MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 2001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	29653365
2	NC_002971	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	29653366
3	NC_002971	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
4	NC_002971	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	215918858
5	NC_002971	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	215918859
6	NC_002971	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
7	NC_002971	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
8	NC_002971	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	215918859
9	NC_002971	TG	3	6	6811	6816	0 %	50 %	50 %	0 %	215918860
10	NC_002971	TG	3	6	7698	7703	0 %	50 %	50 %	0 %	215918860
11	NC_002971	AC	3	6	7817	7822	50 %	0 %	0 %	50 %	215918861
12	NC_002971	CT	3	6	8425	8430	0 %	50 %	0 %	50 %	215918862
13	NC_002971	AC	3	6	8622	8627	50 %	0 %	0 %	50 %	215918862
14	NC_002971	CA	3	6	9766	9771	50 %	0 %	0 %	50 %	29653373
15	NC_002971	CG	3	6	10283	10288	0 %	0 %	50 %	50 %	29653373
16	NC_002971	CG	3	6	11380	11385	0 %	0 %	50 %	50 %	29653374
17	NC_002971	GC	3	6	13552	13557	0 %	0 %	50 %	50 %	29653378
18	NC_002971	GC	4	8	15510	15517	0 %	0 %	50 %	50 %	29653380
19	NC_002971	TA	3	6	15820	15825	50 %	50 %	0 %	0 %	29653380
20	NC_002971	GC	3	6	17489	17494	0 %	0 %	50 %	50 %	29653383
21	NC_002971	GC	3	6	17607	17612	0 %	0 %	50 %	50 %	215918865
22	NC_002971	GA	3	6	18811	18816	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
23	NC_002971	GA	3	6	19376	19381	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
24	NC_002971	CT	4	8	20228	20235	0 %	50 %	0 %	50 %	29653385
25	NC_002971	CA	3	6	20542	20547	50 %	0 %	0 %	50 %	29653385
26	NC_002971	AG	3	6	20563	20568	50 %	0 %	50 %	0 %	29653385
27	NC_002971	AG	3	6	21026	21031	50 %	0 %	50 %	0 %	29653386
28	NC_002971	TC	3	6	24366	24371	0 %	50 %	0 %	50 %	29653391
29	NC_002971	AT	3	6	24427	24432	50 %	50 %	0 %	0 %	29653391
30	NC_002971	AC	3	6	28090	28095	50 %	0 %	0 %	50 %	29653393
31	NC_002971	GA	3	6	28636	28641	50 %	0 %	50 %	0 %	29653394
32	NC_002971	CT	3	6	29811	29816	0 %	50 %	0 %	50 %	29653395
33	NC_002971	GC	3	6	30121	30126	0 %	0 %	50 %	50 %	29653396
34	NC_002971	AC	3	6	30176	30181	50 %	0 %	0 %	50 %	29653396
35	NC_002971	AC	3	6	31537	31542	50 %	0 %	0 %	50 %	29653398
36	NC_002971	AT	3	6	32972	32977	50 %	50 %	0 %	0 %	161511219
37	NC_002971	GC	3	6	33357	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	215918868
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39	NC_002971	TG	3	6	36747	36752	0 %	50 %	50 %	0 %	215918869
40	NC_002971	TG	3	6	37634	37639	0 %	50 %	50 %	0 %	215918869
41	NC_002971	AC	3	6	37753	37758	50 %	0 %	0 %	50 %	215918870
42	NC_002971	CG	3	6	38922	38927	0 %	0 %	50 %	50 %	29653404
43	NC_002971	TC	3	6	39047	39052	0 %	50 %	0 %	50 %	29653404
44	NC_002971	CG	3	6	41838	41843	0 %	0 %	50 %	50 %	29653406
45	NC_002971	TC	3	6	42478	42483	0 %	50 %	0 %	50 %	215918872
46	NC_002971	GC	3	6	42760	42765	0 %	0 %	50 %	50 %	215918872
47	NC_002971	TA	3	6	48900	48905	50 %	50 %	0 %	0 %	215918874
48	NC_002971	CT	3	6	50394	50399	0 %	50 %	0 %	50 %	29653415
49	NC_002971	AG	3	6	50602	50607	50 %	0 %	50 %	0 %	29653415
50	NC_002971	AG	3	6	50838	50843	50 %	0 %	50 %	0 %	29653415
51	NC_002971	GC	3	6	51025	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	29653416
52	NC_002971	TA	3	6	52614	52619	50 %	50 %	0 %	0 %	29653417
53	NC_002971	CA	4	8	53262	53269	50 %	0 %	0 %	50 %	29653417
54	NC_002971	GC	3	6	53302	53307	0 %	0 %	50 %	50 %	29653417
55	NC_002971	AG	3	6	56883	56888	50 %	0 %	50 %	0 %	29653423
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59	NC_002971	AT	3	6	66474	66479	50 %	50 %	0 %	0 %	29653433
60	NC_002971	AC	3	6	67264	67269	50 %	0 %	0 %	50 %	215918879
61	NC_002971	CT	3	6	68134	68139	0 %	50 %	0 %	50 %	215918879
