MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004552	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184648
2	NC_004552	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184648
3	NC_004552	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184648
4	NC_004552	T	7	7	255	261	0 %	100 %	0 %	0 %	62184648
5	NC_004552	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	62184648
6	NC_004552	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	62184648
7	NC_004552	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	62184648
8	NC_004552	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184648
9	NC_004552	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	62184648
10	NC_004552	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	62184648
11	NC_004552	ACC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184648
12	NC_004552	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184648
13	NC_004552	TTG	2	6	554	559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184648
14	NC_004552	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184648
15	NC_004552	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184648
16	NC_004552	TTCT	2	8	725	732	0 %	75 %	0 %	25 %	62184648
17	NC_004552	ATC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184648
18	NC_004552	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184648
19	NC_004552	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184648
20	NC_004552	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184648
21	NC_004552	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184648
22	NC_004552	CGG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184649
23	NC_004552	ATT	2	6	1232	1237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184649
24	NC_004552	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	62184649
25	NC_004552	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
26	NC_004552	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	62184649
27	NC_004552	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184649
28	NC_004552	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
29	NC_004552	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	62184649
30	NC_004552	AGGT	2	8	1487	1494	25 %	25 %	50 %	0 %	62184649
31	NC_004552	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184649
32	NC_004552	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	62184649
33	NC_004552	TCT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
34	NC_004552	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184649
35	NC_004552	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
36	NC_004552	AGG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184649
37	NC_004552	ACT	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184649
38	NC_004552	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
39	NC_004552	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	62184649
40	NC_004552	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
41	NC_004552	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
42	NC_004552	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184649
43	NC_004552	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
44	NC_004552	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184649
45	NC_004552	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184649
46	NC_004552	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184649
47	NC_004552	T	7	7	2289	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	62184649
48	NC_004552	AG	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	62184649
49	NC_004552	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184649
50	NC_004552	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184649
51	NC_004552	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	62184649
52	NC_004552	T	8	8	2616	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
53	NC_004552	T	8	8	2628	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
54	NC_004552	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
55	NC_004552	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184650
56	NC_004552	TCACT	2	10	2701	2710	20 %	40 %	0 %	40 %	62184650
57	NC_004552	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
58	NC_004552	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184650
59	NC_004552	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	62184650
60	NC_004552	ATT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
61	NC_004552	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	62184650
62	NC_004552	T	6	6	2884	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
63	NC_004552	T	6	6	2896	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
64	NC_004552	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184650
65	NC_004552	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	62184650
66	NC_004552	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
67	NC_004552	AGTA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	62184650
68	NC_004552	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184650
69	NC_004552	T	6	6	3010	3015	0 %	100 %	0 %	0 %	62184650
70	NC_004552	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
71	NC_004552	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	62184651
72	NC_004552	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	62184651
73	NC_004552	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
74	NC_004552	GTT	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184651
75	NC_004552	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
76	NC_004552	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
77	NC_004552	TTC	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
78	NC_004552	TGA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
79	NC_004552	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184651
80	NC_004552	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184651
81	NC_004552	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184651
82	NC_004552	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
83	NC_004552	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	62184651
84	NC_004552	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184651
85	NC_004552	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
86	NC_004552	GCC	2	6	4284	4289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184651
87	NC_004552	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
88	NC_004552	AG	3	6	4386	4391	50 %	0 %	50 %	0 %	62184651
89	NC_004552	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	62184651
90	NC_004552	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184651
