MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_003366	TAG	2	6	78586	78591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309043
1503	NC_003366	ATG	2	6	78600	78605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309043
1504	NC_003366	CCAG	2	8	78627	78634	25 %	0 %	25 %	50 %	18309043
1505	NC_003366	TTA	2	6	78678	78683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309043
1506	NC_003366	AGG	2	6	78749	78754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309043
1507	NC_003366	TTGGA	2	10	78830	78839	20 %	40 %	40 %	0 %	18309043
1508	NC_003366	CTA	2	6	78844	78849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309043
1509	NC_003366	TTA	2	6	78859	78864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309043
1510	NC_003366	AAT	2	6	78908	78913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309043
1511	NC_003366	CTT	2	6	78917	78922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309043
1512	NC_003366	AT	3	6	78953	78958	50 %	50 %	0 %	0 %	18309043
1513	NC_003366	TAA	2	6	79000	79005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309043
1514	NC_003366	TAT	2	6	79021	79026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309043
1515	NC_003366	TTC	2	6	79032	79037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309043
1516	NC_003366	GTT	2	6	79041	79046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309043
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1519	NC_003366	A	7	7	79198	79204	100 %	0 %	0 %	0 %	18309043
1520	NC_003366	TA	4	8	79249	79256	50 %	50 %	0 %	0 %	18309043
1521	NC_003366	TAA	2	6	79258	79263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309043
1522	NC_003366	ATA	2	6	79329	79334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309043
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1525	NC_003366	TAT	2	6	79417	79422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309043
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1528	NC_003366	GTA	2	6	79528	79533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309043
1529	NC_003366	ATATT	2	10	79543	79552	40 %	60 %	0 %	0 %	18309043
1530	NC_003366	TTAC	2	8	79619	79626	25 %	50 %	0 %	25 %	18309043
1531	NC_003366	AT	3	6	79629	79634	50 %	50 %	0 %	0 %	18309043
1532	NC_003366	CTA	2	6	79642	79647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309043
1533	NC_003366	ATA	2	6	79656	79661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309043
1534	NC_003366	A	6	6	79680	79685	100 %	0 %	0 %	0 %	18309043
1535	NC_003366	A	6	6	79695	79700	100 %	0 %	0 %	0 %	18309043
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1539	NC_003366	ATTT	2	8	79790	79797	25 %	75 %	0 %	0 %	18309043
1540	NC_003366	AT	3	6	79826	79831	50 %	50 %	0 %	0 %	18309043
1541	NC_003366	A	7	7	79838	79844	100 %	0 %	0 %	0 %	18309043
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1543	NC_003366	A	7	7	80031	80037	100 %	0 %	0 %	0 %	18309044
1544	NC_003366	A	6	6	80087	80092	100 %	0 %	0 %	0 %	18309044
1545	NC_003366	AGA	3	9	80096	80104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309044
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1548	NC_003366	TAG	2	6	80487	80492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309045
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1552	NC_003366	GAT	2	6	80582	80587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309045
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1554	NC_003366	T	7	7	80709	80715	0 %	100 %	0 %	0 %	18309045
1555	NC_003366	AGA	2	6	80746	80751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309045
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1557	NC_003366	TAAGTA	2	12	80821	80832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	18309045
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1559	NC_003366	A	6	6	80928	80933	100 %	0 %	0 %	0 %	18309045
1560	NC_003366	TAAA	2	8	80964	80971	75 %	25 %	0 %	0 %	18309045
1561	NC_003366	AGA	2	6	80974	80979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309045
1562	NC_003366	ATT	2	6	80985	80990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309045
1563	NC_003366	AT	4	8	81006	81013	50 %	50 %	0 %	0 %	18309045
1564	NC_003366	GAAAA	2	10	81034	81043	80 %	0 %	20 %	0 %	18309045
1565	NC_003366	GATGAG	2	12	81044	81055	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	18309045
1566	NC_003366	ATG	2	6	81066	81071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309045
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1571	NC_003366	ATA	2	6	81369	81374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309045
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1574	NC_003366	GGA	2	6	81554	81559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309045
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1579	NC_003366	TA	4	8	81763	81770	50 %	50 %	0 %	0 %	18309045
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1588	NC_003366	AT	3	6	81937	81942	50 %	50 %	0 %	0 %	18309045
1589	NC_003366	A	6	6	81959	81964	100 %	0 %	0 %	0 %	18309045
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1599	NC_003366	GAA	2	6	82454	82459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309045
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1601	NC_003366	AGA	2	6	82486	82491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309045
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1609	NC_003366	TGA	2	6	82855	82860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309046
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1611	NC_003366	CTTT	2	8	82875	82882	0 %	75 %	0 %	25 %	18309046
1612	NC_003366	GATT	2	8	82912	82919	25 %	50 %	25 %	0 %	18309046
1613	NC_003366	ATT	2	6	82931	82936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309046
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1616	NC_003366	TTA	2	6	83249	83254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309046
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1619	NC_003366	TAAA	2	8	83376	83383	75 %	25 %	0 %	0 %	18309046
1620	NC_003366	AT	3	6	83639	83644	50 %	50 %	0 %	0 %	18309046
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