MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004552	TTG	2	6	341024	341029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184925
6002	NC_004552	T	7	7	341060	341066	0 %	100 %	0 %	0 %	62184925
6003	NC_004552	TCT	2	6	341091	341096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184925
6004	NC_004552	AGAA	2	8	341126	341133	75 %	0 %	25 %	0 %	62184925
6005	NC_004552	CAAT	2	8	341142	341149	50 %	25 %	0 %	25 %	62184925
6006	NC_004552	TAC	2	6	341203	341208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184925
6007	NC_004552	AAG	2	6	341211	341216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184925
6008	NC_004552	AGA	2	6	341220	341225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184925
6009	NC_004552	G	6	6	341252	341257	0 %	0 %	100 %	0 %	62184925
6010	NC_004552	TGA	2	6	341260	341265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184925
6011	NC_004552	GCT	2	6	341391	341396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184925
6012	NC_004552	GTT	2	6	341473	341478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184925
6013	NC_004552	TGT	2	6	341493	341498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184925
6014	NC_004552	ACC	2	6	341522	341527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184925
6015	NC_004552	CAG	2	6	341562	341567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184925
6016	NC_004552	GCA	2	6	341572	341577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184925
6017	NC_004552	CTT	2	6	341936	341941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184926
6018	NC_004552	CAC	2	6	341975	341980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184926
6019	NC_004552	AC	3	6	342007	342012	50 %	0 %	0 %	50 %	62184926
6020	NC_004552	AAC	2	6	342048	342053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184926
6021	NC_004552	TTGACT	2	12	342094	342105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	62184926
6022	NC_004552	AGA	2	6	342132	342137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184926
6023	NC_004552	GTT	2	6	342188	342193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184926
6024	NC_004552	AGA	2	6	342256	342261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184926
6025	NC_004552	TTC	2	6	342282	342287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184926
6026	NC_004552	CAG	2	6	342371	342376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184926
6027	NC_004552	AG	3	6	342469	342474	50 %	0 %	50 %	0 %	62184926
6028	NC_004552	AGC	2	6	342495	342500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184926
6029	NC_004552	AGG	2	6	342549	342554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184926
6030	NC_004552	GAAG	2	8	342619	342626	50 %	0 %	50 %	0 %	62184926
6031	NC_004552	GCA	2	6	342634	342639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184926
6032	NC_004552	TTG	2	6	342660	342665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184926
6033	NC_004552	CCT	2	6	342670	342675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184926
6034	NC_004552	T	6	6	342697	342702	0 %	100 %	0 %	0 %	62184926
6035	NC_004552	CTT	2	6	342704	342709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184926
6036	NC_004552	TCTGC	2	10	342734	342743	0 %	40 %	20 %	40 %	62184926
6037	NC_004552	AGT	2	6	342766	342771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184926
6038	NC_004552	ATC	2	6	342861	342866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184926
6039	NC_004552	TCA	2	6	342892	342897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184926
6040	NC_004552	GAA	2	6	342927	342932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184926
6041	NC_004552	CAG	2	6	343046	343051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184926
6042	NC_004552	TAAAT	2	10	343089	343098	60 %	40 %	0 %	0 %	62184926
6043	NC_004552	GTT	2	6	343115	343120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184926
6044	NC_004552	TCT	2	6	343147	343152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184926
6045	NC_004552	CTTGA	2	10	343163	343172	20 %	40 %	20 %	20 %	62184926
6046	NC_004552	GCA	2	6	343197	343202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184926
6047	NC_004552	TGC	2	6	343563	343568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184927
6048	NC_004552	T	9	9	343663	343671	0 %	100 %	0 %	0 %	62184927
6049	NC_004552	CTG	2	6	343882	343887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184928
6050	NC_004552	TAG	2	6	343916	343921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184928
6051	NC_004552	GCA	2	6	343951	343956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184928
6052	NC_004552	A	6	6	343960	343965	100 %	0 %	0 %	0 %	62184928
6053	NC_004552	A	7	7	344018	344024	100 %	0 %	0 %	0 %	62184928
6054	NC_004552	T	7	7	344139	344145	0 %	100 %	0 %	0 %	62184928
6055	NC_004552	A	7	7	344151	344157	100 %	0 %	0 %	0 %	62184928
6056	NC_004552	GAA	2	6	344167	344172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184928
6057	NC_004552	TAA	2	6	344192	344197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184928
6058	NC_004552	ATGTTC	2	12	344253	344264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	62184928
6059	NC_004552	TTC	2	6	344301	344306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184928
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6061	NC_004552	T	8	8	344371	344378	0 %	100 %	0 %	0 %	62184928
6062	NC_004552	GTA	2	6	344435	344440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184928
6063	NC_004552	TGT	2	6	344468	344473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184928
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6065	NC_004552	TGA	2	6	344517	344522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184928
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6073	NC_004552	TTTTC	2	10	344935	344944	0 %	80 %	0 %	20 %	62184929
6074	NC_004552	TAT	2	6	344966	344971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184929
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6089	NC_004552	AGA	2	6	346482	346487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184930
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6099	NC_004552	AG	3	6	346761	346766	50 %	0 %	50 %	0 %	62184930
6100	NC_004552	AAGAA	2	10	346773	346782	80 %	0 %	20 %	0 %	62184930
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6107	NC_004552	ATA	2	6	346928	346933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184930
6108	NC_004552	T	6	6	346942	346947	0 %	100 %	0 %	0 %	62184930
6109	NC_004552	ATG	2	6	346966	346971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184930
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6113	NC_004552	TTCT	2	8	347162	347169	0 %	75 %	0 %	25 %	62184930
6114	NC_004552	G	6	6	347225	347230	0 %	0 %	100 %	0 %	62184930
6115	NC_004552	TAC	2	6	347311	347316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184930
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6120	NC_004552	AGAA	2	8	347467	347474	75 %	0 %	25 %	0 %	62184930
6121	NC_004552	A	6	6	347473	347478	100 %	0 %	0 %	0 %	62184930
6122	NC_004552	AC	3	6	347534	347539	50 %	0 %	0 %	50 %	62184930
6123	NC_004552	GGA	2	6	347677	347682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184930
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6125	NC_004552	TTCG	2	8	347795	347802	0 %	50 %	25 %	25 %	62184930
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6495	NC_004552	TGT	2	6	367974	367979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184947
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6498	NC_004552	TGT	2	6	368180	368185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184947
6499	NC_004552	GC	3	6	368273	368278	0 %	0 %	50 %	50 %	62184947
6500	NC_004552	CCTC	2	8	368281	368288	0 %	25 %	0 %	75 %	62184947

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