MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 22717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005043	GAAG	2	8	80458	80465	50 %	0 %	50 %	0 %	33241403
1502	NC_005043	AAG	2	6	80501	80506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1503	NC_005043	CCT	2	6	80532	80537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241403
1504	NC_005043	TCTA	2	8	80550	80557	25 %	50 %	0 %	25 %	33241403
1505	NC_005043	TAG	3	9	80558	80566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241403
1506	NC_005043	A	6	6	80712	80717	100 %	0 %	0 %	0 %	33241403
1507	NC_005043	GAA	2	6	80767	80772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1508	NC_005043	A	6	6	80775	80780	100 %	0 %	0 %	0 %	33241403
1509	NC_005043	GGAAAA	2	12	80790	80801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1510	NC_005043	AGA	2	6	80802	80807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1511	NC_005043	GAA	2	6	80822	80827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1512	NC_005043	AGA	3	9	80985	80993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1513	NC_005043	TGGT	2	8	81011	81018	0 %	50 %	50 %	0 %	33241403
1514	NC_005043	TATT	2	8	81022	81029	25 %	75 %	0 %	0 %	33241403
1515	NC_005043	GCGT	2	8	81037	81044	0 %	25 %	50 %	25 %	33241403
1516	NC_005043	CGA	2	6	81066	81071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241403
1517	NC_005043	ATA	2	6	81077	81082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241403
1518	NC_005043	AG	3	6	81103	81108	50 %	0 %	50 %	0 %	33241403
1519	NC_005043	A	7	7	81124	81130	100 %	0 %	0 %	0 %	33241403
1520	NC_005043	TTTTC	2	10	81150	81159	0 %	80 %	0 %	20 %	33241403
1521	NC_005043	TTCT	2	8	81181	81188	0 %	75 %	0 %	25 %	33241403
1522	NC_005043	ATG	2	6	81206	81211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241403
1523	NC_005043	T	6	6	81295	81300	0 %	100 %	0 %	0 %	33241403
1524	NC_005043	ATC	2	6	81359	81364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241403
1525	NC_005043	ATT	2	6	81366	81371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241403
1526	NC_005043	GTA	2	6	81389	81394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241403
1527	NC_005043	CTAT	2	8	81446	81453	25 %	50 %	0 %	25 %	33241403
1528	NC_005043	AAC	2	6	81494	81499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241403
1529	NC_005043	AAG	2	6	81500	81505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241403
1530	NC_005043	GCT	2	6	81526	81531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241403
1531	NC_005043	T	7	7	81827	81833	0 %	100 %	0 %	0 %	33241404
1532	NC_005043	GTTT	2	8	81846	81853	0 %	75 %	25 %	0 %	33241404
1533	NC_005043	TC	3	6	81940	81945	0 %	50 %	0 %	50 %	33241404
1534	NC_005043	A	6	6	82086	82091	100 %	0 %	0 %	0 %	33241404
1535	NC_005043	AGA	2	6	82109	82114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241404
1536	NC_005043	T	6	6	82186	82191	0 %	100 %	0 %	0 %	33241404
1537	NC_005043	TTA	2	6	82273	82278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241404
1538	NC_005043	TCC	2	6	82290	82295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241404
1539	NC_005043	TAAA	2	8	82377	82384	75 %	25 %	0 %	0 %	33241404
1540	NC_005043	A	6	6	82382	82387	100 %	0 %	0 %	0 %	33241404
1541	NC_005043	TGT	2	6	83049	83054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241405
1542	NC_005043	GTG	2	6	83170	83175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241405
1543	NC_005043	T	6	6	83295	83300	0 %	100 %	0 %	0 %	33241405
1544	NC_005043	CT	3	6	83418	83423	0 %	50 %	0 %	50 %	33241405
1545	NC_005043	CT	3	6	83570	83575	0 %	50 %	0 %	50 %	33241405
1546	NC_005043	CA	3	6	83583	83588	50 %	0 %	0 %	50 %	33241405
1547	NC_005043	GA	3	6	83613	83618	50 %	0 %	50 %	0 %	33241405
1548	NC_005043	CAA	3	9	83664	83672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241405
1549	NC_005043	CAG	2	6	83730	83735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241405
1550	NC_005043	GAA	2	6	83775	83780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241405
1551	NC_005043	GTAT	2	8	83842	83849	25 %	50 %	25 %	0 %	33241405
1552	NC_005043	TTA	2	6	83897	83902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241405
1553	NC_005043	TGC	2	6	83948	83953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241405
1554	NC_005043	CTA	2	6	84072	84077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241405
1555	NC_005043	ATTC	2	8	84134	84141	25 %	50 %	0 %	25 %	33241405
1556	NC_005043	AT	3	6	84146	84151	50 %	50 %	0 %	0 %	33241405
1557	NC_005043	ACT	2	6	84156	84161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241405
1558	NC_005043	T	6	6	84171	84176	0 %	100 %	0 %	0 %	33241405
1559	NC_005043	TCC	2	6	84190	84195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241405
1560	NC_005043	TTGT	2	8	84231	84238	0 %	75 %	25 %	0 %	33241405
1561	NC_005043	ATG	3	9	84436	84444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241405
1562	NC_005043	CAA	2	6	84450	84455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241405
1563	NC_005043	CGC	2	6	84576	84581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33241405
1564	NC_005043	GGC	2	6	85100	85105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241406
1565	NC_005043	CCA	2	6	85154	85159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241406
1566	NC_005043	AAAG	2	8	85172	85179	75 %	0 %	25 %	0 %	33241406
1567	NC_005043	A	8	8	85198	85205	100 %	0 %	0 %	0 %	33241406
1568	NC_005043	TAAA	2	8	85257	85264	75 %	25 %	0 %	0 %	33241406
1569	NC_005043	A	8	8	85304	85311	100 %	0 %	0 %	0 %	33241406
1570	NC_005043	CTT	2	6	85390	85395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241406
1571	NC_005043	GAA	2	6	85412	85417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241406
