MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 21965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003361	GCA	2	6	317665	317670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840047
6002	NC_003361	ATA	2	6	317755	317760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840047
6003	NC_003361	C	6	6	317805	317810	0 %	0 %	0 %	100 %	29840047
6004	NC_003361	TGT	2	6	317844	317849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840047
6005	NC_003361	CCT	2	6	317896	317901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840047
6006	NC_003361	GAA	2	6	317962	317967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840047
6007	NC_003361	AG	3	6	318043	318048	50 %	0 %	50 %	0 %	29840047
6008	NC_003361	AGG	2	6	318251	318256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840048
6009	NC_003361	ACG	2	6	318258	318263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6010	NC_003361	TG	3	6	318296	318301	0 %	50 %	50 %	0 %	29840048
6011	NC_003361	GA	4	8	318306	318313	50 %	0 %	50 %	0 %	29840048
6012	NC_003361	GCT	2	6	318337	318342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6013	NC_003361	TGT	3	9	318363	318371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840048
6014	NC_003361	AAGA	2	8	318461	318468	75 %	0 %	25 %	0 %	29840048
6015	NC_003361	GA	3	6	318511	318516	50 %	0 %	50 %	0 %	29840048
6016	NC_003361	T	6	6	318517	318522	0 %	100 %	0 %	0 %	29840048
6017	NC_003361	TAT	2	6	318530	318535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6018	NC_003361	TGA	2	6	318577	318582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840048
6019	NC_003361	ATAC	2	8	318614	318621	50 %	25 %	0 %	25 %	29840048
6020	NC_003361	GTT	2	6	318706	318711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840048
6021	NC_003361	TGA	2	6	318764	318769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840048
6022	NC_003361	AGG	2	6	318862	318867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840048
6023	NC_003361	AG	4	8	318887	318894	50 %	0 %	50 %	0 %	29840048
6024	NC_003361	ATC	2	6	318978	318983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840048
6025	NC_003361	GGAA	2	8	319067	319074	50 %	0 %	50 %	0 %	29840048
6026	NC_003361	GA	3	6	319080	319085	50 %	0 %	50 %	0 %	29840048
6027	NC_003361	AAATCC	2	12	319088	319099	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29840048
6028	NC_003361	TTG	2	6	319134	319139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840048
6029	NC_003361	GT	3	6	319148	319153	0 %	50 %	50 %	0 %	29840048
6030	NC_003361	CCT	2	6	319210	319215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840048
6031	NC_003361	TTA	2	6	319261	319266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6032	NC_003361	ATC	2	6	319291	319296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840048
6033	NC_003361	CTT	2	6	319304	319309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840048
6034	NC_003361	CAT	2	6	319379	319384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840048
6035	NC_003361	TGT	2	6	319394	319399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840048
6036	NC_003361	GC	3	6	319409	319414	0 %	0 %	50 %	50 %	29840048
6037	NC_003361	TCA	3	9	319474	319482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840048
6038	NC_003361	AGC	3	9	319515	319523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6039	NC_003361	TGC	2	6	319533	319538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6040	NC_003361	TGC	2	6	319554	319559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6041	NC_003361	T	6	6	319585	319590	0 %	100 %	0 %	0 %	29840048
6042	NC_003361	ATAG	2	8	319591	319598	50 %	25 %	25 %	0 %	29840048
6043	NC_003361	ATT	2	6	319599	319604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6044	NC_003361	GTT	2	6	319606	319611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840048
6045	NC_003361	AAT	2	6	319636	319641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840048
6046	NC_003361	CGT	2	6	319685	319690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6047	NC_003361	AGC	2	6	319821	319826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6048	NC_003361	TAGA	2	8	319882	319889	50 %	25 %	25 %	0 %	29840048
6049	NC_003361	AGC	2	6	319899	319904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6050	NC_003361	TCT	2	6	319930	319935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840048
6051	NC_003361	ATT	2	6	319962	319967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6052	NC_003361	GAT	3	9	319971	319979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840048
6053	NC_003361	TTTC	2	8	319981	319988	0 %	75 %	0 %	25 %	29840048
6054	NC_003361	AGC	2	6	320034	320039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6055	NC_003361	TCC	2	6	320094	320099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840048
6056	NC_003361	T	6	6	320114	320119	0 %	100 %	0 %	0 %	29840048
