MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 21965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003361	CAG	2	6	53018	53023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839809
1003	NC_003361	CTT	2	6	53025	53030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839809
1004	NC_003361	ATG	2	6	53078	53083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839809
1005	NC_003361	TATT	2	8	53116	53123	25 %	75 %	0 %	0 %	29839809
1006	NC_003361	ATA	2	6	53126	53131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839809
1007	NC_003361	TCA	2	6	53197	53202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839809
1008	NC_003361	ATA	2	6	53203	53208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839809
1009	NC_003361	GAA	2	6	53314	53319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839809
1010	NC_003361	GAT	2	6	53420	53425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839809
1011	NC_003361	GCT	2	6	53440	53445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839809
1012	NC_003361	TCA	2	6	53581	53586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839809
1013	NC_003361	GAA	2	6	53611	53616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839809
1014	NC_003361	GAA	2	6	53660	53665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839809
1015	NC_003361	GTT	2	6	53701	53706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839809
1016	NC_003361	AGG	2	6	53727	53732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839809
1017	NC_003361	TCTT	2	8	53737	53744	0 %	75 %	0 %	25 %	29839809
1018	NC_003361	AAG	2	6	53757	53762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839809
1019	NC_003361	GAA	2	6	53774	53779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839809
1020	NC_003361	T	6	6	53795	53800	0 %	100 %	0 %	0 %	29839810
1021	NC_003361	CAG	2	6	53826	53831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839810
1022	NC_003361	AAG	2	6	53893	53898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839810
1023	NC_003361	CGC	2	6	53911	53916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29839810
1024	NC_003361	GCAA	2	8	53940	53947	50 %	0 %	25 %	25 %	29839810
1025	NC_003361	CATAA	2	10	54030	54039	60 %	20 %	0 %	20 %	29839810
1026	NC_003361	TCA	2	6	54062	54067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839810
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1029	NC_003361	GTA	2	6	54154	54159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839810
1030	NC_003361	GACAAG	2	12	54168	54179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29839810
1031	NC_003361	CATA	2	8	54185	54192	50 %	25 %	0 %	25 %	29839810
1032	NC_003361	CTTATC	2	12	54205	54216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839810
1033	NC_003361	TGA	2	6	54263	54268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839810
1034	NC_003361	CGA	2	6	54697	54702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839811
1035	NC_003361	CTT	2	6	54711	54716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839811
1036	NC_003361	TCG	2	6	54731	54736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839811
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1038	NC_003361	TCT	2	6	54797	54802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839811
1039	NC_003361	T	7	7	54817	54823	0 %	100 %	0 %	0 %	29839811
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1041	NC_003361	AAATTT	2	12	54974	54985	50 %	50 %	0 %	0 %	29839811
1042	NC_003361	GCA	2	6	54986	54991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839811
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1045	NC_003361	CTA	2	6	55128	55133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839811
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1050	NC_003361	CATA	2	8	55337	55344	50 %	25 %	0 %	25 %	29839812
1051	NC_003361	GC	3	6	55509	55514	0 %	0 %	50 %	50 %	29839812
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1055	NC_003361	CCT	2	6	55594	55599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839812
1056	NC_003361	GAG	2	6	55609	55614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839812
1057	NC_003361	TAA	2	6	55655	55660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839812
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1059	NC_003361	TGCCA	2	10	55697	55706	20 %	20 %	20 %	40 %	29839812
1060	NC_003361	TAGC	2	8	55717	55724	25 %	25 %	25 %	25 %	29839812
1061	NC_003361	GATT	2	8	55750	55757	25 %	50 %	25 %	0 %	29839812
1062	NC_003361	TCA	2	6	55878	55883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839812
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1072	NC_003361	CTTT	2	8	56286	56293	0 %	75 %	0 %	25 %	29839813
1073	NC_003361	AGAA	2	8	56306	56313	75 %	0 %	25 %	0 %	29839813
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1097	NC_003361	CAA	2	6	57147	57152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839814
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1105	NC_003361	TGA	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839814
1106	NC_003361	T	6	6	57415	57420	0 %	100 %	0 %	0 %	29839814
1107	NC_003361	AC	3	6	57463	57468	50 %	0 %	0 %	50 %	29839814
1108	NC_003361	GTT	2	6	57639	57644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839814
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1111	NC_003361	GAAGC	2	10	58171	58180	40 %	0 %	40 %	20 %	29839815
1112	NC_003361	TAG	3	9	58219	58227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839815
1113	NC_003361	TAA	2	6	58235	58240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839815
1114	NC_003361	AT	3	6	58344	58349	50 %	50 %	0 %	0 %	29839815
1115	NC_003361	AAGA	2	8	58372	58379	75 %	0 %	25 %	0 %	29839815
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1117	NC_003361	GA	3	6	58675	58680	50 %	0 %	50 %	0 %	29839815
1118	NC_003361	GCA	2	6	58752	58757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839815
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1124	NC_003361	GA	3	6	59142	59147	50 %	0 %	50 %	0 %	29839815
1125	NC_003361	AAT	2	6	59169	59174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839815
1126	NC_003361	T	6	6	59189	59194	0 %	100 %	0 %	0 %	29839815
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