MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004552	CTC	2	6	163951	163956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184798
3002	NC_004552	ATG	2	6	164023	164028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184798
3003	NC_004552	TGA	2	6	164112	164117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184798
3004	NC_004552	AAT	2	6	164155	164160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184798
3005	NC_004552	CAG	2	6	164211	164216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184798
3006	NC_004552	GA	3	6	164223	164228	50 %	0 %	50 %	0 %	62184798
3007	NC_004552	AGA	2	6	164240	164245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184798
3008	NC_004552	GAAA	2	8	164252	164259	75 %	0 %	25 %	0 %	62184798
3009	NC_004552	TCA	2	6	164276	164281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184798
3010	NC_004552	TCA	2	6	164307	164312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184798
3011	NC_004552	CTT	2	6	164498	164503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3012	NC_004552	T	6	6	164522	164527	0 %	100 %	0 %	0 %	62184799
3013	NC_004552	AG	4	8	164586	164593	50 %	0 %	50 %	0 %	62184799
3014	NC_004552	ATC	2	6	164601	164606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184799
3015	NC_004552	GAAA	2	8	164613	164620	75 %	0 %	25 %	0 %	62184799
3016	NC_004552	AG	3	6	164627	164632	50 %	0 %	50 %	0 %	62184799
3017	NC_004552	ATT	2	6	164646	164651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184799
3018	NC_004552	TTACT	2	10	164693	164702	20 %	60 %	0 %	20 %	62184799
3019	NC_004552	A	7	7	164800	164806	100 %	0 %	0 %	0 %	62184799
3020	NC_004552	CAC	2	6	164808	164813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184799
3021	NC_004552	ACA	2	6	164814	164819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184799
3022	NC_004552	GTT	2	6	164856	164861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184799
3023	NC_004552	AATT	2	8	164921	164928	50 %	50 %	0 %	0 %	62184799
3024	NC_004552	AAGA	2	8	164933	164940	75 %	0 %	25 %	0 %	62184799
3025	NC_004552	AGGA	2	8	164977	164984	50 %	0 %	50 %	0 %	62184799
3026	NC_004552	TCT	2	6	165007	165012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3027	NC_004552	TGA	2	6	165081	165086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184799
3028	NC_004552	ATC	2	6	165113	165118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184799
3029	NC_004552	TTA	2	6	165184	165189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184799
3030	NC_004552	ATT	2	6	165288	165293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184799
3031	NC_004552	CAA	2	6	165328	165333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184799
3032	NC_004552	TGC	2	6	165365	165370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184799
3033	NC_004552	AAG	3	9	165437	165445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3034	NC_004552	GGT	2	6	165486	165491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184799
3035	NC_004552	TTC	2	6	165552	165557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
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3037	NC_004552	AAT	2	6	165580	165585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184799
3038	NC_004552	AAG	2	6	165596	165601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3039	NC_004552	TGG	2	6	165675	165680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184799
3040	NC_004552	AGG	2	6	165775	165780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184799
3041	NC_004552	AG	4	8	165874	165881	50 %	0 %	50 %	0 %	62184799
3042	NC_004552	AGA	2	6	165933	165938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3043	NC_004552	ACC	2	6	165988	165993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184799
3044	NC_004552	TGT	2	6	166071	166076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184799
3045	NC_004552	GAA	2	6	166099	166104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3046	NC_004552	CTACG	2	10	166141	166150	20 %	20 %	20 %	40 %	62184799
3047	NC_004552	AGA	2	6	166161	166166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3048	NC_004552	GGA	2	6	166212	166217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184799
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3050	NC_004552	GAG	2	6	166243	166248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184799
3051	NC_004552	AAATG	2	10	166278	166287	60 %	20 %	20 %	0 %	62184799
3052	NC_004552	AAGAGA	2	12	166478	166489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3053	NC_004552	AAT	2	6	166579	166584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184799
