MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni RM1221

Total Repeats: 1075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003912	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57236916
2	NC_003912	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57236917
3	NC_003912	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57236917
4	NC_003912	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57236921
5	NC_003912	ATTTAA	2	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	57236921
6	NC_003912	ATGGGT	2	12	17169	17180	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	57236926
7	NC_003912	TTCATT	2	12	18193	18204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57236927
8	NC_003912	AAGAAA	2	12	19408	19419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57236928
9	NC_003912	AAGATA	2	12	20327	20338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57236929
10	NC_003912	AGCAAA	2	12	21110	21121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57236929
11	NC_003912	TTTTCT	2	12	21617	21628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	57236930
12	NC_003912	TTTTAT	2	12	26415	26426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57236934
13	NC_003912	TTATGC	2	12	27477	27488	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57236935
14	NC_003912	CTTTAA	2	12	29724	29735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57236936
15	NC_003912	CTATTT	2	12	29844	29855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57236936
16	NC_003912	ATGTGT	2	12	30538	30549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	57236937
17	NC_003912	ATGGAT	2	12	34405	34416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57236940
18	NC_003912	GAAATT	2	12	34614	34625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57236940
19	NC_003912	AACAAA	2	12	44054	44065	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	57237045
20	NC_003912	TTTGAA	2	12	49003	49014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57237047
21	NC_003912	GAAAGA	2	12	49404	49415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57237047
22	NC_003912	TACACT	2	12	51543	51554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57237048
23	NC_003912	ATGAAA	2	12	53292	53303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237050
24	NC_003912	TAAGCT	2	12	53824	53835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237050
25	NC_003912	AGTTTT	2	12	56006	56017	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237052
26	NC_003912	TTCTTT	2	12	56222	56233	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	57237053
27	NC_003912	CGCCTT	2	12	56627	56638	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	57237053
28	NC_003912	CAAAAT	2	12	60164	60175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57237055
29	NC_003912	TTCATC	2	12	61097	61108	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57237056
30	NC_003912	TAATTT	2	12	62891	62902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57237058
31	NC_003912	ATTTTA	2	12	63143	63154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57237058
32	NC_003912	AAATAT	2	12	63500	63511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57237058
33	NC_003912	GTTGGA	2	12	64440	64451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	57237058
34	NC_003912	GTTTTT	2	12	64585	64596	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	57237058
35	NC_003912	TAGCTT	2	12	73377	73388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237070
36	NC_003912	TTCATT	2	12	75736	75747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237073
37	NC_003912	CATCTT	2	12	77482	77493	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57237074
38	NC_003912	TTTAAA	2	12	79902	79913	50 %	50 %	0 %	0 %	57237077
39	NC_003912	CTAGCT	2	12	80334	80345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	57237078
40	NC_003912	GAATGA	2	12	80588	80599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57237078
41	NC_003912	GATGCT	2	12	81748	81759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57237079
42	NC_003912	TAAATT	2	12	83462	83473	50 %	50 %	0 %	0 %	57237081
43	NC_003912	TTTTTG	2	12	90326	90337	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	57237088
44	NC_003912	GAATTT	2	12	90646	90657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57237089
45	NC_003912	AACTCA	2	12	91161	91172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	57237089
46	NC_003912	CTTTAA	2	12	92941	92952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57237090
47	NC_003912	ATATTT	2	12	93701	93712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57237092
48	NC_003912	GTAACT	2	12	96114	96125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237094
49	NC_003912	CAGGAA	2	12	96821	96832	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	57237095
50	NC_003912	TTGTGT	2	12	97407	97418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57237095
51	NC_003912	ATAAAA	2	12	99230	99241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237096
52	NC_003912	TTAATG	2	12	101447	101458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57237099
53	NC_003912	GCAAGC	2	12	101527	101538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57237099
54	NC_003912	AACTTA	2	12	104265	104276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57237103
55	NC_003912	TGTAGA	2	12	104401	104412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57237103
56	NC_003912	GAACTT	2	12	106511	106522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237105
