MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 2462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TCTAT	2	10	305	314	20 %	60 %	0 %	20 %	28209835
2	NC_004557	ATTTT	2	10	1100	1109	20 %	80 %	0 %	0 %	28209835
3	NC_004557	TAAAT	2	10	2672	2681	60 %	40 %	0 %	0 %	28209836
4	NC_004557	ATGAT	2	10	3028	3037	40 %	40 %	20 %	0 %	28209836
5	NC_004557	AACAG	2	10	3842	3851	60 %	0 %	20 %	20 %	28209836
6	NC_004557	TAAAA	2	10	4209	4218	80 %	20 %	0 %	0 %	28209837
7	NC_004557	CGCTT	2	10	6578	6587	0 %	40 %	20 %	40 %	28209839
8	NC_004557	CTAAA	2	10	11063	11072	60 %	20 %	0 %	20 %	28209840
9	NC_004557	ATAGT	2	10	12959	12968	40 %	40 %	20 %	0 %	28209841
10	NC_004557	TTTTA	2	10	12969	12978	20 %	80 %	0 %	0 %	28209841
11	NC_004557	CACAT	2	10	15494	15503	40 %	20 %	0 %	40 %	28209844
12	NC_004557	TCTAA	2	10	17073	17082	40 %	40 %	0 %	20 %	28209845
13	NC_004557	ATATA	2	10	18013	18022	60 %	40 %	0 %	0 %	28209846
14	NC_004557	TCTTT	2	10	18813	18822	0 %	80 %	0 %	20 %	28209846
15	NC_004557	TTTCT	2	10	20795	20804	0 %	80 %	0 %	20 %	28209847
16	NC_004557	ATTAT	2	10	22251	22260	40 %	60 %	0 %	0 %	28209849
17	NC_004557	GATAT	2	10	26841	26850	40 %	40 %	20 %	0 %	28209852
18	NC_004557	AAAAT	2	10	27346	27355	80 %	20 %	0 %	0 %	28209853
19	NC_004557	TTTCA	2	10	29727	29736	20 %	60 %	0 %	20 %	28209854
20	NC_004557	CTTCT	2	10	30978	30987	0 %	60 %	0 %	40 %	28209856
21	NC_004557	AATTT	2	10	32846	32855	40 %	60 %	0 %	0 %	28209857
22	NC_004557	ACATT	2	10	32858	32867	40 %	40 %	0 %	20 %	28209857
23	NC_004557	AGTTA	2	10	33837	33846	40 %	40 %	20 %	0 %	28209857
24	NC_004557	ATTTT	2	10	33979	33988	20 %	80 %	0 %	0 %	28209857
25	NC_004557	AATTT	2	10	34060	34069	40 %	60 %	0 %	0 %	28209857
26	NC_004557	ATAAA	2	10	34193	34202	80 %	20 %	0 %	0 %	28209857
27	NC_004557	TTTAC	2	10	35792	35801	20 %	60 %	0 %	20 %	28209858
28	NC_004557	TATAT	2	10	36136	36145	40 %	60 %	0 %	0 %	28209858
29	NC_004557	ATACA	2	10	36783	36792	60 %	20 %	0 %	20 %	28209858
30	NC_004557	TTATT	2	10	37111	37120	20 %	80 %	0 %	0 %	28209859
31	NC_004557	TAGTA	2	10	37180	37189	40 %	40 %	20 %	0 %	28209859
32	NC_004557	TTAAT	2	10	37636	37645	40 %	60 %	0 %	0 %	28209860
33	NC_004557	TTAAG	2	10	38105	38114	40 %	40 %	20 %	0 %	28209860
34	NC_004557	CGCTT	2	10	39664	39673	0 %	40 %	20 %	40 %	28209861
35	NC_004557	GCTTT	2	10	45367	45376	0 %	60 %	20 %	20 %	28209862
36	NC_004557	GGTAA	2	10	45385	45394	40 %	20 %	40 %	0 %	28209862
37	NC_004557	TTTTA	2	10	45539	45548	20 %	80 %	0 %	0 %	28209862
38	NC_004557	AATAT	2	10	46027	46036	60 %	40 %	0 %	0 %	28209862
39	NC_004557	GTTTT	2	10	47088	47097	0 %	80 %	20 %	0 %	28209863
40	NC_004557	ACAAA	2	10	47424	47433	80 %	0 %	0 %	20 %	28209863
41	NC_004557	TCAAT	2	10	49108	49117	40 %	40 %	0 %	20 %	28209864
42	NC_004557	ACTAT	2	10	50096	50105	40 %	40 %	0 %	20 %	28209865
43	NC_004557	ATTTT	2	10	51644	51653	20 %	80 %	0 %	0 %	161486853
44	NC_004557	TATAT	2	10	52359	52368	40 %	60 %	0 %	0 %	161486853
45	NC_004557	AATAT	2	10	54104	54113	60 %	40 %	0 %	0 %	28209867
46	NC_004557	TAATT	2	10	54637	54646	40 %	60 %	0 %	0 %	28209868
