MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 20668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004552	GCTT	2	8	304660	304667	0 %	50 %	25 %	25 %	62184910
5502	NC_004552	TAGA	2	8	304770	304777	50 %	25 %	25 %	0 %	62184910
5503	NC_004552	TGT	2	6	304807	304812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184910
5504	NC_004552	GA	3	6	304848	304853	50 %	0 %	50 %	0 %	62184910
5505	NC_004552	CCA	2	6	304910	304915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184910
5506	NC_004552	CGG	2	6	304922	304927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184910
5507	NC_004552	ATG	2	6	304954	304959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184910
5508	NC_004552	AAG	2	6	305085	305090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910
5509	NC_004552	CTTT	2	8	305145	305152	0 %	75 %	0 %	25 %	62184910
5510	NC_004552	TAT	2	6	305268	305273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184910
5511	NC_004552	CTG	2	6	305277	305282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5512	NC_004552	ATTGTA	2	12	305384	305395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	62184910
5513	NC_004552	T	6	6	305405	305410	0 %	100 %	0 %	0 %	62184910
5514	NC_004552	AAC	2	6	305479	305484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184910
5515	NC_004552	CGA	2	6	305533	305538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5516	NC_004552	CAG	3	9	305556	305564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5517	NC_004552	GCT	2	6	305579	305584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5518	NC_004552	AGG	2	6	305631	305636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184910
5519	NC_004552	GAG	2	6	305650	305655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184910
5520	NC_004552	TTG	2	6	305668	305673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184910
5521	NC_004552	CAC	2	6	305724	305729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184910
5522	NC_004552	AGT	2	6	305896	305901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184910
5523	NC_004552	CCA	2	6	306002	306007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184910
5524	NC_004552	CCA	2	6	306092	306097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184910
5525	NC_004552	GAA	2	6	306134	306139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910
5526	NC_004552	TGC	2	6	306181	306186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5527	NC_004552	TTA	2	6	306191	306196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184910
5528	NC_004552	AGA	2	6	306201	306206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910
5529	NC_004552	GCT	2	6	306248	306253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5530	NC_004552	GTTGCC	2	12	306260	306271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184910
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5532	NC_004552	GTT	2	6	306340	306345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184910
5533	NC_004552	GTT	2	6	306364	306369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184910
5534	NC_004552	GCC	2	6	306403	306408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184910
5535	NC_004552	TTA	2	6	306419	306424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184910
5536	NC_004552	AGG	2	6	306487	306492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184910
5537	NC_004552	TGG	2	6	306493	306498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184910
5538	NC_004552	ATGG	2	8	306572	306579	25 %	25 %	50 %	0 %	62184910
5539	NC_004552	ACT	2	6	306680	306685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184910
5540	NC_004552	CCA	2	6	306701	306706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184910
5541	NC_004552	GAA	2	6	306754	306759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184910
5542	NC_004552	ACCGC	2	10	306779	306788	20 %	0 %	20 %	60 %	62184910
5543	NC_004552	TAA	2	6	306903	306908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184910
5544	NC_004552	AGC	2	6	306919	306924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184910
5545	NC_004552	CAT	2	6	306960	306965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184910
5546	NC_004552	GCC	2	6	307025	307030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184910
5547	NC_004552	TGT	2	6	307078	307083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184910
5548	NC_004552	GAA	3	9	313327	313335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184911
5549	NC_004552	AAC	2	6	313404	313409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184911
5550	NC_004552	CAT	2	6	313505	313510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184911
5551	NC_004552	ACAT	2	8	313513	313520	50 %	25 %	0 %	25 %	62184911
5552	NC_004552	AAG	2	6	313539	313544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184911
5553	NC_004552	AGC	2	6	313619	313624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184911
5554	NC_004552	CTT	2	6	313634	313639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184911
5555	NC_004552	TTTG	2	8	313789	313796	0 %	75 %	25 %	0 %	62184911
5556	NC_004552	TATGGC	2	12	313823	313834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62184911
5557	NC_004552	AC	3	6	313894	313899	50 %	0 %	0 %	50 %	62184911
5558	NC_004552	CAC	2	6	313910	313915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184911
5559	NC_004552	TGC	2	6	314034	314039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184911
5560	NC_004552	TTTA	2	8	314067	314074	25 %	75 %	0 %	0 %	62184911
5561	NC_004552	T	7	7	314116	314122	0 %	100 %	0 %	0 %	62184911
5562	NC_004552	TTCT	2	8	314210	314217	0 %	75 %	0 %	25 %	62184911
