MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 40713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002932	CAG	2	6	100149	100154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672947
2002	NC_002932	CGAGC	2	10	100179	100188	20 %	0 %	40 %	40 %	21672947
2003	NC_002932	GAT	2	6	100224	100229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672947
2004	NC_002932	AG	3	6	100284	100289	50 %	0 %	50 %	0 %	21672947
2005	NC_002932	CT	3	6	100323	100328	0 %	50 %	0 %	50 %	21672947
2006	NC_002932	CGG	2	6	100406	100411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672947
2007	NC_002932	AGC	2	6	100417	100422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672947
2008	NC_002932	GTC	2	6	100489	100494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672947
2009	NC_002932	GCG	2	6	100533	100538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672948
2010	NC_002932	TCA	2	6	100558	100563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672948
2011	NC_002932	GTG	2	6	100638	100643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672948
2012	NC_002932	CG	3	6	100668	100673	0 %	0 %	50 %	50 %	21672948
2013	NC_002932	GGT	2	6	100712	100717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672948
2014	NC_002932	T	6	6	100723	100728	0 %	100 %	0 %	0 %	21672948
2015	NC_002932	GCT	2	6	100733	100738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2016	NC_002932	GCT	4	12	100795	100806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2017	NC_002932	CCG	2	6	100807	100812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672948
2018	NC_002932	GCG	2	6	100842	100847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672948
2019	NC_002932	T	8	8	100998	101005	0 %	100 %	0 %	0 %	21672948
2020	NC_002932	ACG	2	6	101008	101013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2021	NC_002932	CCGG	2	8	101047	101054	0 %	0 %	50 %	50 %	21672948
2022	NC_002932	TCG	2	6	101142	101147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2023	NC_002932	CGCC	2	8	101221	101228	0 %	0 %	25 %	75 %	21672948
2024	NC_002932	GTC	2	6	101241	101246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2025	NC_002932	CCT	2	6	101323	101328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672948
2026	NC_002932	CTG	2	6	101330	101335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
2027	NC_002932	CCT	2	6	101347	101352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672948
2028	NC_002932	CAT	2	6	101492	101497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672948
2029	NC_002932	CGG	2	6	101500	101505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672948
2030	NC_002932	TTG	2	6	101523	101528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672948
2031	NC_002932	GCC	2	6	101552	101557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672948
2032	NC_002932	AGGT	2	8	101583	101590	25 %	25 %	50 %	0 %	21672948
2033	NC_002932	CTC	2	6	101666	101671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672948
2034	NC_002932	CG	3	6	101701	101706	0 %	0 %	50 %	50 %	21672948
2035	NC_002932	TCG	2	6	101721	101726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672948
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2039	NC_002932	CGCC	2	8	101770	101777	0 %	0 %	25 %	75 %	21672948
2040	NC_002932	TGA	2	6	101961	101966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672949
2041	NC_002932	AATG	2	8	102025	102032	50 %	25 %	25 %	0 %	21672949
2042	NC_002932	CCA	2	6	102033	102038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672949
2043	NC_002932	TCT	2	6	102139	102144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672949
2044	NC_002932	CGG	2	6	102159	102164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672949
2045	NC_002932	TCA	3	9	102165	102173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672949
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2049	NC_002932	CGA	2	6	102292	102297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2052	NC_002932	CGG	2	6	102421	102426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672949
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2054	NC_002932	GCT	2	6	102493	102498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672949
2055	NC_002932	CTC	2	6	102511	102516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672949
2056	NC_002932	CATCGC	2	12	102517	102528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21672949
2057	NC_002932	TGC	2	6	102636	102641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2059	NC_002932	TGGT	2	8	102699	102706	0 %	50 %	50 %	0 %	21672949
2060	NC_002932	GCA	2	6	102753	102758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672949
2061	NC_002932	CGA	2	6	102802	102807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2063	NC_002932	ATC	2	6	102935	102940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672949
2064	NC_002932	ATT	2	6	102983	102988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672949
2065	NC_002932	CGA	2	6	103012	103017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672949
2066	NC_002932	CGA	2	6	103084	103089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672949
2067	NC_002932	TCG	2	6	103134	103139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2069	NC_002932	GAG	2	6	103166	103171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672949
2070	NC_002932	CGT	2	6	103208	103213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2072	NC_002932	CCGA	2	8	103229	103236	25 %	0 %	25 %	50 %	21672949
2073	NC_002932	ACCGGC	2	12	103262	103273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21672949
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2087	NC_002932	CTCG	2	8	103876	103883	0 %	25 %	25 %	50 %	21672949
2088	NC_002932	TGC	2	6	103896	103901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672949
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2092	NC_002932	CGGGG	2	10	104122	104131	0 %	0 %	80 %	20 %	21672949
2093	NC_002932	TGC	2	6	104260	104265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672950
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2099	NC_002932	GCT	2	6	104851	104856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672950
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2102	NC_002932	GCCA	2	8	104929	104936	25 %	0 %	25 %	50 %	21672950
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2105	NC_002932	GCA	3	9	105031	105039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672950
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2111	NC_002932	GC	3	6	105325	105330	0 %	0 %	50 %	50 %	21672951
2112	NC_002932	CTCC	2	8	105353	105360	0 %	25 %	0 %	75 %	21672951
2113	NC_002932	GTTC	2	8	105395	105402	0 %	50 %	25 %	25 %	21672951
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2116	NC_002932	GTAT	2	8	105489	105496	25 %	50 %	25 %	0 %	21672951
2117	NC_002932	CGG	2	6	105560	105565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672951
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2119	NC_002932	GATC	2	8	105686	105693	25 %	25 %	25 %	25 %	21672951
2120	NC_002932	TCG	2	6	105724	105729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672951
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2122	NC_002932	AGC	2	6	105763	105768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672951
2123	NC_002932	CCG	2	6	105833	105838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672951
2124	NC_002932	CCT	2	6	105893	105898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672951
