MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	TA	3	6	471	476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
2	NC_004565	AT	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
3	NC_004565	AT	4	8	694	701	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
4	NC_004565	AT	3	6	909	914	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
5	NC_004565	TA	3	6	1219	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
6	NC_004565	AG	3	6	1323	1328	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
7	NC_004565	AG	3	6	1722	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
8	NC_004565	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
9	NC_004565	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
10	NC_004565	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
11	NC_004565	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	28373136
12	NC_004565	AT	3	6	5027	5032	50 %	50 %	0 %	0 %	28373136
13	NC_004565	AT	3	6	5361	5366	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
14	NC_004565	AT	3	6	5392	5397	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
15	NC_004565	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	28373137
16	NC_004565	AT	3	6	6554	6559	50 %	50 %	0 %	0 %	28373138
17	NC_004565	TA	4	8	6601	6608	50 %	50 %	0 %	0 %	28373138
18	NC_004565	AT	4	8	7994	8001	50 %	50 %	0 %	0 %	28373139
19	NC_004565	AT	3	6	8471	8476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373140
20	NC_004565	TA	3	6	8586	8591	50 %	50 %	0 %	0 %	28373140
21	NC_004565	TA	3	6	9183	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	28373141
22	NC_004565	AT	3	6	10137	10142	50 %	50 %	0 %	0 %	28373142
23	NC_004565	TA	3	6	10972	10977	50 %	50 %	0 %	0 %	28373143
24	NC_004565	TA	3	6	11212	11217	50 %	50 %	0 %	0 %	28373143
25	NC_004565	TA	3	6	11390	11395	50 %	50 %	0 %	0 %	28373143
26	NC_004565	AT	3	6	11541	11546	50 %	50 %	0 %	0 %	28373143
27	NC_004565	TA	3	6	11780	11785	50 %	50 %	0 %	0 %	28373143
28	NC_004565	AT	4	8	11890	11897	50 %	50 %	0 %	0 %	28373144
29	NC_004565	TA	4	8	12896	12903	50 %	50 %	0 %	0 %	28373145
30	NC_004565	TA	3	6	13082	13087	50 %	50 %	0 %	0 %	28373145
31	NC_004565	AT	3	6	13584	13589	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
32	NC_004565	AT	3	6	13995	14000	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
33	NC_004565	AT	3	6	14282	14287	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
34	NC_004565	AT	3	6	14389	14394	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
35	NC_004565	AT	3	6	14396	14401	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
36	NC_004565	TA	3	6	14562	14567	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
37	NC_004565	AT	3	6	14689	14694	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
38	NC_004565	TA	3	6	15601	15606	50 %	50 %	0 %	0 %	28373146
39	NC_004565	AT	3	6	16748	16753	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
40	NC_004565	AT	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
41	NC_004565	AT	3	6	17460	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
42	NC_004565	TA	3	6	20473	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
43	NC_004565	TA	3	6	20578	20583	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
44	NC_004565	AT	3	6	20942	20947	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
45	NC_004565	TA	6	12	21009	21020	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
46	NC_004565	TA	3	6	21060	21065	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
47	NC_004565	TA	3	6	21406	21411	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
48	NC_004565	AT	3	6	21437	21442	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
49	NC_004565	TA	3	6	21645	21650	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
50	NC_004565	AT	3	6	21934	21939	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
51	NC_004565	AT	3	6	21941	21946	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
52	NC_004565	AT	3	6	22021	22026	50 %	50 %	0 %	0 %	28373150
53	NC_004565	AT	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	28373150
54	NC_004565	TA	3	6	22330	22335	50 %	50 %	0 %	0 %	28373150
55	NC_004565	AT	3	6	22769	22774	50 %	50 %	0 %	0 %	28373150
56	NC_004565	AT	4	8	23867	23874	50 %	50 %	0 %	0 %	28373151
57	NC_004565	TA	4	8	24539	24546	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
58	NC_004565	TA	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
59	NC_004565	AT	3	6	24660	24665	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
60	NC_004565	AT	3	6	24780	24785	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
61	NC_004565	TA	3	6	25373	25378	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
62	NC_004565	AT	3	6	25397	25402	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
63	NC_004565	TA	4	8	25453	25460	50 %	50 %	0 %	0 %	28373152
64	NC_004565	TA	3	6	26766	26771	50 %	50 %	0 %	0 %	28373154
65	NC_004565	TA	3	6	27583	27588	50 %	50 %	0 %	0 %	28373155
66	NC_004565	TA	3	6	27592	27597	50 %	50 %	0 %	0 %	28373155
67	NC_004565	TA	3	6	27915	27920	50 %	50 %	0 %	0 %	28373155
