MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	GAA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
2	NC_003042	AAC	2	6	984	989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081480
3	NC_003042	AGA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
4	NC_003042	TAT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081480
5	NC_003042	TAG	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081480
6	NC_003042	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081480
7	NC_003042	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081480
8	NC_003042	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
9	NC_003042	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081480
10	NC_003042	CCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081480
11	NC_003042	AGA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
12	NC_003042	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081480
13	NC_003042	TAC	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081480
14	NC_003042	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081480
15	NC_003042	GTA	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081480
16	NC_003042	GAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081480
17	NC_003042	TCT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081480
18	NC_003042	GAG	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15081481
19	NC_003042	AGA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
20	NC_003042	TAG	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081481
21	NC_003042	TAA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
22	NC_003042	GTG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15081481
23	NC_003042	AGA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
24	NC_003042	ATA	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
25	NC_003042	ATT	2	6	2243	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081481
26	NC_003042	GAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
27	NC_003042	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
28	NC_003042	GAT	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081481
29	NC_003042	AAG	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
30	NC_003042	GAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
31	NC_003042	GAA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
32	NC_003042	AGA	3	9	2548	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
33	NC_003042	TAA	2	6	2620	2625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
34	NC_003042	GAA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
35	NC_003042	GAA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
36	NC_003042	AGA	3	9	2707	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
37	NC_003042	AGA	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
38	NC_003042	TAA	2	6	2827	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
39	NC_003042	TAA	2	6	2926	2931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081481
40	NC_003042	AGA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081481
41	NC_003042	TTA	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081481
42	NC_003042	AAC	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081482
43	NC_003042	ACC	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081482
44	NC_003042	AGA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
45	NC_003042	AGA	2	6	3332	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
46	NC_003042	AGA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081482
47	NC_003042	ATA	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081482
48	NC_003042	TAA	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081482
49	NC_003042	AAT	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081484
50	NC_003042	ATG	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081484
51	NC_003042	TTC	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081484
52	NC_003042	AAG	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081484
53	NC_003042	TAG	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081484
54	NC_003042	AAT	2	6	4039	4044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081485
55	NC_003042	ACT	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081485
56	NC_003042	AAT	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081485
57	NC_003042	ATG	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081486
58	NC_003042	TAA	2	6	4679	4684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081486
59	NC_003042	TGT	2	6	4688	4693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081486
60	NC_003042	TAA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081486
61	NC_003042	TAT	2	6	5167	5172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
62	NC_003042	ATT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
63	NC_003042	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
64	NC_003042	TTC	2	6	5286	5291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
65	NC_003042	AAT	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
66	NC_003042	CAC	3	9	5375	5383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081487
67	NC_003042	CAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081487
68	NC_003042	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081487
69	NC_003042	TCT	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
70	NC_003042	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
71	NC_003042	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081487
72	NC_003042	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081487
73	NC_003042	ATC	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081487
74	NC_003042	TAA	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
75	NC_003042	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
76	NC_003042	TAC	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
77	NC_003042	TTA	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
78	NC_003042	ATT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
79	NC_003042	ATG	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081488
80	NC_003042	ATA	2	6	6123	6128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
81	NC_003042	TAA	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
82	NC_003042	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
83	NC_003042	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081488
84	NC_003042	ATA	2	6	6521	6526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
85	NC_003042	TAA	2	6	6641	6646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
86	NC_003042	TCT	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
87	NC_003042	TTA	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
88	NC_003042	ATC	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
89	NC_003042	TAC	2	6	7187	7192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
90	NC_003042	GTA	2	6	7216	7221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081488
91	NC_003042	TAA	2	6	7226	7231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
92	NC_003042	TAA	2	6	7265	7270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
93	NC_003042	ACT	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081488
94	NC_003042	AAT	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
95	NC_003042	AAT	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
96	NC_003042	TCT	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
97	NC_003042	TAA	2	6	7561	7566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
98	NC_003042	TGT	2	6	7575	7580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081488
