MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003366	AT	3	6	111814	111819	50 %	50 %	0 %	0 %	18309061
2002	NC_003366	ATTTTG	2	12	111835	111846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	18309061
2003	NC_003366	GCT	2	6	111873	111878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309061
2004	NC_003366	AT	3	6	111895	111900	50 %	50 %	0 %	0 %	18309061
2005	NC_003366	GAAAAA	2	12	111951	111962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309061
2006	NC_003366	T	6	6	111975	111980	0 %	100 %	0 %	0 %	18309061
2007	NC_003366	ATAA	2	8	111981	111988	75 %	25 %	0 %	0 %	18309061
2008	NC_003366	TAGA	2	8	111991	111998	50 %	25 %	25 %	0 %	18309061
2009	NC_003366	GAAAA	2	10	112081	112090	80 %	0 %	20 %	0 %	18309061
2010	NC_003366	A	6	6	112143	112148	100 %	0 %	0 %	0 %	18309061
2011	NC_003366	ATAA	2	8	112158	112165	75 %	25 %	0 %	0 %	18309061
2012	NC_003366	TGA	2	6	112241	112246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309061
2013	NC_003366	TGA	2	6	112289	112294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309061
2014	NC_003366	GAA	2	6	112323	112328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309061
2015	NC_003366	TG	3	6	112348	112353	0 %	50 %	50 %	0 %	18309061
2016	NC_003366	AAT	2	6	112455	112460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309061
2017	NC_003366	AAC	2	6	112577	112582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309061
2018	NC_003366	GATAA	2	10	112584	112593	60 %	20 %	20 %	0 %	18309061
2019	NC_003366	A	6	6	112604	112609	100 %	0 %	0 %	0 %	18309061
2020	NC_003366	TAA	2	6	112610	112615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309061
2021	NC_003366	AGTT	2	8	112625	112632	25 %	50 %	25 %	0 %	18309061
2022	NC_003366	ACAA	2	8	112664	112671	75 %	0 %	0 %	25 %	18309061
2023	NC_003366	TGA	2	6	112826	112831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309061
2024	NC_003366	A	6	6	112834	112839	100 %	0 %	0 %	0 %	18309061
2025	NC_003366	GA	3	6	112933	112938	50 %	0 %	50 %	0 %	18309061
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2027	NC_003366	A	6	6	113061	113066	100 %	0 %	0 %	0 %	18309061
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2031	NC_003366	GTT	2	6	113157	113162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309061
2032	NC_003366	GGA	2	6	113163	113168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309061
2033	NC_003366	TA	3	6	113184	113189	50 %	50 %	0 %	0 %	18309061
2034	NC_003366	CAG	2	6	113191	113196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309061
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2036	NC_003366	TACAT	2	10	113267	113276	40 %	40 %	0 %	20 %	18309061
2037	NC_003366	TCA	2	6	113301	113306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309061
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2041	NC_003366	AT	3	6	113417	113422	50 %	50 %	0 %	0 %	18309061
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2043	NC_003366	TGGAA	2	10	113468	113477	40 %	20 %	40 %	0 %	18309061
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2046	NC_003366	ATA	2	6	113631	113636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309061
2047	NC_003366	AAG	2	6	113656	113661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309061
2048	NC_003366	TA	3	6	114164	114169	50 %	50 %	0 %	0 %	18309062
2049	NC_003366	TTG	2	6	114174	114179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309062
2050	NC_003366	ATGT	2	8	114180	114187	25 %	50 %	25 %	0 %	18309062
2051	NC_003366	GAT	3	9	114218	114226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309062
2052	NC_003366	TAT	2	6	114235	114240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309062
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2054	NC_003366	A	6	6	114274	114279	100 %	0 %	0 %	0 %	18309062
2055	NC_003366	TA	3	6	114308	114313	50 %	50 %	0 %	0 %	18309062
2056	NC_003366	A	7	7	114320	114326	100 %	0 %	0 %	0 %	18309062
2057	NC_003366	GAA	2	6	114588	114593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309063
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2059	NC_003366	AGCA	2	8	114704	114711	50 %	0 %	25 %	25 %	18309063
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2063	NC_003366	ATG	2	6	114920	114925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309063
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2065	NC_003366	TA	3	6	114988	114993	50 %	50 %	0 %	0 %	18309063
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2124	NC_003366	GGAG	2	8	119465	119472	25 %	0 %	75 %	0 %	18309067
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