1572	NC_005043	GAT	2	6	85443	85448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241406
1573	NC_005043	CTC	2	6	85474	85479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241406
1574	NC_005043	AAT	2	6	85480	85485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241406
1575	NC_005043	T	7	7	85495	85501	0 %	100 %	0 %	0 %	33241406
1576	NC_005043	TGATT	2	10	85552	85561	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
1577	NC_005043	T	6	6	85581	85586	0 %	100 %	0 %	0 %	33241407
1578	NC_005043	TTG	2	6	85590	85595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241407
1579	NC_005043	ATA	2	6	85615	85620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241407
1580	NC_005043	AAT	2	6	85638	85643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241407
1581	NC_005043	ATC	2	6	85644	85649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241407
1582	NC_005043	TGT	2	6	85655	85660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241407
1583	NC_005043	TCAAG	2	10	85664	85673	40 %	20 %	20 %	20 %	33241407
1584	NC_005043	AGTTT	2	10	85733	85742	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
1585	NC_005043	AAG	2	6	85745	85750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241407
1586	NC_005043	GTT	2	6	85782	85787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241407
1587	NC_005043	TGAT	2	8	85822	85829	25 %	50 %	25 %	0 %	33241407
1588	NC_005043	TGA	2	6	85841	85846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241407
1589	NC_005043	T	6	6	85887	85892	0 %	100 %	0 %	0 %	33241407
1590	NC_005043	GC	3	6	85935	85940	0 %	0 %	50 %	50 %	33241407
1591	NC_005043	ATC	2	6	86041	86046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241407
1592	NC_005043	AAC	2	6	86178	86183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241407
1593	NC_005043	ACCC	2	8	86196	86203	25 %	0 %	0 %	75 %	33241407
1594	NC_005043	ATG	2	6	86235	86240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241407
1595	NC_005043	AT	4	8	86279	86286	50 %	50 %	0 %	0 %	33241407
1596	NC_005043	GGA	2	6	86300	86305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241407
1597	NC_005043	T	6	6	86315	86320	0 %	100 %	0 %	0 %	33241407
1598	NC_005043	T	6	6	86329	86334	0 %	100 %	0 %	0 %	33241407
1599	NC_005043	AGG	2	6	86412	86417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241407
1600	NC_005043	AGA	2	6	86469	86474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241407
1601	NC_005043	TCC	2	6	86529	86534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241407
1602	NC_005043	AGA	2	6	86535	86540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241407
1603	NC_005043	A	7	7	86565	86571	100 %	0 %	0 %	0 %	33241407
1604	NC_005043	A	6	6	86856	86861	100 %	0 %	0 %	0 %	33241408
1605	NC_005043	AAGGT	2	10	86881	86890	40 %	20 %	40 %	0 %	33241408
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1609	NC_005043	CG	3	6	87367	87372	0 %	0 %	50 %	50 %	33241409
1610	NC_005043	GGAT	2	8	87381	87388	25 %	25 %	50 %	0 %	33241409
1611	NC_005043	AGA	2	6	87429	87434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241409
1612	NC_005043	GTT	2	6	87661	87666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241409
1613	NC_005043	TC	3	6	87689	87694	0 %	50 %	0 %	50 %	33241409
1614	NC_005043	AAG	2	6	87695	87700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241409
1615	NC_005043	TTG	2	6	87719	87724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241409
1616	NC_005043	CTT	2	6	87742	87747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241409
1617	NC_005043	GAA	2	6	87748	87753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241409
1618	NC_005043	TAT	2	6	87774	87779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241409
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1620	NC_005043	GAA	2	6	87956	87961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241409
1621	NC_005043	GA	3	6	88013	88018	50 %	0 %	50 %	0 %	33241409
1622	NC_005043	CTC	2	6	88099	88104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241409
1623	NC_005043	TGG	2	6	88139	88144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241409
1624	NC_005043	TTC	2	6	88199	88204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241409
1625	NC_005043	AGAA	2	8	88205	88212	75 %	0 %	25 %	0 %	33241409
1626	NC_005043	TTC	2	6	88234	88239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241409
1627	NC_005043	TTC	3	9	88258	88266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241409
1628	NC_005043	TAC	2	6	88269	88274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241409
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1887	NC_005043	TGG	2	6	100379	100384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241418
1888	NC_005043	TGA	2	6	100399	100404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241418
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1990	NC_005043	TGA	2	6	105502	105507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241423
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1993	NC_005043	A	6	6	105618	105623	100 %	0 %	0 %	0 %	33241423
1994	NC_005043	TGG	2	6	105815	105820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241424
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1996	NC_005043	CTGT	2	8	105991	105998	0 %	50 %	25 %	25 %	33241424
1997	NC_005043	TGAT	2	8	106039	106046	25 %	50 %	25 %	0 %	33241424
1998	NC_005043	T	6	6	106084	106089	0 %	100 %	0 %	0 %	33241424
1999	NC_005043	CTT	2	6	106090	106095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241424
2000	NC_005043	CAT	2	6	106104	106109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241424

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