2125	NC_002932	CGC	2	6	105972	105977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672951
2126	NC_002932	CGA	2	6	106028	106033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672951
2127	NC_002932	CTG	2	6	106059	106064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672951
2128	NC_002932	GGT	2	6	106071	106076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672951
2129	NC_002932	TTC	2	6	106090	106095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672951
2130	NC_002932	TTTGGT	2	12	106188	106199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672951
2131	NC_002932	CTC	2	6	106218	106223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672951
2132	NC_002932	ATCG	2	8	106230	106237	25 %	25 %	25 %	25 %	21672951
2133	NC_002932	TCC	2	6	106260	106265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672951
2134	NC_002932	GA	3	6	106273	106278	50 %	0 %	50 %	0 %	21672951
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2136	NC_002932	AGC	2	6	106414	106419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672952
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2139	NC_002932	CGCC	2	8	106485	106492	0 %	0 %	25 %	75 %	21672952
2140	NC_002932	TCGA	2	8	106522	106529	25 %	25 %	25 %	25 %	21672952
2141	NC_002932	TTG	2	6	106579	106584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672952
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2143	NC_002932	TGA	2	6	106670	106675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672952
2144	NC_002932	GTT	2	6	106799	106804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672952
2145	NC_002932	TGA	2	6	106805	106810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672952
2146	NC_002932	ACG	2	6	106851	106856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672953
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2148	NC_002932	TCG	2	6	106983	106988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672953
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2151	NC_002932	GTT	2	6	107036	107041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672953
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2153	NC_002932	AGC	2	6	107091	107096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672953
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2230	NC_002932	GTC	2	6	109999	110004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672955
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2233	NC_002932	T	6	6	110151	110156	0 %	100 %	0 %	0 %	21672955
2234	NC_002932	GCGGA	2	10	110171	110180	20 %	0 %	60 %	20 %	21672955
2235	NC_002932	ATCG	2	8	110275	110282	25 %	25 %	25 %	25 %	21672955
2236	NC_002932	AAG	3	9	110308	110316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672955
2237	NC_002932	A	6	6	110397	110402	100 %	0 %	0 %	0 %	21672956
2238	NC_002932	AGA	2	6	110426	110431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672956
2239	NC_002932	AG	3	6	110500	110505	50 %	0 %	50 %	0 %	21672956
2240	NC_002932	GTT	2	6	110508	110513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672956
2241	NC_002932	CAT	2	6	110516	110521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672956
2242	NC_002932	CTT	2	6	110667	110672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672957
2243	NC_002932	GCCA	2	8	110686	110693	25 %	0 %	25 %	50 %	21672957
2244	NC_002932	GAC	2	6	110748	110753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672957
2245	NC_002932	TGG	2	6	110761	110766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672957
2246	NC_002932	AGA	2	6	110906	110911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672957
2247	NC_002932	T	6	6	111048	111053	0 %	100 %	0 %	0 %	21672957
2248	NC_002932	CGT	2	6	111092	111097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672957
2249	NC_002932	TGA	2	6	111113	111118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672957
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2252	NC_002932	GAC	2	6	111180	111185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672957
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2256	NC_002932	GGC	2	6	111320	111325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672957
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2360	NC_002932	CTTCGG	2	12	117259	117270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
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2362	NC_002932	GTTTCG	2	12	117315	117326	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21672964
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2364	NC_002932	TCG	2	6	117525	117530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
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2366	NC_002932	ATG	2	6	117555	117560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672964
2367	NC_002932	GCA	3	9	117589	117597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2368	NC_002932	GCT	3	9	117607	117615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2369	NC_002932	CCT	2	6	117649	117654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672964
2370	NC_002932	CGA	2	6	117658	117663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2371	NC_002932	GC	3	6	117666	117671	0 %	0 %	50 %	50 %	21672964
2372	NC_002932	TCG	2	6	117711	117716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2373	NC_002932	GCT	2	6	117718	117723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2374	NC_002932	TCG	2	6	117741	117746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
2375	NC_002932	GC	3	6	117750	117755	0 %	0 %	50 %	50 %	21672964
2376	NC_002932	GCT	2	6	117770	117775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
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2378	NC_002932	GCT	3	9	117835	117843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672964
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2382	NC_002932	ATG	2	6	118020	118025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672965
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2393	NC_002932	TGA	2	6	118543	118548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672965
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2456	NC_002932	CGA	2	6	122346	122351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672968
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2488	NC_002932	GAC	2	6	123848	123853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672970
2489	NC_002932	TTGTCT	2	12	123858	123869	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672970
2490	NC_002932	CTG	2	6	123894	123899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672970
2491	NC_002932	CGA	2	6	123919	123924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672970
2492	NC_002932	TCG	3	9	123993	124001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672970
2493	NC_002932	TGC	2	6	124020	124025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672970
2494	NC_002932	GGT	2	6	124141	124146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672970
2495	NC_002932	GAG	2	6	124205	124210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672970
2496	NC_002932	GGC	2	6	124225	124230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672970
2497	NC_002932	ATG	2	6	124239	124244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672970
2498	NC_002932	CT	3	6	124429	124434	0 %	50 %	0 %	50 %	21672971
2499	NC_002932	GGCA	2	8	124478	124485	25 %	0 %	50 %	25 %	21672971
2500	NC_002932	AAG	2	6	124521	124526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672971

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