	TGCCC	2	10	73431	73440	0 %	20 %	20 %	60 %	33241397
42	NC_005043	TTCTT	2	10	73544	73553	0 %	80 %	0 %	20 %	33241397
43	NC_005043	TACAT	2	10	73915	73924	40 %	40 %	0 %	20 %	33241398
44	NC_005043	CTAAC	2	10	74180	74189	40 %	20 %	0 %	40 %	33241398
45	NC_005043	TACGA	2	10	74717	74726	40 %	20 %	20 %	20 %	33241398
46	NC_005043	ACAAG	2	10	74835	74844	60 %	0 %	20 %	20 %	33241398
47	NC_005043	AAATC	2	10	76866	76875	60 %	20 %	0 %	20 %	33241401
48	NC_005043	TCTTT	2	10	77093	77102	0 %	80 %	0 %	20 %	33241401
49	NC_005043	AAGAG	2	10	77829	77838	60 %	0 %	40 %	0 %	33241401
50	NC_005043	CAACC	2	10	77859	77868	40 %	0 %	0 %	60 %	33241401
51	NC_005043	TTTTC	2	10	81150	81159	0 %	80 %	0 %	20 %	33241403
52	NC_005043	TGATT	2	10	85552	85561	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
53	NC_005043	TCAAG	2	10	85664	85673	40 %	20 %	20 %	20 %	33241407
54	NC_005043	AGTTT	2	10	85733	85742	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
55	NC_005043	AAGGT	2	10	86881	86890	40 %	20 %	40 %	0 %	33241408
56	NC_005043	AAGAA	2	10	88889	88898	80 %	0 %	20 %	0 %	33241411
57	NC_005043	ATGTA	2	10	90468	90477	40 %	40 %	20 %	0 %	33241413
58	NC_005043	TCAAA	2	10	90507	90516	60 %	20 %	0 %	20 %	33241413
59	NC_005043	ACCAA	2	10	93136	93145	60 %	0 %	0 %	40 %	33241416
60	NC_005043	GTGAT	2	10	93913	93922	20 %	40 %	40 %	0 %	33241416
61	NC_005043	CAAAA	2	10	96163	96172	80 %	0 %	0 %	20 %	33241417
62	NC_005043	ATTAT	2	10	97072	97081	40 %	60 %	0 %	0 %	33241417
63	NC_005043	TCTTG	2	10	98449	98458	0 %	60 %	20 %	20 %	33241417
64	NC_005043	CAAAA	2	10	98926	98935	80 %	0 %	0 %	20 %	33241417
65	NC_005043	TTTCC	2	10	101649	101658	0 %	60 %	0 %	40 %	33241420
66	NC_005043	GCAAG	2	10	109936	109945	40 %	0 %	40 %	20 %	33241427
67	NC_005043	GTTAG	2	10	113308	113317	20 %	40 %	40 %	0 %	33241429
68	NC_005043	TGGTT	2	10	115390	115399	0 %	60 %	40 %	0 %	33241430
69	NC_005043	ATGTT	2	10	119201	119210	20 %	60 %	20 %	0 %	33241431
70	NC_005043	TGAAA	2	10	119470	119479	60 %	20 %	20 %	0 %	33241431
71	NC_005043	TAGCC	2	10	120416	120425	20 %	20 %	20 %	40 %	33241431
72	NC_005043	GAAGA	2	10	121468	121477	60 %	0 %	40 %	0 %	33241431
73	NC_005043	ATTGG	2	10	123133	123142	20 %	40 %	40 %	0 %	33241432
74	NC_005043	TAGAA	2	10	123654	123663	60 %	20 %	20 %	0 %	33241433
75	NC_005043	AGAAA	2	10	123959	123968	80 %	0 %	20 %	0 %	33241433
76	NC_005043	AAAAT	2	10	124551	124560	80 %	20 %	0 %	0 %	33241433
77	NC_005043	CTTAT	2	10	127627	127636	20 %	60 %	0 %	20 %	33241437
78	NC_005043	TTGGG	2	10	127776	127785	0 %	40 %	60 %	0 %	33241437
79	NC_005043	TTTCT	2	10	127992	128001	0 %	80 %	0 %	20 %	33241437
80	NC_005043	ATTTT	2	10	129452	129461	20 %	80 %	0 %	0 %	33241438
81	NC_005043	TCTGG	2	10	131765	131774	0 %	40 %	40 %	20 %	33241440
82	NC_005043	AATCT	2	10	132275	132284	40 %	40 %	0 %	20 %	33241440
83	NC_005043	CTTTT	2	10	133002	133011	0 %	80 %	0 %	20 %	229009100
84	NC_005043	AAGAT	2	10	137399	137408	60 %	20 %	20 %	0 %	33241445
85	NC_005043	AAGAA	2	10	138585	138594	80 %	0 %	20 %	0 %	33241445
86	NC_005043	CGCAT	2	10	139090	139099	20 %	20 %	20 %	40 %	33241445
87	NC_005043	CATAG	2	10	140339	140348	40 %	20 %	20 %	20 %	33241446
88	NC_005043	TTTTC	2	10	141694	141703	0 %	80 %	0 %	20 %	33241447
89	NC_005043	TATGT	2	10	142392	142401	20 %	60 %	20 %	0 %	33241448
90	NC_005043	GGTAG	2	10	142463	142472	20 %	20 %	60 %	0 %	33241448
91	NC_005043	GAAGA	2	10	145039	145048	60 %	0 %	40 %	0 %	33241451
92	NC_005043	AAAGA	2	10	149131	149140	80 %	0 %	20 %	0 %	161484688
93	NC_005043	TTTCT	2	10	149838	149847	0 %	80 %	0 %	20 %	33241458
94	NC_005043	GTAGA	2	10	151213	151222	40 %	20 %	40 %	0 %	33241458
