MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	GCAAT	2	10	4555	4564	40 %	20 %	20 %	20 %	71281227
2	NC_003910	TGAAG	2	10	5754	5763	40 %	20 %	40 %	0 %	71281227
3	NC_003910	ACAAA	2	10	7985	7994	80 %	0 %	0 %	20 %	71281166
4	NC_003910	ATTGG	2	10	12270	12279	20 %	40 %	40 %	0 %	71279252
5	NC_003910	GTTGA	2	10	13399	13408	20 %	40 %	40 %	0 %	71279252
6	NC_003910	AGCAA	2	10	13569	13578	60 %	0 %	20 %	20 %	71279252
7	NC_003910	ATCCT	2	10	15599	15608	20 %	40 %	0 %	40 %	71280265
8	NC_003910	TCAAG	2	10	18857	18866	40 %	20 %	20 %	20 %	71280386
9	NC_003910	AAAAT	2	10	21124	21133	80 %	20 %	0 %	0 %	71279830
10	NC_003910	CAATA	2	10	23023	23032	60 %	20 %	0 %	20 %	71278391
11	NC_003910	TGCTG	2	10	23066	23075	0 %	40 %	40 %	20 %	71278391
12	NC_003910	TGTTT	2	10	23377	23386	0 %	80 %	20 %	0 %	71278391
13	NC_003910	ATTTA	2	10	25687	25696	40 %	60 %	0 %	0 %	71278476
14	NC_003910	TGATT	2	10	26546	26555	20 %	60 %	20 %	0 %	71278476
15	NC_003910	TTCAT	2	10	41025	41034	20 %	60 %	0 %	20 %	71279898
16	NC_003910	TGTTT	2	10	56714	56723	0 %	80 %	20 %	0 %	71278093
17	NC_003910	GTAAA	2	10	58873	58882	60 %	20 %	20 %	0 %	71282060
18	NC_003910	TTGTT	2	10	58889	58898	0 %	80 %	20 %	0 %	71282060
19	NC_003910	AGAAT	2	10	59056	59065	60 %	20 %	20 %	0 %	71280454
20	NC_003910	TAACC	2	10	64833	64842	40 %	20 %	0 %	40 %	71278638
21	NC_003910	TAGCG	2	10	65538	65547	20 %	20 %	40 %	20 %	71281279
22	NC_003910	TTATT	2	10	69476	69485	20 %	80 %	0 %	0 %	71279659
23	NC_003910	TTTAG	2	10	69742	69751	20 %	60 %	20 %	0 %	71279659
24	NC_003910	TTACT	2	10	72865	72874	20 %	60 %	0 %	20 %	71280040
25	NC_003910	TCATT	2	10	73839	73848	20 %	60 %	0 %	20 %	71278400
26	NC_003910	TCTTT	2	10	74534	74543	0 %	80 %	0 %	20 %	71279232
27	NC_003910	TAATA	2	10	77915	77924	60 %	40 %	0 %	0 %	71278494
28	NC_003910	ATTAA	2	10	79868	79877	60 %	40 %	0 %	0 %	71278746
29	NC_003910	TTACT	2	10	80977	80986	20 %	60 %	0 %	20 %	71282521
30	NC_003910	AAATT	2	10	87014	87023	60 %	40 %	0 %	0 %	71282216
31	NC_003910	CCGTA	2	10	89553	89562	20 %	20 %	20 %	40 %	71277809
32	NC_003910	GGTAT	2	10	89593	89602	20 %	40 %	40 %	0 %	71277809
33	NC_003910	TTTGG	2	10	90509	90518	0 %	60 %	40 %	0 %	71277809
34	NC_003910	CAAAT	2	10	92527	92536	60 %	20 %	0 %	20 %	71278732
35	NC_003910	AGTAA	2	10	92630	92639	60 %	20 %	20 %	0 %	71278732
36	NC_003910	TCAGT	2	10	93659	93668	20 %	40 %	20 %	20 %	71278732
37	NC_003910	GGTAT	2	10	94147	94156	20 %	40 %	40 %	0 %	71282214
38	NC_003910	GATTC	2	10	95656	95665	20 %	40 %	20 %	20 %	71282010
39	NC_003910	ATTTC	2	10	99526	99535	20 %	60 %	0 %	20 %	71280633
40	NC_003910	GAGGT	2	10	100479	100488	20 %	20 %	60 %	0 %	71280633
41	NC_003910	GAAAC	2	10	106030	106039	60 %	0 %	20 %	20 %	71277993
42	NC_003910	TGTTT	2	10	107609	107618	0 %	80 %	20 %	0 %	71282477
43	NC_003910	TATTG	2	10	108299	108308	20 %	60 %	20 %	0 %	71281924
44	NC_003910	GCATT	2	10	108467	108476	20 %	40 %	20 %	20 %	71281924
45	NC_003910	AGAAA	2	10	109233	109242	80 %	0 %	20 %	0 %	71278418
46	NC_003910	TAAAC	2	10	109382	109391	60 %	20 %	0 %	20 %	71278418
