MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002971	GAA	2	6	184496	184501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653551
3002	NC_002971	CGAT	2	8	184502	184509	25 %	25 %	25 %	25 %	29653551
3003	NC_002971	ATT	2	6	184546	184551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653551
3004	NC_002971	ATTTT	2	10	184568	184577	20 %	80 %	0 %	0 %	29653551
3005	NC_002971	TAA	3	9	184591	184599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653551
3006	NC_002971	GGT	2	6	184606	184611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653551
3007	NC_002971	AATA	2	8	184633	184640	75 %	25 %	0 %	0 %	29653551
3008	NC_002971	ATG	2	6	184654	184659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653551
3009	NC_002971	TGT	2	6	184821	184826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653551
3010	NC_002971	TAA	2	6	184845	184850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653551
3011	NC_002971	GAG	2	6	184912	184917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653551
3012	NC_002971	TTG	2	6	184960	184965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653551
3013	NC_002971	TTG	2	6	185083	185088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653551
3014	NC_002971	TTTG	2	8	185282	185289	0 %	75 %	25 %	0 %	29653551
3015	NC_002971	CG	3	6	185310	185315	0 %	0 %	50 %	50 %	29653551
3016	NC_002971	T	6	6	185465	185470	0 %	100 %	0 %	0 %	29653551
3017	NC_002971	TTC	2	6	185518	185523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653551
3018	NC_002971	GCA	2	6	185577	185582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653551
3019	NC_002971	TAA	2	6	185590	185595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653551
3020	NC_002971	A	6	6	185598	185603	100 %	0 %	0 %	0 %	29653551
3021	NC_002971	GCC	2	6	185604	185609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653551
3022	NC_002971	AAT	2	6	185709	185714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653551
3023	NC_002971	T	7	7	185734	185740	0 %	100 %	0 %	0 %	29653551
3024	NC_002971	TCA	2	6	185775	185780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653551
3025	NC_002971	A	6	6	185792	185797	100 %	0 %	0 %	0 %	29653551
3026	NC_002971	T	6	6	185883	185888	0 %	100 %	0 %	0 %	29653552
3027	NC_002971	AACAA	2	10	185941	185950	80 %	0 %	0 %	20 %	29653552
3028	NC_002971	TCAC	2	8	185995	186002	25 %	25 %	0 %	50 %	29653552
3029	NC_002971	T	6	6	186037	186042	0 %	100 %	0 %	0 %	29653552
3030	NC_002971	T	6	6	186047	186052	0 %	100 %	0 %	0 %	29653552
3031	NC_002971	CGA	2	6	186071	186076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653552
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3033	NC_002971	A	6	6	186141	186146	100 %	0 %	0 %	0 %	29653552
3034	NC_002971	GAA	2	6	186266	186271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653552
3035	NC_002971	CGC	2	6	186302	186307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653552
3036	NC_002971	TGG	2	6	186311	186316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653552
3037	NC_002971	CTA	2	6	186317	186322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653552
3038	NC_002971	ACA	2	6	186389	186394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653552
3039	NC_002971	AAT	2	6	186456	186461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653552
3040	NC_002971	ATCTTG	2	12	186528	186539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29653552
3041	NC_002971	AAT	2	6	186594	186599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653552
3042	NC_002971	GC	3	6	186700	186705	0 %	0 %	50 %	50 %	29653552
3043	NC_002971	ATTGT	2	10	186738	186747	20 %	60 %	20 %	0 %	29653552
3044	NC_002971	T	7	7	186747	186753	0 %	100 %	0 %	0 %	29653552
3045	NC_002971	ACG	2	6	186820	186825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653552
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3047	NC_002971	A	6	6	186913	186918	100 %	0 %	0 %	0 %	29653552
3048	NC_002971	AAT	2	6	186999	187004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653552
3049	NC_002971	T	6	6	187021	187026	0 %	100 %	0 %	0 %	29653552
3050	NC_002971	A	6	6	187065	187070	100 %	0 %	0 %	0 %	29653552
3051	NC_002971	GCG	2	6	187081	187086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653552
3052	NC_002971	TAAA	2	8	187091	187098	75 %	25 %	0 %	0 %	29653552
3053	NC_002971	A	7	7	187131	187137	100 %	0 %	0 %	0 %	29653552
3054	NC_002971	CCAAA	2	10	187264	187273	60 %	0 %	0 %	40 %	29653552
3055	NC_002971	CTT	2	6	187340	187345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653552
3056	NC_002971	TTC	2	6	187362	187367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653552
3057	NC_002971	TGG	2	6	187382	187387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653552
3058	NC_002971	G	6	6	187458	187463	0 %	0 %	100 %	0 %	29653552
3059	NC_002971	GGC	2	6	187497	187502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653552
3060	NC_002971	A	7	7	187532	187538	100 %	0 %	0 %	0 %	29653552
3061	NC_002971	CAG	2	6	187540	187545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653552
3062	NC_002971	AATAA	2	10	187546	187555	80 %	20 %	0 %	0 %	29653552
3063	NC_002971	GCA	2	6	187774	187779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653553
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3065	NC_002971	ATT	2	6	188053	188058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653553
3066	NC_002971	ATC	2	6	188073	188078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653553
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3071	NC_002971	TCGT	2	8	188268	188275	0 %	50 %	25 %	25 %	29653553
3072	NC_002971	T	7	7	188386	188392	0 %	100 %	0 %	0 %	29653553
3073	NC_002971	CGCAAG	2	12	188415	188426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653553
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3075	NC_002971	AATT	2	8	188616	188623	50 %	50 %	0 %	0 %	29653553
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3082	NC_002971	GTTTT	2	10	188881	188890	0 %	80 %	20 %	0 %	215918911
3083	NC_002971	ATG	2	6	188940	188945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918911
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3090	NC_002971	CCG	2	6	189200	189205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918911
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3103	NC_002971	GA	3	6	190015	190020	50 %	0 %	50 %	0 %	29653555
3104	NC_002971	CGG	2	6	191006	191011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918912
3105	NC_002971	TTA	2	6	191171	191176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918912
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3107	NC_002971	CGA	2	6	191231	191236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918912
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3109	NC_002971	TTGA	2	8	191268	191275	25 %	50 %	25 %	0 %	215918912
3110	NC_002971	A	6	6	191294	191299	100 %	0 %	0 %	0 %	215918912
3111	NC_002971	ACG	2	6	191317	191322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918912
3112	NC_002971	GGT	2	6	191399	191404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918912
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3119	NC_002971	TGA	2	6	191731	191736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918912
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3121	NC_002971	TGGGC	2	10	191752	191761	0 %	20 %	60 %	20 %	215918912
3122	NC_002971	CTG	2	6	191859	191864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918912
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3124	NC_002971	ATG	2	6	192064	192069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918912
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3494	NC_002971	CG	3	6	215161	215166	0 %	0 %	50 %	50 %	215918919
3495	NC_002971	GCA	2	6	215194	215199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918919
3496	NC_002971	CGA	2	6	215314	215319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918919
3497	NC_002971	TCG	2	6	215352	215357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918919
3498	NC_002971	ATC	2	6	215364	215369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918919
3499	NC_002971	CGTT	2	8	215420	215427	0 %	50 %	25 %	25 %	215918919
3500	NC_002971	TGAT	2	8	215452	215459	25 %	50 %	25 %	0 %	215918919

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