68	NC_004565	TA	3	6	28041	28046	50 %	50 %	0 %	0 %	28373155
69	NC_004565	TA	3	6	28404	28409	50 %	50 %	0 %	0 %	28373155
70	NC_004565	GT	3	6	28668	28673	0 %	50 %	50 %	0 %	28373155
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72	NC_004565	TA	3	6	29719	29724	50 %	50 %	0 %	0 %	28373156
73	NC_004565	AT	3	6	29805	29810	50 %	50 %	0 %	0 %	28373156
74	NC_004565	AT	3	6	30475	30480	50 %	50 %	0 %	0 %	28373157
75	NC_004565	AT	3	6	30668	30673	50 %	50 %	0 %	0 %	28373157
76	NC_004565	AT	3	6	30705	30710	50 %	50 %	0 %	0 %	28373157
77	NC_004565	AT	3	6	30825	30830	50 %	50 %	0 %	0 %	28373157
78	NC_004565	AT	4	8	32625	32632	50 %	50 %	0 %	0 %	28373158
79	NC_004565	AT	3	6	33455	33460	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
80	NC_004565	TA	3	6	33468	33473	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
81	NC_004565	AT	3	6	33484	33489	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
82	NC_004565	TA	3	6	33776	33781	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
83	NC_004565	TA	4	8	34277	34284	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
84	NC_004565	TA	3	6	34573	34578	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
85	NC_004565	AT	3	6	34828	34833	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
86	NC_004565	TA	3	6	35670	35675	50 %	50 %	0 %	0 %	28373160
87	NC_004565	AT	3	6	35707	35712	50 %	50 %	0 %	0 %	28373160
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90	NC_004565	AT	3	6	40146	40151	50 %	50 %	0 %	0 %	28373190
91	NC_004565	AT	4	8	41098	41105	50 %	50 %	0 %	0 %	28373190
92	NC_004565	AT	3	6	41186	41191	50 %	50 %	0 %	0 %	28373190
93	NC_004565	TA	3	6	41738	41743	50 %	50 %	0 %	0 %	28373190
94	NC_004565	TA	3	6	43127	43132	50 %	50 %	0 %	0 %	28373162
95	NC_004565	AT	3	6	43193	43198	50 %	50 %	0 %	0 %	28373162
96	NC_004565	TA	4	8	43306	43313	50 %	50 %	0 %	0 %	28373162
97	NC_004565	AT	3	6	43518	43523	50 %	50 %	0 %	0 %	28373162
98	NC_004565	TA	3	6	43621	43626	50 %	50 %	0 %	0 %	28373163
99	NC_004565	AT	3	6	43724	43729	50 %	50 %	0 %	0 %	28373163
100	NC_004565	AT	3	6	43769	43774	50 %	50 %	0 %	0 %	28373163
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102	NC_004565	AT	3	6	44025	44030	50 %	50 %	0 %	0 %	28373163
103	NC_004565	TA	3	6	44174	44179	50 %	50 %	0 %	0 %	28373163
104	NC_004565	AT	3	6	44471	44476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373164
105	NC_004565	AT	4	8	44539	44546	50 %	50 %	0 %	0 %	28373164
106	NC_004565	AT	3	6	44588	44593	50 %	50 %	0 %	0 %	28373164
107	NC_004565	TA	3	6	44741	44746	50 %	50 %	0 %	0 %	28373164
108	NC_004565	AT	3	6	44887	44892	50 %	50 %	0 %	0 %	28373164
109	NC_004565	GA	3	6	45177	45182	50 %	0 %	50 %	0 %	28373164
110	NC_004565	AT	4	8	45271	45278	50 %	50 %	0 %	0 %	28373165
111	NC_004565	AG	3	6	45690	45695	50 %	0 %	50 %	0 %	28373165
112	NC_004565	AT	3	6	45805	45810	50 %	50 %	0 %	0 %	28373165
113	NC_004565	AT	3	6	46661	46666	50 %	50 %	0 %	0 %	28373166
114	NC_004565	AT	3	6	46769	46774	50 %	50 %	0 %	0 %	28373166
115	NC_004565	AT	3	6	46778	46783	50 %	50 %	0 %	0 %	28373166
116	NC_004565	TA	4	8	46856	46863	50 %	50 %	0 %	0 %	28373166
117	NC_004565	AT	3	6	48398	48403	50 %	50 %	0 %	0 %	28373168
118	NC_004565	CA	3	6	48929	48934	50 %	0 %	0 %	50 %	28373169
119	NC_004565	AT	3	6	49183	49188	50 %	50 %	0 %	0 %	28373169
120	NC_004565	TA	3	6	49443	49448	50 %	50 %	0 %	0 %	28373170
121	NC_004565	AT	3	6	49667	49672	50 %	50 %	0 %	0 %	28373170
122	NC_004565	AT	4	8	49838	49845	50 %	50 %	0 %	0 %	28373170
123	NC_004565	AT	3	6	50003	50008	50 %	50 %	0 %	0 %	28373170
124	NC_004565	TA	3	6	50055	50060	50 %	50 %	0 %	0 %	28373170
125	NC_004565	AT	3	6	50482	50487	50 %	50 %	0 %	0 %	28373171
126	NC_004565	AT	3	6	50626	50631	50 %	50 %	0 %	0 %	28373171
127	NC_004565	AT	4	8	50764	50771	50 %	50 %	0 %	0 %	28373171
128	NC_004565	AT	3	6	51021	51026	50 %	50 %	0 %	0 %	28373172
129	NC_004565	AT	3	6	51793	51798	50 %	50 %	0 %	0 %	28373172
130	NC_004565	TA	3	6	52374	52379	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
131	NC_004565	AT	3	6	52490	52495	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
132	NC_004565	AT	4	8	52597	52604	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
133	NC_004565	TA	3	6	52671	52676	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
134	NC_004565	AT	3	6	52812	52817	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
135	NC_004565	TA	3	6	53122	53127	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
136	NC_004565	AG	3	6	53226	53231	50 %	0 %	50 %	0 %	28373173
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138	NC_004565	AT	3	6	53338	53343	50 %	50 %	0 %	0 %	28373173
139	NC_004565	TA	4	8	55009	55016	50 %	50 %	0 %	0 %	28373174
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141	NC_004565	AT	3	6	56410	56415	50 %	50 %	0 %	0 %	28373175
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144	NC_004565	GT	3	6	56963	56968	0 %	50 %	50 %	0 %	28373176
145	NC_004565	AT	3	6	57158	57163	50 %	50 %	0 %	0 %	28373176
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.