MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003366	ATG	2	6	136989	136994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309081
2502	NC_003366	AAT	2	6	137053	137058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309081
2503	NC_003366	AGA	2	6	137089	137094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309081
2504	NC_003366	GAA	2	6	137177	137182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309081
2505	NC_003366	AGA	2	6	137215	137220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309081
2506	NC_003366	AGT	2	6	137260	137265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309081
2507	NC_003366	AATTA	2	10	137272	137281	60 %	40 %	0 %	0 %	18309081
2508	NC_003366	AGATA	2	10	137284	137293	60 %	20 %	20 %	0 %	18309081
2509	NC_003366	AAT	2	6	137316	137321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309081
2510	NC_003366	GAA	2	6	137348	137353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2511	NC_003366	AAT	2	6	137354	137359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309082
2512	NC_003366	CAG	2	6	137365	137370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2513	NC_003366	GTT	2	6	137445	137450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309082
2514	NC_003366	AAAG	2	8	137453	137460	75 %	0 %	25 %	0 %	18309082
2515	NC_003366	GTG	3	9	137491	137499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
2516	NC_003366	CTTCAC	2	12	137578	137589	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	18309082
2517	NC_003366	CTT	2	6	137640	137645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309082
2518	NC_003366	GTG	2	6	137662	137667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
2519	NC_003366	ATG	2	6	137670	137675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2520	NC_003366	AGA	2	6	137705	137710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2521	NC_003366	TGA	3	9	137738	137746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2522	NC_003366	AGC	2	6	137825	137830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2523	NC_003366	AGA	2	6	137852	137857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2524	NC_003366	GCT	2	6	137880	137885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2525	NC_003366	A	6	6	138019	138024	100 %	0 %	0 %	0 %	18309082
2526	NC_003366	CAG	2	6	138031	138036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2527	NC_003366	GAA	2	6	138093	138098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2528	NC_003366	CTC	2	6	138130	138135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18309082
2529	NC_003366	TATT	2	8	138147	138154	25 %	75 %	0 %	0 %	18309082
2530	NC_003366	AAC	2	6	138156	138161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309082
2531	NC_003366	AAT	2	6	138260	138265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309082
2532	NC_003366	TGA	2	6	138272	138277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2533	NC_003366	ATGA	2	8	138345	138352	50 %	25 %	25 %	0 %	18309082
2534	NC_003366	GAA	2	6	138357	138362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2535	NC_003366	GTA	2	6	138363	138368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2536	NC_003366	GAA	2	6	138372	138377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2537	NC_003366	TAA	2	6	138490	138495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309082
2538	NC_003366	AG	3	6	138588	138593	50 %	0 %	50 %	0 %	18309082
2539	NC_003366	AT	3	6	138601	138606	50 %	50 %	0 %	0 %	18309082
2540	NC_003366	TAGAAA	2	12	138607	138618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309082
2541	NC_003366	AT	3	6	138625	138630	50 %	50 %	0 %	0 %	18309082
2542	NC_003366	TGG	2	6	138674	138679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
2543	NC_003366	AGC	2	6	138713	138718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2544	NC_003366	ATG	2	6	138771	138776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2545	NC_003366	AAG	2	6	138778	138783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2546	NC_003366	A	6	6	138799	138804	100 %	0 %	0 %	0 %	18309082
2547	NC_003366	GAA	2	6	138900	138905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2548	NC_003366	AAG	2	6	138919	138924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2549	NC_003366	AGC	2	6	138944	138949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309082
2550	NC_003366	AGA	2	6	138971	138976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2551	NC_003366	TAG	2	6	138979	138984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
2552	NC_003366	AAG	2	6	139016	139021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
2553	NC_003366	TAAA	2	8	139088	139095	75 %	25 %	0 %	0 %	18309082
2554	NC_003366	ATA	2	6	139500	139505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309083
2555	NC_003366	ATT	2	6	139516	139521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309083