3054	NC_004552	TCT	2	6	166596	166601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3055	NC_004552	TCT	2	6	166678	166683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3056	NC_004552	AGC	2	6	166691	166696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184799
3057	NC_004552	TGA	2	6	166848	166853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184799
3058	NC_004552	GTT	2	6	166864	166869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184799
3059	NC_004552	TTGC	2	8	166881	166888	0 %	50 %	25 %	25 %	62184799
3060	NC_004552	TTC	2	6	166897	166902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3061	NC_004552	TC	3	6	166941	166946	0 %	50 %	0 %	50 %	62184799
3062	NC_004552	AAG	2	6	166970	166975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184799
3063	NC_004552	AGCG	2	8	167016	167023	25 %	0 %	50 %	25 %	62184799
3064	NC_004552	CAA	2	6	167109	167114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184799
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3066	NC_004552	TTC	2	6	167212	167217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
3067	NC_004552	GCA	2	6	167296	167301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184799
3068	NC_004552	CTA	2	6	167377	167382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184799
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3070	NC_004552	GAT	2	6	167409	167414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184799
3071	NC_004552	AG	4	8	167434	167441	50 %	0 %	50 %	0 %	62184799
3072	NC_004552	GTAC	2	8	167446	167453	25 %	25 %	25 %	25 %	62184799
3073	NC_004552	TCT	2	6	167458	167463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184799
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3080	NC_004552	TAC	2	6	167812	167817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184800
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3082	NC_004552	ATA	2	6	167901	167906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184800
3083	NC_004552	TGA	2	6	168044	168049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184800
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3087	NC_004552	T	6	6	168284	168289	0 %	100 %	0 %	0 %	62184800
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3089	NC_004552	AAAG	2	8	168355	168362	75 %	0 %	25 %	0 %	62184800
3090	NC_004552	GTA	2	6	168393	168398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184800
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3092	NC_004552	TG	3	6	168530	168535	0 %	50 %	50 %	0 %	62184800
3093	NC_004552	GAA	2	6	168569	168574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184800
3094	NC_004552	GTT	2	6	168589	168594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184800
3095	NC_004552	T	7	7	168614	168620	0 %	100 %	0 %	0 %	62184801
3096	NC_004552	TGA	2	6	168661	168666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184801
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3098	NC_004552	T	7	7	168778	168784	0 %	100 %	0 %	0 %	62184801
3099	NC_004552	CTG	2	6	168785	168790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184801
3100	NC_004552	CTTT	2	8	168865	168872	0 %	75 %	0 %	25 %	62184801
3101	NC_004552	T	8	8	168870	168877	0 %	100 %	0 %	0 %	62184801
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3103	NC_004552	A	8	8	168941	168948	100 %	0 %	0 %	0 %	62184801
3104	NC_004552	CTA	2	6	168949	168954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184801
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3107	NC_004552	AGT	2	6	169204	169209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184802
3108	NC_004552	CTC	2	6	169244	169249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184802
3109	NC_004552	TGG	2	6	169258	169263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184802
3110	NC_004552	GATA	2	8	169294	169301	50 %	25 %	25 %	0 %	62184802
3111	NC_004552	T	6	6	169307	169312	0 %	100 %	0 %	0 %	62184802
3112	NC_004552	TAAA	2	8	169366	169373	75 %	25 %	0 %	0 %	62184802
3113	NC_004552	AG	3	6	169388	169393	50 %	0 %	50 %	0 %	62184802
3114	NC_004552	TAG	2	6	169399	169404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184802
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3119	NC_004552	T	6	6	169532	169537	0 %	100 %	0 %	0 %	62184802
3120	NC_004552	ATG	2	6	169547	169552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184802
3121	NC_004552	AG	3	6	169570	169575	50 %	0 %	50 %	0 %	62184802
3122	NC_004552	CTGTT	2	10	169580	169589	0 %	60 %	20 %	20 %	62184802
3123	NC_004552	AATGA	2	10	169615	169624	60 %	20 %	20 %	0 %	62184802
3124	NC_004552	TTG	2	6	169643	169648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184802
3125	NC_004552	G	6	6	169675	169680	0 %	0 %	100 %	0 %	62184802
