MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003366	AGA	2	6	28173	28178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309002
502	NC_003366	TAG	2	6	28196	28201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309002
503	NC_003366	A	6	6	28266	28271	100 %	0 %	0 %	0 %	18309002
504	NC_003366	ATG	2	6	28274	28279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309002
505	NC_003366	GAAA	2	8	28341	28348	75 %	0 %	25 %	0 %	18309002
506	NC_003366	ATA	2	6	28394	28399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
507	NC_003366	ATA	2	6	28433	28438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
508	NC_003366	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	18309002
509	NC_003366	TA	3	6	28501	28506	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
510	NC_003366	AT	3	6	28537	28542	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
511	NC_003366	ATA	2	6	28660	28665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
512	NC_003366	ATA	2	6	28694	28699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
513	NC_003366	AGAT	2	8	28743	28750	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
514	NC_003366	CCTT	2	8	28875	28882	0 %	50 %	0 %	50 %	18309002
515	NC_003366	TTTA	2	8	28895	28902	25 %	75 %	0 %	0 %	18309002
516	NC_003366	GAA	2	6	28907	28912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309002
517	NC_003366	TAGA	2	8	28913	28920	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
518	NC_003366	TAAAT	2	10	28926	28935	60 %	40 %	0 %	0 %	18309002
519	NC_003366	TAAA	2	8	28997	29004	75 %	25 %	0 %	0 %	18309002
520	NC_003366	AAT	2	6	29056	29061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
521	NC_003366	AGA	3	9	29154	29162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309002
522	NC_003366	GTT	2	6	29224	29229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309002
523	NC_003366	ATA	2	6	29240	29245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
524	NC_003366	AC	3	6	29260	29265	50 %	0 %	0 %	50 %	18309002
525	NC_003366	A	6	6	29310	29315	100 %	0 %	0 %	0 %	18309002
526	NC_003366	TAA	2	6	29324	29329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309002
527	NC_003366	ATT	2	6	29346	29351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309002
528	NC_003366	A	6	6	29369	29374	100 %	0 %	0 %	0 %	18309002
529	NC_003366	AAAATA	2	12	29432	29443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309002
530	NC_003366	GT	3	6	29446	29451	0 %	50 %	50 %	0 %	18309002
531	NC_003366	ATT	2	6	29453	29458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309002
532	NC_003366	ACT	2	6	29462	29467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309002
533	NC_003366	AT	3	6	29471	29476	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
534	NC_003366	AGA	2	6	29496	29501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309002
535	NC_003366	A	6	6	29527	29532	100 %	0 %	0 %	0 %	18309002
536	NC_003366	GGT	2	6	29569	29574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309002
537	NC_003366	GAA	2	6	29600	29605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
538	NC_003366	TAG	2	6	29643	29648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
539	NC_003366	GCT	3	9	29651	29659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309003
540	NC_003366	CTG	2	6	29673	29678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309003
541	NC_003366	GTT	2	6	29747	29752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309003
542	NC_003366	TGC	3	9	29764	29772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309003
543	NC_003366	GA	5	10	29782	29791	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
544	NC_003366	AAC	2	6	29881	29886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309003
545	NC_003366	A	6	6	29914	29919	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
546	NC_003366	GAT	2	6	30032	30037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
547	NC_003366	TGG	2	6	30067	30072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309003
548	NC_003366	TGA	2	6	30082	30087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
549	NC_003366	ATA	2	6	30101	30106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
550	NC_003366	AAG	2	6	30209	30214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
551	NC_003366	AAT	2	6	30254	30259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
552	NC_003366	CAAG	2	8	30278	30285	50 %	0 %	25 %	25 %	18309003
553	NC_003366	GGA	2	6	30305	30310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309003
554	NC_003366	AAT	2	6	30343	30348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
555	NC_003366	TAA	2	6	30400	30405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
556	NC_003366	TGA	3	9	30457	30465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
557	NC_003366	A	6	6	30477	30482	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
558	NC_003366	A	7	7	30506	30512	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
559	NC_003366	CTT	2	6	30546	30551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309003
560	NC_003366	AGA	2	6	30553	30558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
561	NC_003366	A	7	7	30644	30650	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
562	NC_003366	GAA	2	6	30773	30778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
563	NC_003366	TGA	2	6	30787	30792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
564	NC_003366	AAG	2	6	30841	30846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
565	NC_003366	TA	4	8	30895	30902	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
566	NC_003366	AT	3	6	30940	30945	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
567	NC_003366	AG	3	6	30953	30958	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
568	NC_003366	AAT	2	6	30979	30984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
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570	NC_003366	AAT	2	6	31015	31020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
571	NC_003366	ATG	2	6	31080	31085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
572	NC_003366	GAA	2	6	31130	31135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
573	NC_003366	AGAA	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	18309003
574	NC_003366	TA	3	6	31151	31156	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
575	NC_003366	TAAA	2	8	31206	31213	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
576	NC_003366	TGA	2	6	31234	31239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
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578	NC_003366	AAT	2	6	31294	31299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
579	NC_003366	CTTA	2	8	31408	31415	25 %	50 %	0 %	25 %	18309003
580	NC_003366	TGA	2	6	31447	31452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
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584	NC_003366	TA	3	6	31571	31576	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
585	NC_003366	GAA	2	6	31616	31621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
586	NC_003366	ATT	2	6	31636	31641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309003
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588	NC_003366	ATA	2	6	31667	31672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
589	NC_003366	ATG	2	6	31695	31700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
590	NC_003366	GTAAGT	2	12	31725	31736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309003
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592	NC_003366	GA	3	6	31762	31767	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
593	NC_003366	ATTT	2	8	31795	31802	25 %	75 %	0 %	0 %	18309003
594	NC_003366	CAT	2	6	31821	31826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309003
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596	NC_003366	ATT	2	6	31930	31935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309003
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598	NC_003366	TCT	2	6	31970	31975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309003
599	NC_003366	TGT	2	6	32017	32022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309003
600	NC_003366	TGT	2	6	32065	32070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309003
601	NC_003366	AGA	2	6	32116	32121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
602	NC_003366	CTT	2	6	32126	32131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309003
603	NC_003366	AAG	2	6	32171	32176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
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605	NC_003366	ATTA	2	8	32290	32297	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
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611	NC_003366	A	7	7	32571	32577	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
612	NC_003366	TAA	2	6	32599	32604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
613	NC_003366	A	6	6	32618	32623	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
614	NC_003366	TAAATA	2	12	32665	32676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309003
615	NC_003366	TA	3	6	32675	32680	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
616	NC_003366	AG	3	6	32724	32729	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
617	NC_003366	TCA	2	6	32731	32736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309003
618	NC_003366	AGA	3	9	32737	32745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
619	NC_003366	ATT	2	6	32768	32773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309003
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621	NC_003366	A	6	6	32798	32803	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
622	NC_003366	A	6	6	32805	32810	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
623	NC_003366	GGA	2	6	32833	32838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309003
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626	NC_003366	AAG	2	6	32864	32869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
627	NC_003366	TA	3	6	32921	32926	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
628	NC_003366	AGA	2	6	32938	32943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
629	NC_003366	A	7	7	32959	32965	100 %	0 %	0 %	0 %	18309003
630	NC_003366	AGA	3	9	32977	32985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309003
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