91	NC_004552	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184651
92	NC_004552	GTTCG	2	10	4511	4520	0 %	40 %	40 %	20 %	62184651
93	NC_004552	GGC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184651
94	NC_004552	CGC	2	6	4612	4617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184651
95	NC_004552	GA	3	6	4655	4660	50 %	0 %	50 %	0 %	62184651
96	NC_004552	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
97	NC_004552	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
98	NC_004552	ACA	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184651
99	NC_004552	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184651
100	NC_004552	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
101	NC_004552	GAA	2	6	5031	5036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
102	NC_004552	GTTG	2	8	5091	5098	0 %	50 %	50 %	0 %	62184651
103	NC_004552	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184651
104	NC_004552	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	62184651
105	NC_004552	T	7	7	5455	5461	0 %	100 %	0 %	0 %	62184652
106	NC_004552	AGA	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
107	NC_004552	CGAG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	50 %	25 %	62184652
108	NC_004552	TGG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184652
109	NC_004552	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
110	NC_004552	TGT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
111	NC_004552	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184652
112	NC_004552	CAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184652
113	NC_004552	TTA	2	6	5890	5895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184652
114	NC_004552	TGA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
115	NC_004552	GAT	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
116	NC_004552	TGT	3	9	5981	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
117	NC_004552	TGA	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
118	NC_004552	CTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184652
119	NC_004552	T	7	7	6070	6076	0 %	100 %	0 %	0 %	62184652
120	NC_004552	GAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
121	NC_004552	TGC	2	6	6220	6225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184652
122	NC_004552	GTT	2	6	6236	6241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
123	NC_004552	GAT	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184652
124	NC_004552	GAA	2	6	6272	6277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184652
125	NC_004552	A	6	6	6276	6281	100 %	0 %	0 %	0 %	62184652
126	NC_004552	GAG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184652
127	NC_004552	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184652
128	NC_004552	ACC	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184652
129	NC_004552	GTT	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184652
130	NC_004552	A	6	6	6402	6407	100 %	0 %	0 %	0 %	62184652
131	NC_004552	CACG	2	8	6408	6415	25 %	0 %	25 %	50 %	62184652
132	NC_004552	T	6	6	6482	6487	0 %	100 %	0 %	0 %	62184652
133	NC_004552	ATA	2	6	6588	6593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184652
134	NC_004552	CAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184652
135	NC_004552	GAAAAC	2	12	6858	6869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	62184653
136	NC_004552	GAA	2	6	6901	6906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184653
137	NC_004552	GAC	2	6	6921	6926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184653
138	NC_004552	T	6	6	6935	6940	0 %	100 %	0 %	0 %	62184653
139	NC_004552	A	6	6	6954	6959	100 %	0 %	0 %	0 %	62184653
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148	NC_004552	A	7	7	7325	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	62184653
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174	NC_004552	TA	3	6	8646	8651	50 %	50 %	0 %	0 %	62184654
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176	NC_004552	T	6	6	8721	8726	0 %	100 %	0 %	0 %	62184654
177	NC_004552	TAGT	2	8	8769	8776	25 %	50 %	25 %	0 %	62184654
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180	NC_004552	T	6	6	8831	8836	0 %	100 %	0 %	0 %	62184654
181	NC_004552	TACA	2	8	8852	8859	50 %	25 %	0 %	25 %	62184654
182	NC_004552	GAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184654
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261	NC_004552	ACTT	2	8	12690	12697	25 %	50 %	0 %	25 %	62184655
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263	NC_004552	TGT	2	6	12748	12753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184655
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265	NC_004552	AG	3	6	12795	12800	50 %	0 %	50 %	0 %	62184655
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267	NC_004552	AAG	2	6	12861	12866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184655
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270	NC_004552	G	6	6	12983	12988	0 %	0 %	100 %	0 %	62184655
271	NC_004552	ATAAA	2	10	13034	13043	80 %	20 %	0 %	0 %	62184655
272	NC_004552	TTC	2	6	13047	13052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184655
273	NC_004552	AAT	2	6	13072	13077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184655
274	NC_004552	CTT	2	6	13097	13102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184655
275	NC_004552	CT	3	6	13107	13112	0 %	50 %	0 %	50 %	62184655
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393	NC_004552	GTA	2	6	19736	19741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184660
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397	NC_004552	TAC	2	6	20073	20078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184660
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399	NC_004552	T	6	6	20151	20156	0 %	100 %	0 %	0 %	62184660
400	NC_004552	T	6	6	20181	20186	0 %	100 %	0 %	0 %	62184660
401	NC_004552	AGA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184660
402	NC_004552	A	6	6	20417	20422	100 %	0 %	0 %	0 %	62184661
403	NC_004552	TGGT	2	8	20435	20442	0 %	50 %	50 %	0 %	62184661
404	NC_004552	GAAC	2	8	20505	20512	50 %	0 %	25 %	25 %	62184661
405	NC_004552	TGA	2	6	20526	20531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184661
406	NC_004552	GAG	3	9	20589	20597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184661
407	NC_004552	CCT	2	6	20660	20665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184661
408	NC_004552	TGTA	2	8	20724	20731	25 %	50 %	25 %	0 %	62184661
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500	NC_004552	GCA	2	6	25495	25500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663

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