MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 22717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005043	GGA	2	6	26720	26725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241355
502	NC_005043	GAT	2	6	26794	26799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241355
503	NC_005043	TC	3	6	26929	26934	0 %	50 %	0 %	50 %	33241355
504	NC_005043	CTT	2	6	27044	27049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241355
505	NC_005043	ATC	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241355
506	NC_005043	TCAG	2	8	27096	27103	25 %	25 %	25 %	25 %	33241355
507	NC_005043	TTC	2	6	27124	27129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241355
508	NC_005043	GCTAT	2	10	27135	27144	20 %	40 %	20 %	20 %	33241355
509	NC_005043	GGA	2	6	27152	27157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241355
510	NC_005043	TGT	2	6	27327	27332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241356
511	NC_005043	T	6	6	27368	27373	0 %	100 %	0 %	0 %	33241356
512	NC_005043	GAA	2	6	27383	27388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241356
513	NC_005043	TCTAG	2	10	27428	27437	20 %	40 %	20 %	20 %	33241356
514	NC_005043	T	6	6	27444	27449	0 %	100 %	0 %	0 %	33241356
515	NC_005043	AATAT	2	10	27513	27522	60 %	40 %	0 %	0 %	33241357
516	NC_005043	TGT	2	6	27540	27545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241357
517	NC_005043	CCACT	2	10	27594	27603	20 %	20 %	0 %	60 %	33241357
518	NC_005043	TGC	2	6	27670	27675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
519	NC_005043	CTAC	2	8	27681	27688	25 %	25 %	0 %	50 %	33241357
520	NC_005043	TC	3	6	27689	27694	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
521	NC_005043	TA	3	6	27710	27715	50 %	50 %	0 %	0 %	33241357
522	NC_005043	GGT	2	6	27728	27733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241357
523	NC_005043	CTG	2	6	27762	27767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
524	NC_005043	TAC	2	6	27922	27927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241357
525	NC_005043	TGG	2	6	28015	28020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241357
526	NC_005043	A	6	6	28094	28099	100 %	0 %	0 %	0 %	33241357
527	NC_005043	AGG	2	6	28186	28191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
528	NC_005043	TGC	2	6	28270	28275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
529	NC_005043	CTT	2	6	28326	28331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241357
530	NC_005043	TGG	2	6	28363	28368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241357
531	NC_005043	AGG	2	6	28447	28452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
532	NC_005043	TC	3	6	28469	28474	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
533	NC_005043	CT	3	6	28500	28505	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
534	NC_005043	TAA	2	6	28510	28515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241357
535	NC_005043	AGG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
536	NC_005043	AGG	2	6	28564	28569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
537	NC_005043	AGG	2	6	28591	28596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
538	NC_005043	ACA	2	6	28628	28633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241357
539	NC_005043	TGC	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
540	NC_005043	CTAT	2	8	28719	28726	25 %	50 %	0 %	25 %	33241357
541	NC_005043	ACC	2	6	28742	28747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241357
542	NC_005043	GA	4	8	28830	28837	50 %	0 %	50 %	0 %	33241357
543	NC_005043	CAG	2	6	28845	28850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241357
544	NC_005043	TAG	2	6	28899	28904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241357
545	NC_005043	CA	3	6	28942	28947	50 %	0 %	0 %	50 %	33241357
546	NC_005043	CTT	2	6	28976	28981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241357
547	NC_005043	TCA	2	6	29025	29030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
548	NC_005043	CAG	2	6	29091	29096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241358
549	NC_005043	GGGA	2	8	29218	29225	25 %	0 %	75 %	0 %	33241358
550	NC_005043	TTG	2	6	29433	29438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241358
551	NC_005043	TAG	2	6	29470	29475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
552	NC_005043	GTA	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
553	NC_005043	CTC	2	6	29761	29766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241358
554	NC_005043	GTC	2	6	29786	29791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241358
555	NC_005043	AAT	2	6	29825	29830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241358
556	NC_005043	ATG	2	6	29883	29888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
557	NC_005043	TAC	3	9	29918	29926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
558	NC_005043	T	6	6	29938	29943	0 %	100 %	0 %	0 %	33241358
559	NC_005043	TAC	2	6	29951	29956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
560	NC_005043	AGG	2	6	30013	30018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241358
561	NC_005043	GA	3	6	30083	30088	50 %	0 %	50 %	0 %	33241358
562	NC_005043	TC	3	6	30214	30219	0 %	50 %	0 %	50 %	33241358
563	NC_005043	T	6	6	30611	30616	0 %	100 %	0 %	0 %	33241359
564	NC_005043	AAG	3	9	30633	30641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
565	NC_005043	ATC	2	6	30717	30722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241359
