MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003366	AGA	2	6	303316	303321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309213
6002	NC_003366	AGTA	2	8	303361	303368	50 %	25 %	25 %	0 %	18309213
6003	NC_003366	ATA	2	6	303385	303390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309213
6004	NC_003366	TATCT	2	10	303552	303561	20 %	60 %	0 %	20 %	18309214
6005	NC_003366	TCTTTA	2	12	303578	303589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18309214
6006	NC_003366	AAG	2	6	303603	303608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309214
6007	NC_003366	AATG	2	8	303615	303622	50 %	25 %	25 %	0 %	18309214
6008	NC_003366	CTA	2	6	303626	303631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309214
6009	NC_003366	TCCA	2	8	303653	303660	25 %	25 %	0 %	50 %	18309214
6010	NC_003366	AAG	2	6	303708	303713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309214
6011	NC_003366	TAA	2	6	303792	303797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309214
6012	NC_003366	CATA	2	8	303900	303907	50 %	25 %	0 %	25 %	18309214
6013	NC_003366	GCA	2	6	303982	303987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309214
6014	NC_003366	AGC	2	6	304020	304025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309214
6015	NC_003366	TA	3	6	304051	304056	50 %	50 %	0 %	0 %	18309214
6016	NC_003366	AAC	2	6	304068	304073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309214
6017	NC_003366	TTA	2	6	304082	304087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309214
6018	NC_003366	ATTT	2	8	304127	304134	25 %	75 %	0 %	0 %	18309214
6019	NC_003366	ATT	2	6	304153	304158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309214
6020	NC_003366	GTT	2	6	304174	304179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309214
6021	NC_003366	TTC	2	6	304221	304226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309214
6022	NC_003366	CTA	2	6	304286	304291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309214
6023	NC_003366	ATT	2	6	304300	304305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309214
6024	NC_003366	ATTG	2	8	304321	304328	25 %	50 %	25 %	0 %	18309214
6025	NC_003366	TAA	2	6	304350	304355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309214
6026	NC_003366	TAT	2	6	304394	304399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309214
6027	NC_003366	CTTT	2	8	304432	304439	0 %	75 %	0 %	25 %	18309214
6028	NC_003366	GA	3	6	304442	304447	50 %	0 %	50 %	0 %	18309214
6029	NC_003366	TGG	2	6	304473	304478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309214
6030	NC_003366	GAA	2	6	304494	304499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309214
6031	NC_003366	TGA	2	6	304569	304574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309214
6032	NC_003366	ATTTG	2	10	304608	304617	20 %	60 %	20 %	0 %	18309214
6033	NC_003366	ACTT	2	8	304640	304647	25 %	50 %	0 %	25 %	18309214
6034	NC_003366	T	6	6	304744	304749	0 %	100 %	0 %	0 %	18309214
6035	NC_003366	CTAA	2	8	304750	304757	50 %	25 %	0 %	25 %	18309214
6036	NC_003366	GTA	2	6	304758	304763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309214
6037	NC_003366	AATA	2	8	304776	304783	75 %	25 %	0 %	0 %	18309214
6038	NC_003366	ATACGA	2	12	304795	304806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309214
6039	NC_003366	TGA	2	6	304821	304826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309214
6040	NC_003366	A	6	6	304869	304874	100 %	0 %	0 %	0 %	18309214
6041	NC_003366	TTAA	2	8	305080	305087	50 %	50 %	0 %	0 %	18309215
6042	NC_003366	ATT	2	6	305090	305095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309215
6043	NC_003366	ATT	2	6	305112	305117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309215
6044	NC_003366	T	6	6	305116	305121	0 %	100 %	0 %	0 %	18309215
6045	NC_003366	CAG	2	6	305131	305136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309215
6046	NC_003366	AT	3	6	305159	305164	50 %	50 %	0 %	0 %	18309215
6047	NC_003366	TAG	2	6	305191	305196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309215
6048	NC_003366	ATA	2	6	305242	305247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309215
6049	NC_003366	T	6	6	305272	305277	0 %	100 %	0 %	0 %	18309215
6050	NC_003366	TTTC	2	8	305503	305510	0 %	75 %	0 %	25 %	18309215
6051	NC_003366	TAT	2	6	305576	305581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309215
6052	NC_003366	TAA	2	6	305603	305608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309215
6053	NC_003366	TAGGG	2	10	305623	305632	20 %	20 %	60 %	0 %	18309215
6054	NC_003366	ATT	2	6	305744	305749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309215
6055	NC_003366	TTC	2	6	305768	305773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309215
6056	NC_003366	CAT	2	6	305779	305784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309215
6057	NC_003366	CCA	2	6	305817	305822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18309215
6058	NC_003366	CTT	2	6	305875	305880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309215
6059	NC_003366	TA	3	6	305894	305899	50 %	50 %	0 %	0 %	18309215
6060	NC_003366	AAG	2	6	305936	305941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309215
6061	NC_003366	CTT	2	6	305953	305958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309215
6062	NC_003366	AG	3	6	305964	305969	50 %	0 %	50 %	0 %	18309215
6063	NC_003366	AAC	2	6	305975	305980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309215
6064	NC_003366	CTTTT	2	10	306011	306020	0 %	80 %	0 %	20 %	18309215
6065	NC_003366	T	7	7	306017	306023	0 %	100 %	0 %	0 %	18309215
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6067	NC_003366	TAG	2	6	306047	306052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309215
6068	NC_003366	T	7	7	306079	306085	0 %	100 %	0 %	0 %	18309215
6069	NC_003366	TTC	2	6	306096	306101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309215
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6071	NC_003366	TCA	2	6	306139	306144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309216
6072	NC_003366	TA	3	6	306183	306188	50 %	50 %	0 %	0 %	18309216
6073	NC_003366	TAT	2	6	306194	306199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309216
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6075	NC_003366	TA	3	6	306227	306232	50 %	50 %	0 %	0 %	18309216
6076	NC_003366	ATG	2	6	306240	306245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309216
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6089	NC_003366	TTA	2	6	306628	306633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309216
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6102	NC_003366	TTGTT	2	10	307171	307180	0 %	80 %	20 %	0 %	18309217
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6111	NC_003366	A	6	6	307504	307509	100 %	0 %	0 %	0 %	18309217
6112	NC_003366	T	8	8	307510	307517	0 %	100 %	0 %	0 %	18309217
6113	NC_003366	TA	3	6	307546	307551	50 %	50 %	0 %	0 %	18309217
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6124	NC_003366	ATT	2	6	307997	308002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309217
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