MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004552	TA	3	6	135839	135844	50 %	50 %	0 %	0 %	62184772
2502	NC_004552	TTA	2	6	135907	135912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184772
2503	NC_004552	A	6	6	135932	135937	100 %	0 %	0 %	0 %	62184772
2504	NC_004552	CT	3	6	135967	135972	0 %	50 %	0 %	50 %	62184772
2505	NC_004552	AGGT	2	8	136056	136063	25 %	25 %	50 %	0 %	62184772
2506	NC_004552	AAT	2	6	136153	136158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184772
2507	NC_004552	T	6	6	136161	136166	0 %	100 %	0 %	0 %	62184772
2508	NC_004552	ATT	2	6	136175	136180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184772
2509	NC_004552	TCGCG	2	10	136241	136250	0 %	20 %	40 %	40 %	62184772
2510	NC_004552	AGA	2	6	136251	136256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184772
2511	NC_004552	CA	3	6	136261	136266	50 %	0 %	0 %	50 %	62184772
2512	NC_004552	AGA	2	6	136299	136304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184772
2513	NC_004552	GCAA	2	8	136326	136333	50 %	0 %	25 %	25 %	62184772
2514	NC_004552	TAT	2	6	136350	136355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184772
2515	NC_004552	CAA	2	6	136363	136368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184772
2516	NC_004552	CT	3	6	136378	136383	0 %	50 %	0 %	50 %	62184772
2517	NC_004552	TTA	2	6	136463	136468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184772
2518	NC_004552	TGC	2	6	136566	136571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184772
2519	NC_004552	GTC	2	6	136577	136582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184772
2520	NC_004552	TGC	3	9	136647	136655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184772
2521	NC_004552	AAG	2	6	136674	136679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184772
2522	NC_004552	ATG	2	6	136700	136705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184772
2523	NC_004552	GAA	2	6	136729	136734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184772
2524	NC_004552	AGA	2	6	136737	136742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184772
2525	NC_004552	A	6	6	136821	136826	100 %	0 %	0 %	0 %	62184772
2526	NC_004552	TC	3	6	136871	136876	0 %	50 %	0 %	50 %	62184773
2527	NC_004552	GTC	2	6	136981	136986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184773
2528	NC_004552	GTT	2	6	137013	137018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184773
2529	NC_004552	CTG	2	6	137076	137081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184773
2530	NC_004552	ATT	2	6	137121	137126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184773
2531	NC_004552	TGT	2	6	137191	137196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184773
2532	NC_004552	TGA	2	6	137246	137251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184773
2533	NC_004552	A	7	7	137277	137283	100 %	0 %	0 %	0 %	62184773
2534	NC_004552	TCT	2	6	137328	137333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184773
2535	NC_004552	A	6	6	137341	137346	100 %	0 %	0 %	0 %	62184773
2536	NC_004552	ATGC	2	8	137349	137356	25 %	25 %	25 %	25 %	62184773
2537	NC_004552	AGA	2	6	137387	137392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184773
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2539	NC_004552	AGA	2	6	137446	137451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184774
2540	NC_004552	TTC	2	6	137455	137460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184774
2541	NC_004552	AGT	2	6	137542	137547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184774
2542	NC_004552	GAA	2	6	137653	137658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184774
2543	NC_004552	TC	3	6	137666	137671	0 %	50 %	0 %	50 %	62184774
2544	NC_004552	TTC	2	6	137757	137762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184774
2545	NC_004552	ACCT	2	8	137788	137795	25 %	25 %	0 %	50 %	62184774
2546	NC_004552	CTG	2	6	137811	137816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184774
2547	NC_004552	GATTT	2	10	137850	137859	20 %	60 %	20 %	0 %	62184774
2548	NC_004552	AAG	2	6	137861	137866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184774
2549	NC_004552	AGAA	2	8	137904	137911	75 %	0 %	25 %	0 %	62184774
2550	NC_004552	TTA	2	6	137924	137929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184774
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2552	NC_004552	TTGTT	2	10	138192	138201	0 %	80 %	20 %	0 %	62184774
2553	NC_004552	AGA	2	6	138217	138222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184774
2554	NC_004552	TGA	2	6	138274	138279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184774
2555	NC_004552	CTT	2	6	138365	138370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184774
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2558	NC_004552	GGC	2	6	138503	138508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184774
2559	NC_004552	GATA	2	8	138538	138545	50 %	25 %	25 %	0 %	62184774
2560	NC_004552	CGT	2	6	138617	138622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184774
2561	NC_004552	GAA	2	6	138633	138638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184774
2562	NC_004552	TTA	2	6	138657	138662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184774
2563	NC_004552	AAGAA	2	10	138673	138682	80 %	0 %	20 %	0 %	62184774
2564	NC_004552	A	6	6	138787	138792	100 %	0 %	0 %	0 %	62184774
2565	NC_004552	CTTT	2	8	138818	138825	0 %	75 %	0 %	25 %	62184774
2566	NC_004552	TAG	2	6	139131	139136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184775
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2568	NC_004552	AG	3	6	139152	139157	50 %	0 %	50 %	0 %	62184775
2569	NC_004552	TTG	2	6	139197	139202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184775
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2571	NC_004552	T	8	8	139269	139276	0 %	100 %	0 %	0 %	62184775
2572	NC_004552	A	6	6	139341	139346	100 %	0 %	0 %	0 %	62184775
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2576	NC_004552	TAG	2	6	139623	139628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161501896
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2583	NC_004552	AGGT	2	8	140333	140340	25 %	25 %	50 %	0 %	62184777
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2597	NC_004552	GTG	2	6	141235	141240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184777
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2599	NC_004552	TGT	2	6	141272	141277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184777
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2603	NC_004552	AT	3	6	141630	141635	50 %	50 %	0 %	0 %	62184778
2604	NC_004552	A	6	6	141718	141723	100 %	0 %	0 %	0 %	62184778
2605	NC_004552	GCA	2	6	141737	141742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184778
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2607	NC_004552	GAA	2	6	141804	141809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184778
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2609	NC_004552	TGT	2	6	141977	141982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184778
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2612	NC_004552	AGT	2	6	142182	142187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184778
2613	NC_004552	TA	3	6	142335	142340	50 %	50 %	0 %	0 %	62184778
2614	NC_004552	GTCC	2	8	142424	142431	0 %	25 %	25 %	50 %	62184779
2615	NC_004552	TCTGT	2	10	142467	142476	0 %	60 %	20 %	20 %	62184779
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