MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 40713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002932	CAG	2	6	49951	49956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1002	NC_002932	CGCTC	2	10	49986	49995	0 %	20 %	20 %	60 %	21672892
1003	NC_002932	GCT	2	6	50022	50027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1004	NC_002932	CGG	2	6	50071	50076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1005	NC_002932	CCG	2	6	50102	50107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672892
1006	NC_002932	CGGT	2	8	50143	50150	0 %	25 %	50 %	25 %	21672893
1007	NC_002932	CGT	2	6	50169	50174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672893
1008	NC_002932	CCG	2	6	50182	50187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1009	NC_002932	TCA	2	6	50237	50242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672893
1010	NC_002932	CGG	2	6	50255	50260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1011	NC_002932	TGA	2	6	50267	50272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672893
1012	NC_002932	GGC	2	6	50291	50296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1013	NC_002932	GCG	2	6	50351	50356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1014	NC_002932	CGCCGA	2	12	50450	50461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21672893
1015	NC_002932	GCC	2	6	50466	50471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1016	NC_002932	GCC	2	6	50501	50506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1017	NC_002932	CGTT	2	8	50521	50528	0 %	50 %	25 %	25 %	21672893
1018	NC_002932	CGTG	2	8	50534	50541	0 %	25 %	50 %	25 %	21672893
1019	NC_002932	GATGTT	2	12	50580	50591	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672893
1020	NC_002932	CGG	3	9	50621	50629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1021	NC_002932	TGT	2	6	50855	50860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672893
1022	NC_002932	GCC	2	6	51014	51019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1023	NC_002932	CGAG	2	8	51038	51045	25 %	0 %	50 %	25 %	21672893
1024	NC_002932	GACA	2	8	51161	51168	50 %	0 %	25 %	25 %	21672894
1025	NC_002932	AGG	2	6	51195	51200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672894
1026	NC_002932	GCG	2	6	51208	51213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672894
1027	NC_002932	GCT	2	6	51349	51354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1028	NC_002932	CGG	2	6	51370	51375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672894
1029	NC_002932	AGC	2	6	51378	51383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1030	NC_002932	CGATGG	2	12	51412	51423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21672894
1031	NC_002932	CTC	2	6	51443	51448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672894
1032	NC_002932	CAC	3	9	51485	51493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672894
1033	NC_002932	GT	3	6	51497	51502	0 %	50 %	50 %	0 %	21672894
1034	NC_002932	CGCC	2	8	51549	51556	0 %	0 %	25 %	75 %	21672894
1035	NC_002932	TGA	2	6	51559	51564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672894
1036	NC_002932	TGA	2	6	51580	51585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672894
1037	NC_002932	GCC	2	6	51588	51593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672894
1038	NC_002932	CGC	4	12	51629	51640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672894
1039	NC_002932	CGGG	2	8	51676	51683	0 %	0 %	75 %	25 %	21672894
1040	NC_002932	GCA	2	6	51685	51690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1041	NC_002932	CG	3	6	51731	51736	0 %	0 %	50 %	50 %	21672894
1042	NC_002932	CG	4	8	51816	51823	0 %	0 %	50 %	50 %	21672894
1043	NC_002932	AGAT	2	8	51849	51856	50 %	25 %	25 %	0 %	21672894
1044	NC_002932	CAG	2	6	51884	51889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1045	NC_002932	CGC	2	6	52353	52358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1046	NC_002932	CTG	2	6	52392	52397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1047	NC_002932	TTC	2	6	52458	52463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672895
1048	NC_002932	ATT	2	6	52557	52562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672895
1049	NC_002932	TGT	2	6	52565	52570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672895
1050	NC_002932	TGC	2	6	52640	52645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1051	NC_002932	ATG	2	6	52648	52653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1052	NC_002932	TCG	2	6	52660	52665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1053	NC_002932	TGA	2	6	52706	52711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1054	NC_002932	GGC	2	6	52740	52745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1055	NC_002932	TGT	2	6	52796	52801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672895
1056	NC_002932	TGA	2	6	52826	52831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1057	NC_002932	GCC	2	6	52839	52844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1058	NC_002932	TCC	2	6	52891	52896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672895
1059	NC_002932	TGA	2	6	52937	52942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1060	NC_002932	GCC	2	6	53022	53027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1061	NC_002932	CCT	2	6	53087	53092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672895
1062	NC_002932	GCG	2	6	53097	53102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1063	NC_002932	TCGACA	2	12	53128	53139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21672895
1064	NC_002932	TCAT	2	8	53140	53147	25 %	50 %	0 %	25 %	21672895
1065	NC_002932	T	6	6	53167	53172	0 %	100 %	0 %	0 %	21672895
1066	NC_002932	CAT	2	6	53177	53182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672895
1067	NC_002932	ACG	2	6	53189	53194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1068	NC_002932	TAGA	2	8	53343	53350	50 %	25 %	25 %	0 %	21672895
1069	NC_002932	TGT	2	6	53360	53365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672895
1070	NC_002932	GTC	2	6	53451	53456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1071	NC_002932	TCC	2	6	53469	53474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672895
1072	NC_002932	GGC	2	6	53475	53480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1073	NC_002932	CGG	2	6	53523	53528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1074	NC_002932	G	6	6	53533	53538	0 %	0 %	100 %	0 %	21672895
1075	NC_002932	CAT	2	6	53543	53548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672895
1076	NC_002932	AGGC	2	8	53550	53557	25 %	0 %	50 %	25 %	21672895
1077	NC_002932	GCG	2	6	53758	53763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1078	NC_002932	TCG	2	6	53830	53835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1079	NC_002932	ATCTGC	2	12	53836	53847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21672895
1080	NC_002932	TCCA	2	8	54472	54479	25 %	25 %	0 %	50 %	21672896
1081	NC_002932	CAA	2	6	54493	54498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672896
