MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 68021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_003366	TAAAT	2	10	253765	253774	60 %	40 %	0 %	0 %	18309179
5003	NC_003366	TA	4	8	253785	253792	50 %	50 %	0 %	0 %	18309179
5004	NC_003366	AT	4	8	253798	253805	50 %	50 %	0 %	0 %	18309179
5005	NC_003366	TTG	2	6	253822	253827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309179
5006	NC_003366	TGA	2	6	253840	253845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309179
5007	NC_003366	AT	3	6	253931	253936	50 %	50 %	0 %	0 %	18309179
5008	NC_003366	ATT	2	6	253977	253982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309179
5009	NC_003366	AGT	2	6	253987	253992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309179
5010	NC_003366	ATC	2	6	254107	254112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309179
5011	NC_003366	GCA	2	6	254117	254122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309179
5012	NC_003366	TA	4	8	254158	254165	50 %	50 %	0 %	0 %	18309179
5013	NC_003366	TGA	2	6	254212	254217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309179
5014	NC_003366	AAT	2	6	254302	254307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309179
5015	NC_003366	A	6	6	254323	254328	100 %	0 %	0 %	0 %	18309179
5016	NC_003366	TGA	2	6	254350	254355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309179
5017	NC_003366	TA	4	8	254361	254368	50 %	50 %	0 %	0 %	18309179
5018	NC_003366	GGA	2	6	254393	254398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309179
5019	NC_003366	CAA	2	6	254412	254417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309179
5020	NC_003366	ATT	2	6	254419	254424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309179
5021	NC_003366	T	6	6	254423	254428	0 %	100 %	0 %	0 %	18309179
5022	NC_003366	AGA	2	6	254485	254490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309179
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5025	NC_003366	TCAA	2	8	254765	254772	50 %	25 %	0 %	25 %	18309180
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5029	NC_003366	TAAG	2	8	254833	254840	50 %	25 %	25 %	0 %	18309180
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5034	NC_003366	TAA	2	6	255040	255045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309180
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5038	NC_003366	AATAG	2	10	255132	255141	60 %	20 %	20 %	0 %	18309180
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5041	NC_003366	TTA	2	6	255190	255195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309180
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5043	NC_003366	TGG	3	9	255506	255514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309181
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5045	NC_003366	AAGA	2	8	255575	255582	75 %	0 %	25 %	0 %	18309181
5046	NC_003366	ATG	2	6	255598	255603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309181
5047	NC_003366	AAG	2	6	255613	255618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309181
5048	NC_003366	TGG	2	6	255619	255624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309181
5049	NC_003366	ATT	2	6	255641	255646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309181
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5051	NC_003366	GA	3	6	255755	255760	50 %	0 %	50 %	0 %	18309181
5052	NC_003366	A	6	6	255769	255774	100 %	0 %	0 %	0 %	18309181
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5055	NC_003366	ATT	2	6	255910	255915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309181
5056	NC_003366	CAG	2	6	255922	255927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309181
5057	NC_003366	AT	3	6	255979	255984	50 %	50 %	0 %	0 %	18309181
5058	NC_003366	TGG	2	6	256086	256091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309181
5059	NC_003366	TTG	2	6	256165	256170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309181
5060	NC_003366	AGA	2	6	256175	256180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309181
5061	NC_003366	GCTAAA	2	12	256218	256229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309181
5062	NC_003366	AT	3	6	256231	256236	50 %	50 %	0 %	0 %	18309181
5063	NC_003366	ATT	2	6	256279	256284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309181
5064	NC_003366	TGT	2	6	256298	256303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309181
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5067	NC_003366	CTG	2	6	256402	256407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309181
5068	NC_003366	TGA	2	6	256427	256432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309181
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5070	NC_003366	AAGA	2	8	256483	256490	75 %	0 %	25 %	0 %	18309181
5071	NC_003366	AAT	2	6	256509	256514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309181
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5082	NC_003366	A	6	6	257896	257901	100 %	0 %	0 %	0 %	18309183
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5090	NC_003366	TAT	2	6	258310	258315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309183
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5094	NC_003366	TGT	2	6	258499	258504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309183
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5098	NC_003366	ATA	2	6	258594	258599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309183
5099	NC_003366	TGT	2	6	258874	258879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309184
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5103	NC_003366	TAT	2	6	259035	259040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309184
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5105	NC_003366	CAG	2	6	259070	259075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309184
5106	NC_003366	ACC	2	6	259081	259086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18309184
5107	NC_003366	AGC	2	6	259095	259100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309184
5108	NC_003366	AGC	2	6	259122	259127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309184
5109	NC_003366	AGA	3	9	259203	259211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309184
5110	NC_003366	TGA	2	6	259233	259238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309184
5111	NC_003366	TTC	2	6	259356	259361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309184
5112	NC_003366	TCTTT	2	10	259430	259439	0 %	80 %	0 %	20 %	18309184
5113	NC_003366	T	6	6	259516	259521	0 %	100 %	0 %	0 %	18309184
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5115	NC_003366	AAT	2	6	259591	259596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309184
5116	NC_003366	AT	3	6	259624	259629	50 %	50 %	0 %	0 %	18309184
5117	NC_003366	T	6	6	259707	259712	0 %	100 %	0 %	0 %	18309184
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5119	NC_003366	CTTTA	2	10	259752	259761	20 %	60 %	0 %	20 %	18309184
5120	NC_003366	ATT	2	6	259791	259796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309184
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5122	NC_003366	T	6	6	259929	259934	0 %	100 %	0 %	0 %	18309184
5123	NC_003366	CTC	2	6	259935	259940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18309184
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