62	NC_002971	GC	3	6	68308	68313	0 %	0 %	50 %	50 %	215918879
63	NC_002971	CT	3	6	68700	68705	0 %	50 %	0 %	50 %	215918879
64	NC_002971	GC	3	6	68868	68873	0 %	0 %	50 %	50 %	29653435
65	NC_002971	GC	3	6	68877	68882	0 %	0 %	50 %	50 %	29653435
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67	NC_002971	CG	3	6	69277	69282	0 %	0 %	50 %	50 %	29653436
68	NC_002971	CG	3	6	69739	69744	0 %	0 %	50 %	50 %	29653436
69	NC_002971	CG	3	6	70377	70382	0 %	0 %	50 %	50 %	215918880
70	NC_002971	CG	3	6	70577	70582	0 %	0 %	50 %	50 %	215918880
71	NC_002971	GC	3	6	71333	71338	0 %	0 %	50 %	50 %	215918880
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75	NC_002971	GT	3	6	76973	76978	0 %	50 %	50 %	0 %	29653445
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81	NC_002971	GC	3	6	80623	80628	0 %	0 %	50 %	50 %	215918882
82	NC_002971	AT	3	6	82515	82520	50 %	50 %	0 %	0 %	215918884
83	NC_002971	GC	3	6	83583	83588	0 %	0 %	50 %	50 %	215918884
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89	NC_002971	TC	3	6	89588	89593	0 %	50 %	0 %	50 %	29653455
90	NC_002971	TC	3	6	91198	91203	0 %	50 %	0 %	50 %	215918887
91	NC_002971	TA	3	6	91253	91258	50 %	50 %	0 %	0 %	215918887
92	NC_002971	CG	3	6	92312	92317	0 %	0 %	50 %	50 %	29653458
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95	NC_002971	AT	3	6	97023	97028	50 %	50 %	0 %	0 %	29653463
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103	NC_002971	CG	3	6	112727	112732	0 %	0 %	50 %	50 %	29653481
104	NC_002971	CG	3	6	112767	112772	0 %	0 %	50 %	50 %	29653481
105	NC_002971	TG	3	6	113069	113074	0 %	50 %	50 %	0 %	29653481
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107	NC_002971	GA	3	6	116225	116230	50 %	0 %	50 %	0 %	29653485
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109	NC_002971	AG	3	6	117927	117932	50 %	0 %	50 %	0 %	215918898
110	NC_002971	AC	3	6	117942	117947	50 %	0 %	0 %	50 %	215918898
111	NC_002971	TG	3	6	119937	119942	0 %	50 %	50 %	0 %	29653490
112	NC_002971	CA	3	6	120151	120156	50 %	0 %	0 %	50 %	29653490
113	NC_002971	CT	3	6	124790	124795	0 %	50 %	0 %	50 %	29653495
114	NC_002971	AG	3	6	124820	124825	50 %	0 %	50 %	0 %	29653495
115	NC_002971	TG	3	6	124916	124921	0 %	50 %	50 %	0 %	29653495
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119	NC_002971	GC	3	6	130863	130868	0 %	0 %	50 %	50 %	29653501
120	NC_002971	GC	3	6	130874	130879	0 %	0 %	50 %	50 %	29653501
121	NC_002971	AT	3	6	133691	133696	50 %	50 %	0 %	0 %	215918902
122	NC_002971	GC	3	6	133725	133730	0 %	0 %	50 %	50 %	215918902
123	NC_002971	AC	3	6	133731	133736	50 %	0 %	0 %	50 %	215918902
124	NC_002971	AC	3	6	133797	133802	50 %	0 %	0 %	50 %	215918902
125	NC_002971	TC	3	6	134544	134549	0 %	50 %	0 %	50 %	215918902
126	NC_002971	AT	3	6	135826	135831	50 %	50 %	0 %	0 %	29653506
127	NC_002971	AG	3	6	137415	137420	50 %	0 %	50 %	0 %	29653509
128	NC_002971	CG	3	6	138131	138136	0 %	0 %	50 %	50 %	29653510
129	NC_002971	TA	3	6	139396	139401	50 %	50 %	0 %	0 %	29653511
130	NC_002971	AG	3	6	141467	141472	50 %	0 %	50 %	0 %	29653513
131	NC_002971	TC	3	6	144280	144285	0 %	50 %	0 %	50 %	215918905
132	NC_002971	GT	3	6	144480	144485	0 %	50 %	50 %	0 %	215918905
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134	NC_002971	TA	3	6	151972	151977	50 %	50 %	0 %	0 %	29653519
135	NC_002971	AT	4	8	153062	153069	50 %	50 %	0 %	0 %	29653521
136	NC_002971	TA	3	6	153244	153249	50 %	50 %	0 %	0 %	29653521
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138	NC_002971	GA	3	6	154016	154021	50 %	0 %	50 %	0 %	29653522
139	NC_002971	AT	3	6	155719	155724	50 %	50 %	0 %	0 %	29653527
140	NC_002971	TA	3	6	157037	157042	50 %	50 %	0 %	0 %	29653529
141	NC_002971	TC	3	6	158820	158825	0 %	50 %	0 %	50 %	215918906
142	NC_002971	AT	3	6	159608	159613	50 %	50 %	0 %	0 %	215918906
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