MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002971	CGT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653393
502	NC_002971	T	6	6	28259	28264	0 %	100 %	0 %	0 %	29653393
503	NC_002971	TCA	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653394
504	NC_002971	AAT	2	6	28412	28417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653394
505	NC_002971	ACC	2	6	28458	28463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653394
506	NC_002971	GCAGG	2	10	28555	28564	20 %	0 %	60 %	20 %	29653394
507	NC_002971	GCA	2	6	28611	28616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653394
508	NC_002971	GA	3	6	28636	28641	50 %	0 %	50 %	0 %	29653394
509	NC_002971	CCG	2	6	28672	28677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653394
510	NC_002971	AAT	2	6	28743	28748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653394
511	NC_002971	TCT	2	6	28818	28823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653394
512	NC_002971	GTG	2	6	28889	28894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653394
513	NC_002971	TCT	2	6	28971	28976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653394
514	NC_002971	AGC	2	6	29028	29033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653394
515	NC_002971	C	6	6	29053	29058	0 %	0 %	0 %	100 %	29653394
516	NC_002971	T	6	6	29173	29178	0 %	100 %	0 %	0 %	29653394
517	NC_002971	CGG	2	6	29190	29195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653394
518	NC_002971	AATA	2	8	29207	29214	75 %	25 %	0 %	0 %	29653394
519	NC_002971	ATTC	2	8	29216	29223	25 %	50 %	0 %	25 %	29653394
520	NC_002971	AGC	2	6	29228	29233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653394
521	NC_002971	CCT	2	6	29271	29276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653394
522	NC_002971	TTGA	2	8	29297	29304	25 %	50 %	25 %	0 %	29653394
523	NC_002971	CGT	2	6	29570	29575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653395
524	NC_002971	TAT	2	6	29598	29603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653395
525	NC_002971	GAA	2	6	29605	29610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653395
526	NC_002971	TTC	2	6	29675	29680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653395
527	NC_002971	TTTG	2	8	29734	29741	0 %	75 %	25 %	0 %	29653395
528	NC_002971	ACG	2	6	29766	29771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653395
529	NC_002971	T	6	6	29776	29781	0 %	100 %	0 %	0 %	29653395
530	NC_002971	CT	3	6	29811	29816	0 %	50 %	0 %	50 %	29653395
531	NC_002971	TCG	2	6	29928	29933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653396
532	NC_002971	TGG	2	6	29949	29954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653396
533	NC_002971	ATC	2	6	30100	30105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653396
534	NC_002971	GGC	2	6	30117	30122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653396
535	NC_002971	GC	3	6	30121	30126	0 %	0 %	50 %	50 %	29653396
536	NC_002971	CAG	2	6	30136	30141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653396
537	NC_002971	AC	3	6	30176	30181	50 %	0 %	0 %	50 %	29653396
538	NC_002971	CCATT	2	10	30217	30226	20 %	40 %	0 %	40 %	29653396
539	NC_002971	CTA	2	6	30240	30245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653396
540	NC_002971	GGTA	2	8	30321	30328	25 %	25 %	50 %	0 %	29653396
541	NC_002971	A	7	7	30334	30340	100 %	0 %	0 %	0 %	29653396
542	NC_002971	GCAAA	2	10	30381	30390	60 %	0 %	20 %	20 %	29653396
543	NC_002971	T	6	6	30413	30418	0 %	100 %	0 %	0 %	29653396
544	NC_002971	AGC	2	6	30442	30447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653396
545	NC_002971	TGT	2	6	30509	30514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653396
546	NC_002971	T	6	6	30559	30564	0 %	100 %	0 %	0 %	29653396
547	NC_002971	AAATT	2	10	30651	30660	60 %	40 %	0 %	0 %	29653397
548	NC_002971	ATC	2	6	30697	30702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653397
549	NC_002971	ATCA	2	8	30745	30752	50 %	25 %	0 %	25 %	29653397
550	NC_002971	AATT	2	8	30762	30769	50 %	50 %	0 %	0 %	29653397
551	NC_002971	TTA	2	6	30857	30862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653397
552	NC_002971	TAT	2	6	30903	30908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653398
553	NC_002971	CCAAAG	2	12	30945	30956	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	29653398
554	NC_002971	GCC	2	6	31109	31114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653398
555	NC_002971	AGC	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653398
556	NC_002971	GCT	2	6	31411	31416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653398
557	NC_002971	AC	3	6	31537	31542	50 %	0 %	0 %	50 %	29653398
558	NC_002971	CGC	2	6	31588	31593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653398
559	NC_002971	C	6	6	31695	31700	0 %	0 %	0 %	100 %	29653398
560	NC_002971	CCA	2	6	31753	31758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653398
561	NC_002971	AACT	2	8	31802	31809	50 %	25 %	0 %	25 %	29653398
562	NC_002971	ACC	2	6	31829	31834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653398
563	NC_002971	AAT	2	6	31847	31852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653398
564	NC_002971	CGT	2	6	31859	31864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653398
565	NC_002971	TGTGAT	2	12	31873	31884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29653398