566	NC_005043	GCCA	2	8	30757	30764	25 %	0 %	25 %	50 %	33241359
567	NC_005043	AAT	2	6	30810	30815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
568	NC_005043	AG	4	8	30842	30849	50 %	0 %	50 %	0 %	33241359
569	NC_005043	TTTC	2	8	31052	31059	0 %	75 %	0 %	25 %	33241359
570	NC_005043	AACG	2	8	31298	31305	50 %	0 %	25 %	25 %	33241359
571	NC_005043	ATA	2	6	31311	31316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
572	NC_005043	GAG	2	6	31395	31400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241359
573	NC_005043	GGA	2	6	31445	31450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241359
574	NC_005043	GC	3	6	31493	31498	0 %	0 %	50 %	50 %	33241359
575	NC_005043	TAT	2	6	31597	31602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241359
576	NC_005043	TTGG	2	8	31646	31653	0 %	50 %	50 %	0 %	33241359
577	NC_005043	AGA	2	6	31679	31684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
578	NC_005043	GTT	2	6	31760	31765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
579	NC_005043	ATA	2	6	31910	31915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
580	NC_005043	GAG	2	6	32019	32024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241359
581	NC_005043	TCC	2	6	32078	32083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241359
582	NC_005043	TCC	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241359
583	NC_005043	AC	3	6	32168	32173	50 %	0 %	0 %	50 %	33241359
584	NC_005043	TGT	2	6	32180	32185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
585	NC_005043	AGAA	2	8	32195	32202	75 %	0 %	25 %	0 %	33241359
586	NC_005043	GAA	2	6	32211	32216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
587	NC_005043	T	6	6	32249	32254	0 %	100 %	0 %	0 %	33241359
588	NC_005043	AT	3	6	32274	32279	50 %	50 %	0 %	0 %	33241359
589	NC_005043	C	6	6	32324	32329	0 %	0 %	0 %	100 %	33241359
590	NC_005043	AAG	2	6	32366	32371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
591	NC_005043	TACA	2	8	32489	32496	50 %	25 %	0 %	25 %	33241359
592	NC_005043	GTT	2	6	32519	32524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
593	NC_005043	TTTTTC	2	12	32595	32606	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33241359
594	NC_005043	TGA	2	6	32616	32621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241359
595	NC_005043	AAG	2	6	32670	32675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
596	NC_005043	T	6	6	32746	32751	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
597	NC_005043	TCA	2	6	32765	32770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241360
598	NC_005043	T	6	6	32944	32949	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
599	NC_005043	GA	3	6	32961	32966	50 %	0 %	50 %	0 %	33241360
600	NC_005043	T	8	8	32970	32977	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
601	NC_005043	GAT	2	6	33024	33029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
602	NC_005043	A	6	6	33097	33102	100 %	0 %	0 %	0 %	33241360
603	NC_005043	AGT	2	6	33111	33116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
604	NC_005043	CTT	2	6	33170	33175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
605	NC_005043	TAGG	2	8	33176	33183	25 %	25 %	50 %	0 %	33241360
606	NC_005043	ATG	2	6	33268	33273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
607	NC_005043	AGT	2	6	33373	33378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
608	NC_005043	AG	3	6	33404	33409	50 %	0 %	50 %	0 %	33241360
609	NC_005043	CTC	2	6	33525	33530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241360
610	NC_005043	TGCT	2	8	33534	33541	0 %	50 %	25 %	25 %	33241360
611	NC_005043	T	6	6	33541	33546	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
612	NC_005043	CTT	2	6	33566	33571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
613	NC_005043	GCT	3	9	33595	33603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241360
614	NC_005043	T	6	6	33637	33642	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
615	NC_005043	GTA	2	6	33648	33653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
616	NC_005043	CTT	2	6	33695	33700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
617	NC_005043	GAG	2	6	33707	33712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241360
618	NC_005043	GAA	2	6	33743	33748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241360
619	NC_005043	TTG	2	6	33756	33761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241360
620	NC_005043	TTC	2	6	33843	33848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
621	NC_005043	TTC	2	6	33891	33896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
622	NC_005043	ATGA	2	8	33906	33913	50 %	25 %	25 %	0 %	33241360
623	NC_005043	GAT	2	6	33923	33928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
624	NC_005043	TTC	2	6	33943	33948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
625	NC_005043	GGC	2	6	33966	33971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241360
626	NC_005043	GTC	2	6	34020	34025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241360
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628	NC_005043	GAG	2	6	34180	34185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241360
629	NC_005043	TGCTT	2	10	34190	34199	0 %	60 %	20 %	20 %	33241360
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631	NC_005043	GAA	2	6	34230	34235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241360
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