57	NC_003912	TTAGAA	2	12	106562	106573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57237105
58	NC_003912	AAAAAT	2	12	108865	108876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237108
59	NC_003912	GGTTTG	2	12	114571	114582	0 %	50 %	50 %	0 %	57237115
60	NC_003912	AAAATA	2	12	116382	116393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237118
61	NC_003912	ATTTTG	2	12	117919	117930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237120
62	NC_003912	GAAAAA	2	12	118826	118837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237121
63	NC_003912	GTTGTG	2	12	119673	119684	0 %	50 %	50 %	0 %	57237122
64	NC_003912	GGACAT	2	12	119714	119725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57237122
65	NC_003912	TTTGAT	2	12	121299	121310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237124
66	NC_003912	TTCTTT	2	12	130442	130453	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	57237136
67	NC_003912	GGGCTT	2	12	131121	131132	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	57237137
68	NC_003912	AAAGAT	2	12	134193	134204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237139
69	NC_003912	GCTTTA	2	12	135502	135513	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237141
70	NC_003912	TTGTTA	2	12	136281	136292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237143
71	NC_003912	AAAGAA	2	12	136420	136431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237143
72	NC_003912	GAAAAA	2	12	139115	139126	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237145
73	NC_003912	ACCTTT	2	12	142651	142662	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57237147
74	NC_003912	CTATAC	2	12	143299	143310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57237148
75	NC_003912	ATTTTT	2	12	144474	144485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237150
76	NC_003912	TTCATG	2	12	144816	144827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237150
77	NC_003912	TAAGGA	2	12	147667	147678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57237153
78	NC_003912	TTTTAC	2	12	149682	149693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237154
79	NC_003912	CTGCTC	2	12	151558	151569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	57237157
80	NC_003912	ATTTTC	2	12	152480	152491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237158
81	NC_003912	AAAACT	2	12	155519	155530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57237161
82	NC_003912	ATAAAA	2	12	155587	155598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237161
83	NC_003912	TTTTGC	2	12	156143	156154	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	57237162
84	NC_003912	AGCTAT	2	12	157198	157209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237164
85	NC_003912	GGCTAA	2	12	157597	157608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57237164
86	NC_003912	TCAAAT	2	12	159223	159234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57237167
87	NC_003912	AAATAA	2	12	161992	162003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237172
88	NC_003912	ATTTTC	2	12	164064	164075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237174
89	NC_003912	AGCTTT	2	12	164760	164771	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237175
90	NC_003912	GGCTGT	2	12	165398	165409	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	57237176
91	NC_003912	TATAAA	2	12	166063	166074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57237177
92	NC_003912	AAAAGC	2	12	167567	167578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57237178
93	NC_003912	TAAAAA	2	12	168194	168205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237179
94	NC_003912	AACAAG	2	12	168359	168370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57237179
95	NC_003912	ATATTA	2	12	170752	170763	50 %	50 %	0 %	0 %	57237181
96	NC_003912	TAAAAA	2	12	171280	171291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237182
97	NC_003912	TGGAAA	2	12	171341	171352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57237182
98	NC_003912	TATTTT	2	12	174085	174096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237184
99	NC_003912	TTAAAT	2	12	174108	174119	50 %	50 %	0 %	0 %	57237184
100	NC_003912	CTTTCT	2	12	174195	174206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57237184
101	NC_003912	ATTCTA	2	12	176196	176207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57237187
102	NC_003912	GCTATT	2	12	176423	176434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237187
103	NC_003912	TTGCAG	2	12	177770	177781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	57237188
104	NC_003912	AAAACC	2	12	181564	181575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57237193
105	NC_003912	CAAGGA	2	12	183934	183945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	57237195
106	NC_003912	AATGAA	2	12	188338	188349	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237200
107	NC_003912	AAGTGC	2	12	189543	189554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	57237200
108	NC_003912	CCTAAT	2	12	189562	189573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57237200
109	NC_003912	CTTACT	2	12	191162	191173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57237202
110	NC_003912	ATTAAA	2	12	192541	192552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57237203
111	NC_003912	ATCAAT	2	12	193286	193297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57237204
112	NC_003912	TTTTAG	2	12	201947	201958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237210
