MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003366	CAG	2	6	49170	49175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309018
1003	NC_003366	A	6	6	49213	49218	100 %	0 %	0 %	0 %	18309018
1004	NC_003366	GAT	2	6	49316	49321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309018
1005	NC_003366	GCA	2	6	49331	49336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309018
1006	NC_003366	CAG	2	6	49368	49373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309018
1007	NC_003366	AT	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	18309018
1008	NC_003366	TAG	2	6	49446	49451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309018
1009	NC_003366	GTG	2	6	49467	49472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309018
1010	NC_003366	TGA	2	6	49627	49632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309018
1011	NC_003366	AGAAAA	2	12	49652	49663	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	18309018
1012	NC_003366	ATA	2	6	49706	49711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309018
1013	NC_003366	GTA	2	6	49727	49732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309018
1014	NC_003366	TATAA	2	10	49772	49781	60 %	40 %	0 %	0 %	18309018
1015	NC_003366	AAT	2	6	49782	49787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309018
1016	NC_003366	ACT	2	6	50016	50021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309019
1017	NC_003366	TAA	2	6	50023	50028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309019
1018	NC_003366	A	6	6	50027	50032	100 %	0 %	0 %	0 %	18309019
1019	NC_003366	AGA	2	6	50124	50129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309019
1020	NC_003366	AATT	2	8	50144	50151	50 %	50 %	0 %	0 %	18309019
1021	NC_003366	ATA	2	6	50205	50210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309019
1022	NC_003366	AAG	2	6	50287	50292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309019
1023	NC_003366	AATA	2	8	50312	50319	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
1024	NC_003366	AAT	2	6	50411	50416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309019
1025	NC_003366	TAAG	2	8	50515	50522	50 %	25 %	25 %	0 %	18309019
1026	NC_003366	AGAA	2	8	50531	50538	75 %	0 %	25 %	0 %	18309019
1027	NC_003366	A	6	6	50556	50561	100 %	0 %	0 %	0 %	18309019
1028	NC_003366	AAG	2	6	50615	50620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309019
1029	NC_003366	T	6	6	50637	50642	0 %	100 %	0 %	0 %	18309019
1030	NC_003366	ATA	2	6	50751	50756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309019
1031	NC_003366	ATA	2	6	50767	50772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309019
1032	NC_003366	GAA	2	6	50857	50862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309019
1033	NC_003366	TAAA	2	8	50866	50873	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
1034	NC_003366	ATT	2	6	50888	50893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309019
1035	NC_003366	A	6	6	50923	50928	100 %	0 %	0 %	0 %	18309020
1036	NC_003366	TAA	2	6	50942	50947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309020
1037	NC_003366	T	6	6	50952	50957	0 %	100 %	0 %	0 %	18309020
1038	NC_003366	ATC	2	6	50958	50963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309020
1039	NC_003366	GAT	2	6	50995	51000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309020
1040	NC_003366	AGG	3	9	51008	51016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309020
1041	NC_003366	GAA	2	6	51046	51051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309020
1042	NC_003366	TAA	2	6	51053	51058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309020
1043	NC_003366	A	6	6	51081	51086	100 %	0 %	0 %	0 %	18309020
1044	NC_003366	TAA	2	6	51122	51127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309020
1045	NC_003366	AG	3	6	51152	51157	50 %	0 %	50 %	0 %	18309020
1046	NC_003366	TTAAT	2	10	51254	51263	40 %	60 %	0 %	0 %	18309020
1047	NC_003366	ATA	2	6	51310	51315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309020
1048	NC_003366	AAGG	2	8	51445	51452	50 %	0 %	50 %	0 %	18309020
1049	NC_003366	AAAG	2	8	51472	51479	75 %	0 %	25 %	0 %	18309020
1050	NC_003366	GAT	2	6	51492	51497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309020
1051	NC_003366	TAAA	2	8	51517	51524	75 %	25 %	0 %	0 %	18309021
1052	NC_003366	TAGTA	2	10	51542	51551	40 %	40 %	20 %	0 %	18309021
1053	NC_003366	TAA	2	6	51629	51634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309021
1054	NC_003366	ATT	2	6	51653	51658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309021
1055	NC_003366	ATA	2	6	51678	51683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309021
1056	NC_003366	T	7	7	51688	51694	0 %	100 %	0 %	0 %	18309021
1057	NC_003366	ATT	2	6	51734	51739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309021
1058	NC_003366	GCT	2	6	51783	51788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309021
1059	NC_003366	GTA	2	6	51849	51854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309021
1060	NC_003366	TTG	2	6	51855	51860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309021
1061	NC_003366	ATA	2	6	51928	51933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309021
1062	NC_003366	AGAT	2	8	51991	51998	50 %	25 %	25 %	0 %	18309021