99	NC_003042	TCT	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081488
100	NC_003042	TTG	2	6	7597	7602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081488
101	NC_003042	TAT	2	6	7618	7623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
102	NC_003042	TAT	2	6	7775	7780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
103	NC_003042	TAT	2	6	7795	7800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081488
104	NC_003042	TAA	4	12	7924	7935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
105	NC_003042	AAT	2	6	7940	7945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081488
106	NC_003042	AGT	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081489
107	NC_003042	TGT	2	6	9134	9139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081491
108	NC_003042	TAA	2	6	9159	9164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081491
109	NC_003042	TAT	2	6	9308	9313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081491
110	NC_003042	TTG	2	6	9320	9325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081491
111	NC_003042	TAA	2	6	9533	9538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081492
112	NC_003042	TTC	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
113	NC_003042	TCT	2	6	9594	9599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
114	NC_003042	TAT	2	6	9608	9613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081492
115	NC_003042	ATA	2	6	9630	9635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081492
116	NC_003042	TCA	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081492
117	NC_003042	TGT	2	6	9762	9767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081492
118	NC_003042	AGT	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081492
119	NC_003042	TTC	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
120	NC_003042	TAA	2	6	9859	9864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081492
121	NC_003042	TCT	2	6	9905	9910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
122	NC_003042	TAT	2	6	9916	9921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081492
123	NC_003042	CTT	2	6	9930	9935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
124	NC_003042	TTC	2	6	9947	9952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081492
125	NC_003042	TCG	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081493
126	NC_003042	GAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081493
127	NC_003042	ATA	2	6	10259	10264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081493
128	NC_003042	ATA	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081494
129	NC_003042	ATT	2	6	10623	10628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081494
130	NC_003042	AAT	2	6	10730	10735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081494
131	NC_003042	TCT	2	6	10838	10843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081494
132	NC_003042	CAA	3	9	10941	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081494
133	NC_003042	CAG	2	6	10953	10958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15081494
134	NC_003042	TAG	2	6	10972	10977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081494
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262	NC_003042	GAA	2	6	20872	20877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081509
263	NC_003042	CTG	2	6	20972	20977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081509
264	NC_003042	GCT	2	6	20998	21003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081509
265	NC_003042	CAT	2	6	21029	21034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081509
266	NC_003042	TAA	2	6	21153	21158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081509
267	NC_003042	AGT	2	6	21178	21183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081509
268	NC_003042	GAT	2	6	21316	21321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081509
269	NC_003042	GGA	2	6	21331	21336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15081509
270	NC_003042	ATG	2	6	21371	21376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081509
271	NC_003042	TAA	2	6	21710	21715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
272	NC_003042	GAT	2	6	21735	21740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081510
273	NC_003042	AAT	2	6	21741	21746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
274	NC_003042	ATA	3	9	21769	21777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
275	NC_003042	TAA	2	6	21844	21849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
276	NC_003042	TGA	2	6	21863	21868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081510
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278	NC_003042	ATT	2	6	21997	22002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081510
279	NC_003042	TTA	2	6	22044	22049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081510
280	NC_003042	ATT	2	6	22165	22170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081510
281	NC_003042	AAT	2	6	22244	22249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
282	NC_003042	ATA	2	6	22267	22272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
283	NC_003042	TTA	2	6	22273	22278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081510
284	NC_003042	ATA	2	6	22297	22302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
285	NC_003042	TAA	2	6	22370	22375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
286	NC_003042	ATG	2	6	22390	22395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081510
287	NC_003042	GAA	2	6	22397	22402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081510
288	NC_003042	GAT	2	6	22413	22418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081510
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290	NC_003042	ATT	2	6	22456	22461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081510
291	NC_003042	TAA	2	6	22463	22468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
292	NC_003042	ATA	2	6	22558	22563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081510
293	NC_003042	TAA	2	6	22696	22701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081511
294	NC_003042	ATA	2	6	22777	22782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081511
295	NC_003042	AAG	2	6	22831	22836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081511
296	NC_003042	ATC	2	6	22862	22867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081511
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299	NC_003042	TAG	2	6	23443	23448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15081512
300	NC_003042	AAT	2	6	23549	23554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081513
301	NC_003042	AGA	2	6	23582	23587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081513
302	NC_003042	ATA	2	6	23668	23673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081513
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324	NC_003042	TTA	2	6	25763	25768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081515
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380	NC_003042	TAT	2	6	29531	29536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081521
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388	NC_003042	TTA	2	6	30161	30166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081523
389	NC_003042	TAT	2	6	30195	30200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081523
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393	NC_003042	CTT	2	6	30441	30446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081523
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