566	NC_002971	CAG	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653398
567	NC_002971	CAT	2	6	31949	31954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653398
568	NC_002971	GCT	2	6	31955	31960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653398
569	NC_002971	TTC	2	6	31979	31984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653398
570	NC_002971	GAG	2	6	32020	32025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653398
571	NC_002971	A	6	6	32043	32048	100 %	0 %	0 %	0 %	29653398
572	NC_002971	TTG	2	6	32054	32059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653398
573	NC_002971	TGG	2	6	32070	32075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653398
574	NC_002971	ATG	2	6	32142	32147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653398
575	NC_002971	GAT	2	6	32170	32175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653398
576	NC_002971	GCC	2	6	32197	32202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653399
577	NC_002971	T	7	7	32263	32269	0 %	100 %	0 %	0 %	29653399
578	NC_002971	T	6	6	32283	32288	0 %	100 %	0 %	0 %	29653399
579	NC_002971	TAAA	2	8	32352	32359	75 %	25 %	0 %	0 %	29653399
580	NC_002971	TCA	2	6	32370	32375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653399
581	NC_002971	A	7	7	32499	32505	100 %	0 %	0 %	0 %	29653399
582	NC_002971	AGG	2	6	32581	32586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653399
583	NC_002971	TCC	2	6	32669	32674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161511219
584	NC_002971	GTC	2	6	32728	32733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511219
585	NC_002971	CGA	2	6	32796	32801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511219
586	NC_002971	TTG	2	6	32836	32841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511219
587	NC_002971	TGT	2	6	32889	32894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511219
588	NC_002971	A	7	7	32911	32917	100 %	0 %	0 %	0 %	161511219
589	NC_002971	CTT	2	6	32922	32927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511219
590	NC_002971	AT	3	6	32972	32977	50 %	50 %	0 %	0 %	161511219
591	NC_002971	AAT	2	6	32984	32989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511219
592	NC_002971	ATC	2	6	33061	33066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511219
593	NC_002971	CAG	2	6	33142	33147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511219
594	NC_002971	GCAG	2	8	33155	33162	25 %	0 %	50 %	25 %	161511219
595	NC_002971	G	6	6	33178	33183	0 %	0 %	100 %	0 %	161511219
596	NC_002971	TCT	2	6	33224	33229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511219
597	NC_002971	GGT	2	6	33238	33243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511219
598	NC_002971	TATTT	2	10	33263	33272	20 %	80 %	0 %	0 %	161511219
599	NC_002971	GC	3	6	33357	33362	0 %	0 %	50 %	50 %	215918868
600	NC_002971	CGA	2	6	33518	33523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653401
601	NC_002971	A	6	6	33572	33577	100 %	0 %	0 %	0 %	29653401
602	NC_002971	TGC	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653401
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605	NC_002971	AATAA	2	10	33699	33708	80 %	20 %	0 %	0 %	29653401
606	NC_002971	ATAA	2	8	33740	33747	75 %	25 %	0 %	0 %	29653401
607	NC_002971	GTT	2	6	33763	33768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653401
608	NC_002971	TGC	2	6	33781	33786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653401
609	NC_002971	TTG	2	6	33798	33803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653401
610	NC_002971	GCCC	2	8	33812	33819	0 %	0 %	25 %	75 %	29653401
611	NC_002971	CAC	2	6	33831	33836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653401
612	NC_002971	GCA	3	9	33913	33921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653401
613	NC_002971	ATA	2	6	33967	33972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653401
614	NC_002971	AAT	2	6	34040	34045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653401
615	NC_002971	AGA	2	6	34062	34067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653401
616	NC_002971	GCT	3	9	34108	34116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653401
617	NC_002971	GAA	2	6	34151	34156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653401
618	NC_002971	CTA	3	9	34169	34177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653401
619	NC_002971	TGA	2	6	34219	34224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653401
620	NC_002971	CTG	2	6	34263	34268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653401
621	NC_002971	CGT	2	6	34330	34335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653401
622	NC_002971	CATT	2	8	34363	34370	25 %	50 %	0 %	25 %	29653401
623	NC_002971	AAT	2	6	34410	34415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653401
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625	NC_002971	TAAA	2	8	34600	34607	75 %	25 %	0 %	0 %	29653402
626	NC_002971	TCT	2	6	34617	34622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653402
627	NC_002971	ACC	2	6	34625	34630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653402
628	NC_002971	TCG	2	6	34655	34660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653402
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