MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 21270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_002620	GAA	2	6	308536	308541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834882
6003	NC_002620	ACA	2	6	308569	308574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834882
6004	NC_002620	GTT	2	6	308585	308590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834882
6005	NC_002620	AAT	2	6	308599	308604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834882
6006	NC_002620	TGAA	2	8	308662	308669	50 %	25 %	25 %	0 %	15834882
6007	NC_002620	AG	3	6	308722	308727	50 %	0 %	50 %	0 %	15834882
6008	NC_002620	C	6	6	308728	308733	0 %	0 %	0 %	100 %	15834882
6009	NC_002620	AGC	2	6	308814	308819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834882
6010	NC_002620	GTT	2	6	308852	308857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834882
6011	NC_002620	GA	3	6	308872	308877	50 %	0 %	50 %	0 %	15834882
6012	NC_002620	TAA	2	6	308878	308883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834882
6013	NC_002620	GAA	2	6	308887	308892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834882
6014	NC_002620	TAT	2	6	308897	308902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834882
6015	NC_002620	GGA	2	6	308928	308933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834882
6016	NC_002620	GGAAAA	2	12	308937	308948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834882
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6018	NC_002620	CTG	2	6	309039	309044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834882
6019	NC_002620	GTA	2	6	309098	309103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834882
6020	NC_002620	AGA	2	6	309135	309140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834882
6021	NC_002620	ATT	2	6	309147	309152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834882
6022	NC_002620	TA	3	6	309186	309191	50 %	50 %	0 %	0 %	15834882
6023	NC_002620	ACT	2	6	309211	309216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834882
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6027	NC_002620	T	7	7	309337	309343	0 %	100 %	0 %	0 %	15834882
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6030	NC_002620	GGT	2	6	309405	309410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834882
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6035	NC_002620	AGAAT	2	10	309805	309814	60 %	20 %	20 %	0 %	15834882
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6038	NC_002620	T	7	7	310077	310083	0 %	100 %	0 %	0 %	15834882
6039	NC_002620	TCTT	2	8	310126	310133	0 %	75 %	0 %	25 %	15834882
6040	NC_002620	TTG	2	6	310162	310167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834882
6041	NC_002620	GTT	2	6	310168	310173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834882
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6051	NC_002620	ATT	3	9	310404	310412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834882
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6055	NC_002620	TAT	2	6	310517	310522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834882
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6058	NC_002620	TCC	2	6	310593	310598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834882
6059	NC_002620	TG	3	6	310631	310636	0 %	50 %	50 %	0 %	15834882
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6113	NC_002620	GGAG	2	8	313059	313066	25 %	0 %	75 %	0 %	15834883
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6125	NC_002620	TGC	2	6	313351	313356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834883
6126	NC_002620	TCC	2	6	313376	313381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834883
6127	NC_002620	TCC	2	6	313478	313483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834883
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6129	NC_002620	TCT	2	6	313767	313772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834883
6130	NC_002620	AG	3	6	313976	313981	50 %	0 %	50 %	0 %	15834883
6131	NC_002620	ATA	2	6	313996	314001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834883
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6133	NC_002620	ATCT	2	8	314173	314180	25 %	50 %	0 %	25 %	15834883
6134	NC_002620	ACA	2	6	314289	314294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834883
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6137	NC_002620	CTT	2	6	314377	314382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834883
6138	NC_002620	CAT	2	6	314533	314538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834884
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6140	NC_002620	ATC	2	6	314613	314618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834884
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6142	NC_002620	ATT	2	6	314697	314702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834884
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6144	NC_002620	AGA	2	6	314804	314809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834884
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6146	NC_002620	ATAGT	2	10	314914	314923	40 %	40 %	20 %	0 %	15834884
6147	NC_002620	TTC	2	6	314948	314953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834884
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6150	NC_002620	A	6	6	315054	315059	100 %	0 %	0 %	0 %	15834884
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6158	NC_002620	CAATC	2	10	315427	315436	40 %	20 %	0 %	40 %	15834884
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6220	NC_002620	AGT	2	6	318748	318753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834887
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6227	NC_002620	CTT	2	6	319230	319235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834887
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6232	NC_002620	CAG	2	6	319404	319409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834887
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6235	NC_002620	ATAG	2	8	319554	319561	50 %	25 %	25 %	0 %	15834887
6236	NC_002620	CTC	2	6	319563	319568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834887
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6240	NC_002620	AGAA	2	8	319888	319895	75 %	0 %	25 %	0 %	15834887
6241	NC_002620	T	6	6	319899	319904	0 %	100 %	0 %	0 %	15834887
6242	NC_002620	TGT	2	6	319999	320004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834887
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6245	NC_002620	AG	3	6	320031	320036	50 %	0 %	50 %	0 %	15834887
6246	NC_002620	G	6	6	320040	320045	0 %	0 %	100 %	0 %	15834887
6247	NC_002620	AGAA	2	8	320065	320072	75 %	0 %	25 %	0 %	15834887
6248	NC_002620	TGT	2	6	320120	320125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834887
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6250	NC_002620	A	6	6	320181	320186	100 %	0 %	0 %	0 %	15834887
6251	NC_002620	GTTTGT	2	12	320197	320208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834887
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