MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE3

Total Repeats: 832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004320	ATC	2	6	28188	28193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578010
502	NC_004320	AAC	2	6	28194	28199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23578010
503	NC_004320	CCG	2	6	28296	28301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578010
504	NC_004320	AGC	2	6	28325	28330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578010
505	NC_004320	CGG	2	6	28345	28350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578010
506	NC_004320	ACCG	2	8	28370	28377	25 %	0 %	25 %	50 %	23578010
507	NC_004320	GGT	2	6	28400	28405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578010
508	NC_004320	CCG	2	6	28473	28478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578010
509	NC_004320	CGGCGA	2	12	28486	28497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23578010
510	NC_004320	TGG	2	6	28555	28560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578010
511	NC_004320	GTC	2	6	28563	28568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578010
512	NC_004320	TGT	2	6	28600	28605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23578010
513	NC_004320	GGGT	2	8	28614	28621	0 %	25 %	75 %	0 %	23578010
514	NC_004320	GCC	2	6	28647	28652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578010
515	NC_004320	TCC	2	6	28744	28749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578010
516	NC_004320	GAA	2	6	28782	28787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23578010
517	NC_004320	GGC	2	6	28802	28807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578010
518	NC_004320	TCC	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578010
519	NC_004320	GCAG	2	8	28860	28867	25 %	0 %	50 %	25 %	23578010
520	NC_004320	GAA	2	6	28893	28898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23578010
521	NC_004320	AGG	2	6	28911	28916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578010
522	NC_004320	ATC	2	6	28926	28931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578010
523	NC_004320	TCG	2	6	28946	28951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578010
524	NC_004320	TGT	2	6	28964	28969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23578010
525	NC_004320	CGT	2	6	28988	28993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578010
526	NC_004320	CGG	2	6	29030	29035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578010
527	NC_004320	GCA	2	6	29074	29079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578010
528	NC_004320	AGG	2	6	29107	29112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578010
529	NC_004320	GTG	2	6	29164	29169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578010
530	NC_004320	GCG	2	6	29221	29226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578011
531	NC_004320	TCCTC	2	10	29257	29266	0 %	40 %	0 %	60 %	23578011
532	NC_004320	GCCAC	2	10	29272	29281	20 %	0 %	20 %	60 %	23578011
533	NC_004320	ACC	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578011
534	NC_004320	CCA	3	9	29329	29337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578011
535	NC_004320	GGA	2	6	29360	29365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578011
536	NC_004320	CCG	2	6	29386	29391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578011
537	NC_004320	GCCGGT	3	18	29463	29480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	23578011
538	NC_004320	GTC	2	6	29487	29492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578011
539	NC_004320	CGT	2	6	29496	29501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578011
540	NC_004320	CG	3	6	29504	29509	0 %	0 %	50 %	50 %	23578011
541	NC_004320	TGCCA	2	10	29554	29563	20 %	20 %	20 %	40 %	23578012
542	NC_004320	GAC	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578012
543	NC_004320	CAC	2	6	29667	29672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578012
544	NC_004320	TGA	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578012
545	NC_004320	TGT	2	6	29766	29771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23578012
546	NC_004320	GCG	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578012
547	NC_004320	TGA	2	6	29920	29925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578012
548	NC_004320	CTG	2	6	29951	29956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578012
549	NC_004320	ACC	2	6	29960	29965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578012
550	NC_004320	CGC	2	6	29983	29988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578012
551	NC_004320	TGC	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578012
552	NC_004320	ACGG	2	8	30029	30036	25 %	0 %	50 %	25 %	23578012
553	NC_004320	CAG	2	6	30041	30046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578012
554	NC_004320	GAA	2	6	30091	30096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23578013
555	NC_004320	GTG	2	6	30111	30116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578013
556	NC_004320	TCC	3	9	30131	30139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578013
557	NC_004320	CTC	2	6	30163	30168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578013
558	NC_004320	CCA	2	6	30212	30217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578013
559	NC_004320	CTG	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
560	NC_004320	GTTC	2	8	30255	30262	0 %	50 %	25 %	25 %	23578013
561	NC_004320	TGA	2	6	30314	30319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578013
562	NC_004320	CTG	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
563	NC_004320	GAG	2	6	30358	30363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578013
564	NC_004320	GCC	3	9	30364	30372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
565	NC_004320	GGA	2	6	30405	30410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578013
566	NC_004320	GC	3	6	30441	30446	0 %	0 %	50 %	50 %	23578013
567	NC_004320	CTG	2	6	30448	30453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
568	NC_004320	TCG	2	6	30479	30484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
569	NC_004320	GCC	2	6	30550	30555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
570	NC_004320	GGT	2	6	30579	30584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578013
571	NC_004320	CAG	2	6	30597	30602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578013
572	NC_004320	ATCC	2	8	30630	30637	25 %	25 %	0 %	50 %	23578013
573	NC_004320	CCG	3	9	30713	30721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
574	NC_004320	ACC	2	6	30739	30744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578013
575	NC_004320	GTC	2	6	30745	30750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