1063	NC_003366	AGC	2	6	52088	52093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309021
1064	NC_003366	ATT	2	6	52122	52127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309021
1065	NC_003366	T	6	6	52126	52131	0 %	100 %	0 %	0 %	18309021
1066	NC_003366	AAT	3	9	52157	52165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309021
1067	NC_003366	TTG	2	6	52216	52221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309021
1068	NC_003366	A	6	6	52295	52300	100 %	0 %	0 %	0 %	18309021
1069	NC_003366	AAT	2	6	52304	52309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309021
1070	NC_003366	A	6	6	52326	52331	100 %	0 %	0 %	0 %	18309021
1071	NC_003366	AGG	2	6	52400	52405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309021
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1073	NC_003366	TAT	2	6	52453	52458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309022
1074	NC_003366	T	7	7	52504	52510	0 %	100 %	0 %	0 %	18309022
1075	NC_003366	ATA	2	6	52551	52556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309022
1076	NC_003366	TTA	2	6	52557	52562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309022
1077	NC_003366	ATTTTT	2	12	52638	52649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	18309022
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1079	NC_003366	AG	3	6	52742	52747	50 %	0 %	50 %	0 %	18309022
1080	NC_003366	AGA	2	6	52832	52837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309022
1081	NC_003366	AGA	2	6	52853	52858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309022
1082	NC_003366	AGA	2	6	52919	52924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309022
1083	NC_003366	TGC	2	6	52953	52958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309022
1084	NC_003366	TAT	2	6	52984	52989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309022
1085	NC_003366	A	6	6	53012	53017	100 %	0 %	0 %	0 %	18309022
1086	NC_003366	GAA	2	6	53079	53084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309022
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1090	NC_003366	TAT	2	6	53565	53570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309023
1091	NC_003366	GGA	2	6	53665	53670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309023
1092	NC_003366	ATA	2	6	53671	53676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309023
1093	NC_003366	ATTT	2	8	53694	53701	25 %	75 %	0 %	0 %	18309023
1094	NC_003366	A	6	6	53713	53718	100 %	0 %	0 %	0 %	18309023
1095	NC_003366	T	6	6	53724	53729	0 %	100 %	0 %	0 %	18309023
1096	NC_003366	T	7	7	53793	53799	0 %	100 %	0 %	0 %	18309023
1097	NC_003366	TGG	2	6	53814	53819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309023
1098	NC_003366	TTA	2	6	53837	53842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309023
1099	NC_003366	ATC	2	6	53894	53899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309023
1100	NC_003366	AT	3	6	53927	53932	50 %	50 %	0 %	0 %	18309023
1101	NC_003366	TGA	2	6	53948	53953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309023
1102	NC_003366	TA	3	6	53960	53965	50 %	50 %	0 %	0 %	18309023
1103	NC_003366	AGAT	2	8	53973	53980	50 %	25 %	25 %	0 %	18309023
1104	NC_003366	AGT	2	6	53988	53993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309023
1105	NC_003366	TA	3	6	54004	54009	50 %	50 %	0 %	0 %	18309023
1106	NC_003366	TTAG	2	8	54091	54098	25 %	50 %	25 %	0 %	18309023
1107	NC_003366	ATT	3	9	54109	54117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309023
1108	NC_003366	AAT	3	9	54129	54137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309023
1109	NC_003366	GAAA	2	8	54152	54159	75 %	0 %	25 %	0 %	18309023
1110	NC_003366	GAA	2	6	54963	54968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309024
1111	NC_003366	GTA	2	6	55020	55025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309024
1112	NC_003366	A	7	7	55035	55041	100 %	0 %	0 %	0 %	18309024
1113	NC_003366	CAAT	2	8	55044	55051	50 %	25 %	0 %	25 %	18309024
1114	NC_003366	GAA	3	9	55073	55081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309024
1115	NC_003366	A	6	6	55080	55085	100 %	0 %	0 %	0 %	18309024
1116	NC_003366	GAA	2	6	55094	55099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309024
1117	NC_003366	TCA	2	6	55118	55123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309024
1118	NC_003366	A	6	6	55156	55161	100 %	0 %	0 %	0 %	18309024
1119	NC_003366	TAAAT	2	10	55186	55195	60 %	40 %	0 %	0 %	18309024
1120	NC_003366	T	7	7	55231	55237	0 %	100 %	0 %	0 %	18309024
1121	NC_003366	ATG	2	6	55296	55301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309024
1122	NC_003366	ATA	2	6	55304	55309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309024
1123	NC_003366	AAT	2	6	55310	55315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309024
1124	NC_003366	CTT	2	6	55332	55337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309024
1125	NC_003366	GAA	2	6	55348	55353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309024
1126	NC_003366	ATG	2	6	55359	55364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309024
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1128	NC_003366	TAG	2	6	55425	55430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309024
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