MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 40713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002932	GAC	2	6	286011	286016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673112
5502	NC_002932	GAT	2	6	286061	286066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673112
5503	NC_002932	CGG	2	6	286168	286173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673112
5504	NC_002932	GAT	2	6	286189	286194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673112
5505	NC_002932	TGC	2	6	286296	286301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673113
5506	NC_002932	GCG	2	6	286371	286376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673113
5507	NC_002932	T	6	6	286387	286392	0 %	100 %	0 %	0 %	21673113
5508	NC_002932	ATC	3	9	286421	286429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673113
5509	NC_002932	GTGTTC	2	12	286472	286483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21673113
5510	NC_002932	CGA	2	6	286585	286590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673113
5511	NC_002932	CAT	2	6	286612	286617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673113
5512	NC_002932	CGG	2	6	286666	286671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673113
5513	NC_002932	TGCC	2	8	286684	286691	0 %	25 %	25 %	50 %	21673113
5514	NC_002932	TGA	2	6	286798	286803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673113
5515	NC_002932	GCT	2	6	286807	286812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673113
5516	NC_002932	CGG	2	6	286827	286832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673113
5517	NC_002932	GA	3	6	286848	286853	50 %	0 %	50 %	0 %	21673113
5518	NC_002932	TGC	2	6	286887	286892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673113
5519	NC_002932	GATC	2	8	286900	286907	25 %	25 %	25 %	25 %	21673113
5520	NC_002932	CGG	2	6	286961	286966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673113
5521	NC_002932	CTG	2	6	286987	286992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673113
5522	NC_002932	CGC	2	6	286997	287002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673113
5523	NC_002932	CTG	2	6	287050	287055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673114
5524	NC_002932	CTG	2	6	287130	287135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673114
5525	NC_002932	GTG	2	6	287159	287164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673114
5526	NC_002932	CGG	2	6	287180	287185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673114
5527	NC_002932	TTGC	2	8	287235	287242	0 %	50 %	25 %	25 %	21673114
5528	NC_002932	CGC	2	6	287337	287342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673114
5529	NC_002932	CCA	2	6	287354	287359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673114
5530	NC_002932	CCG	2	6	287366	287371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673114
5531	NC_002932	GC	3	6	287390	287395	0 %	0 %	50 %	50 %	21673114
5532	NC_002932	GCC	2	6	287439	287444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673114
5533	NC_002932	GTTTT	2	10	287446	287455	0 %	80 %	20 %	0 %	21673114
5534	NC_002932	GAT	2	6	287487	287492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673114
5535	NC_002932	GGC	2	6	287503	287508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673114
5536	NC_002932	GCA	2	6	287527	287532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673114
5537	NC_002932	AAG	2	6	287544	287549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673114
5538	NC_002932	AG	3	6	287610	287615	50 %	0 %	50 %	0 %	21673114
5539	NC_002932	TGA	2	6	287630	287635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673114
5540	NC_002932	GAT	2	6	287658	287663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673114
5541	NC_002932	ACA	2	6	287680	287685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673114
5542	NC_002932	T	6	6	287703	287708	0 %	100 %	0 %	0 %	21673114
5543	NC_002932	AT	3	6	287720	287725	50 %	50 %	0 %	0 %	21673114
5544	NC_002932	CAGT	2	8	287728	287735	25 %	25 %	25 %	25 %	21673114
5545	NC_002932	CAA	2	6	287805	287810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21673114
5546	NC_002932	TGA	2	6	287822	287827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673114
5547	NC_002932	TGG	2	6	287896	287901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673115
5548	NC_002932	GAT	2	6	287913	287918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673115
5549	NC_002932	AGC	2	6	287996	288001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673115
5550	NC_002932	ATC	2	6	288158	288163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673115
5551	NC_002932	TCT	2	6	288183	288188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673115
5552	NC_002932	T	6	6	288243	288248	0 %	100 %	0 %	0 %	21673115
5553	NC_002932	TCAG	2	8	288254	288261	25 %	25 %	25 %	25 %	21673115
5554	NC_002932	TTGA	2	8	288331	288338	25 %	50 %	25 %	0 %	21673115
5555	NC_002932	CCA	2	6	288349	288354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673115
5556	NC_002932	GTC	2	6	288550	288555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673116
5557	NC_002932	TCG	2	6	288559	288564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673116
5558	NC_002932	ACC	2	6	288582	288587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673116
5559	NC_002932	TTGC	2	8	288632	288639	0 %	50 %	25 %	25 %	21673116
5560	NC_002932	TCAGCA	2	12	288680	288691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21673116
5561	NC_002932	CCG	2	6	288727	288732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673116
5562	NC_002932	T	7	7	288752	288758	0 %	100 %	0 %	0 %	21673116
5563	NC_002932	GAT	2	6	288803	288808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673116
5564	NC_002932	AGC	2	6	288835	288840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673116
5565	NC_002932	GCGTT	2	10	288862	288871	0 %	40 %	40 %	20 %	21673116
5566	NC_002932	AGT	2	6	288876	288881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673116
5567	NC_002932	T	9	9	288998	289006	0 %	100 %	0 %	0 %	21673117
5568	NC_002932	GGA	2	6	289047	289052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673117
5569	NC_002932	TGCT	2	8	289085	289092	0 %	50 %	25 %	25 %	21673117
5570	NC_002932	GCTG	2	8	289195	289202	0 %	25 %	50 %	25 %	21673117
5571	NC_002932	ATC	2	6	289222	289227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673117