113	NC_003912	AAAGAA	2	12	202086	202097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237211
114	NC_003912	GTTTAT	2	12	204611	204622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237216
115	NC_003912	ATGCAA	2	12	207610	207621	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57237226
116	NC_003912	AGGCGG	2	12	207891	207902	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	57237226
117	NC_003912	AAAAGA	2	12	208415	208426	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237227
118	NC_003912	TTAAAA	2	12	209321	209332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57237231
119	NC_003912	TTTTTC	2	12	210369	210380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	57237232
120	NC_003912	TATTTT	2	12	213131	213142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237234
121	NC_003912	TCACTT	2	12	213981	213992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57237237
122	NC_003912	ATCATT	2	12	216242	216253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57237239
123	NC_003912	GCATTA	2	12	218773	218784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237243
124	NC_003912	ACTTTA	2	12	218914	218925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57237243
125	NC_003912	ATATTT	2	12	221196	221207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57237247
126	NC_003912	ATTTTC	2	12	222423	222434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237251
127	NC_003912	TAAAGC	2	12	222435	222446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57237251
128	NC_003912	CATTTA	2	12	222896	222907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	57237252
129	NC_003912	TTTTCA	2	12	222936	222947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237252
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214	NC_003912	AAAATA	2	12	366024	366035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237415
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218	NC_003912	TATCTG	2	12	373856	373867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237422
219	NC_003912	AGTTCT	2	12	377667	377678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237426
220	NC_003912	TATCTT	2	12	381791	381802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57237432
221	NC_003912	TTAAAG	2	12	384462	384473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	57237434
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224	NC_003912	ATAAAG	2	12	389850	389861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237441
225	NC_003912	AAAATA	2	12	390946	390957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237442
226	NC_003912	ATGTTT	2	12	391094	391105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237443
227	NC_003912	ATGAAA	2	12	392302	392313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237444
228	NC_003912	GCTAAA	2	12	394188	394199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57237445
229	NC_003912	ATTGAT	2	12	394845	394856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57237445
230	NC_003912	TATTTT	2	12	398709	398720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237448
231	NC_003912	CATTGA	2	12	399894	399905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237449
232	NC_003912	CAAATT	2	12	400482	400493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57237451
233	NC_003912	GAGCTG	2	12	400836	400847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	57237451
234	NC_003912	TATTTT	2	12	401597	401608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237452
235	NC_003912	ATTTAA	2	12	405707	405718	50 %	50 %	0 %	0 %	57237457
236	NC_003912	AAAGAA	2	12	406005	406016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	57237457
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238	NC_003912	AAAGGT	2	12	411978	411989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57237464
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471	NC_003912	ACTATG	2	12	813109	813120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57237625
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473	NC_003912	CTTATG	2	12	815517	815528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57237629
474	NC_003912	TGAAAA	2	12	816482	816493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57237630
475	NC_003912	TTGTAT	2	12	818454	818465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57237634
476	NC_003912	AGCACA	2	12	819784	819795	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	57237636
477	NC_003912	AAAATC	2	12	820423	820434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57237636
478	NC_003912	TAAAAA	2	12	821627	821638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	57237637
479	NC_003912	TAACAA	2	12	823632	823643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	57237639
480	NC_003912	TTTTTA	2	12	824401	824412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	57237640
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485	NC_003912	TTCTTT	2	12	827564	827575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	57237643
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489	NC_003912	TGTAAT	2	12	836843	836854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	57237650
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499	NC_003912	GCTAAA	2	12	855559	855570	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	57237672
500	NC_003912	AAGCAA	2	12	856615	856626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	57237673

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