MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 12576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	TTGG	2	8	68	75	0 %	50 %	50 %	0 %	71278268
2	NC_003910	TTGG	2	8	910	917	0 %	50 %	50 %	0 %	71278268
3	NC_003910	AACG	2	8	1192	1199	50 %	0 %	25 %	25 %	71278268
4	NC_003910	AACC	2	8	1304	1311	50 %	0 %	0 %	50 %	71278268
5	NC_003910	TGCC	2	8	1370	1377	0 %	25 %	25 %	50 %	71278268
6	NC_003910	GTCA	2	8	1611	1618	25 %	25 %	25 %	25 %	71279230
7	NC_003910	CCAA	2	8	1935	1942	50 %	0 %	0 %	50 %	71279230
8	NC_003910	CTTG	2	8	2812	2819	0 %	50 %	25 %	25 %	71280559
9	NC_003910	AATT	2	8	3494	3501	50 %	50 %	0 %	0 %	71280559
10	NC_003910	GTAT	2	8	3854	3861	25 %	50 %	25 %	0 %	71281227
11	NC_003910	CAAA	2	8	4810	4817	75 %	0 %	0 %	25 %	71281227
12	NC_003910	AAAG	2	8	5418	5425	75 %	0 %	25 %	0 %	71281227
13	NC_003910	TGAA	2	8	5510	5517	50 %	25 %	25 %	0 %	71281227
14	NC_003910	ATTT	2	8	5782	5789	25 %	75 %	0 %	0 %	71281227
15	NC_003910	TCAA	2	8	5893	5900	50 %	25 %	0 %	25 %	71281227
16	NC_003910	ACTT	2	8	7157	7164	25 %	50 %	0 %	25 %	71281893
17	NC_003910	GTAC	2	8	7216	7223	25 %	25 %	25 %	25 %	71281893
18	NC_003910	ATAA	2	8	7316	7323	75 %	25 %	0 %	0 %	71281893
19	NC_003910	TAAA	2	8	7738	7745	75 %	25 %	0 %	0 %	71281166
20	NC_003910	GAAC	2	8	7779	7786	50 %	0 %	25 %	25 %	71281166
21	NC_003910	CTTT	2	8	9022	9029	0 %	75 %	0 %	25 %	71281166
22	NC_003910	TCAA	2	8	9334	9341	50 %	25 %	0 %	25 %	71281166
23	NC_003910	AAAT	2	8	9881	9888	75 %	25 %	0 %	0 %	71281828
24	NC_003910	CGAG	2	8	10822	10829	25 %	0 %	50 %	25 %	71278597
25	NC_003910	CTGT	2	8	12004	12011	0 %	50 %	25 %	25 %	71279252
26	NC_003910	GCAA	2	8	12039	12046	50 %	0 %	25 %	25 %	71279252
27	NC_003910	TACT	2	8	12368	12375	25 %	50 %	0 %	25 %	71279252
28	NC_003910	AAAG	2	8	12700	12707	75 %	0 %	25 %	0 %	71279252
29	NC_003910	ATAG	2	8	12907	12914	50 %	25 %	25 %	0 %	71279252
30	NC_003910	ATTG	2	8	13044	13051	25 %	50 %	25 %	0 %	71279252
31	NC_003910	AATG	2	8	13083	13090	50 %	25 %	25 %	0 %	71279252
32	NC_003910	TGGT	2	8	13344	13351	0 %	50 %	50 %	0 %	71279252
33	NC_003910	AGCG	2	8	14418	14425	25 %	0 %	50 %	25 %	71280096
34	NC_003910	TAAA	2	8	14738	14745	75 %	25 %	0 %	0 %	71280096
35	NC_003910	ATCA	2	8	14798	14805	50 %	25 %	0 %	25 %	71280096
36	NC_003910	AATT	2	8	14891	14898	50 %	50 %	0 %	0 %	71280096
37	NC_003910	AAAC	2	8	15200	15207	75 %	0 %	0 %	25 %	71280096
38	NC_003910	TTGC	2	8	15250	15257	0 %	50 %	25 %	25 %	71280096
39	NC_003910	ATCA	2	8	15359	15366	50 %	25 %	0 %	25 %	71280096
40	NC_003910	ATTT	2	8	16803	16810	25 %	75 %	0 %	0 %	71281222
41	NC_003910	ACTG	2	8	17090	17097	25 %	25 %	25 %	25 %	71281222
42	NC_003910	TTTA	2	8	17326	17333	25 %	75 %	0 %	0 %	71281222
43	NC_003910	TAAA	2	8	17350	17357	75 %	25 %	0 %	0 %	71281222
44	NC_003910	TAAT	2	8	17833	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	71280386
45	NC_003910	AGCT	2	8	18170	18177	25 %	25 %	25 %	25 %	71280386
46	NC_003910	AATT	2	8	18243	18250	50 %	50 %	0 %	0 %	71280386
47	NC_003910	AATA	2	8	18677	18684	75 %	25 %	0 %	0 %	71280386
