MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004552	T	6	6	220226	220231	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4002	NC_004552	CAC	2	6	220246	220251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4003	NC_004552	GTT	2	6	220262	220267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4004	NC_004552	T	6	6	220266	220271	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4005	NC_004552	CTT	2	6	220315	220320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4006	NC_004552	TGC	2	6	220328	220333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4007	NC_004552	CTG	3	9	220339	220347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4008	NC_004552	GC	3	6	220348	220353	0 %	0 %	50 %	50 %	62184844
4009	NC_004552	GTA	2	6	220356	220361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4010	NC_004552	AC	3	6	220441	220446	50 %	0 %	0 %	50 %	62184844
4011	NC_004552	CCA	2	6	220449	220454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4012	NC_004552	TTC	2	6	220457	220462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4013	NC_004552	TTG	2	6	220467	220472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4014	NC_004552	AGA	2	6	220520	220525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184844
4015	NC_004552	AT	3	6	220569	220574	50 %	50 %	0 %	0 %	62184844
4016	NC_004552	CCA	3	9	220578	220586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4017	NC_004552	TTG	2	6	220602	220607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4018	NC_004552	TAAGG	2	10	220634	220643	40 %	20 %	40 %	0 %	62184844
4019	NC_004552	CCA	2	6	220671	220676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4020	NC_004552	TTC	2	6	220679	220684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4021	NC_004552	TTG	2	6	220689	220694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4022	NC_004552	T	7	7	220766	220772	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4023	NC_004552	GTA	2	6	220782	220787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4024	NC_004552	CAC	3	9	220837	220845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4025	NC_004552	GA	3	6	220894	220899	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4026	NC_004552	ACC	2	6	220925	220930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4027	NC_004552	AGG	2	6	220943	220948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4028	NC_004552	TTC	2	6	220973	220978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4029	NC_004552	CTT	2	6	221011	221016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4030	NC_004552	GA	3	6	221077	221082	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4031	NC_004552	ATAG	2	8	221111	221118	50 %	25 %	25 %	0 %	62184844
4032	NC_004552	CCA	2	6	221121	221126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4033	NC_004552	TG	3	6	221154	221159	0 %	50 %	50 %	0 %	62184844
4034	NC_004552	TTGTA	2	10	221174	221183	20 %	60 %	20 %	0 %	62184844
4035	NC_004552	AATGGT	2	12	221348	221359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4036	NC_004552	AGG	2	6	221399	221404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4037	NC_004552	ATG	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4038	NC_004552	T	6	6	221480	221485	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4039	NC_004552	AAT	2	6	221516	221521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184844
4040	NC_004552	CT	3	6	221655	221660	0 %	50 %	0 %	50 %	62184844
4041	NC_004552	GA	3	6	221683	221688	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4042	NC_004552	AGG	2	6	221723	221728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4043	NC_004552	ACC	2	6	221735	221740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4044	NC_004552	CTCCAG	2	12	221743	221754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	62184844
4045	NC_004552	TAAA	2	8	221863	221870	75 %	25 %	0 %	0 %	62184844
4046	NC_004552	CAC	2	6	221872	221877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4047	NC_004552	TTG	2	6	221882	221887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4048	NC_004552	ATC	2	6	221894	221899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4049	NC_004552	TA	3	6	221949	221954	50 %	50 %	0 %	0 %	62184844
4050	NC_004552	CCT	3	9	222060	222068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184844
4051	NC_004552	AGTAGA	2	12	222080	222091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4052	NC_004552	TGT	2	6	222098	222103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4053	NC_004552	GAAGAT	2	12	222123	222134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4054	NC_004552	ATG	2	6	222223	222228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4055	NC_004552	ATC	2	6	222239	222244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4056	NC_004552	GGCTT	2	10	222304	222313	0 %	40 %	40 %	20 %	62184844
4057	NC_004552	TGT	2	6	222458	222463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4058	NC_004552	TGC	2	6	222483	222488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4059	NC_004552	GCA	2	6	222597	222602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4060	NC_004552	ACC	2	6	222851	222856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4061	NC_004552	TGG	2	6	222895	222900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184845
4062	NC_004552	GGT	2	6	222938	222943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184845