47	NC_004557	AAGAG	2	10	54937	54946	60 %	0 %	40 %	0 %	28209868
48	NC_004557	GTAAA	2	10	56982	56991	60 %	20 %	20 %	0 %	28209870
49	NC_004557	TAGAA	2	10	58324	58333	60 %	20 %	20 %	0 %	28209870
50	NC_004557	GCAGA	2	10	58854	58863	40 %	0 %	40 %	20 %	28209871
51	NC_004557	AAATA	2	10	59716	59725	80 %	20 %	0 %	0 %	28209872
52	NC_004557	AAGAA	2	10	59942	59951	80 %	0 %	20 %	0 %	28209872
53	NC_004557	TAGCT	2	10	60349	60358	20 %	40 %	20 %	20 %	28209873
54	NC_004557	ATTAT	2	10	61929	61938	40 %	60 %	0 %	0 %	28209875
55	NC_004557	TAAAG	2	10	63544	63553	60 %	20 %	20 %	0 %	28209877
56	NC_004557	AAGTA	2	10	63824	63833	60 %	20 %	20 %	0 %	28209877
57	NC_004557	AGTGC	2	10	68075	68084	20 %	20 %	40 %	20 %	28209882
58	NC_004557	GATAA	2	10	69212	69221	60 %	20 %	20 %	0 %	28209882
59	NC_004557	TTTTA	2	10	69557	69566	20 %	80 %	0 %	0 %	28209882
60	NC_004557	AAATT	2	10	70397	70406	60 %	40 %	0 %	0 %	28209883
61	NC_004557	TAAAA	2	10	75652	75661	80 %	20 %	0 %	0 %	28209887
62	NC_004557	ATAAA	2	10	77369	77378	80 %	20 %	0 %	0 %	28209889
63	NC_004557	CTATT	2	10	80727	80736	20 %	60 %	0 %	20 %	28209891
64	NC_004557	ATAAA	2	10	85891	85900	80 %	20 %	0 %	0 %	28209896
65	NC_004557	TAGCA	2	10	86780	86789	40 %	20 %	20 %	20 %	28209898
66	NC_004557	GATTA	2	10	87708	87717	40 %	40 %	20 %	0 %	28209899
67	NC_004557	ATAAA	2	10	89329	89338	80 %	20 %	0 %	0 %	28209900
68	NC_004557	AAATA	2	10	91498	91507	80 %	20 %	0 %	0 %	28209902
69	NC_004557	AAGAA	2	10	91732	91741	80 %	0 %	20 %	0 %	28209903
70	NC_004557	ATGGA	2	10	92004	92013	40 %	20 %	40 %	0 %	28209903
71	NC_004557	TTAAG	2	10	92407	92416	40 %	40 %	20 %	0 %	28209904
72	NC_004557	TAATA	2	10	95465	95474	60 %	40 %	0 %	0 %	28209906
73	NC_004557	TAAAA	2	10	96034	96043	80 %	20 %	0 %	0 %	28209907
74	NC_004557	ACATA	2	10	96560	96569	60 %	20 %	0 %	20 %	28209908
75	NC_004557	TATAA	2	10	96799	96808	60 %	40 %	0 %	0 %	28209908
76	NC_004557	TCTAG	2	10	97185	97194	20 %	40 %	20 %	20 %	28209909
77	NC_004557	TTTTA	2	10	98750	98759	20 %	80 %	0 %	0 %	28209910
78	NC_004557	TTCTT	2	10	101894	101903	0 %	80 %	0 %	20 %	28209914
79	NC_004557	TGAAG	2	10	102041	102050	40 %	20 %	40 %	0 %	28209914
80	NC_004557	TAGTG	2	10	104891	104900	20 %	40 %	40 %	0 %	28209918
81	NC_004557	AATAT	2	10	105270	105279	60 %	40 %	0 %	0 %	28209918
82	NC_004557	TTATA	2	10	106153	106162	40 %	60 %	0 %	0 %	28209919
83	NC_004557	CTTTT	2	10	106172	106181	0 %	80 %	0 %	20 %	28209919
84	NC_004557	AAAGA	2	10	107793	107802	80 %	0 %	20 %	0 %	28209921
85	NC_004557	AATTT	2	10	109668	109677	40 %	60 %	0 %	0 %	28209923
86	NC_004557	AAAGA	2	10	112195	112204	80 %	0 %	20 %	0 %	28209925
87	NC_004557	CTTCT	2	10	113316	113325	0 %	60 %	0 %	40 %	28209926
88	NC_004557	AAAAT	2	10	115279	115288	80 %	20 %	0 %	0 %	28209929
89	NC_004557	TAATA	2	10	117162	117171	60 %	40 %	0 %	0 %	28209931
90	NC_004557	ATAAC	2	10	117576	117585	60 %	20 %	0 %	20 %	28209932
91	NC_004557	TAATC	2	10	117640	117649	40 %	40 %	0 %	20 %	28209932
92	NC_004557	TGGTA	2	10	120499	120508	20 %	40 %	40 %	0 %	28209934
93	NC_004557	ATTTT	2	10	121438	121447	20 %	80 %	0 %	0 %	28209936