6057	NC_003361	ATAG	2	8	320124	320131	50 %	25 %	25 %	0 %	29840048
6058	NC_003361	CTC	2	6	320132	320137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840048
6059	NC_003361	TAT	2	6	320264	320269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6060	NC_003361	AATA	2	8	320318	320325	75 %	25 %	0 %	0 %	29840048
6061	NC_003361	TCT	2	6	320341	320346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840048
6062	NC_003361	A	6	6	320360	320365	100 %	0 %	0 %	0 %	29840048
6063	NC_003361	TCAGAC	2	12	320366	320377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840048
6064	NC_003361	CTG	2	6	320405	320410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840048
6065	NC_003361	GATGT	2	10	320440	320449	20 %	40 %	40 %	0 %	29840048
6066	NC_003361	GGT	2	6	320577	320582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29840048
6067	NC_003361	ATT	2	6	320592	320597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840048
6068	NC_003361	TGTT	2	8	320598	320605	0 %	75 %	25 %	0 %	29840048
6069	NC_003361	AAG	2	6	320673	320678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840048
6070	NC_003361	AGA	2	6	320879	320884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840049
6071	NC_003361	CCA	2	6	320893	320898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840049
6072	NC_003361	GCA	2	6	320989	320994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840049
6073	NC_003361	AGC	2	6	321042	321047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840049
6074	NC_003361	AAC	2	6	321054	321059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840049
6075	NC_003361	AAG	2	6	321062	321067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840049
6076	NC_003361	GAG	2	6	321142	321147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840049
6077	NC_003361	ATC	2	6	321256	321261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840049
6078	NC_003361	TC	3	6	321285	321290	0 %	50 %	0 %	50 %	29840049
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6082	NC_003361	CTTG	2	8	321726	321733	0 %	50 %	25 %	25 %	29840049
6083	NC_003361	T	6	6	321742	321747	0 %	100 %	0 %	0 %	29840049
6084	NC_003361	GC	3	6	321835	321840	0 %	0 %	50 %	50 %	29840049
6085	NC_003361	GTG	2	6	322024	322029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29840049
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6087	NC_003361	GGC	2	6	322062	322067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29840049
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6091	NC_003361	C	7	7	322223	322229	0 %	0 %	0 %	100 %	29840049
6092	NC_003361	TC	3	6	322271	322276	0 %	50 %	0 %	50 %	29840049
6093	NC_003361	CAG	2	6	322322	322327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840049
6094	NC_003361	T	7	7	322346	322352	0 %	100 %	0 %	0 %	29840049
6095	NC_003361	CAGA	2	8	322394	322401	50 %	0 %	25 %	25 %	29840049
6096	NC_003361	GTT	2	6	322409	322414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840049
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6098	NC_003361	AAAT	2	8	322570	322577	75 %	25 %	0 %	0 %	29840049
6099	NC_003361	TG	3	6	322603	322608	0 %	50 %	50 %	0 %	29840049
6100	NC_003361	TGT	3	9	322647	322655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840049
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6104	NC_003361	CCCA	2	8	322755	322762	25 %	0 %	0 %	75 %	29840049
6105	NC_003361	GTT	2	6	322785	322790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840049
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6108	NC_003361	TGC	2	6	322914	322919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840049
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6111	NC_003361	GAA	2	6	322948	322953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840049
6112	NC_003361	T	6	6	322975	322980	0 %	100 %	0 %	0 %	29840049
6113	NC_003361	CCA	2	6	323125	323130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840049
6114	NC_003361	ATTT	2	8	323141	323148	25 %	75 %	0 %	0 %	29840049
6115	NC_003361	CCA	2	6	323209	323214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840049
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6118	NC_003361	AGT	2	6	323301	323306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840049
6119	NC_003361	GGA	2	6	323311	323316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840049
6120	NC_003361	CAG	2	6	323366	323371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840049
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6124	NC_003361	TTG	2	6	323579	323584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840049
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6499	NC_003361	AG	3	6	350902	350907	50 %	0 %	50 %	0 %	29840066
6500	NC_003361	TCA	2	6	350916	350921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840066

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