MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004704	GCCAC	2	10	3876	3885	20 %	0 %	20 %	60 %	29648120
2	NC_004704	ATTTT	2	10	4809	4818	20 %	80 %	0 %	0 %	29648120
3	NC_004704	TCTTA	2	10	12023	12032	20 %	60 %	0 %	20 %	29648122
4	NC_004704	TTAAC	2	10	16654	16663	40 %	40 %	0 %	20 %	29648127
5	NC_004704	TCGGC	2	10	20710	20719	0 %	20 %	40 %	40 %	29648133
6	NC_004704	TTTAA	2	10	23076	23085	40 %	60 %	0 %	0 %	29648135
7	NC_004704	CTTTT	2	10	25698	25707	0 %	80 %	0 %	20 %	29648139
8	NC_004704	GCAAT	2	10	28939	28948	40 %	20 %	20 %	20 %	29648143
9	NC_004704	ATGAT	2	10	28984	28993	40 %	40 %	20 %	0 %	29648143
10	NC_004704	TTAAT	2	10	29110	29119	40 %	60 %	0 %	0 %	29648143
11	NC_004704	ATCCC	2	10	29314	29323	20 %	20 %	0 %	60 %	29648143
12	NC_004704	ATCAA	2	10	29491	29500	60 %	20 %	0 %	20 %	29648143
13	NC_004704	ATAAA	2	10	29592	29601	80 %	20 %	0 %	0 %	29648143
14	NC_004704	TTACG	2	10	33292	33301	20 %	40 %	20 %	20 %	29648147
15	NC_004704	AAACA	2	10	34797	34806	80 %	0 %	0 %	20 %	29648148
16	NC_004704	GAATG	2	10	35308	35317	40 %	20 %	40 %	0 %	29648149
17	NC_004704	AGATT	2	10	35723	35732	40 %	40 %	20 %	0 %	29648149
18	NC_004704	ATAAA	2	10	36098	36107	80 %	20 %	0 %	0 %	29648149
19	NC_004704	TTGAA	2	10	36167	36176	40 %	40 %	20 %	0 %	29648149
20	NC_004704	GAGCT	2	10	36559	36568	20 %	20 %	40 %	20 %	29648150
21	NC_004704	TTGAT	2	10	36975	36984	20 %	60 %	20 %	0 %	29648150

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.