1082	NC_002932	CGA	2	6	54508	54513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1083	NC_002932	A	6	6	54557	54562	100 %	0 %	0 %	0 %	21672896
1084	NC_002932	GGT	2	6	54628	54633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672896
1085	NC_002932	AAG	2	6	54644	54649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672896
1086	NC_002932	GAA	2	6	54745	54750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672896
1087	NC_002932	CAT	2	6	54793	54798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672896
1088	NC_002932	GCA	2	6	54817	54822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1089	NC_002932	GCA	2	6	54847	54852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1090	NC_002932	TCG	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1091	NC_002932	GTG	2	6	54950	54955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672896
1092	NC_002932	CAC	2	6	55033	55038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672896
1093	NC_002932	GA	3	6	55047	55052	50 %	0 %	50 %	0 %	21672896
1094	NC_002932	AGC	2	6	55191	55196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1095	NC_002932	ACC	2	6	55208	55213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672896
1096	NC_002932	GCA	2	6	55222	55227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1097	NC_002932	GGC	2	6	55228	55233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672896
1098	NC_002932	CAG	2	6	55280	55285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1099	NC_002932	TCA	2	6	55329	55334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672896
1100	NC_002932	GCG	2	6	55365	55370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672896
1101	NC_002932	GCA	2	6	55402	55407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1102	NC_002932	CCG	2	6	55519	55524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672896
1103	NC_002932	GAT	2	6	55585	55590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672896
1104	NC_002932	GTGGAT	2	12	55619	55630	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21672896
1105	NC_002932	CAA	2	6	55666	55671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672896
1106	NC_002932	T	6	6	55687	55692	0 %	100 %	0 %	0 %	21672896
1107	NC_002932	CAG	2	6	55709	55714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1108	NC_002932	AAC	2	6	55803	55808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672896
1109	NC_002932	CCG	2	6	55828	55833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672896
1110	NC_002932	GCC	2	6	55908	55913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672896
1111	NC_002932	TCT	2	6	55932	55937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672896
1112	NC_002932	AGA	4	12	55971	55982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672896
1113	NC_002932	CCGA	2	8	55988	55995	25 %	0 %	25 %	50 %	21672896
1114	NC_002932	CGG	2	6	56061	56066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672896
1115	NC_002932	GGA	2	6	56071	56076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672896
1116	NC_002932	TGA	2	6	56101	56106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672896
1117	NC_002932	GAC	2	6	56248	56253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1118	NC_002932	GCT	2	6	56271	56276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672896
1119	NC_002932	ACC	2	6	56312	56317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672896
1120	NC_002932	AGCA	2	8	56453	56460	50 %	0 %	25 %	25 %	21672896
1121	NC_002932	ACC	2	6	56495	56500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672896
1122	NC_002932	GCG	2	6	56520	56525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672896
1123	NC_002932	GGCTG	2	10	56562	56571	0 %	20 %	60 %	20 %	21672896
1124	NC_002932	GGC	2	6	56665	56670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672896
1125	NC_002932	CAT	2	6	56737	56742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672896
1126	NC_002932	CG	3	6	56747	56752	0 %	0 %	50 %	50 %	21672896
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1251	NC_002932	AGC	2	6	62584	62589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672903
1252	NC_002932	AAT	2	6	62637	62642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672903
1253	NC_002932	TGCG	2	8	62656	62663	0 %	25 %	50 %	25 %	21672903
1254	NC_002932	CCGC	2	8	62700	62707	0 %	0 %	25 %	75 %	21672903
1255	NC_002932	GGA	2	6	62767	62772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672903
1256	NC_002932	AGC	2	6	62803	62808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672903
1257	NC_002932	CCA	2	6	62810	62815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672903
1258	NC_002932	GTT	2	6	62820	62825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672903
1259	NC_002932	CGG	2	6	62861	62866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672903
1260	NC_002932	GCGCTC	2	12	62937	62948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21672903
1261	NC_002932	CGT	2	6	63014	63019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672903
1262	NC_002932	GAG	2	6	63073	63078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672903
1263	NC_002932	GCC	2	6	63110	63115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672903
1264	NC_002932	TGA	2	6	63234	63239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672904
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1271	NC_002932	CCA	2	6	63525	63530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672904
1272	NC_002932	CCT	2	6	63549	63554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672904
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1274	NC_002932	CTC	3	9	63622	63630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672904
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1278	NC_002932	GCA	2	6	63687	63692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672904
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1280	NC_002932	TCG	2	6	63842	63847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672904
1281	NC_002932	CGG	2	6	63933	63938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672904
1282	NC_002932	GCA	2	6	63939	63944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672904
1283	NC_002932	AGC	2	6	64040	64045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672904
1284	NC_002932	GAT	2	6	64069	64074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672904
1285	NC_002932	GAT	2	6	64102	64107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672904
1286	NC_002932	CTC	2	6	64150	64155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672904
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1289	NC_002932	CGG	2	6	64574	64579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672905
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1312	NC_002932	GCA	2	6	65473	65478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672905
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1500	NC_002932	TGG	2	6	75649	75654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672919

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