48	NC_003910	TTTA	2	8	18978	18985	25 %	75 %	0 %	0 %	71280386
49	NC_003910	GAAA	2	8	19068	19075	75 %	0 %	25 %	0 %	71280386
50	NC_003910	ACTT	2	8	19296	19303	25 %	50 %	0 %	25 %	71280386
51	NC_003910	TAAC	2	8	19304	19311	50 %	25 %	0 %	25 %	71280386
52	NC_003910	AAAG	2	8	20382	20389	75 %	0 %	25 %	0 %	71280386
53	NC_003910	CACT	2	8	21073	21080	25 %	25 %	0 %	50 %	71279830
54	NC_003910	CAAT	2	8	21172	21179	50 %	25 %	0 %	25 %	71279830
55	NC_003910	ACCA	2	8	21248	21255	50 %	0 %	0 %	50 %	71279830
56	NC_003910	AGCA	2	8	21482	21489	50 %	0 %	25 %	25 %	71279830
57	NC_003910	TCAA	2	8	21654	21661	50 %	25 %	0 %	25 %	71279830
58	NC_003910	TCAT	2	8	21765	21772	25 %	50 %	0 %	25 %	71279830
59	NC_003910	CGAA	2	8	22133	22140	50 %	0 %	25 %	25 %	71279830
60	NC_003910	GCCA	2	8	22530	22537	25 %	0 %	25 %	50 %	71278391
61	NC_003910	ACCA	2	8	23331	23338	50 %	0 %	0 %	50 %	71278391
62	NC_003910	TCAC	2	8	23492	23499	25 %	25 %	0 %	50 %	71278391
63	NC_003910	ATTA	2	8	23776	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	71278391
64	NC_003910	AATT	2	8	24704	24711	50 %	50 %	0 %	0 %	71278840
65	NC_003910	TACT	2	8	24809	24816	25 %	50 %	0 %	25 %	71279368
66	NC_003910	ATTC	2	8	26151	26158	25 %	50 %	0 %	25 %	71278476
67	NC_003910	TACA	2	8	26518	26525	50 %	25 %	0 %	25 %	71278476
68	NC_003910	CAAA	2	8	26938	26945	75 %	0 %	0 %	25 %	71277761
69	NC_003910	TTAA	2	8	27473	27480	50 %	50 %	0 %	0 %	71277761
70	NC_003910	AAAT	2	8	27618	27625	75 %	25 %	0 %	0 %	71277761
71	NC_003910	AGAA	2	8	28464	28471	75 %	0 %	25 %	0 %	71282080
72	NC_003910	TATT	2	8	29048	29055	25 %	75 %	0 %	0 %	71281551
73	NC_003910	AGCA	2	8	29246	29253	50 %	0 %	25 %	25 %	71281551
74	NC_003910	TCTG	2	8	30254	30261	0 %	50 %	25 %	25 %	71278206
75	NC_003910	AAGT	2	8	30571	30578	50 %	25 %	25 %	0 %	71278206
76	NC_003910	TCGT	2	8	31746	31753	0 %	50 %	25 %	25 %	71280990
77	NC_003910	TGAT	2	8	33300	33307	25 %	50 %	25 %	0 %	71280837
78	NC_003910	CTTT	2	8	33646	33653	0 %	75 %	0 %	25 %	71282491
79	NC_003910	TTCG	2	8	33937	33944	0 %	50 %	25 %	25 %	71282491
80	NC_003910	TTAG	2	8	34795	34802	25 %	50 %	25 %	0 %	71280609
81	NC_003910	AGTT	2	8	40787	40794	25 %	50 %	25 %	0 %	71279898
82	NC_003910	TTGT	2	8	40835	40842	0 %	75 %	25 %	0 %	71279898
83	NC_003910	AATT	2	8	41129	41136	50 %	50 %	0 %	0 %	71279898
84	NC_003910	TCAA	2	8	41364	41371	50 %	25 %	0 %	25 %	71279898
85	NC_003910	GTAC	2	8	41377	41384	25 %	25 %	25 %	25 %	71279898
86	NC_003910	GCCA	2	8	41595	41602	25 %	0 %	25 %	50 %	71279898
87	NC_003910	ATAA	2	8	41614	41621	75 %	25 %	0 %	0 %	71279898
88	NC_003910	AAAT	2	8	41745	41752	75 %	25 %	0 %	0 %	71279898
89	NC_003910	CAAA	2	8	41927	41934	75 %	0 %	0 %	25 %	71279898
90	NC_003910	AACT	2	8	43100	43107	50 %	25 %	0 %	25 %	71280656
91	NC_003910	AAGG	2	8	43273	43280	50 %	0 %	50 %	0 %	71280656
92	NC_003910	AATA	2	8	43569	43576	75 %	25 %	0 %	0 %	71280656
93	NC_003910	ATTT	2	8	56549	56556	25 %	75 %	0 %	0 %	71278093
94	NC_003910	TCAA	2	8	57287	57294	50 %	25 %	0 %	25 %	71278953