4063	NC_004552	CTT	2	6	222964	222969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4064	NC_004552	TCT	2	6	223038	223043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4065	NC_004552	GAA	2	6	223103	223108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4066	NC_004552	AG	3	6	223119	223124	50 %	0 %	50 %	0 %	62184845
4067	NC_004552	GAA	2	6	223158	223163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4068	NC_004552	TCA	2	6	223357	223362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184845
4069	NC_004552	TTC	2	6	223370	223375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4070	NC_004552	GCC	2	6	223425	223430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184845
4071	NC_004552	ACC	2	6	223518	223523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4072	NC_004552	ACA	2	6	223623	223628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184845
4073	NC_004552	CCA	2	6	223629	223634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4074	NC_004552	TTA	2	6	223668	223673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184845
4075	NC_004552	AGT	2	6	223678	223683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184845
4076	NC_004552	CAT	2	6	223696	223701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184845
4077	NC_004552	CG	3	6	223706	223711	0 %	0 %	50 %	50 %	62184845
4078	NC_004552	AGA	2	6	223736	223741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4079	NC_004552	CCTT	2	8	223755	223762	0 %	50 %	0 %	50 %	62184845
4080	NC_004552	AACG	2	8	223775	223782	50 %	0 %	25 %	25 %	62184845
4081	NC_004552	T	7	7	223820	223826	0 %	100 %	0 %	0 %	62184845
4082	NC_004552	TGT	2	6	223881	223886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184845
4083	NC_004552	TTC	2	6	223895	223900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4084	NC_004552	AT	3	6	223993	223998	50 %	50 %	0 %	0 %	62184845
4085	NC_004552	CAG	2	6	224062	224067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184845
4086	NC_004552	TGT	2	6	224134	224139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184845
4087	NC_004552	CCA	2	6	224178	224183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4088	NC_004552	GGTT	2	8	224256	224263	0 %	50 %	50 %	0 %	62184845
4089	NC_004552	TTA	2	6	224277	224282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184845
4090	NC_004552	AAT	2	6	224414	224419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184845
4091	NC_004552	ATT	2	6	224480	224485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184845
4092	NC_004552	TAAA	2	8	224588	224595	75 %	25 %	0 %	0 %	62184845
4093	NC_004552	CAC	2	6	224599	224604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4094	NC_004552	ATT	2	6	224729	224734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184845
4095	NC_004552	AGT	2	6	224773	224778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184845
4096	NC_004552	T	6	6	224787	224792	0 %	100 %	0 %	0 %	62184845
4097	NC_004552	CCA	3	9	224937	224945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4098	NC_004552	TAG	2	6	224998	225003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184845
4099	NC_004552	CCA	2	6	225030	225035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4100	NC_004552	TAC	2	6	225059	225064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184845
4101	NC_004552	TTGG	2	8	225124	225131	0 %	50 %	50 %	0 %	62184845
4102	NC_004552	CTC	2	6	225151	225156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184845
4103	NC_004552	CTC	2	6	225235	225240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184845
4104	NC_004552	CAG	2	6	225290	225295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184845
4105	NC_004552	CTC	2	6	225409	225414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184845
4106	NC_004552	CAC	2	6	225460	225465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4107	NC_004552	GT	3	6	225469	225474	0 %	50 %	50 %	0 %	62184845
4108	NC_004552	AAT	2	6	225510	225515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184845
4109	NC_004552	GTAT	2	8	225531	225538	25 %	50 %	25 %	0 %	62184845
4110	NC_004552	GAA	2	6	225550	225555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4111	NC_004552	GTG	2	6	225583	225588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184845
4112	NC_004552	GAA	2	6	225594	225599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4113	NC_004552	TTC	2	6	225867	225872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184846
4114	NC_004552	TTAG	2	8	225904	225911	25 %	50 %	25 %	0 %	62184846
4115	NC_004552	TTTG	2	8	225928	225935	0 %	75 %	25 %	0 %	62184846
4116	NC_004552	T	6	6	225987	225992	0 %	100 %	0 %	0 %	62184846
4117	NC_004552	T	7	7	226020	226026	0 %	100 %	0 %	0 %	62184846
4118	NC_004552	GCCAAC	2	12	226106	226117	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	62184846
4119	NC_004552	T	6	6	226188	226193	0 %	100 %	0 %	0 %	62184847
4120	NC_004552	TTACGT	2	12	226318	226329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	62184847
4121	NC_004552	AACC	2	8	226330	226337	50 %	0 %	0 %	50 %	62184847
4122	NC_004552	TAA	2	6	226359	226364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184847
4123	NC_004552	TCG	2	6	226397	226402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184847
4124	NC_004552	ACA	2	6	226497	226502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184847
4125	NC_004552	CAA	2	6	226859	226864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184848
4126	NC_004552	GA	3	6	226878	226883	50 %	0 %	50 %	0 %	62184848
4127	NC_004552	T	6	6	226964	226969	0 %	100 %	0 %	0 %	62184848
4128	NC_004552	TCG	2	6	226993	226998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184848