94	NC_004557	TCTTT	2	10	121489	121498	0 %	80 %	0 %	20 %	28209936
95	NC_004557	GGCAA	2	10	123013	123022	40 %	0 %	40 %	20 %	28209938
96	NC_004557	AACAT	2	10	124187	124196	60 %	20 %	0 %	20 %	28209939
97	NC_004557	ATTTA	2	10	124462	124471	40 %	60 %	0 %	0 %	28209939
98	NC_004557	TGTTC	2	10	127095	127104	0 %	60 %	20 %	20 %	28209941
99	NC_004557	TAAAA	2	10	128234	128243	80 %	20 %	0 %	0 %	28209942
100	NC_004557	GAGTA	2	10	128260	128269	40 %	20 %	40 %	0 %	28209943
101	NC_004557	ATGAA	2	10	129970	129979	60 %	20 %	20 %	0 %	28209944
102	NC_004557	TAGTA	2	10	130316	130325	40 %	40 %	20 %	0 %	28209944
103	NC_004557	TAAAA	2	10	131330	131339	80 %	20 %	0 %	0 %	28209945
104	NC_004557	ACATA	2	10	131856	131865	60 %	20 %	0 %	20 %	28209946
105	NC_004557	TATAA	2	10	132095	132104	60 %	40 %	0 %	0 %	28209946
106	NC_004557	TTAAA	2	10	133096	133105	60 %	40 %	0 %	0 %	28209947
107	NC_004557	AAATG	2	10	134768	134777	60 %	20 %	20 %	0 %	28209949
108	NC_004557	TAAAT	2	10	137581	137590	60 %	40 %	0 %	0 %	28209952
109	NC_004557	ACAGG	2	10	138851	138860	40 %	0 %	40 %	20 %	28209953
110	NC_004557	AAATT	3	15	139615	139629	60 %	40 %	0 %	0 %	28209954
111	NC_004557	AATAA	2	10	141141	141150	80 %	20 %	0 %	0 %	28209955
112	NC_004557	AAGAC	2	10	144584	144593	60 %	0 %	20 %	20 %	28209957
113	NC_004557	TAAAT	2	10	144998	145007	60 %	40 %	0 %	0 %	28209958
114	NC_004557	AGGAA	2	10	148527	148536	60 %	0 %	40 %	0 %	28209961
115	NC_004557	TAGAA	2	10	149665	149674	60 %	20 %	20 %	0 %	28209962
116	NC_004557	CAAGG	2	10	150117	150126	40 %	0 %	40 %	20 %	28209962
117	NC_004557	CAGCA	2	10	151239	151248	40 %	0 %	20 %	40 %	28209962
118	NC_004557	AGAAA	2	10	153139	153148	80 %	0 %	20 %	0 %	28209963
119	NC_004557	TTTTA	2	10	154055	154064	20 %	80 %	0 %	0 %	28209965
120	NC_004557	AATAT	2	10	155307	155316	60 %	40 %	0 %	0 %	28209965
121	NC_004557	GATAA	2	10	156596	156605	60 %	20 %	20 %	0 %	28209966
122	NC_004557	AAAAT	2	10	157013	157022	80 %	20 %	0 %	0 %	28209966
123	NC_004557	TAAAG	2	10	159119	159128	60 %	20 %	20 %	0 %	28209968
124	NC_004557	AGTAG	2	10	160320	160329	40 %	20 %	40 %	0 %	28209969
125	NC_004557	ATTAT	3	15	160664	160678	40 %	60 %	0 %	0 %	28209969
126	NC_004557	AAAAC	2	10	160710	160719	80 %	0 %	0 %	20 %	28209969
127	NC_004557	TAAAG	2	10	161195	161204	60 %	20 %	20 %	0 %	28209969
128	NC_004557	ATTAT	2	10	161524	161533	40 %	60 %	0 %	0 %	28209969
129	NC_004557	AGCAG	2	10	161579	161588	40 %	0 %	40 %	20 %	28209969
130	NC_004557	AATAA	2	10	161694	161703	80 %	20 %	0 %	0 %	28209969
131	NC_004557	ATACA	2	10	162689	162698	60 %	20 %	0 %	20 %	28209970
132	NC_004557	GATAA	2	10	162724	162733	60 %	20 %	20 %	0 %	28209970
133	NC_004557	GAAAT	2	10	163955	163964	60 %	20 %	20 %	0 %	28209970
134	NC_004557	GAAAA	2	10	165919	165928	80 %	0 %	20 %	0 %	28209972
135	NC_004557	CTAGA	2	10	167994	168003	40 %	20 %	20 %	20 %	28209975
136	NC_004557	ATATA	2	10	169013	169022	60 %	40 %	0 %	0 %	28209976
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138	NC_004557	ATATA	2	10	169161	169170	60 %	40 %	0 %	0 %	28209976
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