5572	NC_002932	GAGC	2	8	289246	289253	25 %	0 %	50 %	25 %	21673117
5573	NC_002932	GCG	2	6	289276	289281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673117
5574	NC_002932	CTC	2	6	289339	289344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673117
5575	NC_002932	CCT	2	6	289383	289388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673117
5576	NC_002932	GAC	2	6	289441	289446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673117
5577	NC_002932	TGA	2	6	289779	289784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673118
5578	NC_002932	CAGC	2	8	289786	289793	25 %	0 %	25 %	50 %	21673118
5579	NC_002932	GCT	2	6	289880	289885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5580	NC_002932	TTC	2	6	289901	289906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21673118
5581	NC_002932	TGT	2	6	289932	289937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21673118
5582	NC_002932	GCC	2	6	289995	290000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673118
5583	NC_002932	AGG	2	6	290021	290026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673118
5584	NC_002932	ATGCCG	2	12	290066	290077	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5585	NC_002932	CGC	2	6	290088	290093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673118
5586	NC_002932	TGG	2	6	290109	290114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673118
5587	NC_002932	TCA	2	6	290115	290120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673118
5588	NC_002932	GGC	2	6	290121	290126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673118
5589	NC_002932	CGA	2	6	290289	290294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5590	NC_002932	TCG	2	6	290306	290311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5591	NC_002932	TGA	2	6	290343	290348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673118
5592	NC_002932	GAA	2	6	290374	290379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673118
5593	NC_002932	CGA	2	6	290382	290387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5594	NC_002932	TTCGA	2	10	290570	290579	20 %	40 %	20 %	20 %	21673118
5595	NC_002932	AT	3	6	290588	290593	50 %	50 %	0 %	0 %	21673118
5596	NC_002932	TCG	2	6	290681	290686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5597	NC_002932	AGG	2	6	290715	290720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673118
5598	NC_002932	CCTTGA	2	12	290721	290732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21673118
5599	NC_002932	CGG	2	6	290746	290751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673118
5600	NC_002932	CGC	2	6	290775	290780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673118
5601	NC_002932	CCG	2	6	290814	290819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673118
5602	NC_002932	GCT	2	6	290833	290838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5603	NC_002932	CGA	2	6	290863	290868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673118
5604	NC_002932	GT	3	6	290913	290918	0 %	50 %	50 %	0 %	21673118
5605	NC_002932	GA	3	6	290957	290962	50 %	0 %	50 %	0 %	21673118
5606	NC_002932	GAAG	2	8	291186	291193	50 %	0 %	50 %	0 %	21673119
5607	NC_002932	GCT	2	6	291253	291258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673119
5608	NC_002932	CGGCC	2	10	291261	291270	0 %	0 %	40 %	60 %	21673119
5609	NC_002932	TCGGCG	2	12	291285	291296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21673119
5610	NC_002932	ACC	2	6	291335	291340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673119
5611	NC_002932	CAT	2	6	291352	291357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673119
5612	NC_002932	GCG	2	6	291383	291388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673119
5613	NC_002932	GGC	2	6	291418	291423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673119
5614	NC_002932	CGTG	2	8	291427	291434	0 %	25 %	50 %	25 %	21673119
5615	NC_002932	GCG	2	6	291446	291451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673119
5616	NC_002932	CTC	2	6	291452	291457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21673119
5617	NC_002932	GGC	2	6	291487	291492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673119
5618	NC_002932	GAA	2	6	291499	291504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21673119
5619	NC_002932	CTA	2	6	291523	291528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21673119
5620	NC_002932	GCG	2	6	291559	291564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21673119
5621	NC_002932	TCG	2	6	291657	291662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673119
5622	NC_002932	GAG	2	6	291677	291682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673119
5623	NC_002932	CG	3	6	291721	291726	0 %	0 %	50 %	50 %	21673119
5624	NC_002932	TCG	2	6	291753	291758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673119
5625	NC_002932	CTG	2	6	291761	291766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673119
5626	NC_002932	CGC	2	6	291870	291875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21673119
5627	NC_002932	CGT	2	6	291939	291944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21673119
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5647	NC_002932	TGC	2	6	293106	293111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485731
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5651	NC_002932	CGCC	2	8	293222	293229	0 %	0 %	25 %	75 %	161485731
5652	NC_002932	CTG	2	6	293319	293324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485731
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5989	NC_002932	CGA	2	6	310685	310690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673138
5990	NC_002932	GC	3	6	310693	310698	0 %	0 %	50 %	50 %	21673138
5991	NC_002932	GTG	2	6	310704	310709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21673138
5992	NC_002932	CCA	2	6	310783	310788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21673138
5993	NC_002932	CGA	2	6	310790	310795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673138
5994	NC_002932	TGA	2	6	310804	310809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21673138
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5997	NC_002932	GAG	2	6	310890	310895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21673138
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6000	NC_002932	CAG	2	6	311054	311059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21673138

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