MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 21965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003361	AGA	2	6	26858	26863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
502	NC_003361	GTG	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839786
503	NC_003361	AAG	2	6	26877	26882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
504	NC_003361	GCT	2	6	26892	26897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839786
505	NC_003361	CAT	2	6	26901	26906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839786
506	NC_003361	CG	3	6	26980	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	29839786
507	NC_003361	AGA	2	6	26987	26992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
508	NC_003361	CTA	2	6	27007	27012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839786
509	NC_003361	GTT	2	6	27054	27059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839786
510	NC_003361	CAA	2	6	27082	27087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839786
511	NC_003361	CAC	2	6	27091	27096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29839786
512	NC_003361	TAC	2	6	27218	27223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839786
513	NC_003361	GAA	2	6	27387	27392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
514	NC_003361	CAAT	2	8	27508	27515	50 %	25 %	0 %	25 %	29839786
515	NC_003361	AT	3	6	27514	27519	50 %	50 %	0 %	0 %	29839786
516	NC_003361	TTAT	2	8	27566	27573	25 %	75 %	0 %	0 %	29839786
517	NC_003361	CAA	2	6	27622	27627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839786
518	NC_003361	AAG	2	6	27646	27651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
519	NC_003361	T	6	6	27655	27660	0 %	100 %	0 %	0 %	29839786
520	NC_003361	TAG	2	6	27676	27681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839786
521	NC_003361	CTT	2	6	27682	27687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839786
522	NC_003361	A	8	8	27814	27821	100 %	0 %	0 %	0 %	29839786
523	NC_003361	ATG	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839786
524	NC_003361	AT	3	6	27869	27874	50 %	50 %	0 %	0 %	29839786
525	NC_003361	TTG	2	6	27895	27900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839786
526	NC_003361	TAA	2	6	27917	27922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839786
527	NC_003361	AGC	2	6	27965	27970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839786
528	NC_003361	AAC	2	6	28016	28021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839786
529	NC_003361	ACT	2	6	28038	28043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839786
530	NC_003361	GTG	2	6	28135	28140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839786
531	NC_003361	ATT	2	6	28204	28209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839786
532	NC_003361	GCA	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839786
533	NC_003361	AGG	2	6	28408	28413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839786
534	NC_003361	CTG	2	6	28555	28560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839786
535	NC_003361	CAG	2	6	28594	28599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839786
536	NC_003361	AAAT	2	8	28610	28617	75 %	25 %	0 %	0 %	29839786
537	NC_003361	AGC	2	6	28637	28642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839786
538	NC_003361	CA	3	6	28658	28663	50 %	0 %	0 %	50 %	29839786
539	NC_003361	GAA	2	6	28671	28676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
540	NC_003361	AGA	2	6	28682	28687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839786
541	NC_003361	A	6	6	28695	28700	100 %	0 %	0 %	0 %	29839786
542	NC_003361	ATC	2	6	28743	28748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839786
543	NC_003361	TGGA	2	8	28849	28856	25 %	25 %	50 %	0 %	29839786
544	NC_003361	CAA	2	6	29058	29063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839786
545	NC_003361	GTT	2	6	29073	29078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839786
546	NC_003361	CTT	2	6	29083	29088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839786
547	NC_003361	CTT	2	6	29199	29204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839787
548	NC_003361	TCT	2	6	29206	29211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839787
549	NC_003361	CCACA	2	10	29247	29256	40 %	0 %	0 %	60 %	29839787
550	NC_003361	CAA	2	6	29261	29266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839787
551	NC_003361	TG	3	6	29334	29339	0 %	50 %	50 %	0 %	29839787
552	NC_003361	AAG	2	6	29385	29390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839787
553	NC_003361	AGA	2	6	29398	29403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839787
554	NC_003361	TAA	2	6	29417	29422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839787
555	NC_003361	TGC	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839788
556	NC_003361	GAA	2	6	29477	29482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839788
557	NC_003361	GAA	2	6	29491	29496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839788
558	NC_003361	AAT	2	6	29509	29514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839788
559	NC_003361	AGT	2	6	29540	29545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839788
560	NC_003361	AATACC	2	12	29572	29583	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29839788
561	NC_003361	AGAA	2	8	29590	29597	75 %	0 %	25 %	0 %	29839788
562	NC_003361	TCA	2	6	29654	29659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839788
563	NC_003361	CGT	2	6	29711	29716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839788
564	NC_003361	TCC	2	6	29719	29724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839788
565	NC_003361	T	6	6	29740	29745	0 %	100 %	0 %	0 %	29839788
566	NC_003361	TCG	2	6	29771	29776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839788
567	NC_003361	TTG	2	6	29800	29805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839788
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569	NC_003361	T	7	7	29928	29934	0 %	100 %	0 %	0 %	29839788
570	NC_003361	TGT	2	6	30007	30012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839788
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572	NC_003361	GTT	2	6	30076	30081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839788
573	NC_003361	TGT	2	6	30096	30101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839788
574	NC_003361	T	7	7	30103	30109	0 %	100 %	0 %	0 %	29839788
575	NC_003361	CCT	2	6	30181	30186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839789
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578	NC_003361	GA	3	6	30443	30448	50 %	0 %	50 %	0 %	29839789
579	NC_003361	A	6	6	30484	30489	100 %	0 %	0 %	0 %	29839789
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589	NC_003361	AG	3	6	30998	31003	50 %	0 %	50 %	0 %	29839790
590	NC_003361	GAAA	2	8	31038	31045	75 %	0 %	25 %	0 %	29839790
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593	NC_003361	TGC	3	9	31151	31159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839790
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599	NC_003361	GTT	2	6	31911	31916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839791
600	NC_003361	CTG	2	6	31918	31923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839791
601	NC_003361	GAT	2	6	31977	31982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839791
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603	NC_003361	ATA	2	6	32086	32091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839791
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613	NC_003361	TAGA	2	8	33765	33772	50 %	25 %	25 %	0 %	29839793
614	NC_003361	AGA	2	6	33830	33835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839793
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616	NC_003361	T	6	6	33892	33897	0 %	100 %	0 %	0 %	29839793
617	NC_003361	GTAC	2	8	33927	33934	25 %	25 %	25 %	25 %	29839793
618	NC_003361	TGTT	2	8	33952	33959	0 %	75 %	25 %	0 %	29839793
619	NC_003361	T	6	6	34019	34024	0 %	100 %	0 %	0 %	29839793
620	NC_003361	TTG	2	6	34173	34178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839794
621	NC_003361	TTTTTC	2	12	34223	34234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29839794
622	NC_003361	TTC	2	6	34285	34290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839794
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626	NC_003361	GA	3	6	34592	34597	50 %	0 %	50 %	0 %	29839794
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