47	NC_003910	TTACA	2	10	109766	109775	40 %	40 %	0 %	20 %	71278418
48	NC_003910	GGAAT	2	10	110315	110324	40 %	20 %	40 %	0 %	71277981
49	NC_003910	TTTTA	2	10	115630	115639	20 %	80 %	0 %	0 %	71282300
50	NC_003910	GATCA	2	10	117396	117405	40 %	20 %	20 %	20 %	71281278
51	NC_003910	CTTTT	2	10	121435	121444	0 %	80 %	0 %	20 %	71281794
52	NC_003910	GATTG	2	10	121775	121784	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
53	NC_003910	TGATG	2	10	122071	122080	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
54	NC_003910	ATTTT	2	10	122525	122534	20 %	80 %	0 %	0 %	71282504
55	NC_003910	CTTTA	2	10	127175	127184	20 %	60 %	0 %	20 %	71282364
56	NC_003910	TTACT	2	10	128789	128798	20 %	60 %	0 %	20 %	71281635
57	NC_003910	TTGGG	2	10	128839	128848	0 %	40 %	60 %	0 %	71281635
58	NC_003910	TTTAG	2	10	130777	130786	20 %	60 %	20 %	0 %	71281364
59	NC_003910	TGGCA	2	10	130935	130944	20 %	20 %	40 %	20 %	71281364
60	NC_003910	TTTGG	2	10	130945	130954	0 %	60 %	40 %	0 %	71281364
61	NC_003910	TATTT	2	10	131235	131244	20 %	80 %	0 %	0 %	71281364
62	NC_003910	AAGGG	2	10	131531	131540	40 %	0 %	60 %	0 %	71278425
63	NC_003910	TAAGC	2	10	132254	132263	40 %	20 %	20 %	20 %	71278425
64	NC_003910	AATAG	2	10	132524	132533	60 %	20 %	20 %	0 %	71278425
65	NC_003910	GTGCT	2	10	132778	132787	0 %	40 %	40 %	20 %	71278425
66	NC_003910	ATTAT	2	10	133686	133695	40 %	60 %	0 %	0 %	71277902
67	NC_003910	AATAG	2	10	133926	133935	60 %	20 %	20 %	0 %	71277902
68	NC_003910	TTCTT	2	10	134121	134130	0 %	80 %	0 %	20 %	71277902
69	NC_003910	AGCGG	2	10	136701	136710	20 %	0 %	60 %	20 %	71281242
70	NC_003910	TTATC	2	10	137237	137246	20 %	60 %	0 %	20 %	71281242
71	NC_003910	TTTAT	2	10	137619	137628	20 %	80 %	0 %	0 %	71281242
72	NC_003910	AAATT	2	10	141020	141029	60 %	40 %	0 %	0 %	71281428
73	NC_003910	AGTTT	2	10	142804	142813	20 %	60 %	20 %	0 %	71278784
74	NC_003910	TGAGT	2	10	144287	144296	20 %	40 %	40 %	0 %	71279517
75	NC_003910	AACAG	2	10	148343	148352	60 %	0 %	20 %	20 %	71280909
76	NC_003910	GCTAT	2	10	152162	152171	20 %	40 %	20 %	20 %	71280394
77	NC_003910	AAAGT	2	10	155690	155699	60 %	20 %	20 %	0 %	71280524
78	NC_003910	AAATT	2	10	159973	159982	60 %	40 %	0 %	0 %	71282557
79	NC_003910	TTATA	2	10	160502	160511	40 %	60 %	0 %	0 %	71278303
80	NC_003910	TTGAA	2	10	160791	160800	40 %	40 %	20 %	0 %	71278303
81	NC_003910	GAAAA	2	10	160820	160829	80 %	0 %	20 %	0 %	71278303
82	NC_003910	AAACC	2	10	161926	161935	60 %	0 %	0 %	40 %	71281073
83	NC_003910	AGTAA	2	10	162137	162146	60 %	20 %	20 %	0 %	71281073
84	NC_003910	GATTG	2	10	165304	165313	20 %	40 %	40 %	0 %	71280373
85	NC_003910	TTTAA	2	10	165604	165613	40 %	60 %	0 %	0 %	71280373
86	NC_003910	CCAAA	2	10	166512	166521	60 %	0 %	0 %	40 %	71280110
87	NC_003910	CTTAC	2	10	170924	170933	20 %	40 %	0 %	40 %	71280363
88	NC_003910	ATGAA	2	10	173928	173937	60 %	20 %	20 %	0 %	71280824
89	NC_003910	ATCAG	2	10	174984	174993	40 %	20 %	20 %	20 %	71277787
90	NC_003910	CGAAT	2	10	176207	176216	40 %	20 %	20 %	20 %	71278984
91	NC_003910	TTAAC	2	10	176772	176781	40 %	40 %	0 %	20 %	71280723
92	NC_003910	CAAAC	2	10	178421	178430	60 %	0 %	0 %	40 %	71279107