2556	NC_003366	ACT	2	6	139637	139642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309083
2557	NC_003366	GAA	2	6	139680	139685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309083
2558	NC_003366	AGGT	2	8	139719	139726	25 %	25 %	50 %	0 %	18309083
2559	NC_003366	CTT	2	6	139781	139786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309083
2560	NC_003366	AAT	2	6	139846	139851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309083
2561	NC_003366	CTTT	2	8	139857	139864	0 %	75 %	0 %	25 %	18309083
2562	NC_003366	AG	4	8	139873	139880	50 %	0 %	50 %	0 %	18309083
2563	NC_003366	GGT	2	6	139943	139948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309083
2564	NC_003366	AAT	2	6	140002	140007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309083
2565	NC_003366	T	6	6	140011	140016	0 %	100 %	0 %	0 %	18309083
2566	NC_003366	A	6	6	140061	140066	100 %	0 %	0 %	0 %	18309083
2567	NC_003366	AT	3	6	140158	140163	50 %	50 %	0 %	0 %	18309083
2568	NC_003366	TA	3	6	140206	140211	50 %	50 %	0 %	0 %	18309083
2569	NC_003366	ATTT	2	8	140250	140257	25 %	75 %	0 %	0 %	18309083
2570	NC_003366	GT	3	6	140285	140290	0 %	50 %	50 %	0 %	18309083
2571	NC_003366	AGC	2	6	140315	140320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309083
2572	NC_003366	ATA	2	6	140327	140332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309083
2573	NC_003366	TTTA	2	8	140340	140347	25 %	75 %	0 %	0 %	18309083
2574	NC_003366	ATT	2	6	140383	140388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309083
2575	NC_003366	GATT	2	8	140463	140470	25 %	50 %	25 %	0 %	18309083
2576	NC_003366	TTA	2	6	140489	140494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309083
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2580	NC_003366	TAT	2	6	140566	140571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309083
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2582	NC_003366	CAA	3	9	140709	140717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309083
2583	NC_003366	GAA	2	6	140727	140732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309083
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2585	NC_003366	T	7	7	140813	140819	0 %	100 %	0 %	0 %	18309083
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2591	NC_003366	A	6	6	141170	141175	100 %	0 %	0 %	0 %	18309084
2592	NC_003366	AGA	2	6	141178	141183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309084
2593	NC_003366	A	6	6	141187	141192	100 %	0 %	0 %	0 %	18309084
2594	NC_003366	AGA	2	6	141226	141231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309084
2595	NC_003366	TGAT	2	8	141246	141253	25 %	50 %	25 %	0 %	18309084
2596	NC_003366	AGA	2	6	141259	141264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309084
2597	NC_003366	TGA	2	6	141280	141285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309084
2598	NC_003366	AGA	2	6	141304	141309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309084
2599	NC_003366	GCT	2	6	141320	141325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309084
2600	NC_003366	TAGA	2	8	141354	141361	50 %	25 %	25 %	0 %	18309084
2601	NC_003366	AGA	2	6	141370	141375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309084
2602	NC_003366	AAT	2	6	141432	141437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309084
2603	NC_003366	CTAAT	2	10	141837	141846	40 %	40 %	0 %	20 %	18309085
2604	NC_003366	CGG	2	6	141878	141883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18309085
2605	NC_003366	TTTTCT	2	12	141895	141906	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	18309085
2606	NC_003366	TAG	2	6	141959	141964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309085
2607	NC_003366	TAAA	2	8	141972	141979	75 %	25 %	0 %	0 %	18309085
2608	NC_003366	AGA	2	6	142011	142016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309085
2609	NC_003366	TCA	2	6	142036	142041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309085
2610	NC_003366	TATT	2	8	142106	142113	25 %	75 %	0 %	0 %	18309085
2611	NC_003366	TTC	2	6	142197	142202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309085
2612	NC_003366	TA	3	6	142269	142274	50 %	50 %	0 %	0 %	18309085
2613	NC_003366	TG	3	6	142275	142280	0 %	50 %	50 %	0 %	18309085
2614	NC_003366	AT	3	6	142318	142323	50 %	50 %	0 %	0 %	18309085
2615	NC_003366	TA	3	6	142398	142403	50 %	50 %	0 %	0 %	18309085
2616	NC_003366	TAC	2	6	142428	142433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309085
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2621	NC_003366	CCTTAT	2	12	142661	142672	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	18309085
2622	NC_003366	CAA	2	6	142679	142684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309085
2623	NC_003366	TGT	2	6	142728	142733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309085
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