576	NC_004320	TGG	2	6	30755	30760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578013
577	NC_004320	GCCC	2	8	30811	30818	0 %	0 %	25 %	75 %	23578013
578	NC_004320	GCC	2	6	30856	30861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
579	NC_004320	GT	3	6	30887	30892	0 %	50 %	50 %	0 %	23578013
580	NC_004320	GTC	2	6	30910	30915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578013
581	NC_004320	TGG	2	6	30917	30922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578013
582	NC_004320	GGT	2	6	30963	30968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578013
583	NC_004320	GGC	2	6	30981	30986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578013
584	NC_004320	TCA	2	6	31004	31009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
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586	NC_004320	CGG	2	6	31035	31040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578013
587	NC_004320	CAC	2	6	31110	31115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578013
588	NC_004320	GCG	2	6	31150	31155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578013
589	NC_004320	CCG	3	9	31199	31207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
590	NC_004320	CAG	2	6	31228	31233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578013
591	NC_004320	GCC	2	6	31243	31248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
592	NC_004320	TCA	2	6	31268	31273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
593	NC_004320	GAA	2	6	31348	31353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23578013
594	NC_004320	CGGTG	2	10	31398	31407	0 %	20 %	60 %	20 %	23578013
595	NC_004320	GGC	2	6	31458	31463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23578013
596	NC_004320	CACCGC	2	12	31506	31517	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	23578013
597	NC_004320	GGA	2	6	31566	31571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578013
598	NC_004320	GAT	2	6	31617	31622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578013
599	NC_004320	ACG	2	6	31637	31642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578013
600	NC_004320	CGC	2	6	31698	31703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
601	NC_004320	CCG	2	6	31773	31778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
602	NC_004320	ATC	2	6	31789	31794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
603	NC_004320	CAT	2	6	31803	31808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
604	NC_004320	ATC	3	9	31822	31830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
605	NC_004320	GCTG	2	8	31866	31873	0 %	25 %	50 %	25 %	23578013
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608	NC_004320	CCG	2	6	31982	31987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578013
609	NC_004320	CTA	2	6	32016	32021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578013
610	NC_004320	TCA	2	6	32032	32037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578014
611	NC_004320	CGGA	2	8	32067	32074	25 %	0 %	50 %	25 %	23578014
612	NC_004320	AGC	2	6	32096	32101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578014
613	NC_004320	AGA	2	6	32133	32138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23578014
614	NC_004320	GGA	2	6	32145	32150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578014
615	NC_004320	TCC	2	6	32154	32159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578014
616	NC_004320	CAT	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578014
617	NC_004320	TCG	2	6	32256	32261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578014
618	NC_004320	GCC	2	6	32282	32287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
619	NC_004320	GAG	2	6	32312	32317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578014
620	NC_004320	GCA	2	6	32334	32339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578014
621	NC_004320	GAG	2	6	32348	32353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23578014
622	NC_004320	CTC	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23578014
623	NC_004320	GGTGA	2	10	32474	32483	20 %	20 %	60 %	0 %	23578014
624	NC_004320	CCG	2	6	32507	32512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
625	NC_004320	C	6	6	32527	32532	0 %	0 %	0 %	100 %	23578014
626	NC_004320	CCG	2	6	32543	32548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
627	NC_004320	CCG	2	6	32606	32611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
628	NC_004320	CAT	2	6	32803	32808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578014
629	NC_004320	CGC	3	9	32855	32863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
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631	NC_004320	GCA	2	6	32908	32913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578014
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633	NC_004320	GCCCC	2	10	32997	33006	0 %	0 %	20 %	80 %	23578014
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636	NC_004320	CCG	2	6	33106	33111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23578014
637	NC_004320	ACC	2	6	33335	33340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578015
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659	NC_004320	TTG	2	6	34154	34159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23578015
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664	NC_004320	TGG	2	6	34542	34547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23578015
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752	NC_004320	ATGGG	2	10	42691	42700	20 %	20 %	60 %	0 %	23578021
753	NC_004320	GAT	2	6	44017	44022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578022
754	NC_004320	GAT	2	6	44047	44052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23578022
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756	NC_004320	CTG	2	6	44110	44115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578022
757	NC_004320	ATC	2	6	44122	44127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23578022
758	NC_004320	TGC	2	6	44129	44134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23578022
759	NC_004320	CGA	2	6	44190	44195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23578022
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787	NC_004320	CCA	2	6	45453	45458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23578023
788	NC_004320	CTGCGA	2	12	45462	45473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	23578023
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796	NC_004320	TACC	2	8	46021	46028	25 %	25 %	0 %	50 %	23578024
797	NC_004320	ATTG	2	8	46070	46077	25 %	50 %	25 %	0 %	23578024
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