MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002971	TCC	2	6	300435	300440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653684
5003	NC_002971	ATT	2	6	300459	300464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5004	NC_002971	TAT	2	6	300560	300565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5005	NC_002971	TTA	2	6	300622	300627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5006	NC_002971	AAAAT	2	10	300662	300671	80 %	20 %	0 %	0 %	29653684
5007	NC_002971	ATT	2	6	300708	300713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5008	NC_002971	TTA	2	6	300736	300741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5009	NC_002971	T	6	6	300777	300782	0 %	100 %	0 %	0 %	29653684
5010	NC_002971	TAG	3	9	300914	300922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653684
5011	NC_002971	ATGT	2	8	300928	300935	25 %	50 %	25 %	0 %	29653684
5012	NC_002971	CAG	2	6	300937	300942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653684
5013	NC_002971	CGAT	2	8	301006	301013	25 %	25 %	25 %	25 %	29653684
5014	NC_002971	TTG	2	6	301094	301099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653684
5015	NC_002971	A	6	6	301178	301183	100 %	0 %	0 %	0 %	29653684
5016	NC_002971	A	6	6	301186	301191	100 %	0 %	0 %	0 %	29653684
5017	NC_002971	ATT	2	6	301250	301255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653684
5018	NC_002971	AAG	2	6	301301	301306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653684
5019	NC_002971	CTT	2	6	301409	301414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653684
5020	NC_002971	CGC	2	6	301619	301624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653684
5021	NC_002971	A	6	6	301625	301630	100 %	0 %	0 %	0 %	29653684
5022	NC_002971	AAAT	2	8	301757	301764	75 %	25 %	0 %	0 %	29653685
5023	NC_002971	ATG	3	9	301767	301775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653685
5024	NC_002971	AAAG	2	8	301835	301842	75 %	0 %	25 %	0 %	29653685
5025	NC_002971	A	6	6	301959	301964	100 %	0 %	0 %	0 %	29653685
5026	NC_002971	CGA	2	6	301985	301990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653685
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5029	NC_002971	AGCCGA	2	12	302060	302071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653685
5030	NC_002971	GAT	2	6	302076	302081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653685
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5033	NC_002971	AAG	2	6	302302	302307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653685
5034	NC_002971	TGG	2	6	302447	302452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215918945
5035	NC_002971	TTCG	2	8	302476	302483	0 %	50 %	25 %	25 %	215918945
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5039	NC_002971	CTT	2	6	302628	302633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918945
5040	NC_002971	TTTGA	2	10	302729	302738	20 %	60 %	20 %	0 %	215918945
5041	NC_002971	CGG	2	6	302798	302803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918945
5042	NC_002971	TCG	2	6	302822	302827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918945
5043	NC_002971	TCG	2	6	302835	302840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918945
5044	NC_002971	CGC	2	6	302862	302867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918945
5045	NC_002971	GTTTG	2	10	302940	302949	0 %	60 %	40 %	0 %	215918945
5046	NC_002971	GA	4	8	303009	303016	50 %	0 %	50 %	0 %	215918945
5047	NC_002971	T	6	6	303018	303023	0 %	100 %	0 %	0 %	215918945
5048	NC_002971	CGG	2	6	303141	303146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918945
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5051	NC_002971	GCG	2	6	303314	303319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215918945
5052	NC_002971	TGA	2	6	303323	303328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918945
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5054	NC_002971	CTT	2	6	303402	303407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918945
5055	NC_002971	T	6	6	303462	303467	0 %	100 %	0 %	0 %	215918945
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5063	NC_002971	TCG	2	6	303737	303742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918945
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5091	NC_002971	AT	3	6	305372	305377	50 %	50 %	0 %	0 %	215918946
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5107	NC_002971	ATT	2	6	306430	306435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918946
5108	NC_002971	TGA	2	6	306445	306450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918946
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5110	NC_002971	A	6	6	306495	306500	100 %	0 %	0 %	0 %	215918946
5111	NC_002971	TGA	2	6	306521	306526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918946
5112	NC_002971	CAT	2	6	306546	306551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918946
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5119	NC_002971	CAA	2	6	306771	306776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918946
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