5563	NC_004552	CAC	2	6	314285	314290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184911
5564	NC_004552	GTA	2	6	314495	314500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184911
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5567	NC_004552	T	7	7	314831	314837	0 %	100 %	0 %	0 %	62184911
5568	NC_004552	TGCC	2	8	314854	314861	0 %	25 %	25 %	50 %	62184911
5569	NC_004552	A	6	6	314864	314869	100 %	0 %	0 %	0 %	62184911
5570	NC_004552	TTG	2	6	314905	314910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184911
5571	NC_004552	CAA	2	6	314939	314944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184911
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5573	NC_004552	CTT	2	6	314975	314980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184911
5574	NC_004552	TTG	2	6	315028	315033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184911
5575	NC_004552	TGC	2	6	315077	315082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184911
5576	NC_004552	GAT	2	6	315194	315199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184911
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5578	NC_004552	CCG	2	6	315214	315219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184911
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5581	NC_004552	AGTG	2	8	315270	315277	25 %	25 %	50 %	0 %	62184911
5582	NC_004552	TTG	2	6	315278	315283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184911
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5587	NC_004552	TCC	2	6	315654	315659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184911
5588	NC_004552	GAA	2	6	315721	315726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184911
5589	NC_004552	ATA	2	6	315805	315810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184911
5590	NC_004552	CTG	2	6	315975	315980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184912
5591	NC_004552	TGT	2	6	315991	315996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184912
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5593	NC_004552	TG	3	6	316048	316053	0 %	50 %	50 %	0 %	62184912
5594	NC_004552	AGC	2	6	316088	316093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184912
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5597	NC_004552	ACG	2	6	316220	316225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184912
5598	NC_004552	GA	3	6	316263	316268	50 %	0 %	50 %	0 %	62184912
5599	NC_004552	T	6	6	316269	316274	0 %	100 %	0 %	0 %	62184912
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5602	NC_004552	ATAG	2	8	316637	316644	50 %	25 %	25 %	0 %	62184912
5603	NC_004552	ATC	2	6	316730	316735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184912
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5606	NC_004552	GGA	2	6	316835	316840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184912
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5610	NC_004552	AGA	2	6	317218	317223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184912
5611	NC_004552	TCA	2	6	317226	317231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184912
5612	NC_004552	TGT	2	6	317282	317287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184912
5613	NC_004552	CTATT	2	10	317311	317320	20 %	60 %	0 %	20 %	62184912
5614	NC_004552	AG	3	6	317492	317497	50 %	0 %	50 %	0 %	62184912
5615	NC_004552	TTA	2	6	317580	317585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184912
5616	NC_004552	A	7	7	317632	317638	100 %	0 %	0 %	0 %	62184912
5617	NC_004552	TGT	2	6	317647	317652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184912
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5621	NC_004552	TTTC	2	8	317736	317743	0 %	75 %	0 %	25 %	62184912
5622	NC_004552	GA	3	6	317769	317774	50 %	0 %	50 %	0 %	62184912
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5624	NC_004552	TCC	2	6	317849	317854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184912
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5626	NC_004552	TAG	2	6	317899	317904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184912
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5753	NC_004552	GAT	2	6	327656	327661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184915
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5855	NC_004552	TA	3	6	332511	332516	50 %	50 %	0 %	0 %	62184918
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5858	NC_004552	AGG	2	6	332669	332674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184918
5859	NC_004552	CCG	3	9	332689	332697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184918
5860	NC_004552	CAGC	2	8	332757	332764	25 %	0 %	25 %	50 %	62184918
5861	NC_004552	CCT	2	6	332794	332799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184918
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5867	NC_004552	TAC	2	6	333135	333140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184918
5868	NC_004552	CAA	2	6	333163	333168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184918
5869	NC_004552	AGA	2	6	333227	333232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184918
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5996	NC_004552	CCA	2	6	340774	340779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184925
5997	NC_004552	TGG	2	6	340904	340909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184925
5998	NC_004552	CGG	2	6	340929	340934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184925
5999	NC_004552	CAT	2	6	340958	340963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184925
6000	NC_004552	CGT	2	6	340972	340977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184925

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