95	NC_003910	CTTA	2	8	57460	57467	25 %	50 %	0 %	25 %	71278953
96	NC_003910	AATT	2	8	58015	58022	50 %	50 %	0 %	0 %	71280048
97	NC_003910	GTAT	2	8	58055	58062	25 %	50 %	25 %	0 %	71280048
98	NC_003910	GAAA	2	8	58277	58284	75 %	0 %	25 %	0 %	71280048
99	NC_003910	TAGC	2	8	58291	58298	25 %	25 %	25 %	25 %	71280048
100	NC_003910	ATAG	2	8	58542	58549	50 %	25 %	25 %	0 %	71282060
101	NC_003910	AGCA	2	8	58633	58640	50 %	0 %	25 %	25 %	71282060
102	NC_003910	AACG	2	8	58716	58723	50 %	0 %	25 %	25 %	71282060
103	NC_003910	TCAA	2	8	58956	58963	50 %	25 %	0 %	25 %	71282060
104	NC_003910	ATCG	2	8	59427	59434	25 %	25 %	25 %	25 %	71280454
105	NC_003910	AAGC	2	8	59811	59818	50 %	0 %	25 %	25 %	71280454
106	NC_003910	ACCG	2	8	60844	60851	25 %	0 %	25 %	50 %	71282166
107	NC_003910	AGCA	2	8	60914	60921	50 %	0 %	25 %	25 %	71282166
108	NC_003910	CAAT	2	8	61922	61929	50 %	25 %	0 %	25 %	71280422
109	NC_003910	ATGA	2	8	62144	62151	50 %	25 %	25 %	0 %	71280422
110	NC_003910	GGTT	2	8	62359	62366	0 %	50 %	50 %	0 %	71280422
111	NC_003910	CAAC	2	8	62369	62376	50 %	0 %	0 %	50 %	71280422
112	NC_003910	TGGT	2	8	62901	62908	0 %	50 %	50 %	0 %	71280422
113	NC_003910	TATC	2	8	63197	63204	25 %	50 %	0 %	25 %	71278528
114	NC_003910	AGCA	2	8	63417	63424	50 %	0 %	25 %	25 %	71278528
115	NC_003910	ATCA	2	8	64453	64460	50 %	25 %	0 %	25 %	71281568
116	NC_003910	TGAG	2	8	64503	64510	25 %	25 %	50 %	0 %	71281568
117	NC_003910	AATA	2	8	64643	64650	75 %	25 %	0 %	0 %	71278638
118	NC_003910	ATAG	2	8	64688	64695	50 %	25 %	25 %	0 %	71278638
119	NC_003910	TAAG	2	8	64793	64800	50 %	25 %	25 %	0 %	71278638
120	NC_003910	GATA	2	8	65446	65453	50 %	25 %	25 %	0 %	71281798
121	NC_003910	TTAA	2	8	65788	65795	50 %	50 %	0 %	0 %	71281279
122	NC_003910	AATA	2	8	66163	66170	75 %	25 %	0 %	0 %	71281279
123	NC_003910	GTTG	2	8	67067	67074	0 %	50 %	50 %	0 %	71281279
124	NC_003910	GCTT	2	8	67270	67277	0 %	50 %	25 %	25 %	71281279
125	NC_003910	AAAT	2	8	67284	67291	75 %	25 %	0 %	0 %	71281279
126	NC_003910	TATT	2	8	68526	68533	25 %	75 %	0 %	0 %	71279659
127	NC_003910	GGTA	2	8	68922	68929	25 %	25 %	50 %	0 %	71279659
128	NC_003910	GTTT	2	8	68935	68942	0 %	75 %	25 %	0 %	71279659
129	NC_003910	GACT	2	8	69414	69421	25 %	25 %	25 %	25 %	71279659
130	NC_003910	TTTG	2	8	69468	69475	0 %	75 %	25 %	0 %	71279659
131	NC_003910	ATCG	2	8	70774	70781	25 %	25 %	25 %	25 %	71279659
132	NC_003910	TGAA	2	8	70877	70884	50 %	25 %	25 %	0 %	71279659
133	NC_003910	TGCT	2	8	71744	71751	0 %	50 %	25 %	25 %	71279659
134	NC_003910	TAAG	2	8	72456	72463	50 %	25 %	25 %	0 %	71280040
135	NC_003910	TATT	2	8	72487	72494	25 %	75 %	0 %	0 %	71280040
136	NC_003910	CAAA	2	8	72524	72531	75 %	0 %	0 %	25 %	71280040
137	NC_003910	TTCA	2	8	72605	72612	25 %	50 %	0 %	25 %	71280040
138	NC_003910	AAAC	2	8	72704	72711	75 %	0 %	0 %	25 %	71280040
139	NC_003910	CGGC	2	8	73328	73335	0 %	0 %	50 %	50 %	71280040
140	NC_003910	GTTA	2	8	73523	73530	25 %	50 %	25 %	0 %	71280040
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