93	NC_003910	CATTA	2	10	179728	179737	40 %	40 %	0 %	20 %	71282473
94	NC_003910	AATTT	2	10	181196	181205	40 %	60 %	0 %	0 %	71280441
95	NC_003910	AAGCT	2	10	182605	182614	40 %	20 %	20 %	20 %	71281498
96	NC_003910	AATTG	2	10	187806	187815	40 %	40 %	20 %	0 %	71279498
97	NC_003910	GGCAA	2	10	188174	188183	40 %	0 %	40 %	20 %	71279498
98	NC_003910	TTGCT	2	10	188830	188839	0 %	60 %	20 %	20 %	71279910
99	NC_003910	TTAGC	2	10	189037	189046	20 %	40 %	20 %	20 %	71279910
100	NC_003910	TATTT	2	10	189690	189699	20 %	80 %	0 %	0 %	71281177
101	NC_003910	GGAAA	2	10	198948	198957	60 %	0 %	40 %	0 %	71279081
102	NC_003910	TGCGC	2	10	201228	201237	0 %	20 %	40 %	40 %	71280682
103	NC_003910	TGTTT	2	10	202161	202170	0 %	80 %	20 %	0 %	71280682
104	NC_003910	TCTCT	2	10	203865	203874	0 %	60 %	0 %	40 %	71278072
105	NC_003910	GAAGC	2	10	207302	207311	40 %	0 %	40 %	20 %	71278759
106	NC_003910	AATTT	2	10	209345	209354	40 %	60 %	0 %	0 %	71279324
107	NC_003910	TTTGG	2	10	212285	212294	0 %	60 %	40 %	0 %	71279938
108	NC_003910	ATTTT	2	10	212630	212639	20 %	80 %	0 %	0 %	71279938
109	NC_003910	TTTGA	2	10	213781	213790	20 %	60 %	20 %	0 %	71279938
110	NC_003910	AAATA	2	10	214570	214579	80 %	20 %	0 %	0 %	71281060
111	NC_003910	GAAGC	2	10	214757	214766	40 %	0 %	40 %	20 %	71281060
112	NC_003910	TCGTT	2	10	216585	216594	0 %	60 %	20 %	20 %	71282371
113	NC_003910	ACCAA	2	10	217410	217419	60 %	0 %	0 %	40 %	71281811
114	NC_003910	TCGTT	2	10	218450	218459	0 %	60 %	20 %	20 %	71279933
115	NC_003910	CAAAA	2	10	220187	220196	80 %	0 %	0 %	20 %	71279847
116	NC_003910	TTGAA	2	10	221650	221659	40 %	40 %	20 %	0 %	71282462
117	NC_003910	GTTTG	2	10	225841	225850	0 %	60 %	40 %	0 %	71278674
118	NC_003910	TAACC	2	10	226967	226976	40 %	20 %	0 %	40 %	71278674
119	NC_003910	ATTGA	2	10	228647	228656	40 %	40 %	20 %	0 %	71282649
120	NC_003910	TGGCT	2	10	228988	228997	0 %	40 %	40 %	20 %	71281522
121	NC_003910	AATCA	2	10	232853	232862	60 %	20 %	0 %	20 %	71280042
122	NC_003910	ATTTC	2	10	236249	236258	20 %	60 %	0 %	20 %	71278219
123	NC_003910	AATAA	2	10	237102	237111	80 %	20 %	0 %	0 %	71279325
124	NC_003910	ATGTG	2	10	237270	237279	20 %	40 %	40 %	0 %	71279325
125	NC_003910	CTTTG	2	10	240893	240902	0 %	60 %	20 %	20 %	71281427
126	NC_003910	TTAAC	2	10	244532	244541	40 %	40 %	0 %	20 %	71279502
127	NC_003910	TATTT	2	10	245565	245574	20 %	80 %	0 %	0 %	71282146
128	NC_003910	TATGG	2	10	246214	246223	20 %	40 %	40 %	0 %	71282146
129	NC_003910	CTTAA	2	10	246492	246501	40 %	40 %	0 %	20 %	71281788
130	NC_003910	TTTTA	2	10	247886	247895	20 %	80 %	0 %	0 %	71278642
131	NC_003910	AATTC	2	10	249863	249872	40 %	40 %	0 %	20 %	71280279
132	NC_003910	GAGCT	2	10	250734	250743	20 %	20 %	40 %	20 %	71280279
133	NC_003910	TTTGG	2	10	251168	251177	0 %	60 %	40 %	0 %	71280279
134	NC_003910	GAAAA	2	10	251635	251644	80 %	0 %	20 %	0 %	71279361
135	NC_003910	AGCAG	2	10	254511	254520	40 %	0 %	40 %	20 %	71282096
136	NC_003910	TCAAT	2	10	255198	255207	40 %	40 %	0 %	20 %	71282096
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