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4130	NC_004552	GCTGA	2	10	227177	227186	20 %	20 %	40 %	20 %	62184848
4131	NC_004552	T	7	7	227201	227207	0 %	100 %	0 %	0 %	62184848
4132	NC_004552	AAT	2	6	227225	227230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184848
4133	NC_004552	AGC	2	6	227264	227269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184848
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4135	NC_004552	TGA	2	6	227348	227353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184848
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4137	NC_004552	GTAT	2	8	227401	227408	25 %	50 %	25 %	0 %	62184848
4138	NC_004552	AC	3	6	227416	227421	50 %	0 %	0 %	50 %	62184848
4139	NC_004552	TCC	2	6	227480	227485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184848
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4142	NC_004552	ACC	2	6	227795	227800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184848
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4144	NC_004552	CTC	2	6	227887	227892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184848
4145	NC_004552	TCT	2	6	227895	227900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184848
4146	NC_004552	GAC	2	6	227913	227918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184848
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4149	NC_004552	TAG	2	6	228168	228173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184849
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4153	NC_004552	AAT	2	6	228409	228414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184849
4154	NC_004552	ATATTT	2	12	228439	228450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184849
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4157	NC_004552	TTC	2	6	228747	228752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184850
4158	NC_004552	CTC	2	6	228783	228788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184850
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4160	NC_004552	GATT	2	8	228806	228813	25 %	50 %	25 %	0 %	62184850
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4166	NC_004552	T	6	6	229168	229173	0 %	100 %	0 %	0 %	62184851
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4182	NC_004552	TCGG	2	8	230194	230201	0 %	25 %	50 %	25 %	62184852
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4220	NC_004552	TTCT	2	8	232479	232486	0 %	75 %	0 %	25 %	62184855
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4241	NC_004552	AGT	2	6	233651	233656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184856
4242	NC_004552	CTA	2	6	233953	233958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184856
4243	NC_004552	TGCTG	2	10	233977	233986	0 %	40 %	40 %	20 %	62184856
4244	NC_004552	TGG	2	6	233992	233997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184856
4245	NC_004552	ATC	2	6	233999	234004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184856
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4247	NC_004552	TAG	2	6	234082	234087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184856
4248	NC_004552	TGCGT	2	10	234111	234120	0 %	40 %	40 %	20 %	62184856
4249	NC_004552	TTC	2	6	234139	234144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184856
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4251	NC_004552	GGC	2	6	234217	234222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184856
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4272	NC_004552	TGA	2	6	235603	235608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184857
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4280	NC_004552	T	6	6	236061	236066	0 %	100 %	0 %	0 %	62184858
4281	NC_004552	TATT	2	8	236127	236134	25 %	75 %	0 %	0 %	62184858
4282	NC_004552	CGT	2	6	236185	236190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184858
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4362	NC_004552	ATT	2	6	241557	241562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184863
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4366	NC_004552	CTGGT	2	10	241710	241719	0 %	40 %	40 %	20 %	62184863
4367	NC_004552	ATT	2	6	241769	241774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184863
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4371	NC_004552	GCTT	2	8	242016	242023	0 %	50 %	25 %	25 %	62184863
4372	NC_004552	ATACC	2	10	242133	242142	40 %	20 %	0 %	40 %	62184863
4373	NC_004552	AAC	2	6	242200	242205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184863
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4375	NC_004552	GAA	2	6	242231	242236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184863
4376	NC_004552	ATT	2	6	242246	242251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184863
4377	NC_004552	TGA	2	6	242290	242295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184863
4378	NC_004552	GAA	2	6	242339	242344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184863
4379	NC_004552	TTA	2	6	242366	242371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184863
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4400	NC_004552	CCT	2	6	243360	243365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184865
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4409	NC_004552	TTTA	2	8	243991	243998	25 %	75 %	0 %	0 %	62184866
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4500	NC_004552	GTTT	2	8	248988	248995	0 %	75 %	25 %	0 %	62184870

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