3126	NC_004552	TTC	2	6	169732	169737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184802
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3129	NC_004552	TAC	2	6	170034	170039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184803
3130	NC_004552	T	6	6	170174	170179	0 %	100 %	0 %	0 %	62184803
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3133	NC_004552	AGT	2	6	170303	170308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184803
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3249	NC_004552	GTT	3	9	178009	178017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184811
3250	NC_004552	GGA	2	6	178113	178118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184811
3251	NC_004552	ACC	2	6	178185	178190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184811
3252	NC_004552	GT	3	6	178247	178252	0 %	50 %	50 %	0 %	62184811
3253	NC_004552	TGT	2	6	178376	178381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184811
3254	NC_004552	TGCA	2	8	178392	178399	25 %	25 %	25 %	25 %	62184811
3255	NC_004552	ACC	2	6	178674	178679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184811
3256	NC_004552	GCC	2	6	178696	178701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184811
3257	NC_004552	TCT	2	6	178774	178779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184811
3258	NC_004552	ACT	2	6	178848	178853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184811
3259	NC_004552	TCCAAG	2	12	178878	178889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	62184811
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3262	NC_004552	TGT	2	6	178953	178958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184811
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3264	NC_004552	CTG	2	6	179027	179032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184811
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3277	NC_004552	TTG	2	6	179504	179509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184812
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3283	NC_004552	ATC	2	6	179971	179976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184812
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3289	NC_004552	GGT	2	6	180298	180303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184812
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3341	NC_004552	ATC	2	6	182568	182573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184814
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3343	NC_004552	AT	3	6	182665	182670	50 %	50 %	0 %	0 %	62184814
3344	NC_004552	GCTCC	2	10	182748	182757	0 %	20 %	20 %	60 %	62184814
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3347	NC_004552	T	6	6	182788	182793	0 %	100 %	0 %	0 %	62184814
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3355	NC_004552	T	6	6	183013	183018	0 %	100 %	0 %	0 %	62184814
3356	NC_004552	GAA	2	6	183153	183158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184815
3357	NC_004552	GA	3	6	183197	183202	50 %	0 %	50 %	0 %	62184815
3358	NC_004552	TCA	2	6	183219	183224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184815
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3361	NC_004552	GCAC	2	8	183297	183304	25 %	0 %	25 %	50 %	62184815
3362	NC_004552	AAGA	2	8	183320	183327	75 %	0 %	25 %	0 %	62184815
3363	NC_004552	CTTC	2	8	183369	183376	0 %	50 %	0 %	50 %	62184815
3364	NC_004552	AC	3	6	183379	183384	50 %	0 %	0 %	50 %	62184815
3365	NC_004552	CTTT	2	8	183404	183411	0 %	75 %	0 %	25 %	62184815
3366	NC_004552	TGC	2	6	183417	183422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184815
3367	NC_004552	A	6	6	183426	183431	100 %	0 %	0 %	0 %	62184815
3368	NC_004552	AG	3	6	183497	183502	50 %	0 %	50 %	0 %	62184815
3369	NC_004552	A	6	6	183516	183521	100 %	0 %	0 %	0 %	62184815
3370	NC_004552	CA	3	6	183607	183612	50 %	0 %	0 %	50 %	62184815
3371	NC_004552	AGT	2	6	183655	183660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184815
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3373	NC_004552	AGA	2	6	183800	183805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184816
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3402	NC_004552	CCG	2	6	185159	185164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184817
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3498	NC_004552	ATA	2	6	191277	191282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184819
3499	NC_004552	TCA	2	6	191286	191291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184819
3500	NC_004552	ATT	2	6	191326	191331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184819

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