95	NC_005043	AATAT	2	10	151934	151943	60 %	40 %	0 %	0 %	33241459
96	NC_005043	GATCA	2	10	152193	152202	40 %	20 %	20 %	20 %	33241459
97	NC_005043	TGAGG	2	10	153201	153210	20 %	20 %	60 %	0 %	33241459
98	NC_005043	TAGGA	2	10	153360	153369	40 %	20 %	40 %	0 %	33241459
99	NC_005043	GATAT	2	10	156008	156017	40 %	40 %	20 %	0 %	33241461
100	NC_005043	TTATA	2	10	158317	158326	40 %	60 %	0 %	0 %	33241463
101	NC_005043	GTTAG	2	10	159049	159058	20 %	40 %	40 %	0 %	33241464
102	NC_005043	TAGAG	2	10	159143	159152	40 %	20 %	40 %	0 %	33241464
103	NC_005043	ATACG	2	10	159833	159842	40 %	20 %	20 %	20 %	33241465
104	NC_005043	TATTT	2	10	161396	161405	20 %	80 %	0 %	0 %	33241466
105	NC_005043	CGGAT	2	10	163122	163131	20 %	20 %	40 %	20 %	33241468
106	NC_005043	TCAGT	2	10	163200	163209	20 %	40 %	20 %	20 %	33241468
107	NC_005043	GAAGT	2	10	163914	163923	40 %	20 %	40 %	0 %	33241468
108	NC_005043	GCAAA	2	10	164002	164011	60 %	0 %	20 %	20 %	33241468
109	NC_005043	TATTT	2	10	166631	166640	20 %	80 %	0 %	0 %	33241471
110	NC_005043	ATGTT	2	10	168076	168085	20 %	60 %	20 %	0 %	33241472
111	NC_005043	TCAGT	2	10	168881	168890	20 %	40 %	20 %	20 %	33241472
112	NC_005043	ATAGG	2	10	169523	169532	40 %	20 %	40 %	0 %	33241473
113	NC_005043	TTTGA	2	10	171493	171502	20 %	60 %	20 %	0 %	33241474
114	NC_005043	GAGAG	2	10	173952	173961	40 %	0 %	60 %	0 %	33241479
115	NC_005043	ATACC	2	10	174190	174199	40 %	20 %	0 %	40 %	33241479
116	NC_005043	TTTGC	2	10	174413	174422	0 %	60 %	20 %	20 %	33241479
117	NC_005043	GAAGA	2	10	176844	176853	60 %	0 %	40 %	0 %	33241480
118	NC_005043	TTTTC	2	10	178950	178959	0 %	80 %	0 %	20 %	33241481
119	NC_005043	TCTCT	2	10	179002	179011	0 %	60 %	0 %	40 %	33241481
120	NC_005043	CATTT	2	10	179578	179587	20 %	60 %	0 %	20 %	33241481
121	NC_005043	TTTAT	2	10	179783	179792	20 %	80 %	0 %	0 %	33241481
122	NC_005043	TAAAA	2	10	181898	181907	80 %	20 %	0 %	0 %	33241484
123	NC_005043	TTATT	2	10	185657	185666	20 %	80 %	0 %	0 %	33241486
124	NC_005043	AGATT	2	10	185923	185932	40 %	40 %	20 %	0 %	33241486
125	NC_005043	AAAGA	2	10	188191	188200	80 %	0 %	20 %	0 %	33241486
126	NC_005043	CAAGA	2	10	191480	191489	60 %	0 %	20 %	20 %	33241487
127	NC_005043	CATTT	2	10	193619	193628	20 %	60 %	0 %	20 %	33241489
128	NC_005043	ATACC	2	10	195005	195014	40 %	20 %	0 %	40 %	33241489
129	NC_005043	AAAGG	2	10	198022	198031	60 %	0 %	40 %	0 %	33241493
130	NC_005043	TTTGG	2	10	203689	203698	0 %	60 %	40 %	0 %	33241499
131	NC_005043	CTTTG	2	10	203782	203791	0 %	60 %	20 %	20 %	33241499
132	NC_005043	GTTTT	2	10	204127	204136	0 %	80 %	20 %	0 %	33241500
133	NC_005043	AAGGA	2	10	204916	204925	60 %	0 %	40 %	0 %	33241501
134	NC_005043	TATAA	2	10	206129	206138	60 %	40 %	0 %	0 %	33241505
135	NC_005043	ATATT	2	10	208081	208090	40 %	60 %	0 %	0 %	33241507
136	NC_005043	GGCTT	2	10	208790	208799	0 %	40 %	40 %	20 %	33241508
137	NC_005043	TGGAG	2	10	209291	209300	20 %	20 %	60 %	0 %	33241508
138	NC_005043	TTGCT	2	10	209762	209771	0 %	60 %	20 %	20 %	33241508
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251	NC_005043	AACAA	2	10	388122	388131	80 %	0 %	0 %	20 %	33241687
252	NC_005043	GCTAT	2	10	393240	393249	20 %	40 %	20 %	20 %	33241693
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254	NC_005043	CTGTA	2	10	396747	396756	20 %	40 %	20 %	20 %	33241696
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260	NC_005043	CCAAT	2	10	403975	403984	40 %	20 %	0 %	40 %	33241703
261	NC_005043	AAGGA	2	10	406031	406040	60 %	0 %	40 %	0 %	33241706
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