MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 33995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002971	AGC	2	6	268268	268273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653653
4502	NC_002971	CCG	2	6	268339	268344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653653
4503	NC_002971	AGC	2	6	268364	268369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653653
4504	NC_002971	ACG	2	6	268375	268380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653653
4505	NC_002971	GAA	2	6	268410	268415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653653
4506	NC_002971	GTTGAC	2	12	268416	268427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29653653
4507	NC_002971	AG	3	6	268481	268486	50 %	0 %	50 %	0 %	29653653
4508	NC_002971	A	6	6	268562	268567	100 %	0 %	0 %	0 %	29653654
4509	NC_002971	ATCC	2	8	268609	268616	25 %	25 %	0 %	50 %	29653654
4510	NC_002971	ACC	2	6	268686	268691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653654
4511	NC_002971	CAGTGG	2	12	268692	268703	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29653654
4512	NC_002971	A	8	8	268788	268795	100 %	0 %	0 %	0 %	29653654
4513	NC_002971	GAA	2	6	268817	268822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653654
4514	NC_002971	GC	3	6	268925	268930	0 %	0 %	50 %	50 %	29653654
4515	NC_002971	ATC	2	6	268943	268948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653654
4516	NC_002971	GCG	2	6	269008	269013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653654
4517	NC_002971	AGA	2	6	269092	269097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653654
4518	NC_002971	TGC	2	6	269107	269112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4519	NC_002971	CG	3	6	269160	269165	0 %	0 %	50 %	50 %	29653654
4520	NC_002971	GAAA	2	8	269172	269179	75 %	0 %	25 %	0 %	29653654
4521	NC_002971	TTGA	2	8	269189	269196	25 %	50 %	25 %	0 %	29653654
4522	NC_002971	A	6	6	269196	269201	100 %	0 %	0 %	0 %	29653654
4523	NC_002971	TCT	2	6	269234	269239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653654
4524	NC_002971	TTG	2	6	269346	269351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653654
4525	NC_002971	TAT	2	6	269383	269388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653654
4526	NC_002971	AC	3	6	269467	269472	50 %	0 %	0 %	50 %	29653654
4527	NC_002971	CAA	2	6	269541	269546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653654
4528	NC_002971	ACG	2	6	269576	269581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4529	NC_002971	GC	3	6	269608	269613	0 %	0 %	50 %	50 %	29653654
4530	NC_002971	AGG	2	6	269646	269651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653654
4531	NC_002971	CTT	2	6	269889	269894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653654
4532	NC_002971	GTC	2	6	269901	269906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4533	NC_002971	GCA	2	6	269952	269957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653654
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4537	NC_002971	ATT	2	6	270036	270041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653654
4538	NC_002971	CTTT	2	8	270044	270051	0 %	75 %	0 %	25 %	29653654
4539	NC_002971	A	7	7	270052	270058	100 %	0 %	0 %	0 %	29653654
4540	NC_002971	GAAA	2	8	270088	270095	75 %	0 %	25 %	0 %	29653654
4541	NC_002971	GAT	2	6	270113	270118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653654
4542	NC_002971	TTG	2	6	270119	270124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653654
4543	NC_002971	GAA	2	6	270125	270130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653654
4544	NC_002971	TAG	2	6	270159	270164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653654
4545	NC_002971	GCA	2	6	270176	270181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4546	NC_002971	GAA	2	6	270188	270193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653654
4547	NC_002971	ATTA	2	8	270235	270242	50 %	50 %	0 %	0 %	29653654
4548	NC_002971	TAG	2	6	270261	270266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653654
4549	NC_002971	CTG	2	6	270280	270285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4550	NC_002971	ATC	2	6	270338	270343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653654
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4552	NC_002971	TGC	2	6	270615	270620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653654
4553	NC_002971	AGG	2	6	270715	270720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918933
4554	NC_002971	ACA	2	6	270738	270743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918933
4555	NC_002971	AAT	2	6	270772	270777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918933
4556	NC_002971	ACAA	2	8	270782	270789	75 %	0 %	0 %	25 %	215918933
4557	NC_002971	AAT	2	6	270886	270891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215918933
4558	NC_002971	TATT	2	8	270991	270998	25 %	75 %	0 %	0 %	215918933
4559	NC_002971	TGA	2	6	271035	271040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918933
4560	NC_002971	A	8	8	271147	271154	100 %	0 %	0 %	0 %	215918933
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4562	NC_002971	GTT	2	6	271370	271375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653656
4563	NC_002971	TACG	2	8	271402	271409	25 %	25 %	25 %	25 %	29653656
4564	NC_002971	CAA	3	9	271487	271495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653656
4565	NC_002971	GCGT	2	8	271518	271525	0 %	25 %	50 %	25 %	29653656
4566	NC_002971	CGA	2	6	271541	271546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653656
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4569	NC_002971	AATC	3	12	271684	271695	50 %	25 %	0 %	25 %	29653656
4570	NC_002971	ATT	2	6	271701	271706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653656
4571	NC_002971	GAA	2	6	271727	271732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653656
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4574	NC_002971	GAA	2	6	271874	271879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653656
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4580	NC_002971	TTAA	2	8	271946	271953	50 %	50 %	0 %	0 %	29653656
4581	NC_002971	AAT	2	6	271955	271960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653656
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4583	NC_002971	AAT	2	6	272155	272160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653656
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4590	NC_002971	TCATTG	2	12	272370	272381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29653656
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4593	NC_002971	ATC	2	6	272528	272533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653656
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4596	NC_002971	A	8	8	272615	272622	100 %	0 %	0 %	0 %	29653656
4597	NC_002971	A	6	6	272711	272716	100 %	0 %	0 %	0 %	29653656
4598	NC_002971	ACA	2	6	272719	272724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653656
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4601	NC_002971	GCTTAG	2	12	272901	272912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29653656
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4603	NC_002971	TTG	2	6	273020	273025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653656
4604	NC_002971	T	6	6	273043	273048	0 %	100 %	0 %	0 %	29653656
4605	NC_002971	TAC	2	6	273156	273161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653656
4606	NC_002971	GCT	2	6	273176	273181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653656
4607	NC_002971	T	6	6	273181	273186	0 %	100 %	0 %	0 %	29653656
4608	NC_002971	GCG	2	6	273193	273198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653656
4609	NC_002971	AAG	2	6	273240	273245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653656
4610	NC_002971	GTC	2	6	273254	273259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653656
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4612	NC_002971	GCA	2	6	273633	273638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653657
4613	NC_002971	A	7	7	273676	273682	100 %	0 %	0 %	0 %	29653658
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4616	NC_002971	TGT	2	6	273841	273846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653658
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4619	NC_002971	TAA	2	6	274156	274161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653658
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4622	NC_002971	TAAGC	2	10	274361	274370	40 %	20 %	20 %	20 %	29653658
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4996	NC_002971	G	6	6	300142	300147	0 %	0 %	100 %	0 %	29653683
4997	NC_002971	GC	3	6	300158	300163	0 %	0 %	50 %	50 %	29653683
4998	NC_002971	T	6	6	300202	300207	0 %	100 %	0 %	0 %	29653683
4999	NC_002971	CGG	2	6	300267	300272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653684
5000	NC_002971	AT	3	6	300290	300295	50 %	50 %	0 %	0 %	29653684

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